Viruses: 80558259
Help
Entry
80558259 CDS
T40000
Symbol
QLL95_gp1069
Name
(RefSeq) Cotonvirus japonicus; putative ankyrin repeat protein
Virus
2811091
Cotonvirus japonicus
Taxonomy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
VOG
VOG cluster
Motif
Pfam:
Ank_2
Ank
Ank_4
Ank_3
Ank_5
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
80558259
NCBI-ProteinID:
YP_010841662
RS:
NC_079139
LinkDB
All DBs
Position
NC_079139:606053..611845
Genome browser
AA seq
1930 aa
AA seq
DB search
MSRYPSRIFINNPEKKVPDDLIEQFFLTIKTGDIDKIRNFVAQNKIKYNIIDEVSKNNAP
GSDKTPIHTVLELDDKIADNDAKLKIIEFLDNMGAPIDFPDVDNIWPIHLAASLQSVDII
NYLIKKHVSIDRKDSSNNTPLHYAIYGKETACSSSLDIKPLVPKELNNTSNNETLVMTKN
FIVKLLGSDNKINNDLLHMINTLMIIPEMYSGSKIENELQTQIINIFTEASLNPDYQNNM
TSLLSQEGNIEQLINKTYSIVNDDLLRGLDNPLNIAPNNGGWGPQIPTETGPRYPTDIEQ
IMKNNSNDLIIDVNNKYNQEKNSILNVNITTIDKISRETLPNVINQIDTNYIDTLIFCPD
CRFSSYGENIGLIKMLYLLVWNNYKSNYSTNLANKIMNDFVIMSKTIQSQIINNNYLTVP
AYSNLAVNDSNSLIGYLLGSLLSSSNFSNKTETDQMIEDVVDYIDPINPLIPTITTGENS
CITLNLLRLFTNSDDPNRHINLFNTTLNQPLSNILSLDDFEQYTTEFNSLRLRYRNPANT
WFTVLLSLIREIKPVLAGTDPKDITNNIFVTNTARGVNFILPLTPLPNSQNYGPPPTAPR
GTLANNYTFYEMFAIIDALYQFINTKQMRITKYPDIFNQHINNWIEYIDDTFQNNIQLQQ
FPELMFLHKILVTFAQQEIRKIIKNCIELTITRATNTTIQNPLFDNLKNIFKPLNDAYMY
NLLLPAIPQSEEFNIEDEDPYFDLKQHNWDNDNNLITWFNDFIKNRIPIEFINHLGEYMF
DNYDDFSYKNLNNIRNFIETDSDNINTVSTIIKIPKFRNSIKEYFGTYVYPKKFAGTKIN
NQMVLNRYNKITREIELENIFDIYLSELTNGNISQLLFLTEIYNHTFVIIKQRLIDIQSE
FNIMNGIISDIISNINNGTYYYIPQIFLPALIKYLLLITTKIITIKSVISDFQEYKSKFI
NFVDITIDENNLILELGNNFENYIDTQLQTIYQSAITIINYHNNVINFLNYHSAHQLITS
RTGNTDKDILFVTNFFTKNLVPINDFPNNLSNLSDNRNVINIFNKYSIPEIIYYADPDES
NRINYDVFDVKIDTSEDTPSYFFDNYKNVISYTRSGKLSNSPLPGENTQLNITVNDDGTG
NLMYNIIDINNPINGRWLNFDKNDFDNTDYLDAFIAYFNKKYQLEWKNGMPPSIYKMVNN
HLGILKQKIVEDVIQYIINNKNDSTKELYMKINDLGTQKIFNNIGEVKNYIVIGKLTDEI
LNKIIEYSLRQSISVWIQSFITTDKRFSSISTTISRAISTLQHKDYSKLSLKEIDQTSID
ELLDTNSKYLDTQSSQFETDSKNLIFTSKKPENKFIHHLYNINYVSDNTSNSTCYYTNPD
IVSKLIDGFTINAKNSDGNTPLHLAMTMYNPKLIKLLINEGAKPFGFKNIRGQTPYDLYR
SIINDHLSFTKGETISDSINNFVVPFNDLLVERLRDDKFGGNIIKNITMGIPIRLIMYNH
MFHIFMENYRYGYTNEIRNSIRLMLKKYFKLEDTVYPTDLFDINSLELTKILEKEYPKKL
TKKSSKTKISNYYKKQIIEIDNQINNLIKERRSIVDSSQISLINNIITDLEARKSPISKN
IDEIEPDVISPPIDSGLISSYQSSVKSISTKINTRNLDLTEFYKDSFGRISKNNDLNLEI
WNNYLNKLLLTTPSMIFPLLDRIIGYIIFFFGDNYSTPEIKQELSTIINFYKLAKNYINS
KNYYPNNLDENPVLKQEYDQMIYLINLIITPSIKNILFKQIYSSVNDITKTNSLLGYTDT
TINDQDKIMDEIINTQYNGQTLNTYIDNILPGLAVKYFTTAYNSTEGDNILSKSEDLFLP
IIQILKQNKTLSISDDSTLVQNINEYLIPFFINTYQNFIHHIMLTVYAYERYILNTYQLV
KTLQFFTKNK
NT seq
5793 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtcaagatatccatcgagaatttttataaataatcctgagaaaaaagttccagatgat
cttattgaacaattttttttaacaataaaaactggtgatattgataaaattagaaatttc
gttgcacagaataagataaaatataatataattgatgaagtatcgaaaaataatgcacct
ggatctgataaaactccaatacatacagtgttagaattggatgataaaattgctgataat
gatgcaaaattaaaaattattgaatttttagacaatatgggcgcaccaatagattttcct
