Viruses: 80558326
Help
Entry
80558326 CDS
T40000
Symbol
QLL95_gp1002
Name
(RefSeq) Cotonvirus japonicus; capsid protein 1
Virus
2811091
Cotonvirus japonicus
Taxonomy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
VOG
VOG cluster
Motif
Pfam:
Capsid_N
Capsid_NCLDV
Pox_Rif
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
80558326
NCBI-ProteinID:
YP_010841729
RS:
NC_079139
LinkDB
All DBs
Position
NC_079139:702475..704238
Genome browser
AA seq
587 aa
AA seq
DB search
MAGGLLQLVAYGAQDVYLTSNPQITFFKIVYRRHTNFAVESIEAYFGGNLNFGKKSQVEI
SRNGDLITQAVLKVILPEVRYEGNFDRFGHVGFAWVKNIGHAIVDEIDLEIGGSTIDKQY
GDWLQLWHEVSSSKDHDNGSAKMLGNIPELTSISSLSWDHPDNNLLKPSYTLFIPLQFYF
CRNNGLALPLIALQYHIVKFHVKFRPVEQCYIATDAFKAGSNNPEIDDVSVYVNYVYLDT
EERRRFAQVSHEYLIEQLQFTGEESAGNSNSAKYKLNFNHPVKALYWVTKLGNYQGGKFM
AYDPTNWETARENAAKLLLLSQYDLDEYGFFNDVGIENNSNNYVGDCGVQYVAVDPASHS
EEPTYIFNDSNTAEKFNGSTLIGKLASCVPLLKRTKDNDLREKVEGIIRIHHDENNGNYP
EVEKVTKNDLTIHDLSVPINKFNEDNRNEYIKRYDITVWQHHNHGLLIDGSINPTSEAEL
QLNGQARQSKRSGSWYDTVSPKMHHTRTPNDGLNVFSFAINPEEHQPSCTCNFSRIDTAQ
LNLWFNHFANNKFADVFSDNDNKVLIFAINYNVLRIMSGMGGLAYAN
NT seq
1764 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggcaggtggtttactccaattagtagcttatggtgctcaagacgtatatcttacatct
aatcctcaaatcacattctttaagattgtgtacagacgacacactaattttgctgttgaa
tcaatagaggcatattttggcggtaatttgaatttcggtaaaaaatctcaagtagaaatt
tcgcgtaatggtgatttaatcacgcaagcggtcctcaaagttattcttccagaagttaga
tatgaagggaattttgatcgttttggtcatgttggatttgcctgggttaaaaatattggt
catgccattgtagatgaaatcgatcttgaaattggtggatctacaattgataaacaatat
ggtgattggcttcaactctggcatgaagtttccagtagcaaagatcatgataatggtagt
gctaaaatgcttggtaatattcctgaacttacatctatcagtagtctttcatgggatcat
cctgataacaatcttttaaaaccttcatacacactttttattcctcttcaattttatttc
tgccgcaataatggtcttgctcttcctcttattgctcttcaatatcacattgttaaattc
cacgttaaattcaggcccgtagaacaatgctacattgctactgatgctttcaaagctgga
tctaacaatcctgaaattgatgatgtttcagtatatgtaaattatgtttatcttgatact
gaagaacgtaggagatttgctcaagtgtctcacgaatatcttattgaacaacttcaattt
actggagaagaatccgcaggaaattctaattccgctaaatataaactcaatttcaatcac
cctgtcaaagctctttattgggtcactaaattaggtaattatcaaggaggtaaattcatg
gcatatgatcctaccaattgggaaactgcccgtgaaaatgccgctaaattactcctttta
tcacaatatgatcttgacgaatatggtttcttcaatgatgttggaattgaaaataatagt
aacaattacgttggtgattgtggtgttcaatatgtagctgttgaccctgccagtcacagt
gaagaacccacttatattttcaatgattccaataccgctgaaaaattcaatggttccacc
ctcattggtaaacttgcttcatgtgttcctcttcttaagaggactaaagataacgatctc
agagaaaaagtagaaggtataattcgtattcatcacgatgaaaataatggtaattatcct
gaagttgaaaaagtcaccaaaaatgacttaacaattcatgatctttcagttcctattaat
aaattcaatgaagataatcgtaatgaatatatcaaacgttatgacattactgtatggcaa
caccacaatcatggtctcctcattgacggatccatcaatcctaccagcgaagctgaactt
caacttaatggtcaagctcgtcaaagcaagagatctggttcatggtacgatacagtttct
cccaagatgcatcacactagaactcccaatgatggtcttaatgttttctcattcgcaatt
aaccctgaagaacaccaaccttcatgtacttgcaatttctcacgaattgatactgctcaa
ctcaatttatggttcaatcattttgctaacaataagtttgctgatgttttcagtgataat
gacaataaagtgttgattttcgcaatcaattacaatgtattgaggatcatgagtggaatg
ggaggccttgcctacgctaactga
DBGET
integrated database retrieval system
