Viruses: 80558048
Help
Entry
80558048 CDS
T40000
Symbol
QLL95_gp1280
Name
(RefSeq) Cotonvirus japonicus; putative ABC transporter ATP-binding protein/permease
Virus
2811091
Cotonvirus japonicus
Taxonomy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
VOG
VOG cluster
Motif
Pfam:
ABC_tran
SMC_N
AAA_21
AAA_29
RsgA_GTPase
nSTAND1
DUF285
PRK
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
80558048
NCBI-ProteinID:
YP_010841451
RS:
NC_079139
LinkDB
All DBs
Position
NC_079139:375005..376630
Genome browser
AA seq
541 aa
AA seq
DB search
MDFYNLAINNIPKKLCIHLTINAIILSIIIPSITNTITKNISQENLFNITSLTILLAFTE
LYTSYHKRYYLDHYKIDYQNNIHLAIESQINSSIRKLPLNKSRTLLSKLDINKSKNGIIF
CAIAMIDIVISQASYVFAFVGYTIWILIQSPINLVFYIIIISIIISIIWFTPGNIFKKKI
ISCNNIWEKYRFLHANQFNSLIHYQGEIVHDKMINCIREYETINTNCKLRDSEIVEFIGS
MFNLASKINLMISLWQLPTIVNCIIHIQYCTIVKSTSNSMCCFYKKYLEFIFECEKISTV
INSKTEINNFDQIIDFSTININDLYYEYSDNKFSLKLNRQIEIKQGQIIALVGKSGSGKS
SFMDIVSGIIPCQEYHHEIFIDGIINDNSFEAVTQSRIYAEQFALHNWNATITELIVGNN
NIHFSLICQALQIACCEDFISINDPKCRFNLESNCMNLSGGQKGRIMIAKIVYEILICKP
KLLLLDEIDKSLNTDLALNVIKKILNLCIKNKIACIIVAHNNEINNLSFDNVLHFDNGII
N
NT seq
1626 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggatttttataatttggcgatcaataatattccaaaaaaattatgtattcatttaact
atcaatgccataatattatccataattattccatcaataacaaatacaatcacaaaaaat
atcagtcaagaaaatttatttaatataacatctctaacaatacttttagcatttacagaa
ttatataccagttatcataaaagatattatcttgatcattacaaaattgattatcaaaat
aatattcatttagcgatagaatcacaaatcaattcgtcaattcgaaaattacctctcaat
aaatcaagaactcttttatccaaattagatattaataaatcaaaaaatggcattatattt
tgcgcaattgccatgattgatattgtaatttcacaagccagttatgttttcgcatttgtg
ggatatactatttggatattaatacaatcacctattaatttagttttttacataattata
atttctattataatttctattatttggtttacaccaggaaatattttcaaaaaaaaaata
atttcatgtaataatatttgggaaaaatacagatttttacatgcaaatcaatttaatagc
ttaatacattatcaaggagaaatcgttcacgataaaatgattaattgcattagagaatat
gaaactatcaatactaactgtaaattacgagattctgaaattgtggaatttataggttca
atgtttaatttggcatcaaaaataaatttaatgataagtttatggcaattaccaacaatt
gtaaattgtataattcacatacaatattgtactattgtaaaatcgacatcaaattcaatg
tgctgtttttataaaaaatatttggaatttatttttgaatgtgaaaaaatatcgacagtt
attaactcaaaaactgaaattaataattttgatcaaataattgatttttcgacaataaac
attaacgatttatattacgaatattctgataataaattttcactaaaattaaatagacaa
attgaaataaaacaaggtcaaattattgctcttgttggtaaatctggtagtggaaaatct
tcgtttatggatattgtatcgggtattattccttgccaagaatatcatcatgaaattttt
attgacggtattattaatgataatagttttgaagctgtaacacaatcaagaatttatgca
gaacaatttgcattacataattggaatgccactattacagaattaattgttggtaataac
aatatacatttttcattaatttgtcaagctttacaaatagcatgctgtgaagattttatt
tcaattaatgatcctaaatgtagatttaatcttgaatctaattgtatgaatttaagtgga
ggacaaaaaggtcgtataatgatagctaaaattgtttatgaaatacttatttgtaagcct
aaattattattattggatgaaatagataaaagtctcaacacagatttagcactaaatgtt
attaaaaaaatattaaatttgtgcattaaaaataaaatagcatgtattatagttgctcat
aataatgaaattaataacttaagttttgacaatgtattacattttgataatggtataatc
aattaa
DBGET
integrated database retrieval system