Viruses: 80558027
Help
Entry
80558027 CDS
T40000
Symbol
QLL95_gp1301
Name
(RefSeq) Cotonvirus japonicus; putative ankyrin repeat protein
Virus
2811091
Cotonvirus japonicus
Taxonomy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
VOG
VOG cluster
Motif
Pfam:
Ank_2
Ank
Ank_4
Ank_5
Ank_3
ARM_Cnot1
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
80558027
NCBI-ProteinID:
YP_010841430
RS:
NC_079139
LinkDB
All DBs
Position
NC_079139:complement(347080..350628)
Genome browser
AA seq
1182 aa
AA seq
DB search
MESTINTETKNINTETKNIISDTENINTETKNIICDTENITQSIDIKYKSDAKYECCPDV
KCGKFTLLMFLVAHYKQIPDALLKIKAILINSKTRINAKNKLGWTALMIASRNSSTTCSD
EVVELLLEYGANPDKQNIDGDTALILACQYSRTDSSIKTVNLLLDYGADINITDDNGWTA
LITTTRFINTTSDINVIDILMEKGANINDTTNKKWSSIMLASRYINDNIAVIKNLLKYKP
HLNIKNTNGWSCLMLAVNYAKTDEAINIIQKLLNDGADPRICTKNGKSCLVLAFENDENT
KIMKLLIDSGANINYLYLDDECDYVSKCYNNINHTLSINTDSKAIGKYNGHTLLMTSVLY
ADANNCETIRMLLSNGADPNFCNNYGITALMLAIIKKKISCEVLRMLLEHENNCDPNCCD
KYGNTALSIAMTYYPKKCSLEVINILLDFGADPNPFFNNTTSKIFPSDLLDRNVIWIAYS
HYKLNGTMDTINLLLRYGVNINIKNKQGNTILMQTINDSVNDTNYELVSILIAYDSNFSI
SNSDNESVLHIAVKNNNIKILKLLIDSEVYINTRNDNGMTCLVYYLSLIDKDRKYNIEII
ELLLKYKIDLDTECYDNNKNALTMICSSLLTDENNFNLIKLLIDCGANINYQDADGDTPL
MILVGVLIHYLNDDENQYIAGYLTNIFIDDFNDSDDSDKIISDTYFNKTCNIIYETIKLL
LERGADPNIKNSVVTSVVFDLLEISEVSIILKYIELFYKYGLNINITNAGGDTLLHEISR
NENLTIVKFLCEMGIDVNVQNSIGETALFVAIQCSSFSIIIELLNNGADPNIVNDLGISI
LMEIMKPYCIDNDDENENDDSVIEIINLLIQKNANVNYITNETCVLEYAININNYLSPII
VEDLLKNGADPNLKYSNHTVLHYLIHKGYYFYKKTITQLLFKYGMNPNICDIKGDSILMT
AIKMQEEIEIINIFLDYKIDPNIINNKGNTALILAIRSIINYTPYCSDILIKMLIEYGAN
LNIQNSLGETSLMILFEMIKSINLTFSKSSKENIIKRLFGSDGVISYLLKRSNYKLLNNS
GKTIYSYVPNDIMLEFMEAVETSIIDKHIKNNLHESIISLNTQIIMRPGSIRTRLTALQW
YSDREFSFEEIRDHDKDLIDYFGIYDTESLRMKIQDNLKYIN
NT seq
3549 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggaatcgacaattaatacagaaaccaaaaatattaatactgaaactaaaaatatcatt
agtgatactgaaaatattaatactgaaaccaaaaatatcatttgtgataccgaaaatatc
acacaaagtattgatattaaatataaatctgacgcaaaatatgaatgttgtcctgatgtt
aaatgtggaaaatttacattactaatgtttttagttgctcattataaacaaatacctgat
gctttacttaaaattaaagcaatattaattaattcaaaaacaagaatcaatgctaaaaat
aaattgggatggactgcactcatgatagcatcaagaaattcttccacaacgtgtagtgat
gaagttgttgaattattgttagaatatggtgctaatccagataaacaaaatatagatgga
gatacagctttaattttagcttgtcaatattctcgaacagatagctcaattaaaacggta
aatttattacttgattatggagctgatattaatattactgatgataatggttggactgct
cttattacaactactagatttattaataccacaagtgatattaatgtaattgatatattg
atggaaaaaggggctaatattaatgatacaacaaataaaaaatggtcttctattatgtta
gcatcacgttatattaatgataatattgctgtcattaaaaatttactaaaatataaacca
catttaaatatcaaaaatacaaacggatggtcatgtttaatgttagcagtaaattacgca
aaaaccgatgaagcaattaatattatacaaaaactcttaaatgatggtgctgatccaaga
atatgtaccaaaaatggtaaatcatgtctagtacttgcatttgaaaatgatgaaaataca
