Viruses: 80542297
Help
Entry
80542297 CDS
T40000
Symbol
QKU48_gp0602
Name
(RefSeq) Fadolivirus algeromassiliense; DNA-directed RNA polymerase subunit 2
Virus
3060017
Fadolivirus algeromassiliense
Taxonomy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
VOG
VOG cluster
Motif
Pfam:
RNA_pol_Rpb2_6
RNA_pol_Rpb2_1
RNA_pol_Rpb2_2
RNA_pol_Rpb2_7
RNA_pol_Rpb2_3
RNA_pol_Rpb2_4
RNA_pol_Rpb2_5
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
80542297
NCBI-ProteinID:
YP_010803485
RS:
NC_077067
LinkDB
All DBs
Position
NC_077067:700205..703936
AA seq
1243 aa
AA seq
DB search
MNTLNRQDYMTNESTKKGSNKKKNTKEKNQTTAISKELSRTKDINDDVSFSNNMISIDDV
YRLIDLFFKQKNVMYTHLYNSFDKLLDEEIPNFLTNSSNVFYEHATKDKIYRYKFKYDNI
AIKPPFIDMDDEIMFPQHARLRNLTYGSKLVATITQIQEITDIATDTITTKVIGQPEYEY
PITTIPTMVRSKYCSLNLKKGYDKSECEYDPGGYFIVNGSEKAVMSLERMIDNRPLVFIK
KDSTSVTYTVQVNSKSQHNDLMQIINIRIKKDNTLSIRVPILNEIPVFILMRALGIESDS
DIINYCVYDHNDTDMINIVRLSLENSKPEKGDVKIITQTDALNYLITKMRVIKKYNETDK
DIRQQEKKLHLLQLLRDNFLPHVEGGYIEKAFYLGYMINRLLQCYLGRIKTDDRDSYINK
RVDLPGQLMFELFKQFYKKMLNECNKFFKKRNQDDDNPLNIINQIKPNIIEQGLKTALLT
GAWGKKKGVAQMLQRLTYLQTLASLRRINSPTVDASTNKLTSPRHLHPSILGSMCFIETS
EGAKVGLVKNLSLIGNVTVMKNSLFDIMKEKLVSKVINIQDVKISDLKNYTRVLLNGEVL
GLTDKPRKLYNELKQMKHSGEIDPLIGIAHDIRSEIECKDLRINCDTGRTYHPVIRVINN
EITLTKAMTDLISIDDKESATKITSWNQFMMKFPGTIEYIDPDEQYNSLLAMFPSDVEEM
RLKMVKSVKGLEKLKEQDFKNILNRYDQFHYVKYTHCEIHPSLLIGVVVANIPFAECNQG
PRNIFQYSQARQAMGIYATNWRDRLDISYILYHPQRPIVTTRSMKYVNTERIPAGENCIV
AIACYSGYNQEDSNIMNCSAIEHGLFRSTSVKSYKTTIQKNQSTSQDDIFIKPDRSQVSG
MRHGTYDKLNEKGYAPEETWLENGDILIGKVSPIQPSGNNNKIYKDSSEYYKSHIAGVVD
KVYTEIFNNEGYEMRKVRVRSERVPMVGDKFCSRHGQKGTNGIQLSASDMMFSENGIQPD
IIINPNAIPSRMTVGQLIETLVGKVAALEGQEIDGTAFSRFDLNDIKARMKALGYEENGF
EYMYNGMTGRRLKNMIFIGPTYYQRLKHMVADKLHSRARGPQTVLTHQPPEGRSRDGGLR
FGEMERDAMISHGIAKFLKERLLETADVYHCYVCDHCGLFAQRMMRKDNKAYPTKKDIFY
CPGCRNHTDISKIRIPYAFKLLIQELLAMNICPRIRTKKSAYD
NT seq
3732 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaatacattaaatagacaagattatatgacaaatgaatcgacaaaaaaagggtcaaat
aaaaaaaagaacacaaaagaaaaaaatcaaacaacagctatatcaaaagaattgagtcgt
actaaagatataaacgatgatgtatcatttagtaacaatatgataagtattgatgatgta
tacagattgatcgacttgtttttcaaacaaaagaatgtaatgtatacacatttatataat
tcatttgataaattattagacgaagaaattccaaattttttaacaaattctagcaatgta
ttttatgaacatgcaacaaaagataaaatttatagatacaagttcaaatatgataatatt
gcaatcaaaccaccatttattgatatggatgacgaaatcatgtttccacaacacgctaga
ttaagaaatttaacatatggatcaaaattagttgcaactattacacaaatacaggaaatt
acagatattgcaactgatactattacaacaaaggtaattggtcaaccagaatacgaatat
ccgattacaacaattccaacaatggttagatccaaatattgttctcttaatcttaaaaaa
ggatatgataaatcagaatgtgagtatgatcctggaggttatttcattgttaatggatca
gaaaaagcggttatgtcattagaacgcatgattgataatagaccgttagtattcatcaaa
aaagattctacttctgtcacatatacagtacaagttaattctaaatctcaacataatgat
ttaatgcaaattattaatattagaatcaagaaagataatacattatctattagagtacca
atattaaatgaaataccagtatttattttaatgagagcacttggaattgaatccgatagt
gatataattaattattgtgtatatgatcataatgatactgatatgattaatatagtaaga
