Viruses: 77945755
Help
Entry
77945755 CDS
T40000
Symbol
PQC11_gp172
Name
(RefSeq) Synechococcus phage S-H9-1; structural protein
Virus
2783674
Synechococcus phage S-H9-1
Taxonomy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
VOG
VOG cluster
Other DBs
NCBI-GeneID:
77945755
NCBI-ProteinID:
YP_010669572
RS:
NC_070961
UniProt:
A0A873WFK7
LinkDB
All DBs
Position
NC_070961:complement(74175..77711)
Genome browser
AA seq
1178 aa
AA seq
DB search
MADRFPLIVNAVSKKIEELVAGDNLELTSNGIIIGGDTGSGKYLTSDGTQVLWGSPGDVF
LNQSQTLTNKTLESCALSGTLNSITNLPNSSLINSGITINGSTVALGGSITTPDNNTTYT
ISAQDSISASQKIIRITGSDTSTDDVVITAGTNMNIARSGDEIILSSTYIDTNTVTRLQA
YSGGALQDGDITIRGAGSTIVTQDTQTKTLFITSTDDDTITRLRATAGQVYNSGDFTFLA
GGATSVVQGVDGNGDPTITYSSTNTVTRLKGGGSGTFTSGDVTITGGTNVTVSQAGSTVT
VASVDTNDVTKIAANSESLAFGDFRLLASGATNISTSVNNGVKEITISSVNTDTGAAATA
SGGVQKSGNDFRLKNNANFTGNTVLKWDSGNSQLANSIILDDGSTITIGGDLVVEGTQTT
LNTTTLVVEDNIIELRKGPSITASDGGIQVNLTTDSNENVVTYRQLQWYNAGGYWRSFDG
SVSNRFVTENETQVLTNKTLTSPTLTAPILGAATASSINGLQIATTASATLDIASAKTLD
VNRDLVLTSDNNSASITVNFRNGGNVAYTSDTLATFASTTSTQLRGLITDTTGLDRLVFQ
TNPTILTGITTTSPGFTLLNSGATAITAFGAAASIDMGAAGGTFTINQNLVVNEDLTVGS
GIADTITINGILNSENADILIRGSATDPMRVGRGIGEVSTNTALGVRAINSVSSGSQNTA
IGFESLFTTNTGAANTAIGNRALRANGIGSNNIAIGRDALLVNLSGDKNIAIGNNAMESM
STGSANVCIGHYAGYGITGTGNVLIGPADDENSTNATYVPPNIGGSRQLVIGSGTEAWIR
GDANFNLTLPNNLTVDGDATISGNLVVNGDVTSINSNVIQVDDKEIELASVVATTFSAVT
VDNTSTITSITINTADAGLIPGMEVNSTTGGISVPAGTTIVSISGNTATLSAAVTGSGTA
IFTSPGATDLTADQGGIRVRGTTDKRIFYDHSRTDKYWVMTENLELNFGKKLVIGNQLML
NSTTLGSTIVNSSLTSVGTLTGLDVDGAITLGGVITEKTFNNFSTTLTPSANVLTLNLSA
ANTILGTPATTAINEWAFTNAGLSNGQSKTVTLILSSNTAATYGDACSVDGNAVTNGVQW
SGGSPPIATSNTDILTFVIVRDNAGVVQVFGQGNTDFS
NT seq
3537 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggcagatcgtttcccattaattgttaatgccgtctccaagaaaattgaagaacttgta
gcaggtgacaatctagagttgacatccaatggtattatcattggcggagatactggatca
ggaaaatatttgaccagtgatggaacacaggtattgtggggatctcctggagatgtcttt
ttaaatcaaagtcaaaccctaacaaataagactttggaatcttgtgccctgtctggcacg
ttgaatagcattacaaaccttccaaattcgtctcttattaatagtggtattaccataaat
ggatctactgttgctctgggtggaagcataacaactccagacaataatacaacttatact
atttcagctcaagatagtattagtgcttctcaaaaaatcattcgtattactggcagcgat
acttctacagacgatgttgttattactgctggaacaaacatgaacattgccagaagtggc
gatgaaattattttatcttcgacttatattgatacgaatactgtaacaagactccaagca
tatagtggaggtgctttacaagacggggacattacgataagaggtgctggatctactatt
gttacacaagatactcaaacaaaaactctcttcattacatctacagatgatgatacgatt
accagattgagagcaacggcaggacaagtttataactctggtgattttactttccttgcg
ggcggtgcaaccagtgttgtgcaaggagtagatggcaatggagatccaacaattacttac
agttctactaatactgtaactagattaaaaggtggtggttctggaacatttacctcaggt
gatgtaacaatcactggaggaactaatgtaacagtatctcaggcaggatctactgttact
gttgcttccgtagatactaatgatgtaacaaaaattgctgctaattctgaaagtcttgcc
