Viruses: 80541902
Help
Entry
80541902 CDS
T40000
Symbol
QKU48_gp0207
Name
(RefSeq) Fadolivirus algeromassiliense; DNA helicase uvrD/REp type
Virus
3060017
Fadolivirus algeromassiliense
Taxonomy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
VOG
VOG cluster
Motif
Pfam:
UvrD-helicase
UvrD_C
AAA_19
RNase_T
UvrD_C_2
Viral_helicase1
AAA_12
Rho_N
Cas_Cas4
AAA_30
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
80541902
NCBI-ProteinID:
YP_010803090
RS:
NC_077067
LinkDB
All DBs
Position
NC_077067:216113..219490
AA seq
1125 aa
AA seq
DB search
MDLSLESKTVDELKIFLKKYDLVSGITSLRKDDLIKTIRAVKKYSENKQTDYTQFTFGNK
IVKLNDEQHKVVISNIKQNIRIIASAGSGKTTTIICRIKYLIDHGVDPERIMLTTFNVDA
AESMKNKIIELFGFMPKITIGTIDSIACRFYYRYFKQDFNVGVNEYANYFLKYLQSEGNM
VSNLYKYVFFDEFQDTNEIQFQLLKCFYNYGTVITVIGDDAQNIYSFRGSSIKYILNLEN
HFKNLKTYKLVNNYRSTPEIINLANQSIKFNTEQIPKEMLSNNPSINLVPIVKYYENTSL
QNSEIIKNIFEFNKHGIPFEEIAVLCRVNYPLKLLEEAIEKINSRTGNQLKYVALINDDN
SDTKPKIKQGHLTLTTIHKAKGLEWKVVFLLDCNDSRFPSETDKLSIQEERRLFYVAITR
AKQYLYMFLCGDNKNNKIPKLTRFIQELDKSLYNFVNFDKKFYSYEDYRSVKWVNGVTET
IKMLNEIDIAKLRECNILPKTNPITKKLHDKYEFNSYINTYYLQPDFGEFMDRYITRSIG
RRNLDSGGLVDNPTIIIISSCQFTNEELLIYKKYELNFQLNMRKINAKTPEWQYGAILGE
NNMQLQYVKKIDVNDNRLIKSIVQKIILTANKFNIDVSVLANCFSIKNEIPDKVKKKLIE
AYKRYNNNEYVSNEIGYDIYNISLCGTILGGRRRLLYKDVYENFRDGYDNLFSDIEKYIE
TLSPEFTNLVCKKLIKNDDYDLMGEMDLLDIDNNKIIDFKCSSSDKFKIEWIFQLLAYLA
IIKKSYPNYVIKELEVYNPMQGEIYTLDVSDWNRADEYLSYLYEIRVRQVTRNLNPLDQD
IESNFPIKYDNHDTNNEEDIDDILGKEDVKSIDDDYAFVNPKPKEIKLDDIYNMKHLFGD
NFREYLQYLNLNKNKFVNQIDTINRFNEFNNNKYMVIDTETTGLPERPGYGAFTPYHELS
SYNNARMIQICWAIYDGDKLEEIENFIIKPVGFNIKNSHIHGITDKIASKGANLHMVLTR
FSQSLNKVRYIVGHNILFDWHIICSELYRSKFHDVVKLMEKKEMICTMEKSIPLKVDGFL
KPSKLIKLYKFLFGKEFEHQHNAKYDVLATSEVFRELVKRKLVCI
NT seq
3378 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggatctctctcttgaaagcaaaacagtggatgaattaaaaatatttctaaaaaaatat
gatttagtatctggaataacttcacttagaaaagatgatttgattaaaacaatcagagca
gtcaaaaaatattcagaaaacaaacaaacagattatacacaatttacttttggtaataaa
attgttaaactgaatgatgaacaacataaagttgttatatccaatattaaacaaaatatt
agaatcatagcctctgctggaagtggcaaaacaactaccatcatttgtagaattaaatat
ctcattgaccatggagttgatccagaacgaatcatgttaacaactttcaatgttgatgct
gcagaaagtatgaaaaataaaataatagaattatttggttttatgcctaagattactata
ggtacaattgattcaatagcttgtaggttttattatagatattttaaacaagattttaat
gttggggtcaatgaatatgctaattattttttaaaatatttacaatcagaaggtaatatg
gtatctaatttatataaatatgttttctttgatgaattccaagatacaaatgaaattcag
ttccaattattaaaatgcttttataattatggtactgttataacggtaattggagatgat
gcgcaaaatatttatagctttagaggttcaagtattaaatatatattaaacttagaaaat
cactttaaaaatctaaaaacatataaactagttaataactatagatcaacgcctgaaatt
attaatctggctaaccaatccataaaatttaatactgaacaaataccaaaagaaatgctt
