Viruses: 80542271
Help
Entry
80542271 CDS
T40000
Symbol
QKU48_gp0576
Name
(RefSeq) Fadolivirus algeromassiliense; DNA-directed RNA polymerase subunit 1
Virus
3060017
Fadolivirus algeromassiliense
Taxonomy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
VOG
VOG cluster
Motif
Pfam:
RNA_pol_Rpb1_5
RNA_pol_Rpb1_1
RNA_pol_Rpb1_2
RNA_pol_Rpb1_3
RNA_pol_Rpb1_4
RNA_pol_Rpb1_6
RNA_pol_Rpb1_7
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
80542271
NCBI-ProteinID:
YP_010803459
RS:
NC_077067
LinkDB
All DBs
Position
NC_077067:668080..672591
Genome browser
AA seq
1503 aa
AA seq
DB search
MDPNLQLYDEKIRPIRSIEFAIWGNDEIKRNSALGKDSAGIEIADLYDNMEPKRGGLIDT
RLGVTSNNLECTTCGYDSTNCNGHFGHLDLAEPVFHMGYIAYVKKILSCVCLKCSRLLVY
KNEDELLDMLKNKSGKARFAEIRNISKNITHCVKPGYGCGTPVTKIKIEQKKSSISVNII
SELQVQTTDEGGEGGEGGEGGLTKKVIRQILTPEICYDILKNISDTDCMIMGIDPRKSRP
EDMIHKIFPVSPVAIRPSAKVDFLESSSKEDDLTHKLADIVKVNIRIRKLKESSGDFTPK
YGPDNITLLQFHIYTNFDNESAAIPKSEQRNKATKSLSSRLKGKEGRIRGNLMGKRVNFS
ARTVITSDPTIDINQLRVPIKIATNLTIPEVVTPQNIEKLNELVRNGRDKYPGANFVFPV
GNMESGRRVLPIDLRYRKEKVDLRYGDIVERHIVDGDIVLLNRQPTLHKLSMMGHRIKVI
QDPRFNTFGLSVAVTTPYNADFDGDEMNIFLPQSNQTRIELEEIADVQRQIITPALSVPI
IGIVQDGILGSYTLTQPTMKIDWKTAMNIISYTSIDDFSAFKKEGEMAGIDLFSLIIPSR
ISTSGNLEIKNGQITKGYLSSAMLGAKKPHSLIHLIWDEYGFEETRKFLDNTQRLINNFN
LWNGFSVGIGDIDISKEVEDQMYKLFETKKLEIDHLITEMENNPNLVDLEVFEETIKAEL
DVIKSNVAKLILANMKASNNFNMMINAGSKGGPDNVGQMGGCLGQQGVEGKRIMKKYNGR
ATAFVPQHDDSAVGRGFVEQPFYKGVHPRGFVFHNMASREGLIDTAIKTAESGYVQRKLI
KSLEDIGVKYDNTVRNANHTILQFIYGDSGIDTTRQSIQPLKMLELSNAEISNKIKFTEQ
ELKNFKGFSAKDNDKYYYSVIKLRNDLRNSRTRTAKDNITFESTFMLPVNLKNVINNVKN
TNMKGDDLDPKYVLDKLEDILDYKNTKIIALSEDDIKNNTLKYRDEMMAKTAFRFALYEY
LSPKVCIFEHNLNKAKFDLICERIIKGFNKAVVEPGEMTGIIGAQSIGEPTTQMTLNTFH
KAGSGSSATLGVPRVKELLSLSKNMKTPMMYIFLDDEYRSNSEIANKIASHLKHTTLRDI
RNKIEIYYDPNPLRKGGFMELDNVYNVFYSHNPSKNSCQGDVSTLPWLVRIEMDREKMME
KDITLLDVKSKFCNNWERRYNDIKGLKKEERTLLERITQTSILSNSDNDKFPVIHIRFDM
TEFDFSVMVSFIETFIDNFKLKGVDYISKIGAVNEEPIVTFDESTGEMKTIKNWVTYTSG
VNLADIRYINGINLNRTVCNDIMTIYETYGIDAARAALIKEFKTVFAAAGNNVNYAHLEL
LCDLMTSSGVPISIDRHGMNKSETDPLARASFEKTVEQLLIAAVFGEVDNMNNVSSRIMA
GLVIKGGTGLCNVILDSELLVKSEYLEDIEQKYVKTYTEVTQNSVVNDMINKNVSGIFLP
DSD
NT seq
4512 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggatccaaatcttcaattgtatgatgagaaaattagaccaattaggagtatagaattt