ttatctcttgaaaattcaaagccagaaaaaggagatgttaaaattataacacaaacagat
gcattaaattatctaattaccaagatgagagtaattaaaaagtataatgaaactgataaa
gatattagacaacaagaaaagaaattacatttattgcaattattaagagataacttttta
ccgcatgttgaaggtggatatattgaaaaggcattttatttgggttatatgataaataga
ttgttacaatgttatttgggaagaattaaaacagatgatcgtgatagctatataaataaa
agagttgatttaccaggtcaattaatgtttgaattgtttaaacaattttataaaaagatg
ttaaatgaatgtaataaatttttcaagaaaagaaatcaagatgatgataaccctttgaat
attattaatcagattaaaccaaatattattgaacagggattaaaaacagcattattaact
ggtgcatggggtaaaaagaaaggtgtagctcaaatgttacaaagattaacatatttgcaa
acgttagcatctctgagaagaattaattcaccaacagtagatgcatcaacaaataaattg
actagtcctagacatttacatccttcaattcttggaagtatgtgctttatagagacatct
gaaggtgccaaagtaggacttgtaaagaatttgtcattaataggcaatgttacagttatg
aaaaattctctgtttgatataatgaaagaaaagttagtgtcaaaagtaattaatattcaa
gatgttaaaatatcagatctcaaaaactatacaagagtattattaaatggtgaagtgctt
ggattgaccgataaaccaagaaaattatataatgaattgaaacaaatgaaacattctgga
gaaatagatccattaattggtattgcacatgatattagatctgaaattgaatgtaaagat
ttgagaattaactgtgatacgggtagaacatatcatccagttattagagttattaataat
gaaataacattaactaaagctatgacagatttaatcagtatagatgataaagaaagtgca
accaaaataacaagctggaatcagtttatgatgaaattcccaggcacaatagaatatatt
gatccagatgaacaatataattcattgttagctatgtttccatctgatgttgaagaaatg
agactaaagatggttaagtctgtaaagggattagaaaaattaaaagaacaagattttaag
aatatattaaatagatatgatcaattccattatgttaaatacacacattgtgagattcat
ccatctttgttaattggtgttgttgttgcaaatattccatttgctgaatgtaatcaaggt
cccagaaatattttccagtattcacaagctcgtcaagctatgggtatatatgctacaaac
tggagagatcgtttggatatttcatatattctatatcatcctcaaagaccaattgtcacc
accagatcaatgaaatatgttaatacagaaagaatccctgcaggtgaaaattgtattgta
gcgattgcatgttacagtggttataatcaagaagattctaatataatgaattgttctgct
atagaacatggtttattccgttctacatcagttaagagttataagactaccatacaaaag
aatcaatctacatcacaagatgatatatttataaaacctgatagatcacaagttagtggt
atgagacatggtacatatgataaattgaatgagaaaggttatgctccagaagaaacatgg
cttgaaaacggagatattctgattggtaaagtgtcgccaattcagccatctggtaataat
aataagatatacaaagacagtagtgaatattacaaatcacatatagctggtgttgttgat
aaagtttatacagaaatattcaacaatgaaggttatgaaatgagaaaagttagagttaga
agtgaaagagtacctatggtcggtgacaaattctgctcacgccatggccaaaaaggtact
aatggtattcaattgtctgcatctgatatgatgttttcagaaaatggtatacagcctgat
atcattataaatccaaacgcaattccgagtagaatgactgttggccaattaatagagacc
cttgtaggcaaagtagccgcattagaaggtcaagagatagatggtacagctttcagtaga
tttgatttaaatgatatcaaagccagaatgaaagcgctaggatatgaagaaaatggcttt
gaatatatgtataatggtatgactggtagaagattaaagaatatgatttttattggtcca
acttattaccaaagattaaaacacatggttgctgataaattacacagccgtgctcgtgga
ccacaaacagtactcacacatcaacctcctgaaggtagaagcagagatggtggtttacgt
ttcggtgaaatggaacgtgatgcgatgatttcgcacgggattgctaaattccttaaagag
cgtcttctagagactgcagatgtatatcactgctatgtttgtgatcattgcggactcttc
gctcaaagaatgatgagaaaggataataaagcttatccaacaaagaaagatattttctac
tgcccaggatgcagaaaccatacagatattagcaagattagaattccttatgcattcaaa
ttattaattcaagaattgctggcaatgaacatttgccctagaatcagaactaagaagagt
gcatatgattaa
DBGET
integrated database retrieval system
