Viruses: 80537972
Help
Entry
80537972 CDS
T40000
Symbol
QKQ40_gp1
Name
(RefSeq) Sclerotinia homoeocarpa fusarivirus 1; RNA-dependent RNA polymerase
KO
K26642
Fusariviridae RNA-directed RNA polymerase
Virus
2501221
Sclerotinia homoeocarpa fusarivirus 1
Taxonomy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
VOG
VOG cluster
Motif
Pfam:
RdRP_1
Helicase_C
ResIII
DEAD
NAT10_TcmA_helicase
AAA_19
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
80537972
NCBI-ProteinID:
YP_010799567
RS:
NC_076667
LinkDB
All DBs
Position
NC_076667:115..5271
AA seq
1718 aa
AA seq
DB search
MLKILSSLRQFLRVKSDKFLLRAAHKMNENGIPVIKGLVEDYSTRFAYLGEPRSKMAGRI
IRNRPQTLDVLGVKWVCAMYILLLIFIIFNMLSIFFFLGIFCFIVLMNILFSNSILIVIL
MPLLIYFIILIIGNLGKRCHIIIWDLINLIRGERSWIEPEPNFVSESIKLWFIDHTGNFD
ISEYQLFDKKITDFQMWYLNKYNHGLFGKIFTAGFIFCIYTYMKYLLKKGYQIAKWWLTW
TSITILALITGLGSPLDYFCVAYWLTKGLLVPYLILSRLVLGCWKLSNYLIIKQIAIYAS
GDYSYLHPSPAVIRLGWDEEIDVFYFMKLWFKFTRTRFMTSLLSFGYKSGMIIDRKTSEE
HRFKFRSLFTSFSLEVTRKINEINVPGWVRTIPSKNPVYLESTLQILREIGYPVGEVKIQ
EPQLGIAMGKFDDWISEGSNFITGLFQLRTYEFVEFNAFKTDVQEYRRSDSYVTLDNELE
SVARYFNNKTVSIPNQEKVVDEVWEMTKTIFQDSRITPLRSIYKKWKKNYNVGPFAPSQN
KRRKDGGLRKMRRTEDIARFPNLTTYLQYWEKLYAHFPLMQMVSTAFYKSEALPEKKWRN
NKVRTPIGSMLPQYLWQMVWSYEPNHRFDPENTPIKIGLPLTGFHLSQLFEKHSKFAYHY
GGDCTEFDSTITKNIQEIIKSIRKKGFSRHRQYEIISTMIDINYERLNESKIVTPSTGNV
YNKGTGLTTGHASTSSDNSLTLISLYMAAWVNLTGLSAHEFRSFNELSCYGDDHILSFSE
NAPKVWTFENIQKIFKTWGITMKNEFPNADKRDLEKISFLSKFARKSNHTDDKLFKEVIG
SSAPKYVIYHDTDKLLGKMRAPVLNRDPKYKIQRVISYLDLCAHNEKAYYIGREVIEIMI
TKYPDLAFLRGKVPSYEDVLRKFYSPNTHVREPEERDVEDFDEKDIVEYGQMTILDYLFN
YLSVIPDVLNPSIKNVGFGRVAQRALGPLTSWPKELLSLANNVYSPGHLSHLLKSTCYDF
IEDRDMVLNTTPKITLILRHWLFLKFKLDSEKYNPLAWIDWMLQKLASLQFIINGRVQTK
YKNYSFPVWNLFLLSLLNILVVPDIVITNDDESLSLDMGEFLLKFKLPDATYWISRLYKL
CENLIWDQIPPNFKNLQYLEQVEHHGKIHKIVAGTGTGKSTTMILYLQQSLGMYFNKIIV
IEPRSKVVKGLVSYVKTIGVQASGLTTGLELDDREKVWYMTAQELLLHPQWVSPSNLFVI
DECHIDELPYKVVKEMLTKTKGLTVLLATATPTDEFSSICQTVTEIELPKIYRSYPKEYA
NNVEIPIKGSSWVHRYLGIVTEIMSNYRTPEKFLIFINDKRDLDIFRQNLRGRGFFLSSE
TEDVDLSEEVDFIVTTAVCDVAITIPGVTVVITPNFTRKVSYDRNGLSKPCFALLDSATL
KQRSGRTGRTNNGDVYVIPFSGPDIIQEPTITKEGQIVDWLSSGLDLDVLAKWKPDLFDI
FRKDLKDNQVLKIAEFLENQRQDKFKKSHRVTQPDKQELRELNLFGIHLEGITGLGSGFQ
FNYSDLAQEYSTLLKKALTFVNMPNWDKQPIEKFVHPFEDTSPAKIISVTLETEDGEKQE
LGSFGAHAPKPLYSISTPKVSATTLEAEGRIKVLKEEHAKVEENLMMAFGPDETPLRERR
EEIREELLAIYEQEGKDLESNFKPKRLAGSSGPSFSFG
NT seq
5157 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcttaaaattttaagtagtttgagacaattcctcagggtgaaatctgacaaatttctc
ttgagggcggcacataaaatgaatgaaaatgggattccagtcattaagggattggttgaa
gattactctaccaggttcgcatacttgggtgaacccaggtctaaaatggcagggagaatc
