Viruses: 80554617
Help
Entry
80554617 CDS
T40000
Symbol
QK879_sLgp1
Name
(RefSeq) Ness Ziona virus; L protein
KO
K25345
Peribunyaviridae RNA-directed RNA polymerase L [EC:
2.7.7.48
3.1.-.-]
Virus
2544873
Ness Ziona virus
Taxonomy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
VOG
VOG cluster
Motif
Pfam:
Bunya_RdRp
L_thumb_ring_vir
L_protein_N
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
80554617
NCBI-ProteinID:
YP_010840909
RS:
NC_079117
UniProt:
A0A481U7T3
LinkDB
All DBs
Position
NC_079117:38..6814
Genome browser
AA seq
2258 aa
AA seq
DB search
MDQNQIRQFRARIRAVTEPTLARDILSDMYVARHNQFAIEFCNANSIEYRNDVSATEIFL
AVYPEKDPIIARHIKYTPDNFVFNNGRLYIIDFKVSTDNQTSNEAFQKYTNAFSELFTDI
DMEVVIIRSNPIDMTLSINNCDFRNTYSAIPEGLNYNWFFDLRRFLLDKFRDNDEFQDMI
DHGDFTLTAPWTDEDTPELYSHPIFVEFIDSLDKKYEDLFYRSLNFDAYSSRHDRWNSNL
VYIKDKTQDEYQLYIKNQAKLIFEQSEYPKPSADEINNGWELMTERIKSERELINEPSKA
KPSVHMIWSPPDNKPNTNIDKILFLSKELQSIKSTEQYSENFRALGILFDFSSNINRYIE
FVEMLKFKARQEAKQVSNRKIEPLKIKECTVLWEQQFKYEILDNDKMSRSNFYKNFLGIG
KHKNFKNRSEDDLELDKPKILDFNDSNIIFHAKLAYKKTKVLLYQDNNLKKIGAFLDEYM
DKIIDSDQNMGNFITKLSKTNFWSAVNDFSVLMKNMLAVSQYNKFNSFRVVTCANNNLFG
IVFPSSNIQTKKATIIFITICFHKDESNVFDYGAKYATFKTSNGYLTVSKGIRLDKERCQ
RIISSPGLFLLTSLLLYSGNDTLCDSDIMAFSFMTSLSITKSLLSLTEPSRFMIMNSLAI
SSNVKEYIQEKFSPYTKTLFSVYMCNLIKNGCIQANKQREKINMRNIFLTDNEITQKGVE
ENRDLESIWFPGRVNLKEYINQVYLPFYFNSKGLHEKHHVMIDLAKTVLEIEEDQRINIP
KIWSESPEKQTVNLPVLLHSLAKNLINDTSRHKHLRHRVESRNNFKRSITTISTFTSSKS
CIKIGDFSAEKEKQAKKRVKNYEKMKTKHRIANPILENDFLEECVNHADYTDLKRCIPEF
IDCKSTKVFDELYIKIKNQEIKENTITEIMKVMKNHKQFYFAFFNKGQKTAKDREIFVGE
YEAKMCLYCIERIAKERCKLNPEEMISEPGDSKLKKLEQKAEDELRFIIENSDTISDPIE
LEKALQSKRSITKLEINADMSKWSAQDVLYKYFWLFALDPILYPAEKKRIIFFLCNYMLK
KLILPDELMLNILDQRRLRPDDIIYRMTNGFQTNAVSIKRNWLQGNLNYTSSYLHSCSMD
VFRDINHKISELLEGKVLVNNFVHSDDNQTSITMIQDKVPKDNIIASEITIFQNVCLSFG
NQPNMKKTYITNCIKEFVSLFSIQGEPFSIYGRFILTCVGDCAYIGPYEDLSSRISSTQS
AIKHGCPPSIAWASIALNSWMTYNTYNMLNNQSNDPGQLGITRSNLPLELGGIYKGDLST
LCLVGMDCQNITFLTGLLQKYSSLNLKRSNVLAQIAEVESWETNNLEFYEIFYIKFLRYL
YLESSITNDDTMGETSDMRSRSILTPRKFTTSNSLNRLESYKDYQCIAKDQEMTEELYLY
LLQNPELLVTKGENLKDFIKTIQYRYSSKKFKESLSIQNPVQLLIEQILFSNKPTIDYKN
ISEKFYTNEDLEDDEDFLIHGKLTIIQALKQLQNDLEMMTMSKEDIKIVLNFCIANDPLM
ISISNGILLRVKTIAQKRLGLTTNYMPEFRNLKLIHNSPAVVLRAYLHGLEIIDRDQDEL
RRDVMHLQDFIDKSHIKNEMEERILAYYNTHDDESNAFRIRETTRFLQVCYDYIKSTEHK
VKLFILPTRTYTANDFIAAIIGNLQSDKEWYIIQFLKPLTGANYKGQIAKNPDFMHLIAD
ECFRLMAHFADSFVTEYSRVDFLKQLITDFTYKCIPIKELYELIKRNEQRHKFLPIMYHM
GDLNQNDISRFDALKSNERITWNDWQLSQKMNIGKIDLTITGYNKKIALYGQDNKLLEVI