aaaataatgaaattattgattgattctggtgctaatataaattatttatatttggatgat
gaatgtgattatgtgtcaaaatgttataataatattaatcatactttatcaatcaatact
gattctaaagccatcggaaaatacaatggtcatacattgttaatgacatcagttttatat
gctgatgccaataattgtgaaactattcgtatgttattatcgaatggagcggatcctaat
ttttgtaataattatggaataactgctttaatgttggcaattatcaaaaaaaaaattagt
tgtgaagtacttagaatgttattggagcatgaaaataattgtgatcctaattgttgtgat
aaatatggcaatactgcattgagtattgccatgacatattatcccaaaaaatgtagtttg
gaagtcataaacattttacttgattttggtgctgatccgaatcctttttttaataataca
acaagtaaaatatttccatcagatttattggatagaaatgttatttggatagcatattca
cattataaattgaatggaaccatggacacaataaatttattactaagatatggtgttaat
attaatattaaaaataaacaaggaaatacaattttaatgcaaacaattaatgactcagta
aatgatactaattatgaactagtatcaatattaattgcatatgattcaaatttcagtatt
tccaatagtgataatgaatctgttttacacattgcagtaaaaaataataacattaaaatt
ttgaaactattgatagatagtgaagtatatattaatactcgtaatgataatggtatgact
tgtttggtatattatttatctctcattgataaggatcgtaaatataatattgaaattatt
gaattattactaaaatataaaatagatcttgacacagaatgttatgacaataataaaaat
gcactaacaatgatatgttcatcattattgaccgatgaaaataattttaatttaattaaa
cttttaatagattgcggtgctaatataaattatcaagatgctgatggagacacaccactt
atgattttagtgggcgtgttaattcattatttaaatgacgatgaaaatcaatatatcgca
ggatatttaactaatatatttattgatgattttaatgattctgatgactctgataaaata
atatctgacacttatttcaataaaacatgtaatattatttatgaaactataaaattatta
ttagaaagaggagccgatcctaatattaaaaattccgtggtcacctcggtagtttttgac
cttttagaaatttcagaagtttccataatattgaaatatattgaactattttacaaatac
gggttgaatattaatataacaaatgctggtggtgacactttgctccacgaaatatctcgt
aatgaaaatttaacaattgtgaaatttttatgtgaaatggggattgatgttaatgttcaa
aattctataggcgaaactgctttatttgtggcaatacaatgtagttctttttcaattata
attgaattattaaataatggagcagatccaaatatagtaaatgatttaggtatttccatt
ctgatggaaataatgaaaccgtattgtattgataatgatgatgaaaatgaaaatgatgat
tccgttatagaaattattaatttacttattcaaaaaaatgcaaatgtaaattatataaca
aatgaaacatgtgttcttgaatatgccattaatataaataattacctgagtcctattatt
gttgaagatttattaaaaaatggcgctgatcctaatctcaaatacagtaatcatactgta
ttacattatttaatacataaaggatattatttttacaaaaaaacaataacgcaattactt
tttaaatatggtatgaatcctaatatttgtgacattaaaggtgatagtattcttatgaca
gctattaaaatgcaagaagaaattgaaattattaatatattcttagattacaaaatagat
cctaacattataaacaacaaaggtaacacagcattaatacttgcgattcgtagtattata
aattacacaccatattgtagtgatatattaataaaaatgttaatagaatatggtgctaat
ctaaatattcaaaattcacttggcgaaacttcattaatgattttgtttgaaatgataaaa
tcaatcaatctgacgtttagtaaatcaagtaaagaaaatataataaaaagattatttgga
tccgacggagtaatttcatatttattaaaaagatccaattataaactattaaacaattca
ggaaaaacaatttattcttatgtaccaaatgatattatgttagaatttatggaagcagta
gaaacaagtattattgataaacacataaaaaataacttacatgaatctattattagttta
aatactcaaattattatgagacctgggagcatacgaactagattaacagcacttcaatgg
tattccgatcgtgaattttcttttgaagaaatacgtgatcacgacaaagatttaattgat
tattttggtatttatgatacagaaagtctccggatgaaaattcaagataatctaaaatat
atcaattaa
DBGET
integrated database retrieval system