Viruses: 80544571
Help
Entry
80544571 CDS
T40000
Symbol
QKV45_gp1
Name
(RefSeq) Aksy-Durug Melophagus sigmavirus; putative L protein
KO
K26275
Rhabdoviridae RNA-directed RNA polymerase L [EC:
2.7.7.48
3.6.1.-
2.7.7.88
2.1.1.375
]
Virus
2909205
Aksy-Durug Melophagus sigmavirus
Taxonomy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
VOG
VOG cluster
Motif
Pfam:
Mononeg_RNA_pol
Methyltrans_Mon_2nd
Mononeg_mRNAcap
Methyltrans_Mon_1st
T4_tail_cap
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
80544571
NCBI-ProteinID:
YP_010805655
RS:
NC_077164
LinkDB
All DBs
Position
NC_077164:complement(262..6699)
Genome browser
AA seq
2145 aa
AA seq
DB search
MESVIVDDLLLNAEEPTFIEPTDILETDEFTSLVEDPIMKHLSNVDYSLNSPLIGDEIDD
LIDWLRGYPPVLRWNQSKWGRIKNTLKPFIKGNRLIKTEKFAEWFGLFNLNLNPKITQEF
DDIIRRASKCEIITQPVVHAFIKGWLGKSINTSHIDRNNLKLIERKWGYYFWELHLTTLL
LNCTTIAERKFLEESTKAIFIENPNNHHYFKLKTPNFGHMIICEGFVLFIDHQLLIDRST
ILMMKDTYIARYNTLSALANRLDSLFPSNALSLMTTLYNIGDNILATGGREGYNCIKMLE
PFCNMRMVTLAQNFRPLIPIPNDFRNHLLTTVNEQRAITPFIQDLFDFINSQTDVEMLLT
MYGSFRHWGHPFIDYLQGLEKLYEQTTMHKEIDEVYAEVLASDLAFLVIRSQFRKNKKWP
VDETRVGRGNLLKTYITSNTWPPNNIIHDFGNKWHKLPLIKCFDIPDVIDPSVIYSDKSH
SFTRSELLKHLKKNPCGHIPSHKVLSSLLSNPATNWPIFLQYINDFGIDEDHLIIGLKAK
ERELKIIGRFFALMSWQIRDYFVITEYLIKLHFVPLFKGLTMADDFTTVIGKMLENSSNQ
GESDYKQITIADHIDYTKWNNHQRGKANNPVFKVMGQFLGYPNLITRTHEIFEKSWIYYN
NRGDLLGIDASNNLMNKTEKRVCWLGQQGGLEGLRQKGWSICNLLVLRREGYSLNTKIKV
LAQGDNQVICSLYRIQQFRTEAQLNSNINSIMLNNRMLLNKIADGTRKLGLIINKDETIK
SSEFLNYGKNIIFRGNIRNLETKRWSRVNCVTNDQLPTMANVISTTTSNALTVSHYSDSP
INSMYYYNFIAHFVRIICEFHNPALRGPVQKMLKLQANDLMTKGYLFKTLFLDPSMGGVC
GMSLTRFIVRMFPDPISESLTFLKLVYENILDEQFKILIPQYGYPKIKQEMVPNISKLLE
DPLSLNIARGIDANTMIKEAIKTSLFRSQMEIKNLIIRSAVQHRRETEPAFLSHLRSITP
LFPRFLSEYRAGTYLGITDSMIELFQNSKTIRNQFKRALSIKYDQIIIAAEIYSLKCLIR
QDLKIKIPMWKCSSSHADHLRFLSWGQKVYGATIPHPAELFHIPIQFRGECEPCLGSFPN
RLYISILVPSGFKDLKTIRGSCAAYLGSATLESTSILQSWEKETKIPLLKRATSLRNAIG
WFIDYNSPLAHSILNNLRALTGEDWSQNLEGFKRTGSALHRFNCSRQSNGGYSAQNPSKL
TRMLATTNSLLELGDKNYDFMFQNCILNSLISTGEIHHYDQEHGFYHHHIKCKDCLREID
EIKINCNYAYQHPDVHNLLKDWKPDNASWGVINVTLSIPSRNWNRLTRPQKSFQIAQAQG
FVFGDSVWGSSSLYEDPALFPLTIRNKITPREYMRGLIVGVIRSSALSILHQRGLTSSRS
YHRHIIGHATLTIGKLANNLNLINIWREPQFLRLFASIPHKIPPSYPIITEDITRLGSDY
MKYELSNFGSRYLSEHIGFQPIWIFADIYKSSIVGLIGISDRFMKVLREPHLSKRIREYI
AGLRDLSTQLRSLDDAPENLHTIIQPLLENLILTDQEVRHAVRLIEGETIYFEDNRSLDW
SNEDPGWANFIPVNYLTINNWVNIPELYKDRYQNPLISGLRIAQLATGAHYKVHAILNRL
