Viruses: 80558436
Help
Entry
80558436 CDS
T40000
Symbol
QLL95_gp0892
Name
(RefSeq) Cotonvirus japonicus; putative regulator of chromosome condensation
Virus
2811091
Cotonvirus japonicus
Taxonomy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
VOG
VOG cluster
Motif
Pfam:
RCC1
RCC1_2
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
80558436
NCBI-ProteinID:
YP_010841839
RS:
NC_079139
LinkDB
All DBs
Position
NC_079139:complement(845051..847975)
Genome browser
AA seq
974 aa
AA seq
DB search
MINNIPVAITANETTSSAVTSGGNVYQTGLIGGKIHYSFNEIITNENIVGRVIDAKATDD
RLYLLNSGGSVFEYAYNSGTCVPLVREVYSPAACGGDKAIKIEAGRAHILILTEANKIWG
AGNNEQYQLVPQGQCRYDTAVEIIVTDTNVHDNECPDTFSGIYNELECPVIPVCEKDNHN
ISCVKKNLCDVLLGYINVSHVVIEPTCQSGTLSIPVYGDINYVGFLCVDKTGCATGSVTY
TINRVYIKCGCFVGKFTHKDSCGCHVRELNISSTCQVLIFQSNPCPSANTDLCAQGGSPP
ITGTTQITGKCGSCVIANVDVPCDLALPSVAFEAACKTIVLCLNDCKTSLAVLCDGALND
YCVGSTTLDLDFDVPLDCEAPKIVRPEIELPQPCWAGIYAGFDISVLVDNCNRIYVFGSL
HNIRSNKDLLRGSCLEELLNKTNASISFPADQLNCGGNRSVRNDNCPCPKCKDKEFKTDL
NKFGIHLSFPSGEDECSKNMNVCDFLQSLKTCNESQSCDNTCEPCDGYIYLNVSGNCGCP
CGAPASSPIGSVTLFNKKSICKLASQNCPDIAKISVDVNTIVEFDLNKYCIDSTDVALDK
IVKLNFCNDGPNVNVYIDIDQPGGIKFTSSGKKCNVEFTVSASTQNHQYILNFGSILDPV
ELTNLKYSLSLDCYYPCPKYKNPFDTKITNTYLKGGDRVKFVVSNPKNIRQAVTADIPTV
FRLKRRIIDVGVGYNNLTVLVGGLACPNEIFALGNNCHGELGIGSNETVVSWRQLNRCIF
DCQVNKVFSGKYVTFYVTQSNSVYSTGQWKCFVNSTSPQIVKSICQAWKITDIAISTNQI
LLLGSDGCIFGLGDNHLGELGLCHLDCVKKPTPISFFYKLSNSAVKQFNDSLSHPVEKNN
RKNNRPFNPCEFGNNGGPCAPGPCGPFGPFGPFNNNNFNNNYGPEDYNNYRSNKYPRGTN
KYQPNGRLHSKRGY
NT seq
2925 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgataaataatatacctgtagcaattactgctaatgaaaccacaagttctgctgtgaca
agcggtggtaatgtatatcaaacaggtttaattggtggtaaaatccattattcatttaat
gaaattataaccaatgaaaacattgttggacgcgttattgatgctaaagctactgatgat
agattatatttattaaattctggcggttcagttttcgaatatgcttataattctggtact
tgtgtccctcttgtacgagaagtttattcacctgctgcatgcggtggtgataaagccata
aaaattgaagccggtcgtgctcatatattaattcttactgaagcaaataaaatctggggt
gcgggtaacaatgaacaatatcaattagttccccaaggacaatgcagatacgatactgca
gttgaaattatagtaactgatactaatgtccatgataatgaatgtcctgacactttctca
ggaatttacaatgaattagaatgcccagttattcctgtgtgcgaaaaagataaccataat
atttcatgtgtcaagaaaaatttatgtgatgtattacttggttatattaatgttagtcat
gtagtcatcgaaccaacatgtcaatctggaactcttagtattccagtttatggtgatatt
aattatgttggatttttatgtgtagataaaacaggatgtgctactggatctgttacatac
