Viruses: 80558383
Help
Entry
80558383 CDS
T40000
Symbol
QLL95_gp0945
Name
(RefSeq) Cotonvirus japonicus; putative NTPase
Virus
2811091
Cotonvirus japonicus
Taxonomy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
VOG
VOG cluster
Motif
Pfam:
SNF2-rel_dom
ResIII
DEAD
Helicase_C
AAA_22
AAA_14
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
80558383
NCBI-ProteinID:
YP_010841786
RS:
NC_079139
LinkDB
All DBs
Position
NC_079139:768594..772028
Genome browser
AA seq
1144 aa
AA seq
DB search
MDNQTRDRNKIRTKNKSDTNSNTNSNVELTDLEEKMLENHTYPSPSQENFQEAIYVKRDF
YIHSIPQRGILNDYDDIKEFRDNKCAGSFKLTETQILLSNFINPNTPYKGLLIYQGTGVG
KTCAAVAIAEKFKPMVEKYSMRIHVLVPGPLNKQNFFNEIIKCTGETYTKMFQDKTIILN
ETEKNKIKRNALNIVNQYYRVMSYRSFYKKVLGEKIRDKVVSGNKIKLTSRKTESGEYER
DISIDRIYNLDNTLLIIDEAHNITGNEQGDAVKKIIDSSKNLKIILLTATPMKNLADSIV
ELINFLRPKNFQMERDKIFTSQRGSDMDFKSNGRDYLRKMVRGYVSYLRGADPLTFAERV
DVGEIPPGLSFTKVTRCLMLPFQLQVYNNVVETQDDRLDKNSGAVCNFVFPGLPKNKNNK
EIVGYYGIKGMNDVRNQILNNSTTLNTRIASTILSNYDIKDISSLIYLTENNSVISGNIF
SEKYLKHFSIKFYEALRKINENVYGKRGPGLIFAYLNLVKIGTNIFKEVLRVNGYLEYQE
NPSDYILSSDTKCYYCDYTHGDHQHLPDSIPKHEFFPATYITVTGKSDEDADQIPEEKHD
ILKNVYNNINNRDGKYLKIVVGSKVMNEGITLKNVKEIYILDVHFNLGKVDQAIGRGIRF
CTHYDVINENNPFPKVEINKYVVSLKDGLSTEEQLYKKAEQKYKLIKQVERILQEEAIDC
PLNRNGNIFPEEIERYGNCGTKNNPCPAICGYMPCDYKCGDKMLNARFYDPEKGIYKKIS
KSELDYSTYNNSLASDEINYAKTKIKEMFHIDYTYTLDNIIEYVKNSYPEDKRDMFDDFY
VYQALNDLIPITGNDFNNFHDIMADKFNRPGYLIYINKYYIFQPYDENEELPMYYRKTFN
YPATNKINVKDYIRNTPEYQKYRQIYRDEEDNGQNILEYDFDSVQDYYDTRKEFDYVGII
DREASRKKNKTNEEIKDEFKIRKRRPKILSKKRETGIPSFKGAVCRTSKDKEYLLGIASK
LNISSNKTESRIDICDLIRNKLYDLEKYSTSDTTYLIIPSNHPSIPFPLNLKDRTQFIID
QIKRETRTSITPKVIVTDIPNGEFNDIDYVSYELLYDKSVDKFSDIMELYGAIKNDDGWM
IIIK
NT seq
3435 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggataaccaaacaagagatagaaataaaattagaactaaaaataaatcggatactaat
tcaaatactaattcaaatgtagaactcacagatttagaagaaaaaatgttagaaaatcac
acatatccttctcccagtcaggaaaattttcaagaggcaatttatgtcaaacgtgatttt
tacatacattctattccacagagaggaatacttaatgattatgatgacataaaagaattc
agagacaataaatgcgctggtagttttaaattaacagaaacacaaattttattatcaaat
tttattaatcccaacactccttacaaaggattattaatatatcaaggtaccggtgtcggg
aaaacatgtgctgcagttgctattgcagaaaaatttaaaccaatggtagaaaaatatagt
atgagaattcatgtattagttcccggaccactcaataaacaaaatttttttaatgaaatt
attaaatgtacaggtgaaacttatacaaaaatgttccaagataaaacaataatacttaat
gaaacagaaaaaaataaaataaaacgaaatgcattaaacatagtaaatcaatactacaga
gtaatgtcatatagatctttttacaaaaaagttttaggagagaaaattagagataaagtt
gtttcgggaaataaaattaaattgacaagtcgaaaaacagaaagtggtgaatatgaaaga
gatatttcaattgacagaatatataatttagataataccttgttaattattgacgaggca
cataatataactggaaatgaacaaggagatgctgttaaaaaaataatagattcttcaaaa
aatttaaaaattatattattaacagcaactcccatgaaaaatttagctgatagtattgtt