TLPIQDGLIGGDGSGGLTALFLRKYRTSKAIFNTLCEFSKVNLKGNTPSPPSAILHCLTD
PERCVNLNTCWLEPNDLRLDTTWRNFVKLKTDFQLHLNLLIFDMEVVDIESINLIEDNLV
RWYEILCEHQSVIIFKTYLTRIFSTHNNILNKLAGAFENIELATTATTSSQSSEVYVIFQ
NPTQRGLIRQTTFLDYNDLYENRFLFPYYQTEENEFYRALQIKRQDLIRGIPRELIPEKD
HQLMNLLVSFRIRTDLCYRYSTELTANPTSLNYVILLFSLVTHGIVPYSITYTKKVFIPS
DGVIRSLGTWISGFFIWLGFELNNFPVTKLGQSFINYYFPFYMSKSPPENRYFQSQFKLH
PIPDSISKFIQLDDQMASIGSVIRTLRRIFYNLDLVIDIPTINLLLKEYNPGITINIFDR
NTGLFSLYLNPTIIFESVPPERISILLDNPMIEDDDETENYYIRE
NT seq
6438 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggaatctgtaattgttgatgatctgcttttaaatgctgaagagccaacatttatcgaa
ccgacagacattttagaaacggatgaatttaccagtttagttgaagatccaattatgaaa
catttaagtaatgtggattattccttaaattctcctttaataggagatgaaattgatgac
ttgattgattggttgagaggatatcctcccgttcttcgatggaatcaaagtaagtgggga
agaatcaagaacactctgaaaccatttattaagggaaatagattgataaagacagagaag
tttgcagaatggtttggcctatttaatttgaacctgaacccgaaaattacacaagaattt
gatgatattattcgaagggccagtaaatgtgagataattactcaacccgtagttcatgct
ttcataaagggttggttagggaaatctataaacacctctcacatagacagaaacaatttg
aaattaattgagagaaaatggggatattacttttgggaactgcatcttacaacattgctt
cttaattgcactacaatagccgagaggaaattcttagaggaatctaccaaagcaattttt
attgaaaatccaaacaatcatcattattttaaactcaaaacaccaaacttcggacatatg
atcatttgtgagggatttgtcttattcattgatcatcaattattaattgatagaagcaca
atattaatgatgaaagacacttatatagcaagatataacaccttgtctgcccttgcaaat
cgattagactctctttttccatctaacgccttatcattaatgacaactctttataatatt
ggtgataacattcttgcgactggtggaagagaaggatataactgtattaaaatgctagag
cctttctgcaatatgagaatggttactttagcacaaaattttagaccgttaattccaatc
ccaaatgattttaggaatcatttgttgactacagttaatgaacagagagctattactcct
tttatccaggatctttttgattttattaattctcaaactgatgtagaaatgttattaaca
atgtatggatcttttagacattgggggcatccttttatagactatcttcaaggattagaa
aaactgtatgaacagacaactatgcataaagaaattgatgaggtttatgccgaggtgtta
gcaagtgacttagcatttcttgttatcagatcacaatttaggaaaaataagaaatggcct
gtagatgaaaccagagttggtagaggaaacttattaaagacttacattacatccaataca
tggcctcctaataacattattcacgacttcgggaacaagtggcataaattaccgttaatt
aagtgtttcgatatcccggatgttatagacccatcagtgatttactcagataaaagtcat
tctttcactcgttcggagctattaaaacatcttaaaaagaacccttgtggtcatatcccg
tcgcataaggttttaagttcattattatcaaatccagccaccaattggcctattttcttg
cagtatattaatgattttggaatagatgaagatcacttaattatcggtcttaaagcaaaa
gaaagagaattgaaaataataggaaggttctttgcccttatgtcctggcaaatcagagat
tattttgtaattacagaatatttgatcaaattacattttgtccccttatttaaaggatta
actatggcagatgactttaccaccgtaataggcaaaatgttagaaaattcttcaaatcaa
