Viruses: 80519112
Help
Entry
80519112 CDS
T40000
Symbol
QJ857_gp0359
Name
(RefSeq) Tupanvirus soda lake; collagen alpha-1(XXVII) chain flags precursor
Virus
2126985
Tupanvirus soda lake
Taxonomy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
VOG
VOG cluster
Motif
Pfam:
Collagen
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
80519112
NCBI-ProteinID:
YP_010782348
RS:
NC_075039
UniProt:
A0A6N1P1G1
LinkDB
All DBs
Position
NC_075039:complement(1201940..1204819)
Genome browser
AA seq
959 aa
AA seq
DB search
MISKRNTICTNKTNKCCKNYIDDQINKLHDTVYSDIIINTIPGTNGKNGCKGDKGMKGDK
GDIGNGILRGAGIPNINIGQNGDIYVNTQNGQMYIKTNNIWIFSGYIPGNKGDKGNQGSQ
GLMGPQGSQGSIGPQGAQGSQGLMGPQGSQGSIGPQGAQGSQGSIGSQGAQGSQGSQGIK
GDTGPQGEAGTGIINGSGIPDPVIGENGDVYVDNTTGLIYVKVNNVWILSSDIDGNKGQK
GDQGEVGPRGSQGSQGDIGPRGSQGLPGSRGSQGDIGPRGAQGSQGSMGPQGSQGSIGPQ
GIKGDTGVQGSPGSQGSIGPQGAQGSQGSQGNQGSQGSIGPQGAQGSQGSQGNQGSQGNQ
GSQGNQGSQGDIGPRGAQGSQGSMGPQGNQGSIGPQGSRGAQGDTGQQGNQGSQGAQGSQ
GDIGPRGAQGSQGSQGSQGSQGVQGSQGNTGPQGDAGPQGSQGSQGAQGSQGSQGSQGSQ
GSQGDIGPQGDTGAQGSQGDTGAQGSQGDIGPQGDTGAQGSQGSQGDIGPQGNQGDIGPQ
GPQGDTGAQGSQGDTGAQGPQGDTGAQGSQGDIGPQGPQGDAGAQGSQGDIGPQGPQGSQ
GAQGPQGSQGAQGDTGAQGPQGSQGPQGDTGAQGSQGDVGPQGPQGSQGPQGDTGAQGPQ
GDTGAQGSQGDIGPQGPQGSQGAQGPQGSQGAQGSQGDIGPQGPQGSQGAQGPQGSQGAQ
GAQGDTGGSGGISYQYYYPLQNANMGSNTPMYKEYTTTIATSTRAGTGVRNATEIAPYQV
TNTSGISNAVITIADAAVIPNINNGVGPVTYPVYSFVGIYRNDYSNRELIGVVRFTVTQP
SGGRGVGFNGSFSNTVGLLGTSAGTTDGIYTSTTFFVKPASPSGGINTFVPATSINLTAG
WYIGTELLYPINYQSGTNTAITIQELSGSYTYQVGIPYAQVLGGYKSTIVSLNTVSDTL
NT seq
2880 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgatatcaaaacgtaatacaatatgtactaacaaaacaaacaaatgttgtaaaaactat
attgatgatcaaattaataagttacatgacactgtgtattcggatattattattaacaca
atacccggaacaaacggtaaaaatggttgtaagggtgataaaggtatgaaaggtgataaa
ggtgatattggcaacggtatactacgcggtgcaggtataccaaatattaatattggccaa
aatggtgatatttatgttaatacccaaaatggtcaaatgtatattaaaactaataatatt
tggattttttcaggatacattcctggtaataaaggtgataaaggtaaccaaggtagtcaa
ggtttaatgggtccacaaggtagtcaaggttcaattggtccacaaggtgctcaaggtagt
caaggtttaatgggtccacaaggtagtcaaggttcaattggtccacaaggtgctcaaggt
agtcaaggttcaattggttcacaaggtgctcaaggtagtcaaggttcacaaggtatcaaa
ggtgatactggtccacaaggtgaagctggtactggtatcatcaacggatcaggtatacct
gatcctgttattggcgaaaatggtgatgtttatgttgataacaccactggtttaatttat
gttaaagttaataatgtttggattttatcttcggatattgatggtaacaaaggtcaaaaa
