Viruses: 80558311
Help
Entry
80558311 CDS
T40000
Symbol
QLL95_gp1017
Name
(RefSeq) Cotonvirus japonicus; putative F-box and FNIP repeat-containing protein
Virus
2811091
Cotonvirus japonicus
Taxonomy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
VOG
VOG cluster
Motif
Pfam:
FNIP
CNRIP1
AtzH-like
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
80558311
NCBI-ProteinID:
YP_010841714
RS:
NC_079139
LinkDB
All DBs
Position
NC_079139:complement(686607..688691)
Genome browser
AA seq
694 aa
AA seq
DB search
MIDHLNDDTIIYLTNFLKDREKINFFMTCKHIYVLRQHVNYLNTYKYENIKHLSFINKFK
SIKYTLHRATKIIPYGVTELLFGENNISSYVNKKTDSRDRIFIDHTFFKWNFKKSAENII
PKTVTNLNFGNNFNQSVKKIIPNSVTHLTFGDLFNQDIKDCIPNSVTHLTFGYYFNQNIK
DCIPNSVTLSPKEQVMKKVLPSSLTHLTFGNNFNQNIKDCIPNSVTHLTFGDCFNQPIEK
CIPNSVTHLTFGDLFNQSIEECIPNSVTLSPKEQVMKKVLPSSLTHLTFGIYFNKSIKNC
IPNSVTHLTIGYMFNQDIKDCIPNSVTHLTFGDLFDHDVKKCIPNSVTHLTFGQYFNQSI
EECIPNSVTHLTFGRFFNKSIKNCIPNSVTLSPKEQVMKKVLPSSLTHLTFGHYFNQSIK
NCIPNSVTLSPKEQVMKKVLPSSLTHLTFGDCFNQPIEECIPNSVTHLTFGNKFNQPIQG
FIPNSVTNLEFKGEFNQSIKDAIPDSVTRLILRGKYFNQSIKNCIPTSVTYLVLNSVGMI
DQSLEGCIPNTITHLVWEPPLNKSIKNCIPNSVKYLELIFNGDTTLKECIPNSVTHLLLE
KSNNVIPFNVHIKDCIHNGVTNLVFYNFDQDIKNCIPNTVSDLTFHGKCKSNIKTKIPST
VKKLKFYKNDDHDIIKHIPHKNNYILITGNYYNY
NT seq
2085 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgattgatcatttaaatgatgacacaataatttatttaacgaatttcttaaaagatcgc
gaaaaaattaatttttttatgacatgtaaacatatttatgtattacggcaacatgttaat
tatctgaacacatacaaatatgaaaatatcaaacatttatcattcataaataaatttaaa
agtattaaatatacattacatcgtgctactaaaattattccgtacggggtaacagaatta
ttatttggcgaaaataacattagttcttatgttaataagaaaactgactctcgagatcga
atatttattgatcatacatttttcaaatggaatttcaagaaatcagctgaaaatattatt
ccaaaaacagtcacgaatctaaattttggtaataattttaatcaatccgtaaaaaaaata
atacccaatagtgtaacacatttaactttcggagatttatttaatcaagacattaaggat
tgtatcccgaatagtgttacacatttaactttcggatattattttaaccaaaacatcaaa
gattgtattccgaatagtgtaaccttgtctccaaaggagcaggttatgaagaaggtatta
ccttcttcattaacacatttaacttttggtaataattttaaccaaaacatcaaagattgt
attccgaatagtgtaacacatttaacttttggtgattgttttaatcaacctattgaaaaa
tgtattccgaatagtgtaacacatttaacttttggtgatttatttaatcaatccattgaa
gaatgcattccaaatagcgtaaccttgtctccaaaggagcaggttatgaagaaggtattg
ccttcatcattaacgcatttaacttttggtatttattttaataaatccattaaaaactgt
attccaaacagtgtaacacacttaactattggatatatgttcaatcaagacataaaggat
tgtattccgaatagtgtgacacatttaacttttggtgatttatttgatcatgatgttaaa
aaatgtattccaaatagtgtaacgcatttaacttttggtcaatattttaatcagtccatt
gaagaatgtattccgaatagtgtaacgcatttaacttttggtcgtttttttaataaatcc
attaaaaactgtattccaaatagtgtaaccttgtctccaaaggagcaggttatgaagaag
gtattgccttcttcattaacacatttaacttttggtcattattttaatcaatccattaaa
aactgtattccgaatagtgtaaccttgtctccaaaggagcaggttatgaagaaggtattg
ccttcttcattaacacatttaacttttggtgattgttttaatcaacctattgaagaatgt
attccgaatagcgtaacacatttaacttttggtaataaatttaatcaaccaatacaagga
tttattcccaatagtgtcactaatttagaatttaaaggagaatttaaccaatcaattaaa
gatgctatccccgatagtgtgacacgtttgatattaagaggaaaatattttaaccaatca
ataaaaaattgtatacctactagtgttacttatttagtattaaatagtgttggaatgata
gatcaatctcttgaaggatgtattcctaatacaataactcatttagtttgggaaccacca
ttaaataaatccataaaaaattgtataccaaacagtgttaaatatctggaattaattttt
aatggtgatacaacattaaaagaatgtattcctaatagcgtaacacatttattattagag
aaatctaataatgtaataccatttaatgtacatattaaagactgtattcataacggtgtt
acaaatttagtattttataattttgatcaagatattaaaaattgtattcccaatactgtt
agtgatttaacatttcacggaaaatgtaaatctaatattaaaacgaaaattccttctacc
gtcaaaaaattaaaattttataaaaatgatgaccatgatataataaaacacattcctcac
aaaaataattatatactcataactggtaattattataattattaa
DBGET
integrated database retrieval system
