Viruses: 80520485
Help
Entry
80520485 CDS
T40000
Symbol
QJ968_gp547
Name
(RefSeq) Tetraselmis virus 1; fibronectin type III domain-containing protein
Virus
2060617
Tetraselmis virus 1
Taxonomy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
VOG
VOG cluster
Motif
Pfam:
fn3
Ig_J_second
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
80520485
NCBI-ProteinID:
YP_010783535
RS:
NC_075136
LinkDB
All DBs
Position
NC_075136:505848..512492
AA seq
2214 aa
AA seq
DB search
MSRVVPTSFSVLDYDTNDPRIINKADPSRLYDVVDDPFTMSWVFPQKMKYVRYSVTLPTS
CTSVRVFPVTFLVDGKPGYLYSPVVKVNNVEMQKPLDYDYKETFIELSGTITIEISRGIR
LPGQEDKFLIWLESIQFFTGTIAPSVNTALMALGTPPSSTITFSFSAGSEVQVASTFLLL
RQSSVKPTKTDMINFGDRLDGNITSVNKTDLPDGKVYYGWIMIQDVNGQNGTITSFNPPS
LETVDVTPPTITDPVMVLGNDPGHEIDVSFGITDNKAAQTTYILISTDLSPGGPSASIIK
STGDSIPGSQTTFTKSGLNEVTQYSAWMLSLDAAGNETSPIRISPDIIFTDDVTNPVINS
TTTALGTDTSSQIDFTFDVSDNYDLSKVYTYFNNVAVEPTPNYMKTNGDVYDVTGTNDTA
SYTKDGLPDGFTYYPFIMVEDSYGNFSEVEGMGLSPLTTLDVTPPEIQSATIRLGDNPTS
SIRADYFVTDNVPVTFDVWTLIKQDNTTPNVTEMKNNGSQTTSAIAFILTSGLDPGTRYY
SWVYAEDGTGNGTAVTPTTPSYIDTIADVNRPVINSATMTAGSNPASQISMSYDVQDETS
LVNIFILVKDSSTTPTASEMRTGDLRSPGSTSFVKSGLSRYTTYYAWIMGDDSSGNDSII
TPFSPPSILTEDDTPPVIATFQPVAPDTNPTTSIKFNYNVTSESPLSAVYIFYRPENTIP
STEQVKNDGDSVTATANQPMEYTASSLVSGETYYCWIVASDIYNNETFVISSTPSSYTVD
DIVNPVVDSASMTLGMETSSEIDVTFTVSDNFDVDQVYILCRTSSATPNSSEMLTGDSVA
GSSTSFTKTGLFSLTTYYVWIMAVDFAGNQSTILSVSPGTLTTEEPPITAFKSYLYGTPV
TEDTPLVGQQNTFYDDKNKYYYTTDISNYFTGTIPNLAPEVVVVIFYGRLPTGSNTANMN
CQFNMADTTQYNNNLNFNASLTFGLVRVINPKPGYVVGGPAEDVYNDRNFFAPEDGFCAH
VIRYTNDGFVYQGYTKDGARIWNYGGTFDSTYARKTLDDYVSIQIQKDNSCIRQIYITYG
FDASNDDIQYSIQTWPGTERSNVTFPDFELVPKPIYEVATMAGPYTPQTISDWAAGIGGA
VNTAIQSGNATIRFYIGNLVNGSPSAAIYNANFPTDYLQRYDDIWPNGYTTDDVFTIVIK
GGVVQVYTRRSRVLRTVSGTGTINDTVLFGGNIFNGDSGDDYPLQDQLVNFAVYDKPVLP
KTYFSEATPPTVTATSIELGNNRGEHIDCTFSASDNYALTSIYLYFSLFSDTPTATEMRS
GTSVSGDSTFYTKKGLNPVARYYVWIMAEDQMGNVSDIVTFGDIVTEQSTILPFKSFING
TPNAIITGSSPNIYYDNTNKFFRASSTSLYLRATNLPIFSSRVTLISFHTRIRTDTNTGN
INSHSGMALASDDNINFNASSTFNNVTVTNPGNTVVYTGRDGFLPTDGYSAFVVSYNSSA
FKFRGFDKDANRIWFYDNSIDDRAEEDSFDLQIDNNVSVVRQYYAFYGFDATDDDITHSI
NTWPGYQLSNVTFPDFELLPVPTYTVETMTAPYTPQTIHDWAQGIGGSVYSNILSGNCTI
RFYIGTLTNGTPSRALYNAAFPTTYSWRFNNGSDLWNDPYATDDVITLLIEDGTVTYHHR
RGVTLNNFAGAGTIYNTVLFGGDIFNGNSGDDYPMQDEIKHFSVYNRAIHPYEYLMDDEV
PTIDSATAVLGSAASSDIDMSFTASDNWKVENIYLLATTSSSTPTVSEMKSGDVVSDEIT
SHTITSLVSSTTYYLWIMADDASGNNSIITAFSPPTLTTQSEPIVSYKTQDFGTGGTLDP
