Viruses: 80542070
Help
Entry
80542070 CDS
T40000
Symbol
QKU48_gp0375
Name
(RefSeq) Fadolivirus algeromassiliense; zinc finger RING-type protein
Virus
3060017
Fadolivirus algeromassiliense
Taxonomy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
VOG
VOG cluster
Motif
Pfam:
zf-RING_2
zf-C3HC4_3
zf-C3HC4_2
zf-rbx1
zf-RING_5
zf-C3HC4
Prok-RING_4
MCM_WH_arc
zf-RING_UBOX
RING_XB3-XBAT31
zf-ANAPC11
zf-RING_4
zf-RING_11
SNF2-rel_dom
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
80542070
NCBI-ProteinID:
YP_010803258
RS:
NC_077067
LinkDB
All DBs
Position
NC_077067:complement(431133..433079)
Genome browser
AA seq
648 aa
AA seq
DB search
MNIQELIYARVKLQNPPIGKRIHISKDCSQIFYYNKREKVYMISNEGISIKNDFEFMKAK
IENEGDNGWYKILLDIDVDKLNEILKYPYNINGRKHLFEIFRKCITETKNNYISHLILNL
YEQILLNKNTSFDEWFREKEECSNIYTYLNNDMYKLGEYYIDTMNGQFIKDVTLNNCTVN
GGVVYDLTYSWVDLMINSISKTHSRNIDITDTVTLIYTKCTIIICNKSMCTYWLSKINTQ
QPSASVKIINNLKDHKSITYNELIELDYLIISYEYFCTKKFMTTIDDYNINNNKVEDILK
IIKNEYVKFDNIKDRSDTILFLIYWNRIIIDSVTFNESLKNKNIYDLIMLFKAGKRWIHL
DKMLNSQQDYFNLFKYLLNDTNTVFPLYDNNLNIKYINDLLYVSTNKNNNSIIKEQCVII
RSGLLEKDILKYFENIKCNNIYKFYNTLNNLYESMITRQEYVDILDNLKLNAQFDDLQCS
VCLESNDHDKMLFTNCGHHYCVKCILQYLEFNKACPICRKEIDLKDLHYIDDICTNDKAN
ELIRTLKSYGSRTYIYVNNLKHKRYLANYLKTYEVNCEIEWINNDFNKIQKIINSESGNN
ICIIFYDIFDEIEVIKKQLKLNNFSSIKIYYLIYDILKERFLGNGNTY
NT seq
1947 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaatatacaagaattaatttatgcaagagtcaaattacaaaatcctcccatagggaaa
cgcattcacatttcaaaagattgttctcaaatattttattataacaagagagaaaaagta
tatatgataagtaatgaagggatatcaattaaaaacgattttgaatttatgaaagcaaaa
atagaaaatgaaggtgataatggatggtataagattttattggatattgatgttgataag
ctaaatgaaatactaaaatatccatataatataaatggaagaaaacatttatttgaaata
ttcagaaaatgtataactgaaacaaaaaataattatatatctcatttaattttaaatcta
tacgaacaaatattattaaataagaatacatctttcgatgaatggtttagagaaaaggaa
gaatgtagtaatatctatacatatttaaataacgatatgtataaactgggtgaatattat
attgatactatgaatggtcaatttataaaggatgttacattaaataattgtactgttaat
ggtggtgtagtatatgatttgacttattcatgggtagatttaatgataaactcaatatct
aaaactcattcgagaaatatagatattactgatacagttacattaatttatacaaaatgt
acaataataatatgtaataaatcaatgtgtacatattggctatctaaaattaatacacaa
caaccatctgcgagtgttaaaataataaataatctaaaagatcataaatctataacatat
aatgaattaatagaattagattatttgattataagctatgaatatttttgtactaagaag
tttatgacgactattgatgattataatatcaataacaataaagtcgaagatatattaaaa
ataataaaaaatgagtatgttaaatttgataatataaaagatagatctgatacaatatta
tttttgatatattggaatcgtattataatagattctgtaacatttaacgaatctcttaaa
aataaaaatatttatgatttgataatgttatttaaagcaggaaaacgttggattcattta
gataaaatgttaaattcgcaacaagactattttaatttatttaaatatttattgaatgat
acaaatacagtatttccattatatgataacaatttaaatatcaaatatattaatgattta
ttgtatgtatcaacaaataaaaataataatagtataataaaagaacaatgtgtgattatt
agaagtggattattagaaaaagatatacttaaatattttgaaaatataaaatgtaacaac
atatataaattttacaatacattaaataatttgtatgaatcaatgattacaagacaagaa
tacgttgatattttagataatttgaaactcaatgctcaatttgatgatttacaatgttca
gtatgtttagaaagtaatgatcatgacaaaatgttatttacaaattgtgggcatcattat
tgtgtgaaatgcatacttcaatatttagaatttaataaagcctgtccaatatgtagaaag
gaaattgatttgaaagatttacattatatagatgatatatgtacgaatgataaagcaaat
gaattaataagaacattaaaatcttatggatcaagaacatatatatatgtaaataattta
aaacataagcgatatttggcaaattatttaaaaacatatgaagtaaattgtgaaatagaa
tggattaataatgattttaataagatacaaaagataataaattcagaaagtggtaataat
atatgtataattttttatgatatttttgatgaaattgaagttataaagaaacaattaaaa
ctaaataatttttcaagtattaaaatatattatttaatatatgatattttgaaggaaaga
tttttaggaaatggtaatacatattaa
DBGET
integrated database retrieval system