Viruses: 80542547
Help
Entry
80542547 CDS
T40000
Symbol
QKU48_gp0852
Name
(RefSeq) Fadolivirus algeromassiliense; collagen-like protein
Virus
3060017
Fadolivirus algeromassiliense
Taxonomy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
VOG
VOG cluster
Motif
Pfam:
Collagen
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
80542547
NCBI-ProteinID:
YP_010803735
RS:
NC_077067
LinkDB
All DBs
Position
NC_077067:959271..961856
AA seq
861 aa
AA seq
DB search
MEDQNRIIELQKPVKRNIGKTDNSQSRKQILSVVRKGKPLKETDKYDNDHEHDNDYEHDY
EHENKHENKHESSQIHNCCDNDYCEKCSSSSSSSSSSSSSSSSNHHCEQNSSSSSSSDCH
VGPRGPKGDKGDKGDKGDKGDQGEQGIQGPQGPQGPQGLQGLQGPPGQCRCDDSHSSRHS
SSSSSGSSNSSNSSSSSNNCGDCCDTTNECDGSSDHHCHSSSSSSSSTACDSSSSHSHGH
RSCLSCIGCIIIGPTGATGPTGATGEKGDVGEKGDTGDKGDTGDKGDTGATGETGATGET
GATGETGATGEKGDTGETGPKGDTGSKIRCTNQIFKGICVDDFTNQPGEDGQMLLELDTG
LVFTHINGFWVTAAQPIKPFLFLCDGCGLVQVDDTDPIVQNYVELNALHPGDLLIEITTG
LMYELDEQGCWNVSCSVALGPAGPTGPTGYCGPTGATGLGDTGASGDTGATGVRGSKFKC
VDELYRGVCLPKNDTTPGSTAGQLKFDESDGTVYEWNGSDWVQKVIPLPFNFLCDDGVIY
HMAGTPPVDENVPTLEVACDLLPGDVLLEVTTAILFELQEDGTWTEGCNIQLGPIGPTGP
TGDTGATGETGATGETGATGETGATGETGATGETGATGETGATGETGATGETGATGETGA
TGETGATGETGATGETGATGETGATGETGATGETGATGETGATGETGATGETGATGETGA
TGETGATGPTGATDVAITEPLYSATNLVNINGGVTFAYQRKVVVGTVPNQYVNIQMCFTL
TPQSSPQQVAFTIPGVVTTPLSAGIANNQCIGHVTTISSVYSGNDGIVRLLNNATGDIEV
RFDASTTNPYEVYTTVNYTTI
NT seq
2586 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggaagatcaaaataggattattgaattacaaaaacctgttaaacgcaatatagggaaa
actgataattcgcaatcaagaaaacaaattttatcagttgtaagaaaaggaaaaccatta
aaagaaactgataaatatgataatgatcatgaacatgataatgattatgaacatgattat
gaacatgaaaataaacatgaaaataaacatgaatcatcgcaaatacataactgctgtgat
aatgattattgtgaaaaatgctcaagctcatcaagctcatcaagctcatcaagctcatca
agctcatcaaatcatcattgtgaacaaaattcatcaagctcatcaagttcagattgtcat
gttggtcctagaggtcctaaaggtgataaaggcgataaaggtgataagggagataagggt
gaccaaggagaacaaggtatacaaggtccacaaggtccacagggtccacaaggcctacaa
ggtctacaaggtccacctggacaatgtagatgtgacgacagtcatagttctcgacacagt
tcatctagctcatctggttcatctaactcatctaactcatctagctcatctaataattgt
ggagattgttgtgatacaactaatgaatgtgatggttcatctgatcatcattgtcatagt
tcatcatctagctcatcatctaccgcatgtgactcttcaagttcacattctcatggtcat
cgttcatgcttatcatgcattggatgtattataattggtccaactggtgctactggtcca
actggtgctactggagagaaaggtgatgttggtgagaaaggagatactggtgataagggt
gatactggcgataaaggcgacactggtgccactggagagaccggtgccactggagagacc
ggtgccactggagagactggtgctactggagagaaaggtgatactggagaaactggtcca
aaaggtgatactggttcaaagatcagatgcacaaatcaaatatttaaaggtatatgtgta
gatgatttcaccaatcaacctggcgaggatggacaaatgttattagaattagacactggt
ctagtgtttactcatataaatggtttctgggttaccgcagcacaaccaattaaaccattc
ttattcttatgtgatggatgtggacttgtccaagttgacgatactgatccaatagttcaa
aactatgtcgaattaaatgctcttcatcctggagatttacttattgaaataactactggt
ttaatgtatgaattagacgaacaaggttgctggaatgtatcatgcagtgttgctcttggt
cctgctggtccaactggtccaactggctactgtggtccaactggtgctactggtcttggt
gatactggtgcaagtggtgacactggtgcaactggtgttagaggatctaaattcaaatgt
gttgatgaattatatagaggtgtatgcttaccaaagaatgacaccactccaggcagtact
gctggacaattaaaatttgatgaaagtgatggaactgtatatgaatggaatggttctgat
tgggtacaaaaagtaatacctctgccatttaatttcttatgtgatgatggagttatttat
catatggctggaacacccccagttgatgaaaatgttccaacattagaagttgcatgcgat
ttattaccaggtgatgtattgcttgaagtaacaactgctatattatttgaattacaagaa
gatggaacatggactgaaggatgcaatattcaattaggtccaattggtccaactggtcca
actggtgatactggagctaccggcgagactggagctactggcgagactggagccactgga
gaaactggtgccactggtgaaacaggagctacaggtgagacaggtgccactggagagact
ggtgctactggcgaaacaggtgctactggcgaaactggtgctactggtgaaacaggtgct
actggagagacaggtgccacaggagagacaggtgctacaggtgagactggtgctacaggc
gaaacaggtgccacaggtgagacaggtgcaactggcgagacaggagctacaggtgagaca
ggtgctacaggtgagacaggtgccaccggagagactggtgcaactggcgagactggtgct
accggagagacaggtgctacaggtccaactggtgcaaccgatgttgcaattacagaacca
ttatattcagctacaaacctagtaaatataaatggtggagttacattcgcataccagaga
aaggttgttgtaggaacagtaccaaatcaatatgtaaatattcaaatgtgtttcactcta
actcctcaaagttctcctcaacaagtagcctttacaattccaggtgttgtaacaacacct
ctatccgctggaattgcaaacaatcaatgtataggacatgtaacaaccatatcatctgtc
tatagtggaaatgatggtatagttcgtcttcttaataatgcaactggtgatatagaagtt
agatttgacgctagtacaacaaatccttatgaagtgtatacaacagttaattacacaaca
atataa
DBGET
integrated database retrieval system