gatgttgataatatttggcctatacatttagctgcttcattacagtcagtggatattata
aattatttaatcaaaaaacatgtatccatagatagaaaagatagctccaataatacacca
ttacattatgcaatttatggtaaagaaacggcatgttcgtcttcgttagatattaaacct
cttgtaccaaaagaattaaataatacatctaacaatgagactcttgttatgacaaaaaat
tttattgtaaaattattaggttctgataataaaataaataatgatcttttacatatgatt
aatacattaatgattattcctgaaatgtattcgggaagtaaaatagaaaatgaattgcaa
acacaaattataaatatatttaccgaagcatcattaaatcctgattatcaaaataatatg
acttcattattatctcaagaaggcaatatcgaacaattaataaataaaacatattcaatt
gtgaatgatgatttattacgaggattagataatccattaaatattgccccaaataatggc
ggatggggtcctcaaattccaacagaaactggacccagatacccaactgacatcgaacaa
attatgaaaaataacagtaatgatttaatcattgacgtaaataataaatataatcaggaa
aaaaattccatactaaatgttaacattactacaattgataaaatttccagggaaacactt
ccgaatgtcatcaatcaaattgacacgaattatattgatacactaatattttgtccggat
tgtagatttagttcttatggtgaaaatattggtttgattaaaatgctatatttactcgtt
tggaataattataaatctaattattccactaatttagcaaataaaattatgaatgatttt
gttataatgagcaaaacaattcaatcacaaattattaataataattatttaactgtacca
gcatattctaatcttgcagtaaatgatagtaatagtttaataggatatttattaggtagt
ttattatcttcatctaatttttcaaataaaactgaaacagatcaaatgatagaagatgtt
gttgattatatagatccaataaatccattaataccaacaattactacgggtgaaaatagt
tgtatcacgttaaatttgttacgattattcacaaacagtgatgatcccaatcgtcacata
aatttatttaatacaacattaaatcaacctctcagtaatatattatcattagatgatttt
gaacaatacactactgaatttaatagtttaagattacgatatcgtaatcctgcaaatact
tggtttacagtattattatctttaataagagaaattaaaccagttttagccggtacagat
ccaaaagacataactaataatatttttgtcacaaatacagcaagaggagtgaattttata
ttaccgttaacacctttaccaaattctcaaaattatggtcctcctcctactgcaccacgg
ggaactctcgccaataattatactttttatgaaatgtttgctataattgatgcattatat
caatttattaatacaaaacaaatgagaataacaaaatatcctgatatttttaatcaacat
attaataattggattgaatatattgatgatacatttcaaaataatatacaattacaacaa
tttccagaacttatgtttttacataaaatcttagttacatttgctcaacaagaaatacga
aaaataattaaaaattgtatagaactcacaataacaagagcaaccaacacaacaattcaa
aatcctttgtttgataatttaaaaaatatatttaaaccattaaacgatgcatatatgtat
aatttattattaccagcaattccacaatcggaagaatttaatattgaagatgaagatcct
tattttgacctcaaacaacataattgggataatgataataatttaattacatggtttaat
gattttattaaaaatagaattccaatagaatttataaatcatttaggtgagtacatgttt
gataattatgatgatttttcgtacaaaaatttaaataatattagaaattttattgaaact
gattcagataatattaatacagtttctactatcataaaaataccaaaatttcgaaattcc
ataaaagaatattttggtacatatgtgtatccaaaaaaatttgccggcacaaaaataaat
aatcaaatggtattaaatagatataataaaatcacaagagaaattgaactggaaaatatt
tttgatatatatttatcagaacttactaatggtaatatatcacaattattatttttaaca
gaaatatacaatcacacatttgtaataataaaacaaagattaatagatatacaaagcgaa
tttaatataatgaacggtattatttctgatataatttcgaatattaataatggaacttat
tattacattccacaaatatttttacccgcacttattaaatatcttctcttaataacaacg
aaaataattacaattaagtctgtaatttcagattttcaagaatataaatcaaaattcata
aattttgtggatattactattgatgaaaataatttgattttagaattaggtaataatttt
gaaaattatattgacactcaattgcaaacaatatatcaatcagccattacaattataaat
tatcataacaatgtaataaatttcttaaattatcatagtgctcatcaattaataacatca
