Viruses: 80558218
Help
Entry
80558218 CDS
T40000
Symbol
QLL95_gp1110
Name
(RefSeq) Cotonvirus japonicus; isoleucyl-tRNA synthetase
Virus
2811091
Cotonvirus japonicus
Taxonomy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
VOG
VOG cluster
Motif
Pfam:
tRNA-synt_1
Anticodon_1
tRNA-synt_1g
DUF5915
TEX33
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
80558218
NCBI-ProteinID:
YP_010841621
RS:
NC_079139
LinkDB
All DBs
Position
NC_079139:560684..564037
Genome browser
AA seq
1117 aa
AA seq
DB search
MENITEKMQENSWMKTNFSDMEGEIIKFWRENNIVDKILERVNDYPEKVFLDGPPFATGL
MHYGHILVSTIKDILNRFFTMSGFKVDKRNSWDCHGVPIEMLAKKIIGYNTKKELLDYGI
DKHNDVCRSLVLKCANQWYKDFERIGRWIDIKNEYKTMDTNFMESVIWAFKTLYDKEMIF
EGYKVMPYSTGCNTALSHFEAKQNYKDVIDPSVTCMFEIISDEHSNFKLHYDHKTYALAW
TTTPWTLPGNMALCTYVNGEIIYLFDKQFQCYILVSKHKFESSLSKLKHQNLNRFEIITR
ISSDELINMEYKPPFDYYWNRDILVSKPIESRAFRIIADYYVKESGQDSGTGFVHNAGGH
GEDDFRVCCLNGIIDKKDISTIINLIDDDGCYVKNVHDYHGIYVKNANQSIIKFLKENKL
LFDSKQYTHSYPYCYRTDTPLLYRIVSGWFLGASDEIFREKMLTNNSKINWMPSNIGTNS
FDNWLQGSVDWCISRSRYWGTPIPIWKSDDGLEIICVGSINELEKLSGVTGITDLHIEYI
DKIKIPSQQGRGMLSRVEGVLDCWFESGSMPYGQIHYPFENKELIDRPLEKSRDYIADFI
TESRDQTRGWFYTLTVLSTAIFNKPAFKNVIVTGIINGSDGQKMSKNKGNYPDPNILIDK
YGADTLRLYLLSTPVVKAESIKFDEQILSKLQQNSVVKIYNMVLFLIEKIELFNDEYPDD
PISYPNIIDIQNFNNILDKWIINKTGILFNELFNDFNNYKINTIGAKIIQFIEQMTNWYL
KLSRERMKGIASLYIVSQENWRQTTQTLLYVLSKFVVLVCPVMPFICETIYQMLKPYLNN
TQESIHFESYPKREEFIIDSTLENKFDIIQEIITMVRELRGINKFDSRRPLEYVEIACKN
ITVWNTIQDVLEYILIEGNILQVRFSNFDDYVIHKIEANVAQLSSYLKEINEIRNMKKIL
NAINEMTHDQINEFINNHEIELFGIKFCDDHLMVKFMLKITDTTNITNTKITDNITVKIG
TEYTSNVEKEHVVRLINTAIQMHRKKTKLKPWNIIQVYLYTSSDFLKSFIEHNLESLMHK
NIKFIKFVDSQNLLKNSTTHDVMNYELIINSIFEKKN
NT seq
3354 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggaaaatatcaccgaaaaaatgcaagaaaattcttggatgaaaacaaattttagtgat
atggaaggtgaaattattaagttttggagagaaaataatattgttgacaaaatacttgaa
cgagttaatgattatcctgaaaaagttttcttggatggtcctccttttgctacaggattg
atgcattatggacatattcttgtatcaacgatcaaagatattctaaatagattttttacc
atgtcaggattcaaggttgataaaagaaattcttgggattgtcatggagttccaattgaa
atgctcgctaaaaaaataattggttacaataccaaaaaagaacttttagattatggtatc
gataaacacaatgatgtttgtagaagtttagtattaaaatgtgctaatcaatggtacaaa
gattttgaacgaataggtagatggattgacatcaaaaatgaatataaaacaatggataca
aatttcatggaatcagttatttgggcttttaaaaccttatatgataaggaaatgattttt
gaaggttataaagttatgccgtattctactggctgtaacacggcactatcacatttcgaa
gcaaaacaaaattataaagacgtgatcgatccttctgtaacatgtatgtttgaaattata
tctgatgaacattcaaactttaaattacattacgatcataaaacatatgctttggcttgg
accacaacaccttggactttacctggtaatatggcattatgtacctatgttaacggagaa
attatttatttgtttgacaaacaatttcaatgttacattttggtttcaaaacataaattt