LFIKKDSYDQIPNLSRKLLNSRHNLCLEKMQSIKVTDIREWYLCYQKIRRNQFDYVVLRG
KQIQLRNDQIEMSYHRSKNYLIPIAYVGIGRFEDQEILSLDSLIKINSDRTSLSRIKMNE
VDNAIVKRANIQKMAYFDGPEIVGSGINLTNLMKSKRLLTLDKNTLESINMLDLIEIFKC
DEVNENITFNILSEEELIETETREIDAFPAFSVSFNVKSKGKLTYKSIIMKKIDQACNDF
ESAFDFFNEGFCSKKTLGIIKTIIGIINILETNEWSTKLSSAIHISLFRRGFDSKYHTAR
IPNQFYDKIIKNTTHSIVWGEIVEESLGLDANLDWLKLLKFVNALPKIVNPLWSDIFEHF
KTKTKSLIMEKIKQSQVSELETFGEELADDDGLSINQL
NT seq
6777 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggatcaaaatcaaatacgacaattccgagcacgtattcgtgcagtaactgagcctact
ttagcaagagatatactctcagacatgtatgtagcaagacacaatcaatttgccattgag
ttttgcaatgcaaattctatagaatataggaatgatgtatcagcaactgaaatcttccta
gcagtatacccagaaaaagaccccattattgctagacatataaaatacactcctgacaat
tttgtattcaataatggacgcctttacataatagattttaaagtgtctacagataaccaa
acatcaaatgaagcattccaaaagtacacaaatgcattcagtgagctattcacagatatt
gacatggaagttgttatcattagatcaaacccaatagacatgacattatcaatcaataat
tgcgactttagaaatacttattctgcaatcccagaaggtctaaattataactggttcttt
gatttaagacgttttctattggacaaatttagagataatgatgaatttcaagatatgata
gatcatggtgattttactcttactgcaccttggactgacgaagacacaccagaactctat
tctcatccaatatttgtagaattcatagattctttagacaaaaaatatgaagatctattt
tataggtctttaaattttgatgcttatagctctagacatgatcgttggaattctaattta
gtgtatataaaggataaaacacaagatgaataccaattgtatatcaaaaatcaagcaaaa
ttaatatttgagcaatcagaataccctaaaccatcagctgatgaaattaataatggctgg
gaattaatgacagagcgtattaagagtgagagagaactaataaatgaaccaagtaaggca
aaaccatctgtacatatgatatggtcacctcctgataacaaaccaaatactaatattgat
aaaatactgttcttatcaaaagaattgcagagcattaaaagtacagaacagtattctgaa
aatttcagagctttgggaatcctatttgactttagttctaacattaataggtatattgaa
tttgttgaaatgcttaaatttaaggctagacaagaggcaaagcaagtctcaaatagaaag
atagaacctttaaaaataaaagaatgtactgtgttatgggaacaacaatttaaatatgaa
atattagataatgataaaatgtcaagatcaaacttttataagaatttcttaggtattgga
aaacataaaaactttaaaaatagaagtgaagatgatttggagttggacaaacctaaaatc
ttggatttcaatgattcaaacattatatttcatgcaaagcttgcctataagaaaacaaaa
gtccttttatatcaagataataatttgaagaaaataggagcattcttagatgagtatatg
gataaaataattgactcagatcaaaatatgggtaattttataactaagcttagcaagact
aatttttggtctgcagttaatgatttttcagtattgatgaaaaacatgctagcagtctct
caatataacaaattcaattcatttagagtagtaacatgtgctaataataatttgtttgga
attgttttcccatctagcaacatacaaacaaaaaaagctactataatttttatcactata
tgctttcataaagatgaatctaatgtttttgattatggtgcaaaatatgccacatttaaa
acaagcaatggttatttaacagtgtcaaaaggtataaggttagacaaagaaagatgtcaa
cggataatttctagcccaggattatttctattaacatccctactcctatattctgggaat
gatacactatgtgattcagacattatggcttttagttttatgacatcattgtctataact
aaatcattgttatccttgacagagccttctagattcatgattatgaactcattagctata
