Viruses: 80542170
Help
Entry
80542170 CDS
T40000
Symbol
QKU48_gp0475
Name
(RefSeq) Fadolivirus algeromassiliense; major capsid protein
Virus
3060017
Fadolivirus algeromassiliense
Taxonomy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
VOG
VOG cluster
Motif
Pfam:
Capsid_NCLDV
Capsid_N
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
80542170
NCBI-ProteinID:
YP_010803358
RS:
NC_077067
LinkDB
All DBs
Position
NC_077067:549208..553536
Genome browser
AA seq
1442 aa
AA seq
DB search
MTGGILEVAAKGIEDIYLSGDPNITFFKTVYRRHTNFSKGELDLNFTNKLDFGKEGYSRI
EHYGDLLHRLFLVIKLPKIDISFRSLTVGEVQTLLSQYGITWITPKDPSEIFTEDDFTEV
KRLVGIERVRLERENELILQPAINALTTGEFEPNTWKMNNPGYTDNTDSNNDGISDGADK
YLNDIINSFIEQDPYNLQYQIVNAHLLDESQDPIDLFNSIEIQDLMLQIFTDYVVGTTVF
EPEPFYNDDNMRFYYNVDTANYTSTGSLAQANSNTIFRAGVDAKYTDDITDDYQKYDAYK
IFDVTLTNNNRIVTSAADIQSIKTLLLDNILYGLIKNVRLMKNIYTSLLVSTTPPDLVTQ
TNSQFIFYRLFPVITPGQQVYQTTSSFQTTSLSTNPPPELNDNFSSDFTLTQETNEPSTV
SHPFSNYVNTSINNLNGTFHSTNVGYFNTTKFIQYFNDVNVSGNIWKKLDIYNNAYTPGS
ALPFPELMYYMNYIWFTMAEQIPDAVSKYLRDGFNGNEKRADKGLTNINGVLTASSNTIT
LDTINNIIYPYLLDPVQEEILDVITPKITDALNYTIGRALNDNGYKSRTGITGDIILFGT
VIPGKFTIVTDAESMHSLGNLTIPEYIIARYKKAFNDLKSLIPATFASSGSTLTQRTVYE
GDANNTFTSVLQRLNDIVIKLFDTDLANIPEYSTYQTQNSNIYPDRIRQINGYPLPDEPN
TTLNEVQISIWNSIFLQTVNNYNDLFNTFMLSNSYYLNNIGCELLSYLTWISSTWFDFNV
ATEYYDYYRNILSYQNLINPEPATIGDPNTIGEVQIYLNNKIVELLSIINHYNENRKLLD
MRNIILQRSKYYYQEYEIILNDLTNEIEQNATTLYNHIPHPGTGDIVLDTQQELLTSPNY
SQQNAVDTVLNMRNVANTFFELGGNENQNPDDNPYNPLTEPDLYNEWILNNNSPYNPVTE
PNKYALWQKYKGTFKGSTEQTKFAGNNPYNPTTSIGLFDWLYNTNNIDGIAGELFSFNSQ
IELLYNNFSFDTNVYQFMSDYAIATSIVQDLPALLRPTINETHDAVLKYYQDRYNANVEI
ISKLEETSQDTTSVFNILERSLGGKNLAKFAWIRKIGHYIIDQIWFKIDDQIVDKQYGEW
LEIWHTLTGRIKKKEKGYNILTGNVPELYTYNTLIKNEYELVIPLQFWFCRNIGLSLPIL
ALHNSDVRLYVKLKSFDDVSFYDEFTTFRLKPRLKCNLLAEYIYVDDDERQKISTSKLEY
IIDTLQFNGDIEINNNSFNEEGYIDAITRFKNPCKEMVWLLQRKNFIDGSLTNRQKLWHV
YGYDTDGTLNPMKNAKIKFNSRDREIFKEIEYYNYIQPYEKHYANASTGVNVYSFSINPE
SIQPEGSANMSRIDDASIEFNLKNNVVFDINEGNVVFRLAIYALTMNVLRIFSGLAGLVF
QQ
NT seq
4329 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgacaggtggaatattagaagttgccgcaaagggtattgaagatatatatctgagtggt
gatccaaacataacattttttaaaactgtatatagaagacatacaaacttttccaaaggt
gaattggatttaaattttacaaataaactagattttggcaaagaaggatatagtcgtatt
gaacattatggtgatttgttgcatagattatttttagttattaaacttcctaaaattgat
attagttttagatcattaacagttggcgaagtacaaactctattgtctcaatatggtatt
acatggataacacctaaagatccatcagaaatatttacagaagatgattttacggaggtt
aaacgattagttggtattgaaagagttcgattagaaagagaaaatgaattaatattacaa
ccagcaattaatgcattaacaacaggagaatttgagccgaatacatggaaaatgaacaat
cccggatatactgataatactgattcaaataatgatggtatttcggatggtgctgataaa
tacttaaatgatattataaattcttttatagaacaagatccatataatcttcaatatcag
atagttaatgctcatttactcgatgaatctcaagatccaattgacctatttaattcaatt
gaaatacaagatttaatgttacaaatttttactgattatgtagtgggtacaactgtattt
gaacctgaaccattttacaatgatgataatatgagattctattacaatgtagatactgca
aattatacatcaacaggtagtttggcccaagcaaatagtaatacaattttcagagcaggt
gttgatgctaaatatacagatgatataacagatgattatcaaaaatatgatgcttataaa
atatttgatgtaacgctgactaataataatagaatcgtaacaagtgctgctgatattcaa
agtattaaaacacttttattggataacatattatatggtttgattaaaaatgtaagatta
atgaaaaatatatatacatcattacttgtatcaacaacaccccctgatctagttacacaa
acaaattcgcagtttatattttatagattatttcctgttataactcctggtcagcaagta
tatcaaacaacatcatcattccaaacaacatcattaagtacgaatccacccccagaatta
