Viruses: 80514946
Help
Entry
80514946 CDS
T40000
Symbol
QJ851_gp0489
Name
(RefSeq) Bodo saltans virus; capsid protein
Virus
2024608
Bodo saltans virus
Taxonomy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
VOG
VOG cluster
Motif
Pfam:
Capsid_N
Capsid_NCLDV
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
80514946
NCBI-ProteinID:
YP_010778328
RS:
NC_075036
LinkDB
All DBs
Position
NC_075036:562875..564452
AA seq
525 aa
AA seq
DB search
MGGALIQLAAIGQEDMFLTGEPQITYFKSVYRRHTNFTKEQIPQYFSNTPNFGKTVHCTI
AKNGDLMGNIVLSVILPQILLPTSGRAQFAWVKRIGFALIKSITIVINGYQIDKHYGDWL
NIWAELTGDISGNKSSGFKQMIGDVPSMFNFSYSKQQYQLFIPFQFWFCRSSGTVLPLSS
LQFSDVRIDVEFENDINCYMISPTHYITCMDDIANFTQYEYIEQNINGDLRAGLFMDYDI
NTKRLYYYKITTNKLISIPINTSFDVNNQTSVSSLLSSNYGLQYLITGKTSNYTIFAQLT
ASSISVSTSQISNLNFIDCFLIIDYYYLDDEERIKFMRSRHDYLIEQLFYTPPIQITDVS
SKQKITSYNPCKFTVWTVQYQYINNSLDYYNYTNTYQNKAFNSEKYTVNLYTPIGNNIIQ
YCTILNNGNERLSFRDSEYFEYIQQFQNNKFSPQTGMNTYSYALYPYLTDQPSGSFNTSQ
IEDIDIKMQFENKVNINFPVLFKAYSICHNVLRIVDGLAGLVFTQ
NT seq
1578 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgggaggtgcattaatacaactggcagcaattgggcaagaggacatgtttttaacaggt
gaaccacaaataacatattttaaaagcgtatatcgtcgacatacgaattttacaaaagag
caaattccgcaatatttttcgaatacgcctaattttggtaaaacagttcattgtacaatc
gcaaaaaatggtgatttgatgggtaatattgtattaagtgtaatattaccacaaatatta
ttaccaacatctggtagggcacaatttgcatgggtgaaaagaattggatttgcattaata
aaatcaataacaattgtaataaatggttatcaaatagataaacattatggcgattggtta
aatatttgggctgaattaactggagatatttctggaaataaatcaagtggatttaaacaa
atgataggcgatgtaccaagcatgtttaatttttcatattcaaaacagcaatatcaattg
ttcataccatttcaattttggttttgccgttcatcaggtacagtattgcctttatcaagt
ttacaatttagtgatgtacgtatagatgttgaatttgaaaatgatataaattgttatatg
ataagcccaacgcattatattacatgtatggatgatattgcaaattttacacaatatgaa
tacattgaacaaaacataaatggagatttacgtgctggattgtttatggattatgatata
aatacaaaacgattatattattataaaataactacaaataaattgataagtataccaata
aatacatcatttgatgtaaataatcaaacatcagtatcatcattgttaagtagcaattat
ggattacaatatttaataacaggtaaaacatcaaattatacaatatttgcgcaattaact
gcatcatcaataagtgtttcaacatctcaaatatcaaatttaaattttatagattgtttt
ttgattattgattattattatttggatgatgaagaacgtataaaatttatgaggtcaaga
catgattatttaattgaacaattattttataccccaccaatacaaataacagatgtgtca
tcaaaacaaaaaataacatcatataatccttgtaaatttacggtatggacagtacaatat
caatatataaataattcattagattattacaattatacaaatacatatcaaaataaagct
ttcaattcagaaaagtatacagttaatctgtatacaccaataggaaataatattatacaa
tattgcacaatattaaataatggtaatgaacgattatcattcagagattcagaatatttc
gaatacatacaacaatttcaaaataataaatttagtccacaaactggaatgaatacatat
tcttatgcattatatccttatttaacagatcaaccatctggatcattcaatacaagtcaa
attgaagatattgatataaaaatgcagtttgaaaataaagtaaatatcaattttccagta
ttatttaaagcatatagtatttgtcataatgtattacgcattgttgacggattagcaggt
ttagtttttactcaataa
DBGET
integrated database retrieval system