Viruses: 80542005
Help
Entry
80542005 CDS
T40000
Symbol
QKU48_gp0310
Name
(RefSeq) Fadolivirus algeromassiliense; helicase/uvrB
Virus
3060017
Fadolivirus algeromassiliense
Taxonomy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
VOG
VOG cluster
Motif
Pfam:
ResIII
SNF2-rel_dom
DEAD
Helicase_C
AAA_22
DEAD_2
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
80542005
NCBI-ProteinID:
YP_010803193
RS:
NC_077067
LinkDB
All DBs
Position
NC_077067:343833..347375
Genome browser
AA seq
1180 aa
AA seq
DB search
MSDDKTSSQSDEFFDEDFESSSDIDEDKSVLSDNKLRELMGVDYTYPDNDDPNFQEKVYK
KREFYYHKMPNRPKMDKYQNIREYRDNICAGPKGLLPQQSFLSNFINPDTPYRGILVFHG
LGSGKTCAGIAIAERFKPMVQKYGTKIYVLVSGPIIKENWKDELLNCTGETYLKQQDASV
YTNDADRIKAKKNAISIALQYYRFMSYRSFYKKVLGEKIQEKVKTKDNKVKVIYRKTEEG
EFERDISVDRIYNLNNSLIIIDEAHNLTGNAYGEALMKVIKNSHNLKVVLLTATPMKNLA
DDIIELINFLRPPNDLILRDKVFTSQKNHEMEFKPGGIEYLKNMTRGYISYLRGADPLTF
AKRLDMGVIPKGLLFTKVVQCKMLPFQRKTYDETVRISDDTLDRRSEAVANFAFPGIDDK
KELVGFYGREGINSVRNQLKANLELINRKIATEILNDKTLENDTDLFYVSDSGKSITGKI
LRIEYLKNFSVKFYKALKKINRLVWGKKGTRTAFVYSNLVKVGIEIFQEILLANGYLEYD
DNPNNYKIKGTTRCYFCGKTFAEHQQMKGDFKVREQSRPQDMSESSTEYEKPKDSMPEHI
FQPATFVSVTGKSTEEAAEIIPEEKQYILRNVFSHVDNMDGKYIKLVLGSKVINEGISLK
NVAEVHVLDVYFNLGKVDQVIGRAIRHCSHYYMMNEQDPFPIVKVYKYAVTLGDELSSEE
DLYKKAELKYLLIKKVERALKEASIDCPVNRSGNIFPEELEQFKDCAEPGQAKEGQESCP
ALCDYMECNFKCDSNILNNKYFNEADNIYRQLNKKELDYSTFTQTLARSEIETAKSKIKE
LYRMKYLYTLKDVVNYVRNSYEGEKKELFDDYFVFEALNELTPITENDFNNFRDTIFDKY
NRQGYLIYINKYYIFQPFDQNENVPMYHRTVFDKQMQSNLTLYNYLKNVAKLPLGKAAKQ
KKEEAIVEKQQTLYDFDSIMDYYDSRDEFKYVGIIDKESSRRKTKSVEELADVFKIRDKR
PKVLTKKRSTGLSSVFGSVCATSKSREILEEISKHVNIKTKPEDTRHDICERIKDKLLFL
EKYSTGKDNMTYVMIPANHPLYPFPYNLENRVKFINDKIKDKIKFKIEMTQKKNKIRIDG
NDAFTYTIEITNSKDLSEFSALLSSIGFKLDGKKWVIKIE
NT seq
3543 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtcagacgataaaacatcaagtcaatcagatgaattctttgatgaggattttgaaagt
tcatcagacatagatgaagataaatcagtgttgagtgataataaattaagggaattaatg
ggggttgattatacttatccagataatgatgatcctaatttccaagagaaagtatataaa
aaacgtgaattttattatcataaaatgcctaaccgtcctaaaatggataaatatcaaaat
attcgtgagtatagagataatatatgtgctggtcctaaagggcttttacctcaacaatca
tttttgagtaatttcattaatccggatactccatatagaggtatattagttttccacggg
ttgggttctggaaaaacttgtgcaggaatagcgatagcagagcgattcaaaccaatggtt
cagaagtatggtacaaaaatatatgtattagtatctggtccgataattaaggaaaactgg
aaggatgaattattaaattgtactggagaaacatatcttaaacaacaagatgctagcgta
tatacaaatgatgcagaccgtattaaagcaaagaagaatgctattagtatagctttacaa
tattatagatttatgagttataggagtttttataagaaagtattaggtgaaaaaattcaa
gaaaaagttaaaacgaaagataacaaagtgaaggtaatatatagaaagacagaagaaggt
gaatttgagagagatatatcagttgacagaatttacaatttaaacaacagtttaataatt
atagatgaagcacataatttaacaggtaatgcatatggtgaggcattaatgaaagtaatt
aagaattcacataatttaaaggtagtattactaacagctaccccaatgaaaaatttagcg