aatgataatttttcaagtgattttacattaactcaagaaactaatgaaccaagtacagtt
tcacatccatttagtaattatgtaaatacatctattaataatttgaatggtacatttcat
tcaaccaatgtaggttatttcaatacaactaaattcattcaatattttaatgatgtaaat
gtatctggaaatatttggaagaaattagatatttataacaatgcatatacaccaggtagt
gcattaccatttccagaattaatgtattatatgaattatatatggtttactatggctgaa
caaattccagatgctgtgagtaaatatcttagagatggatttaatggaaatgaaaaaaga
gctgataaaggattaactaatattaatggtgtactaactgcatcttcaaatacaataact
cttgacacaattaataatattatttatccttatttactagatcctgtacaagaagaaatt
ttggacgtgataacacctaaaataacagatgcattaaattatactattggtagagcattg
aatgataatggatataagtcaagaactggtattactggtgatataatattattcggtacg
gttattcctggaaagtttaccattgtaaccgatgcagaaagtatgcatagcttaggtaat
ttaactattccagaatatataattgcacgttataaaaaagcatttaatgacctaaaatcc
ttaataccagcaacgtttgcaagcagtggttcaactcttacccaacgaacggtgtatgaa
ggagacgcaaataatacatttactagtgtattgcaaagactcaatgatattgtgataaaa
ctttttgataccgatttagcaaatataccagaatattcaacatatcaaacacaaaatagt
aatatttatccagatcgtataagacaaattaatggttatccacttccagatgaaccaaat
acaacattaaatgaagtacaaatttcaatatggaattccatctttttacaaactgttaat
aattataatgatctattcaatacatttatgctaagtaatagttattatttaaataatatt
ggatgtgaattacttagttatttaacttggatatcatcaacatggtttgattttaatgtc
gcaactgaatattatgattattatagaaatatactttcatatcaaaatttaattaatcct
gaaccagctactattggtgatcctaatacaataggtgaggtacaaatatatctgaataat
aaaatagtcgaattattgtctataataaaccattacaatgaaaatcgaaaattattagat
atgagaaatatcattttacaaagatcaaaatattattatcaagaatatgaaattatttta
aatgatttaacaaatgaaattgaacagaatgctacaactctatataatcatattccacat
ccaggtacaggggatattgtattagatactcaacaagaattactaactagtccaaattat
tcacaacaaaatgcagttgacactgtattaaatatgagaaatgtcgcaaatacttttttt
gaattaggtggaaatgaaaaccaaaatccagatgataatccatacaatccattaaccgaa
ccagacctatataatgaatggattttaaacaataatagtccatataatccagtaacagaa
ccgaataaatacgcattatggcaaaaatataaaggaacatttaaagggtcaactgaacaa
actaaatttgctggaaataatccatataatccaacgacttctattggtttatttgattgg
ttatataacacaaacaatatagacggaattgctggtgaattattttcatttaatagtcaa
attgaattattatataataatttttcatttgatacaaatgtatatcaatttatgtctgat
tatgctattgcaacatctattgttcaagatttgccagctttattaagaccaacaattaat
gagacacatgatgcagtattaaaatattatcaagacagatataatgcaaatgtagaaata
atttcaaaattagaagaaacatcacaagatacaacaagtgtctttaatattttagagaga
agtttaggtggaaaaaatttagcaaaatttgcatggataagaaaaataggacattatatt
atagaccagatatggtttaaaattgatgatcaaatagtagataaacaatacggagaatgg
ttggaaatatggcatacattaactggaagaattaagaaaaaagaaaaaggatacaatata
ttaactggaaatgtgcctgaattatatacgtataatacacttattaaaaatgaatatgaa
ctagtcataccattacaattttggttttgtaggaatattggcttatcattgcccatatta
gcattacataattcagatgttagattatatgtcaaattaaaatcatttgatgatgtatca
ttttacgatgaatttacgacttttagattaaaacctagattaaaatgtaatctattagca
gaatatatatatgttgacgatgatgaaagacaaaaaatatcaacatccaaattagaatat
ataatagatacattacaattcaatggtgacatagaaatcaataataatagttttaatgaa
gagggatatattgatgcaataacaagatttaagaatccatgtaaagaaatggtttggttg
ttacaaagaaaaaattttatagatggatcattaacaaatagacaaaaattatggcatgtt
tatggttatgataccgatggaacattaaatccaatgaagaatgcaaaaataaagtttaat
agtcgtgatcgtgaaatatttaaagaaattgaatattataattatattcaaccttatgaa
aaacattatgctaatgctagtactggagtgaatgtttatagtttttcaataaatccagaa
tcaatacaaccagaaggttctgcaaatatgagtagaatagatgatgcaagtatcgaattt
aatcttaaaaataatgttgtatttgatattaatgaaggtaatgtagtatttagattagcg
atatatgcattgacaatgaatgtattaaggatattcagtggattagctggtctcgttttt
caacaataa
DBGET
integrated database retrieval system
