KEGG   Viruses: 80515146
Entry
80515146          CDS       T40000                                 
Symbol
QJ851_gp0689
Name
(RefSeq) Bodo saltans virus; intein-containing DNA-dependent DNA polymerase family B precursor
Virus
2024608  Bodo saltans virus
SSDB
Motif
Pfam: DNA_pol_B DNA_pol_B_exo1 POL3_N Elong_Iki1
Other DBs
NCBI-GeneID: 80515146
NCBI-ProteinID: YP_010778528
RS: NC_075036
LinkDB
Position
NC_075036:complement(786943..791655)
AA seq 1570 aa
MATCESNNFIFQVLDWDFTHKEVDEDKRYYVIQMFGKTKDQKTVYVEFTDFKPFFYIRIN
PTWTNTVIQTLIEEIKKNMKKKMDEEDEDGNMKWKNVGDGLISTNVVEAEKFLGFTAGKK
FKFLQLNFDDYEIMKKCEYACKRIYKLPMVKYVIKLEIFESNILPLIRFMHIRGLDAVGW
VSIPIDKLISNTYQKSCCDINYRTKWNNVSKVDDVTISKFDILSFDIECTSTDGSFPQAD
RDGDKVIQIGATFSRFGESECYKRYLLALNETDVVEDCEVQWYEKEEELLLAFTKLLRQT
NPDIITGYNICGFDFLYLHKRAEYLSKKMQPSEGNKFLRSFEKMSRINNEVCEWKEAKLS
SSALGDNILKYYKMTGRVIIDLMKVAQRDYKLSSYKLDYVAANFIKENIVNLLCDNAKSK
DGKCEYKLETKNTFGLQNGNFITIIYSDGTGAIDEKYNEGEKFQIYNLQQKSFCIKGNID
TSEFMGKGYKIFWSQVKDDIKARDIFKLFKQTPQDRAIIAKYCVMDCELCNKLMTKLQII
TNNVGMANVCNVPLSYLFLRGQGVKIFSLVAKKCREKNFIIPVIQKKKIFENKDNDNKDK
PQNQVYKKKLNDCDELDEKQLDKLVYELSNKTNKKNEEVGNDEEDEGYEGAIVFEPIAGV
YLEPIPVLDFASLYPSAMILRNLSHEMFVNDPMYDNLHGYRYHTIWYKKNNGETVTCKFA
EKRDGTKGIIPEILMYLLTTRKKYKKMMNDTSDPFIYSIYDGLQQAYKVTSNSLYGQTGG
THSPICLKEIAASTTATGREMLQFSKYFIENIFSKTINLALSDKEQYYKLMNETFLYHPT
SYVVKDNKNEDITIHVNTDEYDKINDKKFIKNSIGYEVSYEFPNEKKIIDELKAEKKSIS
WENILTKMNYIDEWNKLIKWVNDVVFKLPIEQRHLIKNNLSKIGKITKKLNIVNIFDSID
VSDDVLEYFKTNLTILIDNSGYDNKQQFFDKFYCFANELLEGYSIDAKIIYGDSVTGDTP
LLLLNKKNEIVIKTVNSIGNVWKNDIYHDEKFIDDNIDYKVWTEKGWSKIKKVIKHRTNK
KIYEVFTHSGCVKVTEDHSLLNKNGEMIKPTVCDIGTELLHSFPNIEKKYDDISYNDLQL
YRMYHENEKFIIKSQIQAQHLYYLLSTFRLNGTKCENIRIEKQEDNYVIYKGNTEDTENK
DKITSIQEVKYNEIDVYDLETENHHFQAGIGNIIVHNTDSVFFCSHIKNNETGELLKNKH
ALYIGIRLGIWASICISTLLPAPMAQEYEKVLWPFIIQGKKRYVGNLYEKDPDHFKQKSM
GIELKRRDNAPIVKTVSAGIIDQILNKLSPEGAFEFTKDILNKIIFKQFKIDKFIITKTL
KGNALTKKEREEEQKKPKEQRVYVDRTRIVHAVLADRMADRDPGNRPLSNDRIPYAYIIT
KFEPELQGDRVETPDYIVENNLELDFLFYITNQIMKPALKFLDLITTNAHGLFKEYIIRE
ENRKNNILPITYYSKNNIEENVDEFIKNNVNDDIIIKKIKKKTQKKKSKKIEANTNTNSI
KDSKSLLDGF
NT seq 4713 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atggcaacatgcgaatcaaataattttatatttcaggtacttgattgggattttactcat
aaagaagttgatgaggataagagatattatgttattcaaatgtttggaaaaacaaaagat
caaaaaactgtatatgttgaatttacggatttcaaaccatttttctatattagaattaat