agaactggaaatactgacaaagatattctttttgttacaaattttttcactaaaaattta
gtaccaattaatgattttccaaataatttatcaaatttatcagacaacagaaatgttatt
aatatttttaacaaatattcaattccagaaataatttattatgctgatccagatgaatct
aatagaataaattatgatgtttttgatgttaaaatagatactagtgaagatacgccttca
tatttttttgacaattataaaaatgttatatcatacacaagatccgggaaattatcaaat
tctccactgcctggtgaaaatactcaattaaatattacagttaatgacgatggtacaggt
aatttaatgtataatattattgatataaataatccaataaacggacgttggttaaatttt
gacaaaaatgattttgataatactgattatttagatgcattcattgcatattttaataaa
aaatatcaattagaatggaaaaatggtatgccaccttctatttataaaatggttaataat
catcttggtattttaaaacaaaaaattgtagaagatgttattcagtatattattaataat
aaaaacgattcaacaaaagaattatatatgaaaatcaatgatttaggaactcaaaaaatt
tttaataatattggtgaagttaaaaattacattgtcataggtaaattaactgacgagatt
ttaaataaaattatagaatattctctgagacaaagtatcagtgtgtggatacaaagtttt
ataacaacagataaaagattcagtagtatttcaacaactatttcaagagccatcagcact
ttgcaacacaaagattattctaaactatctttaaaagaaattgatcaaactagcattgac
gaattattggacacaaattctaaatatttagacacacaatcatcacaatttgaaactgat
tcaaaaaatttaatttttacatcaaaaaaaccggaaaataaatttattcatcatttatac
aatataaattatgtgtctgataacacatccaatagtacttgttattatacaaatcctgat
attgtttctaaattaattgatggatttactattaacgctaaaaattccgatggtaatact
cccttacatttagctatgacaatgtataatcctaaattaataaaattattaataaatgag
ggagcaaaaccttttggatttaaaaatattcgtggtcaaactccgtatgacttatatagg
agcattataaatgatcatttatcatttacaaaaggagaaactataagtgattctattaat
aattttgttgtaccatttaatgatttactagttgaaagattgcgtgatgataaatttggc
ggaaatataattaaaaatatcacaatgggtatacccataagattaatcatgtacaatcat
atgtttcatatatttatggaaaattatagatatggttatacaaatgaaataagaaattcc
ataagattaatgttaaaaaaatattttaaattggaagatactgtatatcctacagattta
tttgatattaattccctggaattaacaaaaatacttgaaaaagaatatccaaaaaaatta
actaaaaaatcttctaaaactaaaatatcaaattattataaaaaacaaatcatagaaatt
gataatcaaattaataatttaataaaagaaagaagatcaatagtcgatagtagtcaaata
tctttaataaataacataattactgatttagaagcaagaaaatctcctattagtaaaaat
attgatgaaatagagcctgatgttatttctccaccaattgactctggattaatatccagt
tatcagtcaagtgtaaaatctattagcacaaaaataaataccaggaatcttgatttgaca
gaattttataaagattcttttggtagaataagtaaaaataatgatttgaatttggaaatt
tggaataactatttaaataaactactattaacaacaccatcaatgattttccctttatta
gaccgtattattggatacattatatttttctttggagataattattcaacaccagaaata
aaacaagaattatccacaatcattaatttttataaattggctaaaaattacataaactca
aaaaattattatcctaataatcttgatgaaaatcctgttcttaaacaagaatatgatcaa
atgatttatttaataaatttaataatcactccatcaattaaaaatattttatttaaacaa
atatattcaagtgttaatgatattactaaaacaaattcattactaggatataccgatact
acaattaatgatcaagataaaatcatggacgaaataataaatacccaatacaatggacaa
acacttaatacttacatagataatattttacccggacttgctgtgaaatattttacaaca
gcttataattctacagaaggtgataatattttatccaaatctgaagatttatttttgccc
attattcaaatactcaaacaaaataaaactttatcaatttctgatgattctacacttgta
caaaatataaatgaatatttaattccattttttattaatacatatcaaaattttattcat
catattatgttaacagtttatgcatatgaaagatatatattaaatacatatcaattagtc
aaaacactacaattttttaccaaaaacaaataa
DBGET
integrated database retrieval system