gcaatatggggtaatgacgaaataaagcgaaattctgcacttggtaaagattcagcaggt
attgaaattgctgatttgtatgataatatggagccaaaacgtggtggattaattgacacg
cgtcttggtgtgacaagtaataatttagaatgtacaacatgtggatacgattcaacaaat
tgcaatggtcattttggacatttagatttagcagaaccagtatttcatatgggatatata
gcttatgttaaaaaaatattaagctgtgtatgtttaaaatgttctagattacttgtatac
aaaaacgaagatgaattattggatatgttaaaaaacaagtcaggaaaagcaagatttgcg
gaaatcagaaatatatctaagaatataactcattgtgtaaaacctggatatggttgtggt
actccagtcactaaaattaagattgaacagaagaagtcttcaatatctgtaaatataatt
tctgagttacaagttcaaacaacagacgaaggaggcgaagggggtgaaggaggtgaagga
ggtctaacaaagaaagtaattagacaaattttaactcctgaaatttgttatgatatattg
aagaatattagtgatactgattgtatgattatgggtattgatccgagaaaatcaagaccg
gaagatatgattcataaaattttcccagtatcacctgttgctatcagaccatcagctaaa
gtagatttcttggaatcatcatcaaaggaagatgacttgacgcataaattagcggatatt
gtgaaagttaatattagaattcgtaaattaaaggaatcatctggtgactttacgccaaaa
tatggtccagataacataacattattacaatttcatatttacactaattttgacaacgag
tctgcagcaattccaaaatcagaacaaagaaataaagcaactaaatctttaagttcacgt
cttaaaggtaaagaaggtcgtattcgtggtaatcttatgggtaaacgtgtaaacttttca
gctcgtacggtaattacatctgatccaacaattgacataaatcagttaagagtgccaatt
aaaatcgcaacaaatttgactattcctgaagtagtaacacctcagaatatagagaaattg
aatgaattggtaagaaatggtcgtgataaatatcctggagcgaactttgtgttcccagtt
ggaaatatggaatcaggaagaagagtacttccaattgatttgagatacagaaaagagaaa
gtcgatttaagatatggtgatattgttgagagacatattgttgatggtgatattgtatta
cttaatcgtcaaccaactcttcacaaattatctatgatgggtcatagaattaaagtcatt
caagatccaagattcaatacatttggtttgagtgttgcggttacaacaccttacaacgca
gattttgatggcgatgaaatgaatattttccttccgcaaagcaaccaaacacgtattgaa
ttagaggaaatcgcggatgtacaaagacaaataattactcctgcgttgagtgtacctatt
ataggtattgtacaagatggtatattgggttcatatactttaacacaaccaacaatgaaa
atagattggaagactgcaatgaatataatatcatatacatcaattgatgattttagcgcg
tttaagaaagaaggtgaaatggcaggtatagatttattttcattaattataccatcaaga
attagcacaagtggcaacttagaaattaagaatggtcaaataacaaaaggctatttaagt
tcggcaatgttaggtgcaaagaagccacacagtttaatccatttaatatgggatgaatat
ggatttgaggaaactcgcaaattcttagataacacacaaagattaatcaacaatttcaat
ttatggaatggtttttcagtaggtataggtgatattgatatttccaaggaagtcgaagat
caaatgtacaaactatttgaaactaagaaattagaaattgatcacttgattactgaaatg
gaaaacaatcctaatttggttgacttggaagtttttgaggagacaattaaagctgaatta
gatgtaattaaatcaaatgttgcgaagttaatcttagcaaatatgaaagcatcaaataac
ttcaatatgatgattaatgcaggttcaaagggtggtccagataacgttggtcaaatgggt
ggttgtttgggccaacaaggtgtagaaggtaaacgtattatgaagaaatataatggtaga
