Viruses: 80514948
Help
Entry
80514948 CDS
T40000
Symbol
QJ851_gp0491
Name
(RefSeq) Bodo saltans virus; capsid protein
Virus
2024608
Bodo saltans virus
Taxonomy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
VOG
VOG cluster
Motif
Pfam:
Capsid_N
Capsid_NCLDV
DUF5363
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
80514948
NCBI-ProteinID:
YP_010778330
RS:
NC_075036
LinkDB
All DBs
Position
NC_075036:567166..569205
Genome browser
AA seq
679 aa
AA seq
DB search
MTGGLINIISYGADDLYLTGSPQMTFFKSVYRRYTNFSKESISIPLGSINFNKTLSIELS
HIGDLISNTYLQINIPQMNILKVDTASDLTVAQYNILNTPYPVSYPDSQPNFTSDYTLIK
QYMTVNMTGYRTALSLVNVKNQTVLQYISSITNAIQIAATQPEIIQNYQLALNNAFKFEM
ENITTTRTTITTTTQTYNTQMMSTNNASIQNELTRVYNNTINQLNQQLQTNITNASLLNF
NSTDINYILTTLANNITTNTQASVYGFTDSTLITAQDVLDIIINAVAACKLVTNYYFLNV
QRINNDTADSQSQYAKFAWNEKLGYSIIDYVEIQIGGEVIDKHYGDFMDIWTELTMQKEQ
NVLYNKMLGNVIEMTTYDRNAKPSYNLLIPFNFWFCKKNGLAFPLIALQYNRFFVNIKFK
NIERCAYIEPLPTVDQNGNYVDFTQNALQLTDIWENSNLSLTGNLLVDYIYLESQERTRF
AKSAHEYLIEAVETQQLINLSNVSEQIELNFTGTSKELIFVCQKNAYVNNYNSNLRCINF
DYSTIVNTNINPIVNAQLILHNQQRFSKAEFDYATDYLNVVSPYMRHSNVPFKGINDYSF
ALYPEEHQPSGTCNFTRISYPILDLTLNPNIFQYSIIDVDPNITSANNVILPTDISITVY
SVKYRILRIINGMACFAFY
NT seq
2040 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgacaggaggtttgataaacataatttcttatggagcggatgatttgtatttaacagga
agtcctcaaatgacattttttaaatctgtatacagacgctatacaaacttttcaaaagaa
tctatatcgataccattaggaagtattaattttaataaaacattatcaattgaattgagt
catattggagatttgataagtaatacatatttacaaataaatattccccaaatgaatatt
ttaaaagtggatacagcatctgatttaacggttgcgcaatataatatactaaatacccca
tatcctgtcagttatcctgatagtcaaccaaatttcacatcggattatacattaataaaa
caatatatgactgtaaacatgacaggatatagaacagcgttatcattggtaaatgtaaaa
aatcaaacagtattgcaatatatatcatcaataacaaatgctattcaaattgccgcaaca
caaccggaaataattcaaaattatcaacttgcattaaataatgcatttaagtttgaaatg
gaaaatattacgacaacaagaacaacaataacaacaacgacacaaacatataatactcaa
atgatgagtacaaataatgcaagtattcaaaatgaattgacaagagtatataataacaca
ataaatcaattaaatcaacaattgcaaacgaatataacaaacgcatcattattaaatttt
aattcaactgatataaattacatattaacaacattagcaaataatataacaacaaataca
caagcatctgtatatggatttacagattcaacattaataactgcacaagatgtattagat
ataataataaatgcagtggctgcatgtaagttggttacgaattattattttttaaatgtt
caaagaataaataatgatactgctgattcacaatcacagtatgcgaaatttgcatggaat
gagaaattgggatattcaataatcgattatgttgaaattcaaattggtggagaagtaatt
gataaacattatggtgattttatggatatttggacagaattaacaatgcaaaaagagcag
aatgtattgtataataaaatgttaggaaatgttatagaaatgacaacatatgatagaaat
gctaaaccgagttataatttgttgataccatttaatttttggttctgtaaaaaaaatgga
ttagcatttccattgattgcattacaatataatagattttttgttaatattaaatttaaa
aatatagaaagatgtgcatatattgaaccgttaccaacagttgatcaaaatggtaattat
gttgattttacacaaaatgctctacaattaacagatatatgggaaaattctaatttatca
ttaacaggtaatttgttagttgattatatatatcttgaatcacaagaacgaacaagattt
gcaaaatctgcgcatgaatatttaattgaagcggtagaaactcaacaattaataaatttg
tcaaatgttagtgaacaaatagaattaaattttactggtacaagtaaagaattaatattt
gtctgtcaaaaaaatgcatatgttaataattataattcaaatttgcgttgtataaatttt
gattattcaacaattgtaaatacaaatatcaatcctatagtaaatgcccaattaatatta
cataatcaacaaagatttagtaaagcagaatttgattatgcaactgactatttaaatgtt
gtttcgccatatatgcgtcatagtaatgttccatttaaaggtataaatgactattcattt
gcattatatcctgaagaacatcaaccgtcaggtacttgtaatttcacacgaatatcatat
ccaatattagatttaacattgaatccaaatatatttcaatatagtattattgatgttgac
ccaaatataacatctgcaaataatgtaatattgccgactgatattagtattacagtttat
tcagtaaagtatagaattttacgtattattaacggaatggcatgttttgcattttattaa
DBGET
integrated database retrieval system
