Viruses: 80542425
Help
Entry
80542425 CDS
T40000
Symbol
QKU48_gp0730
Name
(RefSeq) Fadolivirus algeromassiliense; 5'-3' exoribonuclease
Virus
3060017
Fadolivirus algeromassiliense
Taxonomy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
VOG
VOG cluster
Motif
Pfam:
XRN_N
XRN_M
DsrC
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
80542425
NCBI-ProteinID:
YP_010803613
RS:
NC_077067
LinkDB
All DBs
Position
NC_077067:complement(843742..846039)
AA seq
765 aa
AA seq
DB search
MGIERFFSSIEQNNITNLDDNFTHKLEKKLDTDILLIDFNSIVHITSSAIIGDLNYILYQ
IINKSYKNNQKVIQLFKTYKIKLNIDDDLNYEDYLELLNTESLNEIILNKVKDFLINILI
NFVESKKLKCLYIAVDGVPHKSKMLEQKKRRYMGTIINDLKSKIFNKYENELMDNKNRYL
FEKNKISWSKIYISPGTPFMEMLNKLLSGSFNKEVKLLCPRLKDYIFSGSDEFGEGEKKI
IDYAYMNNHYNNVTVYSPDSDMTLLCLILSNKVPNIKILRHNQQENNYDIIDIDKLKHNI
FNYIINSIKIDYKQDTVKLDIISVISDIVFILTIFGNDFLPKIESFNVKYDFDKIIDKYI
KMLVENKYSYIIQFNKVNQKSLLQIIRILHYDEGGNLQKTYMASHYQNYDKLKKIIGTNQ
SDFTKDILEFLDKLRKLNEEIKDNNIDISKWIADESNFISKLIKLTKLENQYKPEIDHYE
FIDNYVKYYKKHNQFPEVRVTFRRYSKSLKNPHHTTKLEKSLDHLDPNLKPVKYDEEIYK
LDNMLDEYVKKLNATSLNLGYVAIDPNTYIWKTEKVEKGVMRYYFDFFGINDINIKNPEL
SKIVSEYIEGVVWVFDYYFNLKFNKNKIVNNPDIWYYKHTHAPLLTQIYQYLKNQSNEYL
DKLQNNLHKYKVKESEYFKPQEHLMYVSPINSYKEIIPKEYKNKKINSINIDSIVNEVWN
NNVSDEVDCRGILFLNKCHVNEIHTDIDVMESWKNDQIFIKNLRN
NT seq
2298 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgggaattgaaagattcttcagtagtatagaacagaataatatcaccaatctggatgat
aactttactcataaattagaaaagaaactagatacagatattcttcttatagattttaat
tctatagttcatataactagttccgcaattattggagatttaaattatatactttaccaa
ataatcaataagtcatataaaaataatcaaaaagtaattcagctatttaaaacatataaa
ataaaattaaatatagatgatgatctgaattatgaagactatctagaattactcaatact
gaatcattaaatgagattatattaaataaggtaaaagatttcttgattaacatattgatt
aattttgtagaaagtaaaaagttaaagtgtttatatattgcagtagatggtgttccacat
aaatccaagatgttggaacaaaaaaagagaagatatatgggtactattatcaacgatctc
aaatcaaaaatattcaataaatatgaaaacgaattaatggataataaaaatagatactta
tttgagaaaaataaaatatcatggagtaaaatatatatttcacctggaactccattcatg
gaaatgttaaacaaattattgtcaggatcatttaacaaagaagtaaaattattatgtccc
agattaaaagattatatattttccggttcagatgaatttggtgaaggagaaaagaaaata
atagactatgcatatatgaataatcattataataatgtaactgtctattctccagattct
gatatgacattattgtgtctgatattgagtaataaagtaccaaatattaaaattttaaga
cataatcaacaagaaaataattatgatatcatagatattgacaaattaaaacataatata
tttaattatatcataaattcaattaaaatagattacaaacaagatactgttaaattggat
atcatatcagttatcagcgatattgttttcatattaacaatatttggtaatgatttttta
cctaaaatagaatcatttaatgttaaatatgattttgataagataatagataaatacatt
aagatgttagtagaaaataaatacagttacattatacaattcaataaggttaaccaaaaa
tcattattgcaaatcattagaatattacattatgatgagggtggaaatcttcagaaaact
tatatggcgtctcattatcaaaattatgataaattaaagaagataattggaacaaatcaa
agtgattttactaaagatattttagaatttctagacaagttaaggaaactgaatgaagaa
ataaaagataataatattgatataagtaaatggattgctgacgaaagtaattttatatcc
aaattaattaaacttaccaaattagaaaatcaatataaaccagaaattgatcattatgaa
ttcattgataattatgtgaaatattataaaaaacataatcaatttccagaagttagagtt
acatttagaagatattctaagagtcttaaaaatccacatcatacaacaaaattagaaaaa
tcattagatcacttggatccaaatttaaaaccagtcaaatatgatgaagagatatataaa
ttagataatatgttggatgaatatgtcaaaaaacttaatgcaacctcgctgaatctagga
tatgttgcaattgatcctaatacttatatatggaaaacagaaaaagtagaaaaaggtgtt
atgagatattattttgatttctttggtattaatgatataaatattaaaaatccagaatta
tcaaagatagtgagtgaatacattgaaggtgttgtgtgggtatttgattattattttaat
ctaaaatttaataaaaataaaatagtcaataatccagatatatggtattacaaacataca
cacgctcctttacttacacaaatttatcaatatcttaaaaatcaatcaaatgaatattta
gataaattgcaaaataatttacataaatataaagttaaagaatcagaatattttaaaccg
caggaacatttaatgtatgtctctccaattaattcatacaaagaaattataccaaaagaa
tataaaaataaaaaaataaatagtatcaatattgactcgattgttaatgaggtatggaat
aataatgtttctgatgaagttgactgcagaggaatattatttttgaacaaatgtcatgtc
aatgagattcatacagatattgatgtaatggaaagctggaaaaatgaccagatttttatt
aagaatttaagaaattga
DBGET
integrated database retrieval system