Viruses: 80516929
Help
Entry
80516929 CDS
T40000
Symbol
QJ856_gp1127
Name
(RefSeq) Tupanvirus deep ocean; putative ORFan
Virus
2126984
Tupanvirus deep ocean
Taxonomy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
VOG
VOG cluster
Motif
Pfam:
Sigma54_activ_2
DUF6491
DUF1106
AAA_18
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
80516929
NCBI-ProteinID:
YP_010780238
RS:
NC_075038
UniProt:
A0A6N1NVA0
LinkDB
All DBs
Position
NC_075038:complement(220757..222805)
Genome browser
AA seq
682 aa
AA seq
DB search
MDTRIKINITVVGEPGAGKETFAKMLFLENVSKIRVTPLSILAEMYMEIDHINFQITSKK
TIEECKQHNNLIMQQKEINSVGDLRNKGLQPMFYKNTKRIRDLINFEVNSSNKNPRMSKN
VLLNFYFIGNNFRDFEEEISSSNIIIYITDVNKTFKADNDLFIYISKLVKESNNKKYLLT
LVNKCDNLNSNGDVDVNSQYYNNIASIDEIIRKLAQESDAHQNILPLIPISFKYAHIYRQ
FLYYSGADISNEDKVHLCNIFNVKPDVLVKDINKNSRKYLKRSGFICFRDILADILNTKY
KSMIDDNFEIDIQKLKKIIIAKPDDFPKHLESFRKKALRTEKLFKKDYVQFTNPLVKFYL
EKVCEIPNPNLSGIEHLMVIYQEDNELYKHIMDTHSKIKNKFFALVTDNLYNSELCDNTF
LPSQVHIIYDKFVELYPPKSDIDKFSTYICDLYSTKAKFLLSSEKHINLLFDAYFNENEY
IKMMSMLNDITSKMDFDKFKIYLIQILLTKLMVVENCIKFRDSLNKHQVDTIIEYCNSLR
HYLMDNTHKQYDYLFSNICDICTNIIFRLDGFSHLQYLSDNLFNVIKHNPNRIIKFEKFI
VKTIKKYNYKSLLATDQNDSDDDSDIDIDGNESSNFDFTKDDMKDVPSEENDDEISDTDE
TKTNTTRKNKKNKSTKTKIVDV
NT seq
2049 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggatactcgcataaaaattaatattactgtggttggtgaaccaggtgctggcaaagaa
acttttgccaaaatgctgtttttggagaatgtgtcaaaaataagagttactccattatcc
attctggctgaaatgtatatggagattgatcatattaattttcaaattacctccaaaaaa
acaatcgaagaatgtaaacaacataacaatttgataatgcaacaaaaagaaattaatagt
gtgggagaccttagaaataaaggactacaaccgatgttttataaaaatacgaaaagaata
agagatcttatcaattttgaagtcaatagttcgaataaaaatcctcgcatgagtaaaaat
gtattgctaaatttttatttcattggtaataattttcgagattttgaagaagaaatctca
tcctctaatattatcatatatattaccgacgttaataagacattcaaagccgacaatgat
ctttttatttatattagtaaattagttaaagaatcgaacaacaaaaaatacttacttacg
cttgttaacaaatgtgataatcttaattcaaatggtgatgttgatgtcaattctcaatat
tataataacatagcgagtattgacgaaataataagaaaacttgcacaagaaagtgatgcc
catcaaaatatactaccactaataccaataagtttcaaatatgcacatatttatagacaa
tttctatattatagtggtgctgatattagtaatgaagacaaagttcatttgtgcaatatt
tttaatgtaaaacctgatgtcttggttaaggatattaataaaaatagtagaaaatattta
aaaagatcaggttttatttgcttcagagacatattagcggatatattaaataccaaatat
aaatcaatgatagatgataattttgaaatcgatatacaaaaactaaaaaaaataattatt
gcgaagccggacgattttccaaaacatttggaatcatttagaaaaaaggcactacgtacc
gaaaaattatttaagaaagattatgtgcaattcacaaacccattagtcaaattttatttg
gaaaaagtttgcgaaataccaaatccaaatttatcaggtattgaacatttaatggtaata
taccaagaagacaacgagttatataaacacattatggatactcattcgaaaattaagaac
aaattttttgcacttgttaccgataatttatacaatagtgagttatgtgataatacattt
ttaccaagtcaggttcatattatttatgataaatttgttgaattgtatccaccgaaaagt
gatatcgataaattttcaacatacatctgtgatctttatagcacgaaagccaaatttttg
ttatcctcggaaaaacatataaatttactttttgatgcatattttaatgaaaacgaatat
attaaaatgatgagtatgctgaatgacataacatctaaaatggattttgataaatttaaa
atttatttgatacaaatactattaacaaaactaatggttgttgagaattgtattaaattc
agagactcattgaataaacaccaagttgatacaataattgaatattgtaattcattgcga
cactatttaatggataacacacataaacagtatgattatttgttttccaatatttgtgat
atatgtacaaatattattttcagacttgatggattttcacatttacaatatttatcggat
aatttgtttaatgtgattaaacacaatcccaacagaatcatcaaatttgaaaaattcatt
gtcaaaacaattaaaaaatacaattataaatcattgcttgccactgaccaaaatgattcg
gacgatgattctgatattgatattgatggcaatgaatcatctaattttgattttaccaaa
gatgatatgaaggatgttcccagtgaagaaaatgatgatgaaatatctgacacagatgaa
acaaaaactaatactactagaaaaaacaaaaaaaacaaatccacaaaaactaaaatagtg
gatgtttaa
DBGET
integrated database retrieval system