Viruses: 80558460
Help
Entry
80558460 CDS
T40000
Symbol
QLL95_gp0868
Name
(RefSeq) Cotonvirus japonicus; hypothetical protein
Virus
2811091
Cotonvirus japonicus
Taxonomy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
VOG
VOG cluster
Motif
Pfam:
Ank_2
Ank
Ank_4
Ank_3
Ank_5
VWA_2
ANK_LRRK2
VWA
zf-Nse
U-box
ART
zf-RING_2
zf-C3HC4_2
zf-RING_UBOX
DUF7234
zf-rbx1
CttA_N
PolC_DP2_N
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
80558460
NCBI-ProteinID:
YP_010841863
RS:
NC_079139
LinkDB
All DBs
Position
NC_079139:871691..875944
Genome browser
AA seq
1417 aa
AA seq
DB search
MEIEKENDLHKDLQCPITNELMEDPIRVPCCGQAFERLAIVQWLETSRTCPWCKENLITF
DALTARKDILLVRIIDTLKSQKKIIQQHSKHHTWNCKVTPIFDLQNKILPISQLSVTLDN
SVFDTKMSLFIIVIDKSGSMGGNPFNQVKSALTHIISLTASSPFIKTVIVPYDSTAKIID
INGSEADTIRIIHSLSASGGTNFNAAFNRVGEILSQYNSNVSNYGHANIAFLTDGDSSEP
IEPLMQNFKHILNENWCGSLTVHSIGFGQHCNKILLEALWQSGTINGTFRYAEPQDDPDT
LCNKLTGLFDLVKNFSNVPINFKLSNLSFVLNKNNKSTNIDVQFPINQRKQGIYDCWING
NINDTGSLIINSQLDNNIEIPIQINESTNVVQRKILYHKWISVSADEIASDILELNKIDK
SIYDSDLYELQTAILVSKIESMMFCVDKNIDLVLYQKIEYLNTSLSNMINGQKINEGKLG
DMRFASQYTVTSGQKQKQIIDTQSRQQPIFQISNEQAFEEYTKRYTRNNKNKNRNDLQES
IMNNVMDTTSSITTYWLNLATPEIMKQRDIDGNTALMLAAFCGQSSTIDVIIKKFPDIDL
ELVNNDGETAITLAIKSRGFDRSINILLDAGAVIPHNRVKSLERYAIDMNYNRTAKIIGE
RGDDSTDIHENMSETYILFMYEKIIKRNLRFDINNYLKIALAKSMTELVEKLIEVHGAKP
SIDMLLKLITSESNCYEIIKYLISYSYEEGLIDVNQVNDNGDFILFRASEKGNLQLVKMF
IELGANVNQQNKLGNTAIWIACWKKYPCIISELIDSGADINLANFKGNVPLTNTCQMGPK
KIAEMLVARGADVNVINKNGDTLLLLCCRNGQHEVLEVLLSRICPSLIEHKAHIDGFSAI
LAATESNKPDCIKILCDYGINIEQKTDINNEIIKGATSLHLAAYYNRIEAAVMLISLGAN
INSLDINNQTPLHTAIIQGNYEIVKLLRNYKANLFIIDSFGGIPMSYCRDSKIKDYLANP
LLKPLMKLASGNFSTISEKNACKLLRENESIGILNNSDIIDVVNFDGKTPLMMAIINSKY
ELVKLFLELGANPAHENNQGNNCYFWVFWINNPKITSLFDKPDIKVVEKINQLKKISIKN
SQNAMILYLNNKPKTTTISQKMTSSIYSRMDDFINDIGKSSYFIKSICNNPLLESVSIID
LFDQKEFLKLCSLDSCADIIFEAKVLTINLIASGNTNLEPHQAITITMYSTILSSLINSL
ILKENISFMKVYIQHLMESLNRLPSFEAEVFIGTDKLCNRERFIVGEKISWPIFISGSTS
WKIATENTINFTTKKQGTIFLIRSRTGKYIGQYSFTPFDSEVVFLPNTNFTVTAWYTGDV
IALGQSNIRTHSFEVKEDNIHKMIHSNNSLIIELTEI
NT seq
4254 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggaaattgaaaaagaaaatgatttgcataaagatcttcaatgtccgattactaatgag
ttaatggaagatccgattcgcgtaccttgttgtggtcaggcttttgagcgattggctatt
gttcagtggttagaaacatcacgtacttgtccttggtgtaaagaaaatttaattacattc
gatgcacttactgcacgtaaagatattttattggtgagaattattgatacattaaaatct
caaaaaaaaataattcaacaacattcgaagcatcacacatggaattgtaaagtaacacca