gacgatataatagaattaattaatttcttaagaccaccaaatgatttaatattgcgtgac
aaagtatttacaagtcaaaagaatcatgagatggaatttaaaccaggcggtattgaatat
ttgaagaatatgacacgaggatatatttcttatttgagaggtgctgatccattaacattt
gccaagagattggacatgggtgtaattccaaagggattattatttacaaaagtagttcaa
tgtaaaatgttaccatttcaaagaaagacatatgacgaaactgtaagaatttcagatgat
actctggatagaagaagtgaagctgttgcaaactttgcatttccaggtattgatgataaa
aaagagcttgtaggtttttatggaagggaaggtattaattctgttagaaatcagcttaag
gcaaatttagaattaataaatagaaagattgcgactgaaattctgaatgataaaacatta
gaaaatgacactgatttattctatgtatcagatagtggcaaatcgataacaggaaagata
ttaagaatagaatatttaaagaatttttcagttaaattttacaaagcattaaagaagata
aatagattagtatggggtaaaaaaggaacaagaactgcatttgtttattctaatttggtc
aaagtaggtattgaaattttccaggaaatattattagcgaatggctatttagaatatgac
gataatccaaataattataagataaaaggcacaacaagatgttatttttgtggtaaaaca
tttgcagaacatcagcaaatgaaaggagattttaaagtaagagagcaaagtagaccacaa
gatatgtcagaatcatcaactgaatatgaaaaaccaaaagattcaatgcctgaacatata
ttccaaccggcaacatttgtatctgtaactggtaaatcaacagaagaggctgctgaaata
attcctgaagaaaagcaatatatattaaggaatgtatttagtcatgttgataatatggat
ggtaagtacattaaattagtgttaggttcaaaagttatcaatgaaggtattagtttaaag
aatgtagctgaagtgcatgtattagatgtatatttcaatttaggtaaagtagatcaagta
attggtagagctataagacattgttcacactattatatgatgaatgaacaagatccattc
ccaattgtaaaagtatataaatatgcggtaacattaggagatgaattatcaagtgaagaa
gatttatataagaaagctgaattaaaatatctattaattaagaaagtagaaagagcgtta
aaagaagcatcaattgactgtccggttaatagatctggcaatatattcccagaggaatta
gagcaatttaaagattgtgctgaaccaggacaagcaaaagaaggtcaagaatcatgtcca
gccttatgtgactatatggaatgtaatttcaagtgtgatagtaatatattaaataataaa
tattttaatgaagctgataacatttatagacaattaaataaaaaagaattagattattca
acattcactcaaacacttgcaaggagtgaaattgagacagccaagtcaaaaattaaggaa
ttatatagaatgaaatatttgtatacattaaaagatgttgtaaattatgtaagaaattca
tatgaaggtgaaaagaaagaattatttgatgattattttgtatttgaagcattaaatgaa
ttaactccaataactgagaatgattttaataattttagggatactatttttgataaatat
aacagacaaggatatttaatttacataaacaagtattatattttccaaccatttgatcaa
aatgagaatgttccaatgtatcatagaactgtatttgataaacaaatgcaaagtaattta
actttatataattatttgaagaatgttgctaaattgccattaggtaaggcagctaaacaa
aagaaagaagaagcaattgttgagaagcaacaaacattatatgattttgatagtataatg
gattattatgattcaagggacgaatttaaatatgttggtattattgataaagaatcaagc
agaagaaagactaaatcagttgaagagcttgcagatgtctttaagattagggataaaaga
cctaaagtattaacaaagaaacgtagtacagggttatcgagtgtatttggttcagtatgt
gcaacatctaagagtagagaaattttagaggaaatatctaaacatgttaatattaaaacc
aaaccagaagatacaagacatgacatatgtgaaagaattaaagacaaactattatttttg
gagaaatatagtactggtaaagataacatgacatatgtaatgattccagcaaaccatcca
ttatatccattcccatacaatttagagaatagagttaaattcattaatgataagatcaag
gataaaattaaatttaagattgaaatgacacagaaaaagaataaaatacgtatagatggc
aatgatgcatttacatatacgatagaaattacaaattccaaggatttgagtgaattttct
gccttgttgagtagtataggatttaaacttgatggaaagaaatgggtcattaaaattgaa
taa
DBGET
integrated database retrieval system