gaatcatccttatctaaattgaagcatcaaaatttaaatagatttgaaattattacaaga
atttcgagtgatgaattgattaatatggaatataaaccacccttcgattattattggaat
cgtgatatattggtttcaaaaccaattgaatcccgagcatttagaattatagctgattat
tatgttaaagaatcaggacaagattcaggtacaggttttgtgcataatgctggaggtcat
ggtgaagatgattttagagtttgctgtttgaatggtataattgataaaaaagatatatcg
actattattaatttaattgatgatgatggatgttatgttaaaaatgttcatgattatcat
ggtatttatgtaaaaaatgcaaatcaatcaattatcaaatttctcaaagaaaataaatta
ttatttgatagtaaacaatatactcactcttatccatattgttatagaactgatacaccc
cttctttatagaattgtttcgggatggtttttaggagcaagtgatgaaatttttagagaa
aaaatgttaacaaataattctaaaattaattggatgccttcaaatattggaacaaatagt
tttgataattggcttcagggttccgtcgattggtgtatatccagaagtagatattgggga
acaccaattcctatttggaaatctgatgatggtctggaaattatttgtgttggttccatt
aacgaacttgaaaaattatctggtgttacaggaataactgatttacacattgagtatatt
gataaaattaaaattccatcacaacaaggacgtggtatgttatcaagagttgaaggtgta
cttgattgttggtttgagtcaggatctatgccttatggtcaaatacattatcctttcgaa
aacaaagagttgattgatagacccttggaaaaatcaagagattacattgcagattttatt
acagaatccagggatcaaacaagaggttggttttatactttgaccgtattatctacggct
atttttaataaacctgcttttaaaaatgttattgttacgggtattattaatggatccgat
ggtcaaaaaatgtcgaaaaataaaggaaattatcctgatccaaatattcttattgacaaa
tatggagcagatactctaagattatatttactatcaacacctgttgttaaagctgaatca
ataaaattcgatgaacaaattttatctaaattgcaacaaaattctgtcgtaaaaatttat
aatatggtacttttccttattgagaaaattgaattattcaatgatgaatatcctgatgat
cctatttcatatcctaatatcattgacatccaaaattttaacaatattttggacaaatgg
atcattaataaaactggcattttatttaacgaattatttaatgatttcaataattataag
attaatactattggtgcaaaaattattcaattcattgagcaaatgacaaattggtatctc
aaattatcaagagaaagaatgaaaggtattgctagtttatatattgtttcacaagaaaat
tggagacaaacaacacaaacattattgtatgttttgagtaaatttgttgtacttgtttgt
ccagtcatgccctttatttgcgaaacaatttatcaaatgttaaaaccttatttaaataat
acacaagaatctatacattttgaatcttatcctaaacgtgaagaatttattattgattct
acactagaaaataaatttgatatcattcaagaaattataactatggtacgagaattaaga
ggaataaataaatttgatagtagaagacctttggaatatgttgaaatcgcttgtaaaaat
ataactgtttggaatacaattcaggatgttttggaatatattttaatagaaggtaatatt
ttacaagtaagattttcaaattttgatgattatgttattcataaaatagaggcaaatgtc
gcacaattaagttcttatttaaaagaaataaatgaaattcgtaacatgaaaaaaattcta
aatgccattaatgagatgacccatgatcaaattaacgaatttattaataatcatgaaatt
gaattatttggaattaaattttgtgatgatcatttgatggtcaaatttatgcttaaaatt
actgatacaaccaatatcactaatacaaaaataactgataatattacagtaaaaattgga
acagaatatacgtcaaatgttgaaaaagaacatgttgttagattaattaatactgcaatt
caaatgcatagaaagaaaacaaagctcaaaccttggaatatcattcaagtttatttatac
acaagttcggattttttaaaatcttttatcgaacataatttagaaagtttgatgcataaa
aatattaaatttatcaaatttgtggatagtcaaaatttattaaaaaattcaacaactcac
gatgttatgaattatgaattaatcattaattcaatttttgaaaaaaaaaattga
DBGET
integrated database retrieval system
