Viruses: 80514623
Help
Entry
80514623 CDS
T40000
Symbol
QJ851_gp0166
Name
(RefSeq) Bodo saltans virus; putative tRNA ligase/uridine kinase
Virus
2024608
Bodo saltans virus
Taxonomy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
VOG
VOG cluster
Motif
Pfam:
RNA_lig_T4_1
AAA_33
RNA_ligase
ABC_tran
AAA_14
TsaE
AAA_18
RsgA_GTPase
Thioredoxin_3
Viral_helicase1
SRP54
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
80514623
NCBI-ProteinID:
YP_010778005
RS:
NC_075036
LinkDB
All DBs
Position
NC_075036:197044..199719
Genome browser
AA seq
891 aa
AA seq
DB search
MVKVRISFCKNIGKMKEISSTIVEPEFNEIIKIAKNKLKLKINESKIRLFVAKTTFTSTI
GQELTIDNTPSIVINDTIICVSEGEDFMLSKEIKNANCTLICPFNFILKKSQLNLPLNIS
NAQNTRNTTIEQLESLNNSQQYDMHGDFPILDGDVLKHFKDIVKNNNTFVQIDCGDYYAF
DYNSATSCDFPNPSTFKNKKEKWIASVKREMRGIIICAHTGKVLARRFHKFFNINECDET
NINKIQLAHDFILTEKIDGSLVSPFLINSKLVFATRSQIRHDIENPNKDFIEYCIESNKS
PLFELCENDHLVGVIDHTVKSLTLLAIRDNITGEYMNYDNMILLASKYNIKYAKRILING
SLYDIVNDIYNRNLIEGCVLANGQQMYKIKTNWYSSIAYSLKQGGNNNTCFLLELIKCRP
IISDIPIYKIYQTILNENSDDYLSHCCTLLPQNERDFLMKTKMDFLDNINKLHTEITTWI
DDMTAQYSKDIITQSMINANFTYQFIYACIHNNLDSKTIFINNIKDLCSPIHYKNLQDIL
LLNDKNIIHVYCDLDGVLVDFEKGVKELTGKFPQEYPNVGYMWANIEKVDNFWTKLEWTE
DGKELWDFIIANNNRIHVEILTGLPDGKFKDISNRDKKIWCKNNLGDTKINTCMGREKYT
YCQKNFILIDDREEYGVNWQKKGGVFIHHTNTKDTIEQMENILQGKAIVAKQKIYDGIFK
NNFELLTQKPANETIYKILNGECIQNLIIIMRGISGCGKTTFTNLLYKSQKEGNVSICSA
DHYFTIIGKYNKDLTNIAHDYCKDEFNTAIKLKTNIIIIDNTNIMKKHFEYYINTAKNLN
KDIIIIELNTYEIADEFNLRNVHNVSLSKIKLMKRNFEMIDNDNVMRILTK
NT seq
2676 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggtaaaagtaagaataagtttttgcaaaaatatcggtaaaatgaaggaaatttccagt
acaattgttgaaccagaatttaatgaaattataaaaattgcaaaaaataaattaaaatta
aaaataaatgaatcaaaaatacggttgtttgttgcgaaaacaacgtttacatcaacaata
ggacaagaattaacaattgataatacaccatcaattgtcatcaatgacacaattatttgc
gtttccgaaggtgaagattttatgttatcaaaagaaatcaaaaacgcaaattgtacttta
atttgtccatttaattttatattaaaaaaatcacaattaaatttaccattaaacatatca
aacgcgcaaaatacacgaaatacaaccatagaacaattagaatcattaaataattcgcaa
caatatgatatgcatggtgattttccaattcttgatggtgatgttctaaaacatttcaaa
gacattgtaaaaaataataatacatttgtgcaaattgattgtggagattattatgcattt
gattacaattccgcaacgtcatgtgattttccaaatccatcaacattcaaaaacaaaaaa
gaaaaatggattgcaagcgtcaaaagagaaatgcggggaattattatatgtgcacataca
ggaaaagtattagcacgacgttttcacaaattcttcaatataaatgaatgtgatgaaaca
aatataaataaaatacaattagcacatgattttatattgaccgaaaaaatagatggaagt
ttagtatcaccattcttgataaattcaaaattagtgttcgcaacacgttcacaaataaga
catgatattgaaaatccaaataaagattttattgaatattgtattgaatcaaataaaagt
ccattgtttgaattatgtgaaaatgatcatttagttggtgttatagatcatacagtaaaa
tcgctaacattgttagcaatacgggataacattacaggtgaatatatgaattatgataat
atgattcttcttgcttcaaaatataatattaaatatgctaaaagaatattgataaatggt
tctttatatgacattgtaaatgatatatacaatagaaatttaatagagggatgtgttttg
gcaaatggacaacaaatgtacaaaataaaaacaaattggtattcatcaatcgcatattct
ctaaaacaaggtggaaataacaatacatgtttcctattagaattaatcaaatgtcgccct
ataatatcagatattccaatttacaaaatttatcaaacaatattgaatgaaaattctgat
gattatttgtcacattgttgcacattgttgccacaaaatgaaagagattttttgatgaaa
actaaaatggattttcttgataatatcaataaattacacactgaaattacaacatggatt
gatgacatgactgctcaatacagtaaagatataataacacaatcaatgatcaacgcaaat
tttacatatcaattcatttatgcatgtatacataataatttagattcaaaaacaatattc
ataaataatattaaagatttgtgttcaccaattcactataaaaatttacaagatatttta
ttattgaatgataaaaatatcattcatgtatactgtgatttagatggtgttttagttgat
tttgaaaaaggggtcaaggaattaaccggtaaatttccgcaagaatatccaaatgttgga
tatatgtgggcaaatatcgaaaaagttgataatttttggacgaaattagaatggacagaa
gacggaaaagaattatgggattttataatcgcgaataataatagaatacacgtcgaaata
ttaacaggattacctgatggcaaattcaaagatatttccaacagagataaaaaaatatgg
tgtaaaaataatttaggtgatactaaaattaatacttgtatgggaagagaaaagtataca
tactgtcaaaaaaattttattttaatagatgatcgagaagaatatggtgtaaattggcaa
aaaaaaggaggcgtatttattcatcacacaaatactaaagatacaattgaacaaatggaa
aatatattgcaaggaaaagcaattgttgcaaaacaaaaaatatacgatggaatatttaaa
aataattttgaattactaactcaaaaacctgcaaatgaaacaatatataaaatattgaat
ggtgaatgtatacaaaatttaattatcataatgagaggaatttccggatgtggtaaaacg
acatttacgaatttattatacaaatcacaaaaagaaggaaatgttagcatatgtagtgcg
gatcactattttactatcattggaaaatacaataaggatttaacaaatattgcacatgat
tattgcaaagatgaattcaatactgcaataaaattaaaaacaaatataatcataatagat
aacacaaatataatgaaaaaacattttgaatattacataaacactgcaaaaaacctaaac
aaagatataataataattgaattgaatacatatgaaattgcagatgaatttaatttacga
aatgttcacaatgtatcattgtcaaaaattaaattgatgaaacgaaattttgaaatgata
gataatgataatgtaatgcgaatattgacaaaataa
DBGET
integrated database retrieval system
