Viruses: 80542885
Help
Entry
80542885 CDS
T40000
Symbol
QKU48_gp1190
Name
(RefSeq) Fadolivirus algeromassiliense; putative pectin lyase
Virus
3060017
Fadolivirus algeromassiliense
Taxonomy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
VOG
VOG cluster
Motif
Pfam:
Beta_helix
Peptidase_A3B
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
80542885
NCBI-ProteinID:
YP_010804073
RS:
NC_077067
LinkDB
All DBs
Position
NC_077067:complement(1328979..1330616)
Genome browser
AA seq
545 aa
AA seq
DB search
MKSKKHCCKCIKVKDACIEISCLPYVIEKSGKYCLKKDLTWSGVGVAILIESDDVSLDGN
FHKLSIKKPGSVIVTENISSWDPNIGIKVNGPVINNLNLDDSRFKNITIKNMTIGSKVNT
PNPSPLPSSPSAQSVSTAIRLIGCSHINITNVVLDKTTHGIETQNVDGLRIQDSQFIDNY
GIRFQINPFFVESYGSNIFQYEDSTDLKIERCMFIGRATGDDSLISFGIFGNSDTLRNRD
ILIVDCDFNNSDSAIHPIQGKNIIVDRCNIYCDKNNYRQIQLGSNINLEQTVENFKITNS
NIWASDGNFLIQLVLGNNALFQNLNITYFGAFSFLIGFPDPSIKFNNVVIDNINIQGDYL
AGFFIFNSNNITIENSTITNTNNPIIINPIISNTDDDENLIIAPIKSDFITILNNEITGN
SPIVDGSVGIYLAYTNSSVIKNNRIRSFCTAIQLESNVTDNSDPPITAGPLNNVIEGNTI
VNNADTGQNPGESIIYDGNDNNNLITRFNVNPNPNIFYNNNVSCGFTITTKTKTTIEEYK
LKIKL
NT seq
1638 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaatcgaaaaaacattgttgtaaatgtatcaaagttaaagatgcttgtatagagatt
tcttgtctaccctatgttattgaaaaatcaggtaaatattgcttaaaaaaagatttaacg
tggtctggtgtcggtgttgctattttgattgaaagtgatgatgtaagtttggatggaaat
tttcataaattatcaattaaaaaacctggttcagttatagtaactgaaaatatatcatct
tgggatcctaatattggtatcaaagtaaatggtcctgttataaataatcttaatcttgac
gatagtcgatttaaaaatataacgattaaaaatatgactataggatcgaaagttaataca
cctaatccatcaccattaccatcatctccatccgctcaaagtgtatcaactgcaataaga
ttaattggttgttctcatattaatattacaaatgttgttcttgataaaacaactcatgga
attgaaacacaaaatgttgatggtttaagaattcaagattcccaatttattgataattat
ggtattcgttttcaaataaatccattttttgttgaatcgtatggatcaaatattttccaa
tatgaggactcaactgatttaaagattgaacgttgtatgtttattggccgagctactggt
gatgattcacttatttcattcggtatttttggaaacagtgatacattaagaaatagagat
attttgattgtagattgtgattttaacaattcagatagtgctattcatcctatacaagga
aagaatattattgttgatagatgtaatatttattgtgataaaaataattatcgtcaaatt
cagctaggttctaatattaatttggaacaaacagttgaaaatttcaagataactaattcc
aatatatgggcatctgatggtaattttcttattcagttagttttaggtaataatgcttta
tttcaaaatcttaatataacttattttggcgctttttcatttttaataggattcccagac
ccatcaataaaatttaacaatgttgttattgataatattaatattcagggtgattattta
gctggattttttatatttaattctaataatattaccattgaaaattcaactattactaat
actaataatcctattataattaatcctattataagcaacactgatgatgatgaaaatcta
ataatagcaccaatcaaatctgattttataactattttgaataatgaaattactggtaat
tcacctattgttgatggttctgttggtatttatcttgcttatacaaattcttcagttatt
aaaaataaccgaatacgatcattttgtacggctattcaactggaatccaatgttactgat
aatagcgatcctccaattactgctggacctttaaataatgtaattgaaggaaatacaatt
gtaaataatgctgatactggccagaatccaggtgaatcaattatttatgatggaaacgat
aataataacttgattacacgatttaatgttaatcctaatcccaatatcttttataataat
aatgtttcatgtggttttacaataacaacaaaaacaaaaacaacaattgaagaatataaa
ttaaagattaaattataa
DBGET
integrated database retrieval system