SNSAVVYDNVNKYYTSTGNYYISASSISKPANNVTFIYFTGRATTSTSGNQNVTVSTTNE
TPNSNNLTYNASSVFNLVRVSSPRPGYVSPGTEDIYNDRTKFNPDNAFAAHVVVYRPSSF
NFYGYDTNAIQLWDYGDGFVLERSTSDSFSVQIDANSLIRQAYIFYGTIPTEAGIQHSIA
TWPGTDKSVTVFPDFELLPEPIHFEASKTAPYTPQTIEDWAAGIGGAVNTAIQSGNATIR
FYIGTLTNGTPSRVLFNINFSSDYLWRFNNGSDLWPNPYATNDVITVVIQDGVVTAYSRR
ENTLFNVTGAGTISDTVLFGANILNGNSGDDYPMQDEILNFSVYDTPVLPYTFN
NT seq
6645 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtctagagtggtccccacttctttctctgtgttggattacgatacgaatgatccgcgg
attattaacaaggcggacccgagtcgcttatatgacgttgtagacgatccctttactatg
tcgtgggtttttcctcaaaaaatgaaatatgttcgttattctgttactttgccgacttcg
tgcacatctgttcgcgtctttcctgttacgtttttagttgatgggaaacccggttatctc
tattctcctgtagttaaagtcaataatgtggaaatgcaaaaacccctcgattatgattac
aaagaaacttttatagaattatctggaactataaccattgaaatatctcgaggaattagg
ttgcctggtcaagaagataaatttcttatatggttagaatccatacaattttttacagga
actattgctcctagcgtcaatactgctcttatggccttgggaacgcctcctagttctacc
atcacgttttctttttccgctggatctgaagttcaagtagcttcaacctttttgctcttg
cggcagtccagcgtaaaacccactaaaaccgatatgatcaattttggtgatagattagat
ggaaatattactagcgttaataagactgatcttcccgacggaaaagtctattacgggtgg
attatgatacaagatgtcaacggtcaaaatggtaccatcacttccttcaaccctccttcc
cttgaaaccgttgacgtcactcctcctaccattaccgatcccgtcatggttctaggaaac
gatcctggacacgaaatcgatgtttccttcggtatcaccgacaacaaggccgcacaaacc
acgtatattttgatttctaccgatctttcgcctggcggaccttccgcttctatcatcaaa
tccacaggagattctataccaggatctcagaccacctttaccaagagcggattaaacgaa
gttacccagtactctgcatggatgctttcattagacgctgctggaaacgaaacttctcct
atacgtatttctccggatattatattcacggatgatgttacaaatccagttattaattcc
acaactaccgctctaggaactgatacgtcctcgcagatcgattttacctttgatgttagc
gacaattacgatctttctaaagtttatacgtacttcaataatgttgccgttgaacccacc
cctaactatatgaaaaccaacggagacgtgtatgacgtcacgggaacaaatgacacagca
agttataccaaagacggtttgcccgacggcttcacatattaccctttcatcatggtcgaa
gactcttacggtaatttctctgaagtagaagggatgggtttatctcctcttaccaccttg
gacgttactcctcctgaaatacaatccgcaaccattcgtctcggagacaatcccacgtct
tccatacgcgccgattattttgtaacagacaatgtccctgttacattcgacgtatggact
ctcattaaacaagataatactacacctaatgtcaccgaaatgaaaaataacggcagtcaa
accacatctgctattgctttcattctcacttctggtttagatccaggtactagatattat
agttgggtttacgccgaagacggcacgggaaacggcacggctgttactcccaccaccccg
tcgtatatcgataccatagctgatgtaaacagacccgttatcaattctgctactatgaca
gcaggctctaatcctgcttcgcaaatatccatgtcttatgatgtacaagacgaaacctct
cttgtcaacatatttatccttgttaaagattcttctactacacccactgcttctgaaatg
agaacaggagatttgcgttctcctggatccacatctttcgttaaatctggtctatccaga
tacactacttactatgcatggattatgggagacgatagctcaggaaatgacagtatcatt
