Viruses: 77946112
Help
Entry
77946112 CDS
T40000
Symbol
PQC12_gp147
Name
(RefSeq) Synechococcus phage S-SCSM1; tail fiber protein
Virus
2588487
Synechococcus phage S-SCSM1
Taxonomy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
VOG
VOG cluster
Other DBs
NCBI-GeneID:
77946112
NCBI-ProteinID:
YP_010669918
RS:
NC_070962
LinkDB
All DBs
Position
NC_070962:176745..182306
AA seq
1853 aa
AA seq
DB search
MGLSRLDNFLKSTKGEILYVDPSSLDSTDSIENKGNSLARPFKTIQRALLEAARFSYQAG
ENNDRFGKTTILLYPGEHVVDNRPGWIPIHDQVANTYRLRSGTTSDDFPPLDVNSNFDLD
SPNNALYKLNSIHGGVIIPRGTSLVGLDLRKTKIIPKYVPNPENDQIERSAIFRVTGACY
MWQFSIFDGDQTGTVYKDYTNNSFVPNFSHHKLTVFEYADGVNPVSINDDFLVYDDTNTD
LDMFYQKVGFAYGKPSGREVSPDYPSDSLDIEPKVDEYRIVGSTGAEVGITSIKAGDGAI
SSTEITVTLENEVPGLDVNTPIRIEGIADEGYDGQFAVFEVLSTTEIKYQVSVPPTNPLP
ATTSGATLNISVDTVTSASPYIFNISLRSVYGMCGLHADGSKATGFKSMVLAQYTGIGLQ
KDDNAFVKYNSSTGLYEGTLAAGNENIHTDSNARFKPEYENHHIKCSNNALLQIVSVFAI
GFNNHFLLESGGDASITNSNSNFGAKALVSRGFRPDAFPRDDIGYISHFVTPKEIESVEG
GIEFLGIDVGVTTSVGIATTSKLFLYGEDNLDVPPATVIDGYRIGSKKDEALKVLLASGN
EIETYHSQVVMPSTEGTANEKISEKIHKVKQSNDINVIVSNTLTLEENHTFLNGETIRII
SENGGLPDGITEDKIYYAITTAIAPNPALGANQLKIAATLNDANNDVPITINNTGGILSI
VSRVSDKSAGDLGHPVQWDETQQQWYVNVSTGSTDVSIYKQLWMRGVAELGETTPRTFVL
RKPTDRNVEGSLYKVRYVLPKDSPTLGRPPVDGFVIQESNNIDGTSNSEVEKYLSFDSQT
LSNSTEFRNFKFIADAEWSSVDSKATIRTEIPHNLNAGAQVEITNVYSGFNTTGKDNNGF
NGTFIVDSVENRKEFKIGIAVNPGDFTSDTSIRNQNLPKLKKKKNSGTFLVYKSDEIQPY
VQNEQDGVYHLTIINSSNTPTVSPFTGVKLLQPLDNLYPEYDRDNPSSDPDPARCFAVPD
PIGKVVINDPEKSITKETVISTLENNGVGFAVTDILSEDAIDGYRHTVYTSADHGLNRVI
EVEIVDPGTNYGSGIGITENLYNAQLVGFAGSVTGSNATARVQVSSAGTLANVQIIDGGS
SYGIGNTMSVVGIATTSGHTTGSVRVTKIYDNVGDSVTIERISDLYHGYNTTYQINSIDV
GESNSFDVVSATAVGIGSTISGIGNKNSSLGYAYLNGKAYAISASDYTPATGIATFTTGI
NAHGLQVNDKIYIGGATGDSVLFNGEYLIERTDSLTSLVVNVGVSTLTTITLGGSPTIFS
TTLNSKGGEITVGDESYSSRLSIPYGNLQGTLALAMTKVDSNMNVTDLDDLDLEIGDYIL
VNDEIMRVKQTVVGNPVKVYRGLLGTQAESHVSGSVFRRINARPIEFRRHSIIRASGHTF
EYLGYGPGNYSTAFPDRHDRQLSAAEEVLSQSFTEEGGFVVYTGMNSDGDFYISNKRVIT
TAGDEEVFSTPRPRFRGESKTIPDTKLGFNVIKASEVNVSEAVRVDGGEDKTTISQFDGP
LLVNNKLTVTSNKGLESPSLFLQGDETVSRKYTVGVTQPASSVELVGEGAGNPGDIIFNG
NPFKGQNAGWVYTTDNDWYPWGAISNKTDVFEIGGYFIGTFTGDGSGLYDVSDIWAIDAT
GIHTTRNVGFGSTNSSKADVSMYVQGNAEIRGTMKVFEIIENTTLDNATVLGIGTTVINV
DLDTSSIYYYTQDAGANWAVNMRARAGLALTDFLEVSESITVAITTKQGGTPYYNDEVYI
DDIRMSPRYYGSLTINTGNANSLDLYTYVLVRKSNTGDPVTDFDVLYSQSQYQ
NT seq
5562 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgggtcttagtcgtctggataattttctaaagagcaccaagggtgagattctttatgta
gatccctcaagtctcgattctacggacagtatcgagaataaaggtaactctttagcaagg
ccatttaaaacaattcaaagggcactgctggaagcagcacgtttctcctatcaagcagga
gaaaataatgatagatttggtaaaacaaccattctactctatcctggtgagcacgtagta
gataatagaccaggatggataccaattcatgatcaagtggcaaacacgtacagacttaga