ccaacttggactaatactgtaatacaaacattaattgaagaaatcaaaaagaatatgaag
aaaaaaatggatgaagaagatgaagatggtaatatgaaatggaagaatgtgggtgatggt
ttgatatcgacaaatgttgttgaggctgaaaaatttttagggtttacggcgggaaaaaaa
tttaaatttttgcaattaaattttgatgattatgaaattatgaagaaatgtgaatatgca
tgtaaaagaatttataaattaccaatggtaaaatatgtaattaaattggaaatatttgaa
tcaaatattttaccgttaatacgtttcatgcatataagaggattagatgcagttggttgg
gtgtcgatcccgatagataaattaatatcaaatacttatcaaaaatcttgttgtgatatt
aattatagaacaaaatggaataatgtaagcaaagttgatgatgtaactatatcaaaattt
gatattttatcttttgatatagaatgtacaagtacagatggatcatttccacaagcagat
cgagatggcgacaaagttattcaaattggtgctacattttcgcgttttggcgaatcagaa
tgttataaacgatatttattagcattaaatgaaacagatgttgttgaagattgtgaagtg
caatggtatgaaaaagaagaagaattattgttagcatttacaaaattattaagacaaaca
aatccggacatcataacgggatataatatttgtggatttgattttctttatttgcacaag
agagcggaatatttgtcaaaaaaaatgcaaccatctgaaggaaataaatttttgagaagt
tttgaaaaaatgtcaagaattaataatgaagtttgtgaatggaaagaagcaaaattatca
tcatcagcattaggtgacaatattttaaaatattataagatgacaggtcgtgtgattata
gatttaatgaaagtagcgcaaagagattataaattatcgtcatataaattggattatgtt
gcagctaattttataaaagaaaatatagtaaatttactttgcgataatgcaaaatcaaaa
gatggtaaatgcgaatataaattagaaacgaagaatacatttggattacaaaatggaaac
tttataacaattatatattcagatggaacaggtgcaatagatgaaaaatataatgaaggt
gaaaaatttcaaatatataatcttcaacaaaaaagtttttgcataaaaggtaatatagat
acaagtgaatttatgggaaaaggatataaaatattttggtcacaagtaaaagatgatatt
aaagcaagagatatatttaaattatttaaacaaacaccacaagatagagcaataattgcg
aaatattgtgtaatggattgtgaattgtgtaataaattaatgacaaaattacaaattatt
acaaataatgttggtatggcaaatgtatgtaatgttccattgtcatatttatttttaaga
ggacagggtgtaaagatttttagtcttgttgctaaaaaatgtagagaaaagaattttatc
attcctgtaatacaaaaaaagaagatatttgagaataaagataacgataataaagacaaa
ccgcagaatcaagtgtacaaaaaaaaattaaatgattgtgatgaattagatgaaaaacaa
ttagacaaacttgtatacgaattatcaaataaaacaaataaaaaaaatgaagaagtcgga
aatgatgaagaagatgaaggatatgaaggtgcgattgtatttgaaccaatcgctggtgta
tatttggaaccgattcctgtattggattttgcaagtttatatccgagcgcgatgatattg
cgaaatttgtcacatgaaatgtttgtaaatgatcctatgtatgataatcttcatggatat
agatatcataccatttggtataaaaaaaataatggggaaacagtaacatgtaaatttgcg
gaaaaacgcgatggaacaaaagggattatacctgaaattttaatgtatttattaacaaca
agaaagaaatataaaaagatgatgaatgatacgtcagatccatttatatattctatatat
gatggtcttcaacaagcatataaggtaacaagtaatagtctttatggacaaacgggtggt
actcattcacctatatgtttgaaagaaattgctgcatctacaacagcaacaggacgtgaa
atgttacaattttcgaaatattttattgagaatatattttcaaaaacaataaatcttgca