ggagaatcagattataaacaaattactatagcagatcacatagattacaccaaatggaac
aatcatcaaagaggcaaagcaaataaccctgtatttaaagtcatggggcaatttttagga
tatcctaatttaataacaagaactcatgaaatatttgaaaaatcttggatttattacaat
aacagaggagatttactaggaatcgatgcttcaaataatctaatgaacaaaaccgaaaag
agagtttgttggttagggcaacaaggaggattagaaggactacgtcaaaaagggtggagc
atttgcaatttattagttctcagaagggaaggatactccttgaatacaaaaattaaggtt
ttagcccaaggtgacaatcaggtgatttgttccctataccgaattcaacagttcagaaca
gaagcccaattaaatagtaacataaattccataatgttgaataaccgaatgttgttaaat
aaaattgcagatggaaccaggaagcttgggttaattataaataaagatgagacaattaaa
agttccgaatttttaaattatgggaaaaatataatattcaggggaaatatcagaaattta
gaaaccaaacgttggtcaagagttaattgtgttacaaatgatcaattacctactatggcc
aatgtaatatccacaactactagcaatgccttaacagtatcacactactccgactcaccg
attaattctatgtactattataacttcattgcccattttgtcagaatcatttgtgaattt
cataatcccgctttacgaggtccagttcaaaaaatgttgaaactccaagcaaatgattta
atgacgaagggttacttatttaaaaccttatttttagacccatcaatgggaggagtgtgc
ggaatgtcattaactagattcatagtcagaatgtttcctgacccaatttctgagagtttg
acatttttgaaattagtttacgaaaatatcctagatgaacaatttaaaattttaatccct
caatatggatacccaaaaatcaaacaagagatggtccctaacataagtaaacttttagaa
gatcctttgtccttaaatatagctagaggtatagatgctaatacaatgattaaagaggca
attaagacttccttatttcgctcacaaatggaaataaagaacttgatcattaggtcagca
gttcagcatagacgagaaactgagcctgctttcttaagtcatctgagatcaattacccct
ttgtttcccaggtttctgagtgaatatcgagctgggacttatttgggaattactgattca
atgattgaattatttcaaaattcaaaaacaattagaaatcaattcaaaagagctttgagt
attaaatatgatcagattataatagcagcagaaatatatagtcttaaatgtttgataaga
caagatttaaaaattaaaattccaatgtggaaatgttcctcgtctcatgcagatcattta
agattcttatcatggggacaaaaagtgtacggagctactattcctcatcctgccgaatta
tttcatatcccgatacaatttmgaggwgagtgtgaaccatgtcttggttcattcccaaac
cgtttatatatttcgattttggttccgtctgggttcaaggatttaaaaacrattagagga
tcatgtgcagcttacttaggatcagcaacattagagtctaccagtattctacagtcatgg
garaaagaaacaaaratccctttattaaagagagctacatcattaagaaatgcaataggg
tggtttattgattayaattctcctcttgcacattctattttaaacaatcttagggcatta
acgggggaagaytggtctcaaaatcttgaaggattyaagagaacgggatcagcattacac
agatttaattgttccagacaaagtaatggtggatattcagctcaaaayccctctaaatta
actcgaatgttagctacaacaaatagtcttttggaactgggtgataaaaattatgactty
atgtttcaaaattgtatcttaaatagcttgatatccaccggagaaattcatcattatgat
caagaacatgggttttaycatcatcacatcaaatgtaaagactgtttaagagaaatagat
gaaatyaaaatcaattgcaattatgcttatcaacatccagacgtacacaatttattaaar
gattggaaacctgataatgcatcatggggtgtgattaatgtaaccttatccatcccctca
agaaactggaatagattaacaagacctcagaaatcattccagattgcacaagctcaagga