tctggtactacttctgatgactttccaccacttgatgtcaatagcaactttgacctagac
agtcctaataacgcattatataaacttaacagtattcatggtggtgttatcattcctaga
ggtacatcactagtaggtctcgaccttagaaaaaccaaaattattcctaagtatgttcct
aatccagaaaacgaccaaattgaaagatctgctatcttccgtgtaactggtgcttgttac
atgtggcagttctccatctttgatggtgatcaaactggaactgtatataaagactatact
aataattctttcgttcctaatttctcacaccataagctaacagtatttgaatatgctgat
ggtgtaaatccagtatctattaatgacgacttcctagtctatgatgatacaaataccgat
cttgatatgttctatcaaaaggttggttttgcatatggtaaaccatctggaagagaagtt
tctcctgattatccttctgatagcctagacatcgaaccaaaggttgatgaatatcgtatt
gttggttctactggtgctgaagtaggaattaccagtattaaggcaggtgatggagcaatt
tcttcaacagaaattacagttacactagagaatgaagttcctggtcttgacgtaaatacc
ccaattcgtattgaaggtattgctgatgagggttatgacggtcagtttgctgtatttgaa
gttctttcaactacagagattaagtatcaagtttctgttccaccaacaaatccactacca
gcaacaacttctggtgcaacactgaatatttccgttgatactgttacatctgcatcacca
tatatctttaacatctctctgaggtctgtttatggtatgtgtggacttcatgctgatgga
tctaaggcaactggattcaagtccatggttcttgcacaatatactggtattggactccag
aaagacgataatgcatttgtaaaatataattcttctactggattatatgaaggaactcta
gcagcaggtaatgaaaatattcataccgactccaatgctagattcaaaccagagtatgag
aaccatcatattaagtgcagcaacaatgcacttttacagatcgtttcggttttcgcaatt
ggtttcaacaatcacttcttgctagagtctggtggtgacgcatctatcaccaactccaac
tctaactttggtgcaaaagctcttgtctctagaggtttcagaccagatgcattcccaaga
gatgatattggttatatctcacattttgtaacaccaaaagaaattgaatctgttgaaggt
ggtattgaattcttaggtattgatgtaggtgttactacttctgttggtatcgcaacaact
agcaaacttttcctatatggagaggataatttagacgttccaccagcaaccgtaattgat
ggttatcgtattggttctaagaaagatgaagcactaaaagttcttcttgcatcaggtaat
gagattgagacatatcattctcaagttgtaatgcctagtactgaaggtactgcaaatgaa
aaaatatctgaaaaaattcataaagttaaacaatctaatgatattaatgtaattgtatca
aatacacttactcttgaagaaaatcacacattcttgaatggtgagactattaggattatt
agtgaaaatggtggtcttcctgatggtattactgaggataagatatactacgcaattact
acagcaattgctcccaatccagcactcggtgcaaatcaattaaaaattgctgcaactcta
aatgatgctaacaacgatgttccaattactatcaataatactggtggtatcctcagtatt
gtaagtagagtatctgataaatctgctggagatcttgggcacccagttcagtgggatgaa
acacagcaacagtggtacgttaatgtttctactggaagcactgatgtaagtatctacaag
caattgtggatgagaggtgttgcagaactaggtgaaacgacaccaagaacatttgttctc
agaaaaccaactgatagaaatgttgagggaagtctttataaagttcgttatgttctacca
aaagattctccaacattgggtagacctccagttgatggatttgttattcaagagtccaat
aatatagatggaactagcaattctgaggttgaaaagtatttaagttttgacagtcaaact
ctctcaaactcgacagagtttagaaactttaaatttattgcagatgccgagtggtcatct
gttgatagcaaagcaacgattagaacagaaataccacacaatttaaatgctggggcacag
gtagaaattaccaatgtgtatagtggttttaatactacaggaaaagataataatggattt
aatgggacatttattgttgatagtgttgaaaatagaaaagaatttaagattggtattgca
gtaaatcctggtgattttacaagtgatacttctattcgtaatcaaaatttaccaaaactt
aagaaaaagaagaacagtggaacattcttagtatataagagtgatgagatacaaccatat
gttcaaaatgaacaagatggtgtatatcatttaactattattaactcatcaaatactccc