actcctttctctcctcctagtattttgactgaagacgacactcctcctgtcattgcaaca
ttccagccggttgctccggatactaatcctaccacaagcatcaaattcaattataacgtt
acaagcgagagtcctctttcggctgtctatatattttatcgacccgaaaataccatacct
tctacagaacaagtcaaaaatgatggagacagcgttaccgctaccgcaaatcaacccatg
gagtacaccgctagttctttagtaagcggagaaacttactattgctggatagtcgcgtct
gatatttataataacgaaacgtttgttatctcttctactccatctagttataccgttgac
gatatcgttaatcccgttgttgattcggcttccatgacactcggtatggaaacctcctca
gaaatagatgttacctttactgtttccgataattttgatgtcgaccaagtctacattctt
tgcaggacttcatccgcaacacctaattcctctgaaatgcttaccggcgatagcgttgca
ggttcttctacttcttttacaaaaacaggtttattttcattaacaacctattacgtttgg
atcatggctgtcgattttgctggaaaccaatccactatcctttccgtttctcctggaact
cttactacagaagaacctcccattacggccttcaagtcttatctttacggaacacctgtt
accgaagatacacctcttgttggacaacaaaacaccttttacgacgataaaaacaaatat
tattacactactgatatttccaactattttaccggaactatccctaatttggctccagaa
gttgttgtagttatattttacggtcgtttgcctactggaagcaatacagctaacatgaat
tgccaattcaatatggcagataccactcagtataacaataatctcaattttaatgcatct
ctcactttcgggttagttcgtgttataaatcctaaaccagggtatgtagtaggaggacca
gctgaagacgtatataacgaccgaaatttctttgcaccagaagatgggttctgtgcacac
gtaatcaggtataccaatgacggtttcgtttatcaaggttacaccaaagacggcgctaga
atatggaattatggaggaacttttgattccacatatgctagaaaaactcttgatgattac
gtatcaattcaaattcaaaaagacaactcttgcatcagacagatttatatcacttacgga
tttgatgcttccaacgatgatattcagtattctattcaaacatggccaggaaccgaaaga
agcaatgttactttccccgattttgaattggtacctaaacccatttatgaagttgccacc
atggcaggaccgtatactcctcaaaccatctccgattgggcagcaggaattggaggagca
gttaatacagctatacaatctggaaatgccaccattcgattctatatcggtaatctcgtt
aacggctctccttctgcggctatttataatgcaaatttccctaccgattatcttcaaaga
tacgacgatatatggcctaacggttatacaaccgatgatgtttttactatcgttattaaa
ggcggtgtagtacaagtatatacaagaagatcaagagttttgcgtactgtttctggaacg
ggaactatcaatgatacagttttgtttgggggaaatatatttaatggtgattctggagat
gactatcctttacaagatcagttagtcaattttgctgtgtatgataaaccggttttacct
aaaacatacttctctgaagcaacccctcctacagttactgcaacttctatagaattagga
aacaatcgcggagaacatatagattgcacgttctctgcttccgataattatgcgttgaca
tctatatatctttatttcagtttgttttctgatacacccactgcaacagaaatgagatca
ggtacaagtgtatctggtgattctactttttatactaaaaaagggttgaatcctgtagct
aggtactacgtatggatcatggctgaagatcaaatgggaaatgtttccgacattgttact
tttggtgatatcgttaccgaacaatcaactattctccctttcaaatcatttatcaatgga
actcctaatgctattattaccggttcaagtcctaatatatattacgataataccaataaa
tttttccgtgcatccagcacaagtttgtatcttagagcaactaaccttccaatattctct
tcaagagttactttaatatcgttccatacaagaatccgtacagatactaatactggcaat