ttatcagacaaagaacaatattataaattaatgaatgaaacatttttgtatcatccgact
tcatatgttgtgaaagataataaaaatgaagacataacaattcatgtaaatacagatgaa
tatgataaaattaatgacaaaaaattcataaaaaattcaataggatatgaggtgtcatat
gaatttccgaatgaaaaaaaaataatagatgaattaaaggctgaaaaaaagagtatatca
tgggaaaatattttaacaaaaatgaattatattgatgaatggaataaattaataaaatgg
gtaaatgacgttgtatttaaattaccaatcgaacaacggcatttaataaaaaataattta
tctaaaataggtaaaataacaaaaaaattaaatattgttaacatttttgattctattgat
gtttctgatgatgtgttagaatattttaaaacaaatcttacaatactaatagataattct
ggatatgataataaacaacaattttttgacaaattttattgttttgcgaatgaattatta
gaaggatacagtattgatgcaaaaattatatatggtgattctgtaacaggagatacgcca
ttattattgttgaacaaaaagaatgagattgttattaaaacagttaatagtattggcaat
gtatggaaaaatgatatttatcatgatgaaaaattcattgatgataatattgattataaa
gtatggacggaaaaaggatggtcaaaaatcaaaaaggttattaaacatagaacaaataaa
aaaatatatgaagtatttacacattcgggatgcgttaaagtcacggaagatcattcatta
ttaaataaaaatggtgaaatgataaaaccaacagtatgcgatattggaacagaattattg
cattcatttccaaatatagaaaaaaaatatgatgatatatcatacaatgatctgcaatta
tatagaatgtatcatgaaaatgaaaaatttataattaaatcgcaaatacaagcacaacat
ttatattatttattatcaacattcaggctaaatggtacgaaatgcgaaaatataagaata
gaaaaacaagaagacaattatgttatttacaaaggtaatacagaagatacagaaaataaa
gataaaataacaagtattcaagaagtaaaatataatgaaattgatgtatacgaccttgaa
acagaaaatcatcattttcaagcaggtattggaaatattattgtgcataatacagatagc
gtattcttttgttctcatattaagaataatgagactggcgaattattaaaaaataaacat
gcattatatataggcataagattgggaatatgggcgagtatttgtatttcaacattgtta
ccggctccaatggcacaagaatatgagaaagtactctggccgttcataattcaaggtaaa
aagcgttatgttggaaatttatatgaaaaagatccggatcatttcaaacaaaaatctatg
ggaattgaattaaaacgtcgcgataatgcaccaattgtaaaaactgtatctgctggcatc
attgaccaaattttaaataaattaagtcctgaaggcgcttttgaatttacaaaagatatt
ttaaataaaattatatttaaacaattcaaaattgataaattcattataacaaaaacatta
aaaggaaatgcgttgacaaagaaagaaagagaagaagaacaaaaaaaaccaaaagaacaa
cgtgtatatgttgacagaacacgaatagttcatgctgtattggcagatcgtatggcagat
agagatccgggtaatagacctttatcaaatgatagaattccatatgcatatataataact
aaatttgaaccagaattgcaaggcgatagagtagaaacacctgattatattgtcgaaaat
aatcttgaattagatttcttattttacataacaaatcaaataatgaaaccggcattaaaa
tttttggatttaataacaacaaatgcacatggtttattcaaagaatatattattagagaa
gaaaatcgaaaaaataatattttacctataacatattattcaaaaaataatattgaagaa
aatgttgatgaatttattaaaaataatgttaatgatgatattattattaaaaaaataaaa
aagaaaacacaaaaaaagaaatcaaaaaaaattgaggcaaacacaaacacaaattcaatt
aaagacagcaaatcattattagatggtttttaa

DBGET integrated database retrieval system