Viruses: 77946117
Help
Entry
77946117 CDS
T40000
Symbol
PQC12_gp142
Name
(RefSeq) Synechococcus phage S-SCSM1; concanavalin A-like lectin/glucanase
Virus
2588487
Synechococcus phage S-SCSM1
Taxonomy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
VOG
VOG cluster
Other DBs
NCBI-GeneID:
77946117
NCBI-ProteinID:
YP_010669923
RS:
NC_070962
LinkDB
All DBs
Position
NC_070962:195527..198295
Genome browser
AA seq
922 aa
AA seq
DB search
MAEKSSGVRELSVIGIGTSTPSIKSSSNLNLSASTVAVGATLSVGDTLQLVGVNTSLAGT
AGTTGDIRMFHGAPFIHDGTAWREFYLKEGVPVTESADTEWDNVIYRNTFDSSFTDLKFG
QTAYDTYLSDVVASPRKFGDKALRLRDGYIRYQHRSEYVFDGDWTIEGWIYFDTLPSGTA
SGGSGDGLITKQKTGNTTHWAINADLRNSGYVDFSWYNSFLHGSSYGGAGIGSVTNAEAL
HNWNHFALVRDSTNGSLHFYFNGVESVFTINDQVIDNNIVDYSDHDLWFGSSYYQGYWDG
CFDDIRISTVARYTSVGISTTATFTPPTEPYPTTGTLSGPVDPPYFSAITEIADLSDVNG
ATPSNGQVLKWNGTQWAPATDLVGVGTTGVGIGLSDLSVTTNPVGTNALSYDDTTGTFTF
TPTSLVGYATETYVDNAVSGIATTGYVDNAIVGFITSGASGAGLTALTGAAAGTYGDNGN
SAQIVVDANGRITSITQVAITTDGAGVNVSGVSTFNDNVSFGSTILVDGAVNLAVNNATI
TGTAGSTGDIKMIGGAPFFYDGSSWREFALATGTPVTVAEDTEWDNVIFRNDFDTSLTDQ
KFSQAITDQTNSSLVTSPVKYGTQALRIQNGYVRYPHRSEYSFDGEWTIEGWMYWDALPT
GAAASGSGDSFISKYTPGNTSHWAISADVRNSGYVDFSWFNSYLHGSSYGGAGIGSVTNA
ELLQTWNHFAVVREPDNGSIHFYFNGVESVFTINDQVIDNNIIDISNSYLYFGDSYHQNY
FDGCFDDVRISNVARYTSVGISTTTTFTPPTQAYATSGTLTVTTDPPGDKYGEIGLGTSP
TWTGTSGVTVSQQDQGEYRLTFTSSYTNADDYFVLTQPMDQGFAAYVGAARSTTHVDFTI
NRQSNNAGVDTGSLAVQVTNHP
NT seq
2769 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggcagaaaaatcttctggtgtaagagaactgagtgttataggcataggtactagcact
ccatcaattaagagttctagtaatctaaatcttagtgcttcaacagttgctgttggagca
acactgtctgtaggtgatactttacaattagttggtgttaataccagtcttgcaggaaca
gcaggaacaactggtgacatcagaatgttccatggtgctccatttattcatgatggaact
gcttggagagagttctatcttaaagaaggtgtaccagtaactgaatctgctgatactgaa
tgggataatgttatctatagaaacacttttgactctagttttactgatttaaaatttgga
cagacagcttatgatacttatctatctgatgttgtagcatcaccacgtaaatttggtgat
aaagcattacgattacgagatggttatataagatatcagcatagaagtgaatatgttttt
gatggtgattggaccattgaaggttggatttattttgatacactgcctagtggtactgct
agtggtggatctggggatggattaataaccaaacaaaagactggtaatactacccattgg
gcaattaacgctgatcttaggaactctggatatgtagattttagttggtacaattcattt
ttacatggaagttcttatggtggcgcaggaattggatctgttactaatgcagaggctctg
cacaattggaatcattttgctttagttagagatagtactaatggttctttacacttctat
tttaatggtgtagaaagtgtatttacaataaatgatcaagttatagataacaatattgtt
gactactctgaccacgatttatggttcggttcttcatattatcaaggatattgggatgga
tgttttgatgacataagaatttctactgtcgcaagatatacttcggttggtatttctact
acagcaacatttactccacctacagaaccatatccaaccacaggaactttaagtggtcca
gttgatccaccatattttagtgcaattacagaaattgctgatttaagtgatgtaaatgga
gcaactccatccaatggtcaagttcttaagtggaatggaactcaatgggcacctgcaact
gatttagttggtgttggaacaacaggagttggtattggactttcagatctatcagtaaca
acaaatcctgtaggaacaaatgctttatcatatgatgatacaacaggaacctttacattt
acaccaacatctttagttggatatgctactgaaacttatgttgacaatgctgtatcagga
attgcaactactggatatgttgataatgcgattgtaggatttattacttctggtgcatct
ggtgcaggattaactgcattaacaggtgctgctgcaggaacatatggtgataatggaaac
tctgcacaaattgtagttgatgcaaatggtagaattactagcatcacgcaggtagcaatt
actactgatggtgctggagtaaatgtctctggagtttcaacttttaatgataacgtttca
tttggttcaaccatattagttgatggtgctgtaaatcttgcagttaataatgcaacaatc
acaggcactgctggttcaactggtgatattaagatgattggtggtgctccattcttctat
gatggatcttcttggagagagtttgctcttgcaactggcacaccagttactgttgctgaa
gacaccgagtgggataatgttatctttagaaatgattttgatacgagtcttacagatcaa
aaatttagtcaggctataacagatcaaactaattcatctttggtcacatctcctgttaag
tatggtactcaagcattacgaatacaaaatggttatgtaagatatccacatagaagtgaa
tatagttttgacggagaatggaccatcgaaggttggatgtattgggacgcattaccaact
ggagccgcagcatcaggatctggagattcatttatatcaaaatatactcctggtaatact
tcccattgggcaattagcgctgatgtcaggaactctggatatgtagattttagttggttc
aattcctatcttcatggaagttcttatggtggcgcaggaattggatctgttactaatgca
gaacttcttcagacttggaatcattttgctgtagtcagagaaccagataatggttcgatc
cacttctattttaatggtgtagaaagtgtatttacaataaatgatcaagttatagataac
aatattattgacatctctaattcttatttgtactttggtgatagttatcatcaaaattat
tttgacggatgttttgatgacgtaagaatttccaatgttgcaagatatacttctgttggt
atttctaccacaacaacatttactccaccaactcaggcatatgcaacttcaggaacactt
acagttacaactgatccaccaggagataagtatggtgagattggacttggaacttctcca
acttggacaggaacatctggtgttactgtttcacaacaagatcaaggagagtatcgtctg
acatttacatcttcttatactaatgctgatgattactttgttctaactcaaccaatggat
caaggatttgctgcatatgttggtgctgcaagatctactacacacgtagactttacaatc
aatagacaaagtaataatgcaggagtagatactggatcacttgcagttcaagttactaat
catccataa
DBGET
integrated database retrieval system