tttgtatttggtgattctgtttggggatctagttccctttatgaagatccagcattattt
ccactaacaatcagaaataaaattacacctagagaatatatgagagggctaatagttgga
gttataaggagtagcgctttatctatattacatcaacgaggattgacaagctcgagatct
tatcatagacatataatcggacatgcaactttaactatcggtaaattagccaataattta
aatttaatcaatatttggagagaacctcagtttttgaggttatttgcttcaatacctcat
aaaattcctccatcttatccaataattacagaagatataacccgattaggatcagactac
atgaaatatgaactttctaattttggatctaggtacctttcagaacatataggatttcaa
ccaatatggatatttgcagatatttataaatcctccatagtaggccttataggaatttcg
gatagatttatgaaagtgttaagagaacctcatttgtcaaaacgtattagagagtatatt
gcaggattgagagatttgtctacacaactaagaagtctagatgatgctccagaaaacttg
catacaataattcaacctcttttagaaaatcttattttgaccgaccaagaggtcagacat
gcagtcagactaatagaaggagaaactatctatttcgaagataatcgtagtttagactgg
tctaatgaggatccaggatgggcaaactttataccggtcaattatttaacaataaataat
tgggtaaatattcccgaattatacaaggatcgatatcaaaatcccttaatatccggatta
agaattgcacaattagcaactggagctcattacaaagttcatgctatattaaaccgattg
actcttccaattcaggatggattgattggaggtgatggatcaggtgggttaactgcttta
tttttaaggaaatatcgcacttccaaagcaatttttaatacactttgcgaattttcgaaa
gttaacttaaaggggaacactccatctcccccatctgcaatactacactgtttaacagac
cctgaaagatgtgttaatttgaatacttgctggcttgaaccaaatgatttaaggcttgat
accacatggagaaatttcgtaaaattaaaaactgacttccaattgcatttgaatttacta
atctttgatatggaagtcgttgatatcgagtctatcaacttaatcgaagataacttagtt
agatggtatgagatattgtgtgaacatcaatctgtaatcatctttaaaacttatttaact
agaatcttttcaacccacaacaatattttaaacaaactagctggagcgtttgaaaatatt
gaattggcaactactgcaacaacctcgtcccaatcttctgaagtttatgtaatatttcaa
aatccaacacaaagaggattaatcagacaaacaacattcttggattataatgacttatat
gaaaatagatttttattcccatattatcaaacagaagaaaacgaattttacagagcccta
caaataaaaagacaagatttaataaggggtatacctcgtgaactaattccggaaaaggat
caccaattgatgaacttattagtttcatttagaataagaactgatttatgttatagatac
tcaactgagttaactgcaaaccctacatctttaaattatgttattttattattttcacta
gttactcatggaattgttccctacagcattacttacactaaaaaagtatttataccatct
gatggagttatacgatcattgggtacttggatatctgggttttttatttggttaggattt
gaattaaataacttccctgttacaaaattaggacaatcattcatcaattattattttccc
ttttatatgagcaaatccccacctgaaaatagatatttccaatctcaattcaaattacac
cccataccagattctatttccaaatttattcaacttgatgatcaaatggcaagtattgga
tcagtcataagaaccctaagaagaatcttttataaccttgatttagtaattgatattcca
acaattaatctattattgaaagaatacaatcctggaatcactataaatatctttgatcgt
aatacaggactattttctctatatttaaaccccactataatctttgagtcagttccgcct
gaaagaatttccatattgttagataaccccatgatagaagacgatgatgaaactgaaaat
tattacattagagaataa
DBGET
integrated database retrieval system