actattaatagagtatatattaaatgtggatgttttgttggtaaattcactcacaaagat
tcatgtggatgccatgttcgcgaattaaatatttcaagtacatgtcaagttcttattttc
caatcaaatccatgcccatcagccaatactgatttatgcgctcaaggaggctcaccacct
attacaggcacaactcaaatcactggtaaatgtggatcatgtgttattgctaatgtcgat
gttccatgtgatctcgctttaccttcagttgcatttgaagctgcatgcaagaccatagtt
ctttgtttaaatgattgtaaaacaagtttagcagtattatgtgacggtgctcttaatgat
tattgtgttggatcaacaactttagatcttgattttgatgttcctcttgattgtgaagct
cctaaaattgtgagacctgaaattgaattacctcaaccttgctgggctggtatttatgct
ggatttgacataagtgttttagtagataattgtaatcgtatttacgtttttggttctctt
cataatattagaagcaataaggatttactcagaggttcatgcctagaagaacttttaaat
aaaacaaatgcatcaattagtttcccggctgatcaattaaattgtggtggtaatagaagt
gtaagaaatgataattgtccttgtcctaaatgcaaagacaaagaatttaagaccgatctt
aataaattcgggattcatttaagtttccccagtggtgaagatgaatgctcaaagaacatg
aacgtttgtgatttcttacaatcattaaaaacttgtaatgaaagtcaaagctgtgataat
acttgtgaaccttgtgatggatatatttaccttaatgtttccggaaattgtggatgtcct
tgtggtgctcctgcttcaagtcctattggatctgtcacattatttaataaaaagagtatt
tgtaaattagcaagtcaaaattgtcctgatatcgctaaaatatcagttgatgttaatact
attgttgaatttgatttaaataaatactgcattgattcaactgatgttgctcttgataaa
atcgttaaattaaatttctgtaatgatggtcctaatgttaatgtatatattgatattgat
caacctggtggtattaaatttacatcttctggaaagaaatgtaatgttgaattcactgta
agtgcaagcacacaaaaccatcaatacattttgaacttcggttccattttagatcctgtt
gaattaacaaatcttaaatattcactcagtctcgattgttattatccttgtcctaaatat
aaaaatcctttcgatactaagatcactaatacatatctcaaaggtggtgatcgtgttaaa
tttgttgtaagcaatcctaagaatattagacaagcagttactgctgatattcctacagtt
ttccgtctcaagagaagaattattgatgtaggtgttggttataataatttaacagtttta
gtcggaggtcttgcttgccccaatgaaatatttgccttaggtaataattgtcatggtgaa
cttggtattggcagtaatgaaactgttgtgtcatggagacaactcaatagatgtatcttt
gattgtcaagtcaataaagtgttctcaggtaaatatgttacattctatgtaactcaatct
aacagtgtttatagtactggtcaatggaaatgttttgtaaattcaacaagtccacaaatc
gtcaaatctatttgccaagcatggaaaattactgatatagctattagcacaaatcaaatt
ctattactcggttctgatggttgcatatttggtcttggtgataatcatcttggagaactt
ggtttatgtcatttagattgtgtcaaaaaacctacacctattagtttcttctataaatta
agtaacagtgccgttaaacaatttaacgatagtctcagtcatccagttgaaaagaataat
agaaaaaataatagaccattcaatccttgtgagtttggtaataatggaggtccttgtgct
cctggtccctgtggcccattcggaccttttggcccctttaataataataattttaacaac
aattatggtcctgaagattacaataattatagatcaaataaatatcctcgaggaacaaat
aaataccaacctaatggtagacttcattcaaaacgaggttattaa
DBGET
integrated database retrieval system