Viruses: 80557843
Help
Entry
80557843 CDS
T40000
Symbol
QLL95_gp0149
Name
(RefSeq) Cotonvirus japonicus; ankyrin repeat protein
Virus
2811091
Cotonvirus japonicus
Taxonomy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
VOG
VOG cluster
Motif
Pfam:
Ank
Ank_2
Ank_4
Ank_3
Ank_5
ANK_LRRK2
DsrE
LAGLIDADG_WhiA
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
80557843
NCBI-ProteinID:
YP_010841246
RS:
NC_079139
LinkDB
All DBs
Position
NC_079139:complement(153797..155731)
Genome browser
AA seq
644 aa
AA seq
DB search
MNNFNNKYDYNREYYYLPEYKCHHFTKLMFLIINEKKIKNGHQKIIRFLKNKNNIKKINH
KNSDGLTALMISCLHSRNHTKTVKLLLDHGANIEVLDNNERTALLYACKYSRNRSSLATV
KLLLDHGADINPKNVKILTTLMLACRYSGTSSTIETVKLLLDHGANINPKNLKELTPLML
ACRYSGSSSTIETVELLLDRGADINLENDYKLTALMCACIKSRKKSTIATIELLLNRGAN
IEAQDEDGLTPLMLSCRCSGTSSTIETVKLLLNRGANIETRDEDGWTPLMTTCYYKNGTI
EVIKLLLDHGADINAHSNSNRTSLIIAIKNFDKPKNIEVIKLLLDHGANIDARDGNEWTA
LMIACKYSGALSTVETVKLLLDHGANIEAQNKSGWTPLIISCINYKTSNVISTVELLLNY
GADINHQTIKGNNLITIILDKINEHTICTIQYIMILLLKRGININIKNNEEYTCLDLIFE
KYSSEKYDILKLLLQYNINLNLFHHKSGILLWISKNIADKNRLKLLQLLLEYGVNYDIMD
KKGRIFTNFISDDEIIPCMKIIEARTSARDNMNVVIKSIPEIIPEHIYRIDSFCIQLMNL
KWNIHEYNSRQELPESYQKYYDYFNAVDMEDFRDKINDASKYVY
NT seq
1935 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaataattttaataataaatatgattataatcgagaatattattatttacccgaatat
aaatgtcatcattttactaaacttatgttcttaataataaacgaaaaaaaaattaaaaac
ggacatcaaaaaataattcgatttttgaaaaataaaaataacataaaaaaaataaatcac
aaaaatagtgacggattaactgctttaatgataagttgtttacattctagaaatcataca
aaaaccgtgaaattattattagatcatggtgccaatatcgaagtacttgataataatgaa
cggactgctttattatatgcgtgcaaatattccagaaatagaagtagtttggcgactgtc
aaattattattagatcatggtgctgatattaatccaaaaaatgtaaaaattttaactaca
ttaatgctagcttgtcgatattctggaacatcaagtactattgaaactgtcaaattatta
ttagatcatggtgctaatattaatccaaaaaatctaaaagaattaactccattaatgtta
gcttgtcgatattcaggaagttcaagtactattgaaactgttgaattattactagatcgt
ggtgctgatattaatttagaaaatgattataaattgacagccctaatgtgtgcatgtatc
aaatctagaaaaaaaagtacaatagctacaattgaattattattaaatcgcggtgctaat
atcgaagcacaagatgaagatggattaaccccattaatgttatcttgtcgttgttcagga
acatcgagcacaattgaaactgtcaaattattattaaatcgcggtgctaatatcgaaaca
cgtgatgaagatggatggactccattaatgacaacatgttattataaaaatggtacaata
gaagtaattaaattattattagatcacggtgccgatattaatgcacattctaatagtaat
cgtacttctttaataatagctataaaaaatttcgacaaaccaaaaaatatcgaagtcatt
aaattattattagatcatggtgctaatattgatgcacgtgatggaaatgaatggactgct
ttaatgattgcatgtaaatattccggagcattaagtacggttgaaacagttaaattatta
ttagatcatggtgctaatatcgaagcacaaaacaaaagtgggtggacccctttaataata
tcatgcatcaattataaaacaagtaatgtaatttcgactgttgaattattgttaaattat
ggtgcagatatcaatcaccaaactattaagggtaataatttgattacaattatattagat
aaaattaacgaacatacaatatgcacaattcaatatattatgatattattattaaaaaga
ggtattaatattaatatcaaaaataatgaagaatatacatgtttagatttaattttcgaa
aagtattcatccgaaaaatatgacatattaaaattattattacagtataatataaatctt
aacctgtttcatcataaatcgggcatattattatggatctctaaaaatattgctgataaa
aatagattaaaattattacaattattgcttgaatatggtgtgaattatgatattatggac
aaaaaaggtcgtatttttacaaattttattagtgatgatgaaattataccttgtatgaaa
attattgaagcaagaacatcagcaagagataacatgaatgttgtcattaaatcaatacct
gaaataattcctgaacacatttatcgtatagatagtttttgtattcaattaatgaattta
aaatggaacatacatgagtataattcaagacaagaattacctgaatcgtaccaaaaatat
tatgattattttaatgctgttgatatggaagattttcgagataaaattaatgatgctagt
aaatatgtctattaa
DBGET
integrated database retrieval system