tcctctaatgttaaagaatatatacaagaaaagttttcaccatatacaaaaacattattt
tctgtatacatgtgtaatttaatcaaaaatgggtgtattcaagcaaacaaacagcgggag
aaaatcaatatgcggaacatattccttacagataacgagataacacaaaaaggtgtggaa
gaaaatagggacttagaatcaatatggttcccagggagagtaaatcttaaagagtatatc
aatcaagtatatctaccattttatttcaattctaaaggtctccatgagaaacatcatgtc
atgatagatttagcaaagacggttttagaaatagaggaagatcaaagaataaacattcca
aaaatatggtcggaatctcctgaaaaacaaactgtaaacttaccagtgctattacattca
ctagcgaaaaatttaatcaatgacacttcaagacataaacacttaagacatagagttgaa
tcaagaaataattttaaaagatcaataacaactatatcaacatttacaagctctaaatct
tgcataaaaattggagactttagtgctgaaaaagaaaaacaagcaaagaaaagggtcaaa
aattatgaaaagatgaaaactaaacatagaatagcaaatcctatattagaaaatgacttc
cttgaagaatgtgtaaatcatgcagattatacagatttaaaacgttgtataccagaattt
attgattgtaagtcaacaaaagtatttgatgaattatatataaaaattaaaaaccaagaa
attaaagaaaatacaatcacagaaataatgaaagtaatgaaaaatcataaacagttttat
tttgccttttttaataaaggccaaaagacagccaaagacagggaaatatttgttggtgaa
tatgaagcaaagatgtgtctatactgtatagaaagaatagcaaaagaacgatgcaaatta
aatcctgaagaaatgatttcagaaccaggggatagtaagcttaaaaaattagaacagaaa
gctgaagatgagttaagattcataatagaaaattctgacacaatatctgaccctatagaa
ttagaaaaagctttgcaatcaaaaaggtctataacaaaattagagattaatgcagatatg
tctaaatggagtgcacaagatgtgttatataaatatttttggttatttgcattagaccca
attctatatccagctgagaaaaaaagaataatattcttcctttgcaattatatgttaaag
aaattaatcttaccagatgaacttatgcttaatattcttgatcagagacggctgaggcca
gatgatataatatatagaatgacaaatggatttcaaaccaatgcagtgagtataaaaagg
aactggctgcaaggtaatttaaattacaccagcagctacttgcatagttgttcaatggat
gtttttagagatattaatcataaaatatcagaactcctggaagggaaagttctagtcaac
aattttgtacattctgacgacaatcaaacatcaataacaatgattcaagataaggtacct
aaagacaatataattgcaagtgaaatcacaatttttcaaaatgtttgcctatcatttggt
aatcaaccaaatatgaaaaaaacatacattactaattgtatcaaggaatttgtctcctta
ttctcaatccaaggggaaccatttagtatatatggtagattcatcttaacttgtgttggt
gattgtgcttatattggtccatatgaagatttgtcatctagaatttcatcaacacaatca
gcaataaagcatggttgcccaccaagcattgcttgggccagtatcgctctaaactcatgg
atgacttataatacatacaatatgctcaataatcaatcaaatgaccctggacaattagga
attactagatcaaatcttccattagaattagggggcatatataaaggagatttatcaaca
ttgtgtcttgttggaatggattgccagaatatcactttcttaacaggattattacaaaaa
tatagctctttaaatttaaaaagatctaatgtattggcacaaattgctgaagtagaatcc
tgggaaacaaataatttggaattttatgaaatattttatataaaattcctgagatatctg
tatctagagtcatctataacaaatgatgacacgatgggagaaacatctgatatgagatca
agatctatattgacaccacggaaattcactacttctaattctttaaatcgattagaatca
tataaagactatcaatgtatagcaaaagatcaagaaatgacagaagaattatatttatat
ttattgcaaaacccagagttattagtgactaaaggagaaaatttaaaagattttattaaa