actgtatcaccatttactggtgtaaaactattacaacctctggataatctttatcctgag
tatgatagagataacccaagttctgatccagatcccgcaaggtgttttgctgttcccgat
cctatcggtaaagttgttattaatgacccagaaaagagtattactaaagaaacagtaatt
tctaccttagagaataatggggttggatttgcagttactgatattttatcagaagatgct
attgatgggtatagacatactgtttatacaagtgccgatcatggactcaatagagttatt
gaagttgaaattgttgatccaggaactaattatggttcaggaattggtattacagaaaat
ctttacaatgcacaactagtaggttttgctggttctgttactggatcaaatgcaacagca
agagtccaagtatcatcagcaggtacacttgctaatgttcaaattattgatggtggttca
tcttatggtatcggaaacactatgtctgttgttggtattgcaactacatctggacataca
acaggaagtgtaagagtaactaaaatttatgataacgttggagattctgtcactattgaa
agaatcagtgatctttatcatggatacaatacaacttatcaaatcaatagtattgatgtt
ggtgaatctaatagttttgatgtagtctcagcaactgctgttggaattggatccactatt
tctggaattggaaataaaaattcctctcttggatatgcttatctaaatggaaaagcatat
gccatctcagcatcagactatactccagcaactggcattgctacatttacaactggcatt
aatgctcatggattgcaggtaaatgataagatttatattggtggagccacaggtgatagt
gttttatttaatggtgaatatttaattgaaagaacagattctttaacatcactggttgta
aacgtaggtgtttctactttaacaacgataacacttggtggatcaccaactattttctca
actacattaaattcaaaaggtggtgagattactgttggtgatgaaagttatagcagtaga
ctttctattccttatggcaatcttcagggaacactcgcacttgcgatgacaaaagttgat
agtaatatgaatgtaactgatcttgatgacttagatttggaaatcggtgattatattctt
gtcaatgatgagattatgagagttaagcagacagtagttggaaatccagttaaggtttac
agaggtcttttaggaacgcaagcagaatcacacgtatctggatctgtattcagaagaatt
aatgcaagaccaattgaatttagaaggcactctattattcgtgcttctggtcatacgttt
gaatatcttggttatggtcctggtaactactctactgcattccctgatcgtcatgatcgt
caactaagtgcagcagaagaagttctttcacaatcatttactgaagaaggtggatttgta
gtttacactggcatgaatagtgatggtgacttctacatctctaacaagagagttatcact
actgctggtgatgaagaagtgttctccactccacgtccaagatttagaggtgagtctaag
acaattccagatactaaactcggatttaatgttattaaagcatctgaagttaatgtttct
gaggcagtaagagttgatggtggtgaagacaagacaactatttcacagtttgatggtcca
cttctagtcaataataaactcactgttacttcaaacaaaggactagaatcaccaagtcta
ttcttacagggtgatgaaacagtttctagaaaatatactgtaggtgttactcaaccagca
tcttctgttgaacttgttggtgaaggtgcaggaaacccaggtgatattatctttaacgga
aacccattcaaaggtcaaaatgctggttgggtgtacaccactgataatgattggtatcct
tggggtgctatctctaataagacagatgtctttgagattggcggatacttcatcggtaca
ttcacaggtgatggatctggtctctatgacgtgtctgatatctgggcaattgacgcaaca
ggtattcacaccactcgtaatgtaggttttggttctacaaatagttccaaagcagacgtt
tccatgtatgttcaaggaaacgcagagattagaggcaccatgaaggtgtttgaaattatt
gaaaacaccactttagataatgctactgttcttggtattggtactacagtcattaatgtg
gacttagatacctcatctatctactactatacacaggatgctggtgctaactgggcagtg
aacatgagagcacgtgcaggacttgcacttaccgatttcctagaagttagtgagtctatc
acagttgctataaccacaaaacaaggtggaacaccatattataatgatgaagtctatatt
gatgatattaggatgtctccaagatactatggttcattgactataaatactggaaacgca
aatagtttagatctttacacgtatgtgttagtcagaaaatcaaatactggagatccagta
actgactttgatgttctatactctcaatcacaatatcaataa
DBGET
integrated database retrieval system