atcaggaatagaccccaaacactagacgtgttaggtgttaagtgggtgtgtgctatgtac
atattattattaatattcataatatttaatatgttgagcatattctttttcttgggaatt
ttctgttttatagttttgatgaacatattatttagtaatagcattttgatagttatctta
atgcctttgctaatttattttatcattttaataattggaaacttgggcaaaagatgtcac
atcataatctgggatctaataaacctcataagaggtgaacgtagttggatagaaccagaa
ccgaattttgtttctgaatctataaaattatggttcatagatcacacaggcaattttgac
atctcagaataccagttgtttgacaagaaaatcactgatttccaaatgtggtatttaaac
aaatataaccatggtttatttggaaaaattttcactgctggattcatcttttgcatctat
acctatatgaaatatcttttgaaaaagggatatcaaattgctaaatggtggttgacttgg
acaagcatcacaattctggcactaataacagggttaggatcacctcttgactacttctgc
gtagcctattggctcaccaaagggttattggtgccttacctaattctttcaagattagtg
ttgggttgctggaaattgtctaattaccttattatcaaacaaattgcaatttacgcgtct
ggggactactcatatctacatccttcccctgctgttataagattgggatgggatgaagaa
attgatgtattctacttcatgaaattgtggttcaaattcaccaggactcgtttcatgaca
tcacttctgagctttggctataaaagtggtatgattattgacaggaaaacttctgaggaa
catagattcaaattcagatctttatttaccagtttctctttagaggtaactaggaagata
aatgaaatcaatgttccagggtgggttaggacaataccttccaagaatcctgtgtatttg
gaaagcaccctacagatattaagggaaatagggtatcctgttggtgaggttaagattcaa
gaaccacagttaggaattgcaatgggcaaattcgatgactggatttctgaaggatctaat
ttcataacagggctattccaactcagaacatatgagtttgttgaattcaatgctttcaaa
actgatgtgcaagaataccgccgatctgattcatatgtcacgttagacaatgaattggag
tctgttgctaggtattttaacaacaaaacagtttcaattccaaatcaagagaaagttgtt
gacgaagtttgggaaatgaccaaaaccatttttcaagactctcgtattacacctctcaga
tcaatatacaagaaatggaaaaagaactacaatgtaggcccattcgctccctctcaaaat
aagaggcgaaaagatggtggattaagaaaaatgagaaggacagaagatattgctagattt
ccaaatttgacaacttatttgcaatactgggaaaaattgtatgcacattttcctctgatg
caaatggtgtctacagcattttacaagtctgaagctctgcccgaaaagaaatggagaaac
aacaaagtaaggactccaattgggtcaatgttgccccaatatctatggcagatggtgtgg
tcatacgagccaaaccaccggtttgatcctgagaacacacctattaaaattggactacca
ctaactggtttccacctatcacaattgtttgaaaagcattcaaagtttgcttatcattat
ggaggtgattgcactgaatttgactctactatcacaaagaacattcaagaaattataaaa
tctattaggaagaaaggtttctcacgacatcgtcaatatgagataatttcaaccatgata
gacattaattatgaacgtttaaatgaaagtaagatagtcactccatcaacaggaaatgtg
tacaataagggaacagggctgacaacaggtcatgcctcaacatcctctgataattcacta
acattgataagcttatacatggctgcatgggtaaacctaacaggattgtccgcgcatgaa
tttagatccttcaatgaactatcctgttatggtgatgaccatattttatctttttctgag
aatgcaccaaaagtttggacttttgagaacatacagaaaatttttaaaacatggggcata
accatgaaaaatgaatttcccaatgctgataaaagggatcttgaaaagatatcatttctt
tccaagtttgccagaaaatccaatcacacggatgacaaacttttcaaagaagtgataggc
tcaagtgcaccaaaatatgtgatctaccatgacacagacaagttacttggtaaaatgaga
gcccctgtgttgaacagagaccctaagtataagattcaaagagttatatcttatctggat
ctatgtgctcacaatgaaaaagcctattatatcgggagggaagttattgaaataatgata