accatacaatatagatatagctctaaaaaatttaaagaatcattatctatacaaaatcct
gtccaattattgatagaacaaatactattttcaaataagcctacaattgattataaaaat
atatcagagaaattttatactaacgaagatttagaagatgatgaagatttccttatacat
ggaaaattaacaatcatacaggcattgaagcaattacaaaatgatttagagatgatgaca
atgtcaaaagaagatattaaaatagtactaaacttctgtattgctaatgatccactaatg
atatctatttcaaatggtatcttattacgtgttaaaactatagcacaaaaacgattaggt
ctaacaactaattacatgccagaatttaggaatctaaagttaatacataattccccagct
gttgttttaagagcatatctacatggtttagaaattatagatcgagaccaagatgaatta
agaagagatgtaatgcacttgcaagactttatagataaatcacatataaaaaatgagatg
gaagaaagaatattagcatattataatactcatgatgatgaatctaatgctttccgaata
agagaaaccacaagatttttacaagtctgttatgattatatcaaatcaacagaacataaa
gtaaagttatttatattgccaacaagaacatatacagcaaatgatttcattgcggcaata
ataggcaacctacagagtgacaaagaatggtatataatacaatttctaaagcccttgact
ggtgcaaattataagggacaaattgctaaaaatccagatttcatgcatttaatagcagac
gaatgctttagactcatggcacattttgctgattcttttgtaacagaatatagtagagta
gatttcttgaaacagttgatcactgattttacatacaagtgtattcctataaaagaatta
tatgaattaatcaagaggaatgaacagagacataagtttttaccaattatgtatcatatg
ggggatctaaatcaaaatgatataagtagatttgatgctctgaagtcgaatgaaaggatc
acatggaacgactggcaattatctcaaaagatgaatataggtaagatagatttaactata
acaggatacaataaaaaaatagcattatatggtcaagataacaagttattggaggtcatc
ctttttataaaaaaagactcttatgaccagataccaaatctctcaagaaaattattaaat
tctagacataatctctgtttagagaaaatgcaatcaatcaaagttacagatattagagaa
tggtatctatgttatcaaaaaattagaagaaaccagtttgactatgtagtcttacgaggg
aaacagatacaattacgcaatgatcaaattgaaatgtcttatcacagatcaaaaaattat
ttaatcccaatagcatatgttggaatagggagatttgaagaccaagaaattttaagtctt
gattctctaataaaaataaattctgatagaacatcactaagtagaataaaaatgaatgaa
gttgacaatgctattgtaaaaagagcaaatatccaaaagatggcctactttgatggtcct
gagattgtaggttcaggaataaatctgactaatttaatgaagtcaaagcgactattaaca
ttagacaaaaatactttagagtcgataaatatgctagatttaattgaaatattcaaatgt
gatgaagttaatgaaaacataacgtttaatatattatcagaagaagaattaatagaaact
gaaactcgagagatagatgcatttccagcattttctgtctcttttaatgttaagagcaaa
ggaaagttgacttataaaagtataataatgaaaaaaatagaccaagcatgtaacgacttt
gaatctgcatttgacttttttaatgaagggttttgtagcaagaaaactttaggaattata
aaaactattataggtatcataaatatattggagacaaatgaatggagtactaaattaagt
tcagcaatacatatttcgttatttaggcgtggatttgactctaaataccacactgcaaga
ataccaaatcaattctatgataaaataataaaaaacacaacacactcaatagtttggggt
gagattgtcgaagagtcattaggattagatgcaaatttagactggttaaaattattaaaa
tttgtcaatgcattaccaaagattgtaaatccgctatggagtgatatctttgaacacttt
aaaactaaaacaaaatctttaataatggaaaaaatcaagcaaagtcaagtatctgaatta
gaaacatttggagaagaattagcagatgacgatggattatctatcaatcaactttaa
DBGET
integrated database retrieval system