KEGG   Viruses: 80510845
Entry
80510845          CDS       T40000                                 
Symbol
S, QKS20_gp2
Name
(RefSeq) Hipposideros pomona bat coronavirus CHB25; spike glycoprotein
Virus
2691598  Hipposideros pomona bat coronavirus CHB25
SSDB
Motif
Pfam: CoV_S2 CoV_S1 CoV_S1_C CoV_S2_C DUF8567 dCache_1 Orbi_VP5 DUF2959 YjcZ PSI_induc_2 PEX14-like_2nd Syntaxin FBF1 FemAB WXG100 DUF16 T4SS_LegC2C7 ATG17_like
Other DBs
NCBI-GeneID: 80510845
NCBI-ProteinID: YP_010037474
UniProt: A0AAE6R6Q1
LinkDB
Position
NC_054004:20439..24497
AA seq 1352 aa
MISLAVFLAELLVIISKLPPVLLNSPADLCNWNAGEKPTIDLGLPPNSTVFVSGYLPTPE
NQWHCKAGLVSYNDVHGFFWSYYAQAENVAIGISSADQTSNSDQWAMYIWQRNNGGGNAR
LKICKWSGTFAPTYSPHVERGVCIVNIRFTMQFYHAGKEVVGVTWNDDIVTIYGLSKTYR
FHLANKWSRVTVQCQTPQSCGILPVYNVTTLNITTDANGRIATYSVCDSCAGFPAHVFPV
GDGGYIPIDFDFTNWFVLTNKSTIIQGRTTAIQPLRLLCLWPVPVLLATDNPIYFNLSRS
EGVRCNGFRTEGVADVLRFSLNFTQTQVLNGVHNIVFNTDYSNYTFTCTNDTVIGNGRSI
VPFGFLDEVYRCFVLTQTPNGTISTFVGVLPPVTREFVVSRYGAVYVNGVRMMSLPPLES
VIFNVTSSVGSDFWTVAFANDAEVLLDINATNIVGLQYCDTHVDKLKCSQLSYTLSDGFY
TAASFVKATLARTYVALPYHATHTTIELNVTMQFTGHSITLNGQTAGSVCVNTSQFTTSL
HTNDDPAYHGDVTNVDCPFNFHTLNNYLSFGTICFSLQPLASSCSMSIDSVILGYHQPLG
VLYISHSSGSTTTGMPRSTGGVYDSSVVYTGVCTDYTIYGVTGRGIITELNTTIIAGLYY
TSVSGQLLGFKNATNGVVYAVRPCDLSSQVAVYEDNIIGVVSSEPNVTFGFNNTVQLPNF
YYHSNSLDNCSDPVLTYGSIGVCSDGSITQVQIRKSEPQPATPILTGQINIPSNFSLSVQ
VEYLQMHMQPVSVDCSRYVCNGNPHCLRLLTQYVSACKNIEDALQLSARLESMEINSAIT
VSDNALQLANVSNFDHFNMSALLPRQNGKSAIEDLLFNKVVTSGLGTVDQDYKKCIQDSG
LADVADLACAQYYNGIMVLPGVVDEVKMGLYTASLTGAMVLGGFTAAAAIPFSLAVQSRL
NYVALQTDVLQQNQKILADSFNSAMSNITLAFTEVNEALKDTSEAINTVAQALNKVQTVV
NEQGQALAQLTRQLASNFQAISSSIEDIYNRLDILAADAQVDRLISGRLSALNAFVTQTL
TKYTDVRASRQLALQKINECVKSQSSRYGFCGNGTHLFSIANAAPNGIMLFHTVLVPTQY
VAVNAWAGICVSGSGFVLRDVKSALFNVNNTYYITARDMYEPRTPQSSDFVRITGCIVTY
LNLSSDELSQVIPDYIDVNKTLEDFAQNMPNYSVPDLDLGVYNHTILNLTTEIDLLQNKS
DQLLASTVRLQELIDNLNKTYVDLEWLNRFEQYIKWPWYVWLAIFLAIILFSFLMLYCCC
ATGCCGCLSCLSSSCDCGKNLQHYEVEKVHIQ
NT seq 4059 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgatttcacttgctgtgttcctggctgagttgttggtcattattagcaaattacctcct
gttttattaaatagtcccgctgacctgtgcaactggaatgctggtgagaaacctacaata
gatttaggtttacctcctaattccaccgtgtttgttagtggctatttaccgacgcctgaa
aaccaatggcattgtaaggcaggcttagtttcctataatgatgtacatggttttttctgg
tcttactatgctcaagctgaaaatgttgctattggcatctctagcgctgaccaaacttct
aacagtgatcaatgggcaatgtacatttggcagcgtaacaatggtggtggcaacgcacgt
cttaaaatttgtaagtggtctggcacttttgcacccacatatagtccacatgttgagcgt
ggtgtttgcattgttaatattaggtttactatgcaattttaccatgctggtaaagaagtt
gttggtgtgacctggaatgatgacattgtcaccatttatgggttaagtaaaacttacagg
tttcacctagctaacaaatggtctagagttactgtgcagtgtcaaacaccacaatcttgt
ggcatcctacctgtttacaatgtaaccacgcttaacatcactactgatgctaatggccgt
attgccacctatagtgtttgtgattcatgcgctggttttcctgcacacgtttttcctgtt
ggtgatggcggttacatacctattgactttgactttactaattggtttgtcctaacaaac
aaatcaaccattattcaaggtcgcactactgccattcaacctttgcgtttactttgtctt
tggccggtgcctgttttactcgcaacagacaaccctatttacttcaatttgtccagaagt
gaaggtgttcgctgtaatggttttagaactgaaggtgttgctgatgtcttaaggttttcc
cttaattttacgcaaacacaagtgcttaatggtgtgcacaatattgtttttaacaccgat
tacagcaattacactttcacgtgcacgaacgacactgtcataggcaatggccgttcaatt