actaaatatccggatttggcttttctaagggggaaagtcccttcatatgaagatgtttta
aggaaattctacagtccgaacacgcatgtccgagaaccggaagagcgtgatgtagaagat
tttgatgaaaaagacatagttgaatatggacagatgacaattttagattatctgtttaat
tacttatctgtcattcccgatgttctaaacccctctataaagaatgtgggtttcgggaga
gttgctcagagagcacttgggcctctaacaagttggccaaaagaacttttaagtttagct
aataatgtctactcccctggacatttaagtcaccttcttaaaagcacatgttatgacttc
attgaagacagggatatggtgttaaacacaactccaaaaataacattaatcctgcgacat
tggttatttttgaaatttaaacttgatagtgaaaagtacaaccccttagcttggattgac
tggatgcttcaaaagcttgcaagtttacaatttataataaatggtagagttcaaactaaa
tacaagaattactcttttccagtatggaatttgtttctactatcattattaaacatatta
gttgtgccagacatagttattaccaacgatgatgaaagtttaagtctggatatgggagaa
tttctcttaaaattcaaattgccagatgcaacctattggataagtaggctttataaatta
tgtgaaaatctgatctgggatcaaataccacctaattttaaaaacctccaatatcttgaa
caggttgaacatcatgggaagattcataaaatagttgctggtacaggaactggtaaatca
acaaccatgatcctctacctacaacaaagtttgggtatgtattttaataagatcattgta
attgagcctagatccaaagtagtaaaaggattagtctcatatgttaaaaccataggagtt
caagcctccgggttaactacgggtttagaacttgatgatcgagaaaaagtttggtatatg
actgcacaagaacttctactacaccctcaatgggtgagtccaagtaatctattcgtcata
gatgaatgccacattgacgaactaccatataaggtggttaaagaaatgttgacaaaaacc
aaaggattaactgttttattggcaacagccactccaacagatgaattttcatccatttgt
cagacagttactgaaattgagttacccaagatatataggagttatcccaaagaatatgca
aataacgttgagataccaattaaaggttcttcatgggtgcatagatatcttggaattgta
acagagattatgtctaattacagaactcccgaaaagttcttaattttcattaatgacaaa
agagatcttgacattttcaggcaaaatctacgtggcaggggattcttcctatcttctgaa
acagaagatgttgacttaagtgaagaagttgatttcatagtgacaactgctgtttgtgac
gtagcaatcaccataccaggagtcactgtggtcataacaccaaattttactagaaaagtc
tcatatgataggaatggtttatctaaaccgtgttttgctctacttgattcagccacccta
aaacaaaggagtggtaggacaggtagaaccaacaatggtgatgtgtatgtaattcctttt
tctggtcctgacatcattcaggaaccaaccatcactaaagaaggccaaatagttgattgg
ttgtcttcaggtttagatttggatgttctggccaaatggaaacctgatctatttgatatt
ttcagaaaagatcttaaagataaccaggttcttaaaatagcagagtttcttgaaaaccag
agacaagacaaatttaagaagtctcatagggtaacccaacctgataaacaagaactcagg
gaattaaacttgtttggtattcacttggaaggtataactggactgggatctggattccag
ttcaactattctgacctagcacaagaatattccacattgttaaagaaggcactcacattt
gtgaacatgcccaactgggataaacaaccaattgagaaatttgtgcacccatttgaagac
acaagtcctgcgaaaatcatatcagttactcttgaaactgaagatggtgagaagcaggaa
ttaggatcttttggggcacatgcacctaaacccttatattccatcagcactccaaaagtg
tcagcaacaacgctggaagctgaaggtaggataaaggtgttaaaagaagaacatgctaaa
gttgaggagaatttgatgatggctttcggccctgacgaaactcctttacgggaacgcagg
gaagagatcagagaagaactcctcgctatatatgaacaagaaggtaaagatctagaatct
aacttcaaacccaaaagacttgctggttcaagtggtccctcttttagttttggttaa
DBGET
integrated database retrieval system