attaattctcattcgggtatggctcttgcttctgatgataatattaatttcaatgcatct
tccacttttaataacgttaccgttacaaacccaggaaatacggttgtttatactggaaga
gacggcttcttacctacggacggttattcggcttttgtagtatcatataattcttctgcg
ttcaagtttagaggtttcgataaagatgcgaatagaatttggttctatgataattctatt
gatgatagagccgaggaagattcattcgatttacaaattgataacaacgtttccgttgtt
agacaatattatgcattttatggcttcgatgcaactgatgatgatattacgcattctatc
aacacatggcctggttaccaactaagcaatgttactttccctgatttcgaacttcttcct
gtacccacttatactgtggaaactatgacagctccttatactcctcagaccattcatgac
tgggcacaaggaatcggaggatcagtatatagcaatatattatctggcaattgtactatc
cgattctatattggaacgctcactaacggaactccgtcgagagctctttataacgcagct
ttccctacaacttattcatggagattcaataacggcagcgatctttggaatgatccttat
gctacagacgatgttatcactttgcttattgaagacggaactgttacttatcatcataga
cgtggtgtcacacttaataattttgctggtgcgggaactatatacaacactgttttgttt
ggcggagatatttttaatggaaactcaggggacgactatcccatgcaagacgaaatcaaa
cacttttctgtctataatagagccatacatccttatgaataccttatggatgatgaggtt
ccaactatagattcggcaacagccgtactaggatctgctgcttcttctgatatagacatg
agctttaccgcgtctgataattggaaggtcgaaaatatttatttattagcaactacatcc
tcgtctacaccgaccgtttcagaaatgaaatccggagatgttgtttctgatgaaattaca
tcccatacgatcactagtttagtctcttccactacatattatttatggattatggccgat
gatgcatccggaaataattccattatcacagcgttttcccctccaactcttactactcaa
tctgaacctattgtttcttacaaaactcaagattttggaactggcggtactctagatccc
agtaattcggccgtagtttacgataatgttaataagtattatacttctaccggtaattat
tacatatctgccagttctatttcaaaaccagctaataacgttactttcatttattttact
ggaagggcaacaacctctactagtggaaatcaaaacgttactgtgtcaactaccaatgaa
acccctaattcaaataatttaacttataatgcttcttctgtgttcaatttagttagagta
tccagtcctcgtcccgggtatgtcagtccaggcacagaagatatttacaatgatagaact
aaattcaatccagataatgcatttgccgcgcacgtggtggtttatagaccgtcatctttt
aacttctatggttatgatactaacgctatacaattatgggactatggagatggttttgtt
ttagaaagatcgacatcagattcattcagcgttcagatagatgcaaactctctcattcgt
caagcttacatattttatggtacaattcccacagaggcaggtatacaacattccattgcc
acatggcccggtacagacaaatcagttaccgtatttcctgattttgaattgcttcctgaa
cctattcattttgaagcatctaagacagctccttatactcctcaaactattgaagattgg
gcggctggaataggaggagcagttaatacggctatacaatccggaaatgccactattcga
ttctatatcggtacccttaccaacggaacaccgtctagagtcctttttaatataaacttt
tctagcgactatctttggagatttaataacggatctgatttgtggccaaatccttatgct
acaaatgatgttattactgtcgttatacaagatggggttgtaacggcatacagcagaagg
gaaaatactctcttcaacgttacgggagctggaacaattagcgataccgtcttgtttggt
gcaaatattttgaatggaaattcaggcgatgattatcccatgcaagacgaaatcttaaat
ttttctgtttacgatacaccagtcttaccatatacttttaattaa
DBGET
integrated database retrieval system
