Viruses: 80558335
Help
Entry
80558335 CDS
T40000
Symbol
QLL95_gp0993
Name
(RefSeq) Cotonvirus japonicus; putative BTB/POZ domain and WD-repeat protein
Virus
2811091
Cotonvirus japonicus
Taxonomy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
VOG
VOG cluster
Motif
Pfam:
WDR55
WD40_CDC20-Fz
WD40_WDHD1_1st
Beta-prop_EML_2
BTB
WD40_Prp19
WD40
Beta-prop_TEP1_C
WDR90_beta-prop_4th
Beta-prop_HPS5
EIF3I
Beta-prop_WDR75_1st
Beta-prop_WDR90_POC16_2nd
ANAPC4_WD40
Beta-prop_EML
Beta-prop_IFT140_1st
KNTC1_N
Beta-prop_TEP1_2nd
G8
Beta-prop_LRRK2
Beta-prop_NUP159_NUP214
Beta-prop_VPS8
Beta-prop_WDR11_2nd
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
80558335
NCBI-ProteinID:
YP_010841738
RS:
NC_079139
LinkDB
All DBs
Position
NC_079139:complement(714349..715725)
Genome browser
AA seq
458 aa
AA seq
DB search
MDYLNFFESGIFSDLSLIIKDDNDNLVEMNVHKIIICSKSAILYRMLTGNFREATESTIT
ITTPNAHVTHDIIISMYGKTMNSTDYEQWYYELMWIMCCDYLEIQQDFQSLVDIKVPEEG
FELLVHVIDTIKNPLDKKSKIILENLPKNYDITKLPQCLIGRICDLTLKDISVFVKGSKI
IICDDKLLFIDKIKTPVKPKLIAKLYDHQVVIADNTGEVYVYNLYTKNIVIKSGYSCGAD
VLTVSPDNQFVVIGKNDCVYIFNSATMKLKSTIRTAKITAIACSSNHIATGHNDGSINVW
DIYTKQLIDTLNCNNDYINTIVFSSDYTKLLCCDNMGHIIIKNMITNEIFKHKISIEKQF
FYLNFTPGSGNNSICYYNGRCYYNGQCYYGREWRIGNSKTDRVVSRNLSEKILGIYSHIY
LLKKSKDKSKKINFKDYIVWTTYHDNENIRNYVTNIQK
NT seq
1377 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggattatttaaatttttttgaatctggtatattttctgatttatcattgattataaaa
gatgacaatgataatttagttgaaatgaatgttcacaaaattataatttgttcaaaatct
gcaatactatatcgtatgttaacaggaaattttcgtgaagctacagaatcaactattacc
ataacaacaccaaatgctcatgtcacacatgatattatcatatcaatgtatggaaaaact
atgaattcaactgattacgaacagtggtattacgaattaatgtggattatgtgttgtgat
tatttggaaatacaacaagatttccaatcactcgttgatattaaagttccagaagaagga
tttgaattacttgttcatgtaattgacacaataaaaaacccacttgacaaaaaatctaaa
attattttagaaaatttacccaaaaattatgatataacaaaattacctcaatgtttaatt
ggtagaatttgcgatttgacactgaaagacatttcagtttttgtgaaaggtagtaaaatt
attatttgtgatgacaaattattatttatcgacaaaataaaaacaccagtaaagccaaaa
ttaattgctaaattatatgatcatcaggttgtcattgctgataacacaggtgaagtttat
gtttataatttgtatacaaaaaatattgtcattaaatcaggttatagctgtggtgctgat
gtactaacagttagtccagataatcaatttgtcgttattggaaaaaatgattgtgtttat
atatttaatagtgccacaatgaaattaaaatcaacaataagaacagctaaaattaccgca
atagcttgttcatcaaatcatattgctacaggtcataatgacggaagcattaacgtttgg
gatatttacactaaacaattaatagacacattgaattgtaataatgattatatcaataca
atagtattttcatcagattatacaaaattattatgttgtgataatatgggtcatattatt
attaaaaatatgataactaatgaaatatttaaacataaaatttctattgaaaaacaattc
ttttatttgaattttacacctggatcaggtaataattctatatgttattataatggacga
tgttattataatggacaatgttattatggacgtgaatggcgtattggaaattcaaaaact
gatcgagtagtttctcgaaatttatcagaaaaaatacttggtatttatagtcatatatat
ttattaaaaaaatccaaagataaatctaaaaaaattaattttaaggactatattgtttgg
acaacatatcatgacaatgaaaatatcagaaattacgtgacaaatattcaaaaataa
DBGET
integrated database retrieval system