Viruses: 80515229
Help
Entry
80515229 CDS
T40000
Symbol
QJ851_gp0772
Name
(RefSeq) Bodo saltans virus; 5'-3' exoribonuclease
Virus
2024608
Bodo saltans virus
Taxonomy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
VOG
VOG cluster
Motif
Pfam:
XRN_N
XRN_M
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
80515229
NCBI-ProteinID:
YP_010778611
RS:
NC_075036
LinkDB
All DBs
Position
NC_075036:878409..879788
AA seq
459 aa
AA seq
DB search
MGIKNYNKWMRDNHAPAFKQYWLKFYDHLYIDINFALHFSHYNATSEKEILVRLQWFIDS
VILAFMPSTSITLASDCQAPMAKLLTQRDRRQSYEPISNLESSSLLFTAGTKFMNTLEDK
LKNYIDKIRILYNIKINCLFDKEGEAELKLKKEIMINSQKYPSDTHMMISNDADIIAMFA
MFDIDILPNIFVCLNLGLNKKKECEIVSIGKLMDCHVKKYGMTKSFGADFTLMSIMMGND
YLPKLHFLTIDKVFDSYKNMVHYSDSNNLVNNNGINYYALILLIQGIMAMTKSCYLTSFT
LNDYNVALYENYVEGLLWCLDMYKNGECKRYDYMYESEDIPHPFGLIMYLESKKDKLCFS
DTIFPCANIKLYPILVLPKNAFGIIDAELYEFAEQCKILYEKESCQKCNEIYVKIKDSND
ECGTKKYKNELKLHEATHQRIIASDIIDIIKDYDKYKEI
NT seq
1380 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgggtattaaaaattataataaatggatgcgagataatcatgcgcctgcatttaaacaa
tattggttaaaattttatgatcatttatatattgatattaattttgcattgcatttttct
cattataatgctacatcagaaaaagaaatattagtacgattacaatggtttattgattca
gtaattttagcatttatgccatcaacatcaattaccttagcaagtgattgtcaagcccct
atggcaaaattattgacgcaacgcgatagaagacaatcatatgaaccaatatcaaattta
gaaagtagttcattgttatttacggcaggaacaaaatttatgaatacattggaagataaa
ttaaaaaattatattgataaaatacgtatactttataatataaaaataaattgtttattt
gataaagaaggagaagcagaattaaaattaaaaaaagaaattatgataaattctcaaaaa
tatccatcagatacacacatgatgatatcaaatgatgctgatatcattgcgatgtttgcg
atgtttgatattgatatattacctaacatatttgtttgtttgaatttgggattaaataaa
aaaaaagaatgtgaaattgtatcgattggaaaattgatggattgtcacgtaaaaaaatat
ggaatgacaaaatcatttggtgcggattttacattaatgagtattatgatgggaaatgat
tatttgccgaaattacattttctaactattgataaagtatttgattcatacaaaaatatg
gttcattattcagatagcaataatcttgtaaataataatggaatcaattattatgctcta
atattattaatacaaggaataatggcaatgacaaaatcatgttatttaacttcatttaca
ttaaatgattataatgttgcattatatgaaaattatgttgaaggattattatggtgtttg
gatatgtataaaaatggcgaatgtaaaagatatgattatatgtatgaaagcgaagacatc
ccgcatccttttggactaataatgtatttagaatcaaaaaaagataaattatgtttcagt
gacacaatatttccttgtgctaatataaagttatatcctattttagttttaccgaaaaat
gcatttggtattatagatgctgaattatatgaatttgcagaacaatgcaaaatattatat
gaaaaagaatcatgtcaaaaatgcaatgaaatttatgtaaaaataaaagattcaaatgat
gaatgtggaacaaaaaaatataaaaatgaattaaaattacatgaggcaactcatcaacga
ataatagcaagtgatattattgatattataaaagattatgacaaatataaagaaatttaa
DBGET
integrated database retrieval system