gaattaataaattttttacgcccaaaaaattttcaaatggaacgtgataaaatattcacg
agtcaacgaggcagtgacatggatttcaaatctaatggaagagattatttaagaaaaatg
gttcgtggatatgtttcatatttacgaggagctgatccgttaacttttgctgaaagagta
gatgttggtgaaattccaccaggtcttagttttactaaagtaactagatgtctcatgtta
ccatttcaacttcaagtttataataatgttgtggaaacacaagatgacagattagataaa
aattctggagcagtttgtaattttgttttccctggtcttcccaaaaataaaaataataaa
gaaattgttggatattatggaatcaaaggtatgaatgatgttagaaatcaaatattaaat
aattccactacacttaatacacgtatagcatcaacaatattatcaaattatgacattaaa
gatatttcgtctttaatatatttaacagaaaataacagtgttattagtggtaatattttt
agtgaaaaatatttaaaacatttttcaataaaattttatgaagctcttcgtaaaataaat
gaaaatgtgtatggaaaacgtggtcctggattaattttcgcatatttgaatttagtcaaa
attggaactaatatttttaaagaagttttgcgcgttaatggttatcttgaataccaagaa
aatcctagtgactatatattatcttctgatactaaatgttattattgtgattatacacat
ggcgatcatcaacatcttccagattcaataccaaaacacgaatttttccctgcaacttat
attacagtaacaggtaaatctgatgaagatgcagatcaaataccagaagaaaaacacgat
atattaaaaaatgtttataataatattaataaccgtgatggtaaatatttaaaaattgtt
gtaggatctaaagtaatgaatgaaggaataacattgaaaaatgtcaaagaaatatatata
ttggatgtgcattttaatttgggtaaagttgatcaagcaataggtagaggtattcgattt
tgcactcattatgatgttatcaatgaaaataatccatttccaaaagtagaaataaataaa
tatgtagtttctcttaaagatggattatcaactgaagagcaactttataaaaaagcagaa
caaaaatataaacttattaaacaagtcgaacgtattttacaagaagaagcaattgactgt
ccactaaatcgtaatggaaacatatttcctgaagaaattgaaagatatggaaattgtgga
acaaaaaataatccatgtccagctatttgtggatatatgccatgtgattataaatgtgga
gataaaatgttaaatgccagattttatgatcctgaaaaaggaatttataaaaaaattagt
aaatctgaactagattattcaacatataataattcattagcaagtgatgaaattaattat
gctaaaacaaaaattaaagaaatgtttcatattgattatacgtatacacttgataatatt
attgaatatgtaaaaaattcatatcctgaagataaaagagatatgtttgatgatttttat
gtttatcaagctttaaatgatttaattccaattactggaaatgattttaataattttcac
gatattatggctgacaaatttaatagaccaggatatttgatttacatcaataaatactat
atatttcagccatatgatgaaaatgaagaattacctatgtattatagaaaaacatttaat
tatcctgcgactaataaaataaatgtaaaagattacatacgcaatacaccagaatatcaa
aaatatcggcaaatatatcgtgatgaagaagataatggacaaaatattttggaatacgat
tttgattctgttcaagattattatgatactcgcaaagaatttgattatgttggaattata
gatagagaagcttctagaaaaaaaaataaaacaaatgaagaaattaaggatgagtttaaa
attagaaaaagacgtccgaaaattttatctaaaaagcgagaaactggtataccatctttc
aaaggagctgtatgtagaacctcaaaagacaaagaatatttacttggaatagccagtaaa
ttaaatatatctagtaataaaacagaaagtagaatagatatatgtgatcttataagaaat
aaattgtatgacttagaaaaatattcaacatcggatacaacatatttgattataccatca
aatcatccatcaataccttttccactaaatttaaaagatagaacgcaatttattattgat
caaattaagagagaaacaagaacatctataacacctaaagtaatcgtcactgatatacct
aatggtgaatttaatgatattgattatgttagttatgaattattatatgataaatctgtg
gataaattttctgatattatggaattatatggagctattaaaaatgatgacggatggatg
attattattaaataa
DBGET
integrated database retrieval system
