Viruses: 80558305
Help
Entry
80558305 CDS
T40000
Symbol
QLL95_gp1023
Name
(RefSeq) Cotonvirus japonicus; putative capsid protein
Virus
2811091
Cotonvirus japonicus
Taxonomy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
VOG
VOG cluster
Motif
Pfam:
Capsid_N
Capsid_NCLDV
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
80558305
NCBI-ProteinID:
YP_010841708
RS:
NC_079139
LinkDB
All DBs
Position
NC_079139:complement(674036..675604)
Genome browser
AA seq
522 aa
AA seq
DB search
MAGGLIQLVAYGIQDLYLTGDPQITFFKLVYRRHTNFSIESIEQNFSSKANFGETVGCTL
SRSGDLVSKIFVCVDIPSIPDFFDITTGETDNIKKFAWVNNLGYALINDVNIEIGGKQID
KQYGEWMFIWSQVSNRHDEALSKMIGNLPEIFTFTNGKPSYRLYIPLEFWFCRNSGLSLP
MIALASSSIKINVKFRNADECYRIGPTHSIDIMEDIIPFRSGDYIYQTINGQTINGYVID
YDYLTKKLYYIKIHGPTNVRKNFESYMNDDFESQSTNHFSEYRIYDSINKRYCTPKPGSV
ESIEYTSLEQEPHIINAFLYVNYVYLDEEERNLFAKMSHEYLIEQIQFNQEIGIQNVNIK
QKLTLNHPCKSHYWVVQLDSLVGPKTMNDRFNFTTSHVRYNTTNMSNNFYGESLVDRAKL
MLNNRERFSERSWQFFNYLQPFEHHYRGPQLGINTYSPSLNPESIQPSSTINMTKIDDIF
MDMHLKNVINYNNTCKIRSYTVNYNIFRVFLNQGSLAFDMNN
NT seq
1569 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggcaggtgggttaattcaattagttgcatacggaatacaagatttgtatttaactggt
gatccacaaataactttttttaaattagtatatcgacgtcatactaatttttctattgaa
tcaatagaacaaaatttttcatcaaaagctaattttggagaaacagtaggatgcacatta
tcaagatcaggtgatttagtgagtaaaatttttgtatgtgttgatattccatcaatacca
gatttctttgatataacaaccggggaaactgataatattaaaaaattcgcatgggtcaat
aatttgggttatgcattaattaatgatgttaatattgaaataggtggaaaacaaatagac
aaacaatatggagaatggatgtttatttggtcccaagtaagtaatcgacatgacgaagct
ttatcaaaaatgataggtaatcttcctgaaatttttacatttactaacgggaaaccatct
tacagattatatatacctttagaattttggttctgcagaaatagtggattatcattgcct
atgattgcactagcttcatcatcaataaaaataaatgttaaatttcgtaacgctgacgaa
tgttatcgtatcggaccaacacattctatagatataatggaagatataataccctttaga
tcaggagattatatttatcaaacaattaatggacaaacaattaatggttatgttattgat
tatgattatttaacgaaaaaattatattatattaaaatacatggtccgacaaacgtgaga
aaaaattttgaatcatatatgaatgatgattttgaatcacaatcaaccaatcatttttct
gaatatagaatttatgatagtattaacaaaagatattgtacaccaaaacctggttctgta
gaatcaatagaatatacaagtttagaacaagagccacatataattaatgcttttttatat
gtaaattatgtttatttggacgaagaagaaagaaatttattcgctaaaatgtcacatgaa
tatctcatagaacaaatacaatttaatcaggaaataggtattcaaaatgtcaatatcaaa
caaaaattaacattaaatcatccgtgtaaatctcattattgggtcgtgcaattagatagt
ttagttggtccaaaaacaatgaatgatagatttaattttacaacatcacacgtgagatat
aatactacaaatatgtcaaataatttttatggagaaagtttagtggatagagcaaaattg
atgttaaataatagggaaagatttagtgaaagatcttggcaattttttaattatttgcaa
ccatttgaacatcattatcgaggacctcaattgggaattaacacatattcaccttcatta
aatcctgaatcaattcaaccatcatcaacaataaatatgacaaaaattgatgatattttt
atggatatgcatttaaaaaatgttataaattataataatacttgtaaaattcgaagttac
acagttaattataatattttcagagttttcttgaatcaaggttcgttggctttcgatatg
aataattaa
DBGET
integrated database retrieval system