ggtgatcaaggtgaagtgggtccacgaggatctcaaggtagtcaaggtgatattggccca
cgaggatctcaaggtttaccaggctcacgaggtagtcaaggtgatattggcccacgaggt
gctcaaggtagtcaaggttctatgggtccacaaggtagtcaaggttcaattggtccacaa
ggtatcaaaggagatactggtgtacaaggatctccaggtagtcaaggttcaattggtcca
caaggtgctcaaggtagccagggcagtcaaggtaaccaaggtagtcaaggttcaattggt
ccacaaggtgctcaaggtagccagggcagtcaaggtaaccaaggtagtcaaggtaaccaa
ggtagtcaaggtaaccaaggtagccaaggagatattggtccacgaggtgctcaaggtagt
cagggttcaatgggtccacaaggtaaccaaggttcaattggtccacaaggaagtcgaggt
gctcagggtgataccggtcaacaaggtaaccagggtagtcaaggtgctcaaggttctcaa
ggagatattggtccacgaggtgctcaaggtagccagggtagtcagggtagtcagggtagt
caaggtgtacaaggtagccaaggaaatactggaccacaaggagatgctggaccacaaggt
tcgcaaggtagtcaaggtgctcagggtagtcagggtagtcagggtagtcagggtagtcag
ggtagtcaaggtgatattggaccacaaggagatactggtgctcaaggttcccaaggtgat
actggtgctcaaggtagtcaaggtgatattggaccacaaggagatactggtgctcaaggt
tcccaaggtagtcaaggtgatattggtccacaaggtaatcaaggtgatattggtccacaa
ggaccacaaggagatactggtgctcaaggttcacaaggagatactggtgctcaaggacca
caaggagatactggtgctcaaggtagtcaaggagatattggtccacaaggaccacaagga
gatgctggtgctcaaggttcacaaggagatattggtccacagggtccacaaggtagtcaa
ggagcacaaggtccccaaggtagccaaggtgcccagggagatactggagcacaaggtccc
caaggcagtcaaggaccacaaggagacactggagcacaaggtagtcaaggtgatgttggt
ccacagggtccacaaggcagtcaaggaccacaaggagacactggagcacaaggaccacaa
ggagatactggtgctcaaggatcacaaggagatattggaccacaaggcccacaaggtagt
caaggtgctcaaggaccccaaggtagtcaaggtgctcaaggatcacaaggagatattgga
ccacaaggcccacaaggtagtcaaggtgctcaaggaccccaaggtagccaaggtgcccag
ggagcacaaggagacactggtggatcaggtggtataagttatcaatattactatccatta
caaaatgcaaatatgggaagtaatacacctatgtacaaggaatacacaaccacaatagct
acttcgacaagagctggtactggtgtaagaaatgcaactgaaattgcgccataccaagtt
actaatacatcaggtatatcaaatgccgtaataacaatagctgatgcggcagttatacca
aatataaataatggagtcggaccagtgacatatcccgtatattcttttgttggtatatat
agaaatgattattcaaatagagaattaataggagtagtacgttttacagtaacacagcca
tctggaggaagaggagttggattcaatggttcatttagtaatacagtaggactattaggt
acaagtgcaggtacaacagatggtatatatacatcaaccacattttttgtcaaaccagca
tcgccatcgggtggtattaacacatttgttccagcgacaagtataaatttaacagctggt
tggtatattggtactgaattactttatccaataaattatcaaagcggaacaaatactgca
ataacaatacaagagttatcaggttcatatacttatcaagttggaattccttatgcacaa
gttcttggtggttataaatcaacaatcgtttcattaaatacggtatctgacacactataa
DBGET
integrated database retrieval system
