Viruses: 80542102
Help
Entry
80542102 CDS
T40000
Symbol
QKU48_gp0407
Name
(RefSeq) Fadolivirus algeromassiliense; 5'-3' exoribonuclease
Virus
3060017
Fadolivirus algeromassiliense
Taxonomy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
VOG
VOG cluster
Motif
Pfam:
XRN_N
XRN_M
DUF4931_C
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
80542102
NCBI-ProteinID:
YP_010803290
RS:
NC_077067
LinkDB
All DBs
Position
NC_077067:466332..468119
AA seq
595 aa
AA seq
DB search
MGVPGFFAWLLKNYRKGHIILQNIDKDVDWLYLDSNCLIHPQCYKILNFYSNMTDLEKLE
NKMIKRVLNYIDYLVGMVNPKKGVFISVDGVAPMAKMSQQRKRRQKAIYDNALREDIKRK
YGKSSSTIWTNTTITPGTVFMEKLHQKILEYIKQNRLQLKISYVYSSYHTVGEGEHKILQ
DIKLKKQNPEFKDDVYVIYGLDADLIFLALASDKNNIFLLREETFFGHGKETPKEEIINI
VKDVAEDLNYVSIDETKVCINEQVKNLIEKKMEVDELEGEFKYLDINYNDNDFTNDFIII
CYLLGNDFIPNLPSLDIKNDGLNLLLDMYVDIYLTIGHGIVHIENNNAIMNNVFIELYFN
KLGEFEDYYFKVKYPKYVENLSRRKCLSDDPYDKEIWELDNLKNIKIDDPIKLGFGDSTL
WKFNYYEYYYNVSIHQQEHINNMCEDYLMGIKWTLEYYFNKCPSWNWNYKYINAPFVSDL
GYYFKKNKYDINKIEFAKSMPLTPIVQLLAVLPSNCADLLPKLYGELMVSVTSPIIDLYP
SEVIIDMLYKDSLHKCMPMIPNININRILNAVRNIKLNESEKNRNIITENIIANY
NT seq
1788 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgggagtaccaggattttttgcatggttattaaaaaattatagaaaaggacatattata
ttacaaaatatagataaagatgttgattggttatatttagattcaaattgtttaattcat
ccacaatgttataaaattttaaatttttattcaaacatgactgatttagaaaaattagaa
aataaaatgataaaaagagtgttaaactatattgactatctggtaggcatggttaaccct
aagaaaggagtgtttatatcagttgatggtgttgcaccaatggcgaagatgagtcagcaa
agaaaaagaagacagaaagctatatatgataatgcgttacgagaagatattaagagaaaa
tatggaaaatcatcatccacaatatggactaatacaactataacaccaggaacagtattt
atggaaaaacttcatcaaaaaatattagaatacataaaacaaaatagacttcaattaaaa
atatcatatgtttattcctcttatcatacagttggagaaggagaacacaaaatattacaa
gatataaaattaaagaagcaaaatccagaatttaaagatgatgtttatgtaatttatgga
ttggatgcagatttaatatttttagcattagcaagtgataaaaataacatatttttgtta
agagaagaaacattttttggtcatggcaaagaaacaccaaaagaagaaataattaatatt
gtaaaagatgtggctgaagacttgaactatgtttcaattgatgaaacaaaagtatgtatt
aatgaacaagtaaagaatctgattgaaaagaaaatggaagttgatgaacttgagggagaa
ttcaaatatttagatattaattataatgataatgattttacaaatgattttataataata
tgttatttacttggtaatgatttcattccaaatttaccctcacttgatattaaaaatgat
ggattaaatcttttattagatatgtatgttgatatctatttaactataggacatgggatt
gttcatattgaaaataataatgcaattatgaataatgtattcatagaattatattttaat
aaacttggtgaatttgaagattattattttaaggttaaatacccaaaatatgttgagaat
ttatcaagaagaaaatgtttatctgatgatccttatgataaagaaatatgggagctggat
aatttaaaaaatatcaaaatagatgatcctattaaactaggatttggtgattctacatta
tggaaattcaattattatgaatattattataatgtgtctattcatcaacaagaacatatt
aataatatgtgtgaagattatctaatgggaattaaatggacattagaatattattttaat
aaatgtccttcttggaactggaattacaaatacattaatgcaccatttgtaagtgatttg
ggatattatttcaaaaaaaataaatatgatataaacaaaattgaatttgctaaatcgatg
cctttaacaccaattgttcaattacttgcagtattaccatcaaattgtgctgatttatta
ccaaaattatatggtgaattaatggtatctgtaacatcaccaattatagatttataccca
tctgaagtgataatagatatgctttataaggacagtttacataaatgtatgccaatgatt
cccaatattaatattaatcgaatattaaacgcagtaagaaatataaaattaaatgaatct
gaaaaaaatagaaatataataactgaaaatattatagcaaattattaa
DBGET
integrated database retrieval system