tctaataatccttctattaatttagttcctatagtcaaatattatgaaaatacctcatta
caaaatagtgaaataattaaaaatatatttgaatttaataaacatggtattccttttgaa
gaaattgctgttttatgtagagttaattatccattaaaactattagaagaagcaattgag
aaaatcaatagtcggactggaaaccaactcaaatatgtagctctgattaatgatgataat
agtgatactaaaccaaaaattaaacaaggacatcttacattaacaacaattcataaagcc
aaagggctggaatggaaagttgtatttttacttgattgtaatgattcacgattcccatca
gaaacagataaattaagtattcaagaggaaagaaggttattttatgttgcaataactaga
gctaaacaatatctttacatgtttttatgtggtgataataaaaataataaaatacctaaa
ttaacaagatttattcaagaattagataaaagtttatataactttgttaattttgataag
aaattttattcatatgaagattatagatcagtcaaatgggtaaatggtgttacggaaact
attaaaatgttaaatgaaatcgatatagctaaattaagagaatgcaatatattaccaaaa
acaaatccaatcactaaaaaattacatgataaatatgaatttaatagttacataaatact
tattatttacaacctgattttggtgaatttatggatagatatattacaagaagtattggt
agaagaaatttagattctggtggtcttgtagataatccaactataattataatatcatct
tgtcaatttacaaatgaagaactattgatttataaaaaatatgaattaaacttccaattg
aatatgagaaaaattaatgcaaaaacaccagagtggcaatacggtgcaatattgggagaa
aataatatgcagctgcaatatgttaaaaaaatagatgtcaatgataatagattgattaaa
agtattgtacagaaaataatattaactgcaaataagttcaatattgatgttagtgttttg
gcaaattgtttctctatcaaaaatgaaattcctgataaagttaaaaagaagctgattgaa
gcttataaaagatacaacaataatgaatatgtatctaatgaaattgggtatgacatttat
aatatttcattatgtggtacaatactgggtggaagaagaagattactgtataaagatgtc
tatgaaaactttagggatggatatgataatttattcagtgatattgaaaaatatattgaa
acactaagcccagaattcactaatttggtatgcaaaaaacttatcaagaatgatgattat
gatctgatgggtgaaatggatctgctagatattgataataataaaattatagatttcaaa
tgttcatcatctgataaattcaaaatagaatggatattccaattgctggcatatttggct
attattaagaaaagttatcctaattatgtgatcaaagaattggaagtatataatccaatg
caaggagaaatatatacattggatgtaagtgattggaatcgggcagatgaatatttatct
tatttatacgaaataagagtccgacaagtgaccagaaacttaaatccactggatcaagat
attgaatctaattttcccatcaaatatgataatcacgatactaataatgaagaagatata
gatgatatactaggtaaagaagatgtaaaatcaatagatgatgattatgcatttgttaat
cccaaaccaaaagaaatcaagttggatgatatatataacatgaaacatctgtttggtgat
aattttagagaatatctccaatacctgaatctaaataaaaataaatttgttaaccagata
gatacaataaaccgatttaatgaattcaacaataataaatatatggttattgatactgaa
actacaggattaccagaaagacctggatatggtgcatttactccatatcatgaattatca
agttacaataatgccagaatgatacaaatatgctgggctatttatgatggcgataagctg
gaagaaatagaaaatttcattattaaaccagttggattcaatatcaagaattcgcatatt
catggtataactgataaaatagccagtaaaggagcaaacctgcatatggtattgactcga
tttagtcaatcactcaataaagtccgatatatcgtaggccataatattttatttgactgg
cacatcatttgcagtgaactttatagaagcaaattccacgatgttgtcaagttgatggaa
aagaaagaaatgatatgcactatggaaaaaagtattccattgaaagtagatggttttcta
aaaccatcaaaactcataaaattatacaaattcttatttggtaaagaatttgaacatcaa
cataatgctaaatatgatgtgttggcaacaagtgaagtctttagagaacttgttaaaaga
aaattagtttgtatttaa
DBGET
integrated database retrieval system