ttcggtgactttagattgctagcatctggagctacaaatatctctacatcagtcaataat
ggtgtaaaagaaattactattagctctgtcaacactgatactggtgccgcagcaactgct
tctggtggtgttcaaaaatctggtaatgattttagattaaaaaacaacgcaaactttact
ggaaacactgttctcaaatgggatagtggaaactctcagctagcaaatagtattatttta
gatgatggatctacgataactattggtggagatttggttgtcgagggaacacagaccact
ctgaacacaaccactcttgtagtggaagataatattattgaacttagaaaaggaccaagt
atcactgcttccgatggtggtattcaagtcaacttaacaactgattcaaatgaaaatgtt
gtaacttacagacaacttcaatggtataatgctggtggatattggagatcttttgatggt
tctgtttctaatagatttgtaacggagaatgaaactcaagttcttacaaacaaaactctt
acgtctccaacattaacagctccaattcttggtgctgccacagcatcatctattaatgga
ttgcaaattgcaaccactgcttcggcaactcttgacattgcttctgccaaaacattagat
gtcaatagagatcttgttttaacttctgataataactctgcatctatcacagttaacttt
aggaatggcggtaacgtagcatatacatcagacacacttgctacgtttgcatctacaaca
tccactcagttgagaggtttgattactgacacgactggtcttgatcgtcttgtattccaa
accaacccaactatacttactggaattactactacttcacctggatttacgctgttaaat
tctggtgccactgctattacagcatttggagcagctgcttctattgatatgggtgctgct
ggtggtacgtttaccatcaatcagaatctagttgttaatgaagatctaacagtgggttct
ggtattgctgatactattactatcaacggtattcttaactctgagaacgctgatatttta
attcgtggtagtgctaccgatccaatgagagttggacgtggtattggtgaagttagtaca
aacactgccttgggtgtgagagcaattaattctgtatcctctggttctcagaatacagcg
attggttttgaatctttatttaccacaaatactggtgctgctaacactgcaattggtaat
agagcactgagagcaaatggtattggatctaacaacattgctattggtcgtgatgctcta
ctggtaaatctttctggtgataagaacatcgctattggtaacaatgcgatggaaagcatg
agcacaggtagtgccaacgtttgtattggtcactatgctggttacggtatcactggtact
ggtaacgttctcatcggtcctgctgatgatgagaactcaactaacgcaacttatgtacca
cctaacattggtggcagcagacagttagttattggttctggtactgaagcatggattcgt
ggtgacgctaacttcaatcttacattacctaataacctgacagtagatggtgatgctact
atctctggtaatttagttgttaatggagatgtcacatcaattaactctaacgtcattcaa
gtagatgataaagagattgaacttgcctctgttgtagctacaacattctccgctgtaacc
gtcgataatacttctacaattactagtattactattaatacagctgatgcaggtttgatt
cctggaatggaggtcaactccacaacaggtggtattagtgttcctgcaggaacaactatt
gtgagtattagtggaaatactgctactctctcagctgctgttacaggaagtggaactgca
atcttcacttctcctggtgcaacggatctgacagcagatcaaggtggcattcgtgtcagg
ggaactacagacaagcgaattttctacgatcactccagaactgataagtattgggtgatg
actgagaaccttgaactcaacttcggtaagaagctagttattggtaaccagttgatgctc
aacagcaccacccttggttctacaattgtcaattcttcactaacatctgttggtacactg
actggactagatgttgatggtgctatcactcttggtggtgtgattactgaaaagacattc
aataatttcagtacgactcttactccatctgctaacgttctaactctaaacctttctgct
gccaacacaattcttggaacaccagcaacaacagcaatcaatgagtgggcatttactaat
gctggtctaagcaatggtcagtccaagacagtaactctcattctatcttctaacactgct
gctacatatggtgacgcttgtagtgttgatggcaacgcagttactaatggtgttcagtgg
tctggaggttcgccaccaattgccacatcaaacacagacattctcacgtttgttatcgtc
cgagataatgcgggtgtcgttcaggtattcggacaaggcaacacagacttcagctga
DBGET
integrated database retrieval system