gtaccatttggctttcttgatgaagtttatagatgttttgtcctaacacaaacacccaat
ggaactattagcacttttgttggtgttttaccgccagttacaagagagtttgttgtttca
cgttatggtgctgtttatgttaatggtgtcaggatgatgtcacttccaccgctagagagc
gttatttttaatgttactagtagtgtgggttcagacttttggactgttgcatttgccaat
gatgctgaagttttacttgatattaacgccaccaatatagttggcttgcagtattgtgac
acgcacgttgacaaacttaagtgctcgcagctttcatacactcttagtgatggtttttac
actgctgcaagctttgttaaagccacactagcacgcacttatgttgccttgccgtaccat
gctactcatactactattgagttaaatgtcaccatgcaatttactggccatagcattaca
cttaatggacaaacagctggcagtgtgtgtgttaacacatcacagtttaccacctcattg
catactaatgacgaccctgcgtatcatggagacgtcactaatgttgattgtcccttcaat
ttccatacacttaacaattatttatcctttggcactatttgtttctcattgcaaccacta
gctagttcttgcagtatgagtatagatagtgtcattttagggtatcatcagcctttaggt
gtgttgtacataagtcactctagtggttctacaaccacaggcatgccacgctctacaggt
ggtgtttatgactcaagtgttgtttacacaggtgtttgtactgactatacaatttatggt
gtgacaggcagaggtataattaccgagcttaacaccactataattgctggtttgtattac
acttctgtgtcaggtcaattacttggcttcaaaaatgctactaatggtgttgtgtatgct
gtacgaccctgtgatttgtctagtcaggttgctgtttatgaagacaatatcataggtgtg
gtttcttcagaacctaatgtgacttttgggtttaataacactgtgcaactgcctaatttc
tactatcactccaatagcctagacaattgttcagaccccgttctgacgtatggttctatt
ggcgtgtgtagtgatggcagtattactcaagttcaaatccgcaaatccgaacctcaacct
gccactcctattcttactggacagattaacataccttctaatttcagcttgtctgtacaa
gttgaatatttgcaaatgcacatgcaaccagttagtgttgattgcagtaggtatgtttgt
aatggaaatcctcattgtctccgattacttacgcaatatgtttctgcttgcaaaaacatt
gaagatgcactgcaacttagtgctcgtttagagtccatggagattaatagtgctattact
gtttctgacaatgctttgcaattggccaacgtatccaactttgatcattttaacatgtct
gcattgttgccaagacaaaatggtaagagtgctatcgaagacttgctgtttaacaaagtt
gttactagtggccttggcactgttgaccaggactataagaagtgtatacaggatagtggt
ttggcagatgttgctgacttagcttgtgcacagtattacaatggcattatggtgctgcca
ggtgttgttgacgaagttaagatgggtttgtacaccgcctcattaactggtgctatggtg
ttaggtggctttactgccgcagctgccataccattttctttggctgtacagtcgcgtctt
aactatgttgctttgcaaactgatgttttgcagcaaaatcaaaagattttagcagattct
tttaacagcgctatgagtaatatcactcttgcttttacagaagttaatgaagcgctcaaa
gatacctctgaagcaattaatactgttgcacaagctcttaacaaagtccaaactgttgtc
aatgaacaaggacaggcactagctcagcttacacgtcaattagcctctaacttccaagct
atttcatcttctatagaagatatttataatagactggacattttggctgctgacgcacag
gttgacaggttgatttctggtcgtctaagtgcacttaatgcttttgtaacacaaacgtta
actaagtacacagacgtgcgtgctagtcgccaactggccttacagaaaattaatgagtgt
gttaaatcccaatcctcacgctatggattttgtggtaatggcactcatttgttttccatt
gctaatgcagcgcccaatggtattatgctattccacactgttttggttccaacgcagtat
gtggccgtaaatgcttgggctggaatttgtgtttcaggttctggatttgtgttgcgtgat
gttaaaagtgctttgtttaatgttaacaacacttattacatcactgctcgagatatgtat
gaacctcgtacaccacaatctagtgatttcgtccgtattactggttgtattgttacttac
ctcaatcttagttctgatgagttgagccaagttataccagattatatagacgttaataag
acacttgaggattttgcccaaaatatgcctaattactctgtgcctgacctagaccttggt
gtttacaatcatactattctcaatctcactactgaaatagacttgcttcaaaacaagtct
gaccagctgcttgcttccactgtgcgtttgcaagaacttattgacaaccttaataagacc
tatgtggaccttgaatggttaaatcgcttcgagcaatacattaaatggccctggtatgtt
tggttggcaattttcctggctatcatacttttctcctttttaatgctatattgttgttgc
gccacgggctgttgtggttgtttaagctgcttgtctagttcttgtgattgtggtaaaaat
cttcaacattacgaagtagaaaaagtccacattcagtga

DBGET integrated database retrieval system