gcaactgcatttgttcctcaacatgatgattcagcggttggtagaggttttgttgaacaa
ccattttataagggggtacatccaagaggttttgttttccacaacatggctagtagagaa
ggtttgatcgatacagctataaaaaccgcggagtcaggctatgttcaaaggaagctaatc
aaatcattagaagacattggtgttaaatacgataatacagtaagaaatgcaaaccataca
atattacagttcatctatggagatagtggtattgatacaaccagacaatcaattcaacca
cttaagatgttagaattaagtaatgctgaaatttcaaataaaattaaatttactgaacaa
gaattaaagaatttcaaaggattttcagctaaagataatgacaaatattattattcagtg
atcaaacttagaaacgatttgagaaattccaggacaagaacggctaaggataatattaca
tttgaatctacatttatgttaccagtaaatcttaagaatgtaattaataatgttaaaaat
actaatatgaagggtgatgatttggatccaaaatatgtattagacaaacttgaagatata
ctggattataagaatactaaaattattgcattgagtgaagatgatataaagaacaataca
ttgaaatatagagatgagatgatggctaaaacagcatttagatttgctttgtatgaatac
ttatctcccaaagtatgtatatttgaacataatttaaataaagccaagtttgacttgata
tgtgaaaggattattaaaggttttaacaaagcagttgtagaacctggtgaaatgactgga
attataggtgcacaatcaattggtgaaccaacaacacaaatgactctcaatactttccac
aaagcaggttccggttcatctgcaacacttggtgtaccgagagttaaagaattattaagt
ttatcaaagaacatgaaaacaccaatgatgtacatatttttagatgatgaatatagatca
aatagtgaaattgctaataagatagcatcacatttgaaacatacaacattaagggatatt
agaaacaagatagaaatttactatgatccgaatccactaagaaaaggaggatttatggaa
ttggataatgtatataatgtattctatagtcataatccaagtaaaaatagttgtcaaggg
gatgtatcgactttaccatggttagtaagaatcgaaatggacagagaaaaaatgatggaa
aaagacattacattattagatgtcaaatctaaattttgtaataactgggagagaagatat
aatgatattaaaggtctcaagaaagaagaaagaacattattggaacgaataacacaaaca
tctatattatcaaattctgataatgacaaattcccagtaatccatataagatttgatatg
acagaatttgattttagtgtaatggtaagtttcattgaaacatttattgataattttaaa
ctaaaaggtgtagattacatttccaagataggtgctgttaatgaagaacctattgttaca
tttgatgaatcaactggggaaatgaaaacaattaaaaactgggtaacatatacatctggt
gtcaatttagcagatattagatatatcaatggtattaatttgaatcgaacagtatgtaat
gatattatgacaatatacgaaacatatggtattgatgcggctagagcagctttgattaag
gaatttaagacggtgtttgcagcggcaggtaataatgtaaactatgctcatttggagtta
ttatgtgatttaatgaccagtagtggtgtaccaatttcaatagacagacacggtatgaat
aaatcagaaactgatccattggcaagggcatcatttgaaaagacagtagaacaattattg
atagctgctgtatttggcgaagttgataatatgaacaatgtatcatcaagaattatggct
ggattggtaattaaaggaggtacaggattatgtaatgtaatattagattcagaattattg
gtaaaatcggaatatttagaagatattgaacagaagtatgttaagacatacactgaagta
actcaaaactctgttgtaaatgatatgattaataagaatgtatctggaatattcttaccg
gattctgattaa
DBGET
integrated database retrieval system