atattcgatctacaaaataaaattttaccgatatcacaattgtctgtcacactagataat
tctgtatttgatactaaaatgagtctgtttattattgttattgataaatctggttcaatg
ggtggtaatccattcaatcaagtcaaaagtgcattgactcatataatttcattaaccgct
tcaagtccttttattaaaactgtaatagttccttatgatagtacagctaaaattattgac
ataaatggatcagaagctgatacaattagaataatacattcattaagtgcgagtggtggt
actaattttaatgcagcatttaatcgggtaggtgagatattgagtcaatataattctaat
gttagtaattatggacacgctaatatcgcatttttgactgacggtgattctagtgaacca
attgaaccactcatgcaaaattttaaacatattttaaatgaaaattggtgtggatctctt
acagttcactctattggttttggtcaacattgtaataaaatattattagaggctttatgg
caatcaggtacgataaatggcacgtttagatatgctgaaccgcaagatgatcctgatact
ctttgtaataaattaactggtttatttgatttagttaaaaatttttctaatgtacctatt
aattttaaattatctaatttatcatttgttttaaataaaaataataaatctaccaatatc
gatgtacaatttccaatcaatcagcgaaaacaaggaatatatgattgttggataaatgga
aatattaatgatactggtagtttaattataaattcccaacttgataataatattgaaatt
cctattcaaatcaacgaatctactaatgtagtacaacgtaaaattttatatcataaatgg
atttccgtttcagcagatgaaatagcatcagatattttggaattgaataaaattgacaaa
tctatttatgattcagatctgtacgaacttcaaactgccattttagtctcaaaaatagaa
tctatgatgttttgtgttgataaaaatatagatttagtgctttatcaaaaaatcgaatat
cttaacacttcattatccaatatgataaatggtcaaaaaattaatgaaggtaaattaggc
gatatgagatttgccagtcaatataccgtcacatctggacaaaaacaaaaacaaattatt
gacacacaatctcgtcaacaaccgatattccaaatttctaacgaacaagctttcgaggag
tatacgaaaagatacacaagaaataataaaaataaaaatcgtaatgatttacaagaaagt
atcatgaataatgtcatggatacaacatcaagtattactacatattggcttaatttagct
acaccagaaattatgaaacaacgtgatattgatggtaatactgcactaatgttagctgca
ttttgcggacagagttctactattgatgtgattattaaaaaatttcctgatattgactta
gaattagtaaataatgatggagaaacagccattaccttagccattaaaagtcgaggtttt
gacagatctatcaatattttacttgatgctggtgcggttattccacacaatcgtgttaaa
tcattagaacgatacgcaattgatatgaattataatcgtactgcgaaaataattggtgaa
cgtggtgatgattccacagatattcatgagaatatgtcagaaacgtatattttgtttatg
tatgaaaaaatcatcaaacgaaatttgagattcgatatcaataattatttaaaaattgcg
ttagcaaaatctatgacagaattagtcgagaaattgattgaagttcatggtgcaaaacca
tcaattgatatgttattgaaattgattacatctgaatcaaattgttatgaaattattaaa
tatttaatttcatattcttatgaagaaggtttaatagatgttaaccaagtcaatgacaat
ggtgattttatattgtttagagctagtgaaaaaggaaatttgcaattagtcaaaatgttt
attgaactgggagcgaatgttaaccaacaaaataagctaggaaatacagctatttggata
gcttgttggaaaaaatatccttgtattatttctgaattaattgattcaggtgctgatatt
aacttggcaaatttcaaaggtaatgtgccattgacaaacacatgtcaaatgggtcctaaa
aaaatagcagaaatgcttgtggctcgtggagccgatgtaaatgttatcaataaaaatggt
gacacattattgttattatgttgtagaaatggccaacatgaggtcttagaagtattacta
agtaggatttgtccatcgttaattgaacataaagcacatattgatggattttctgccata
ttagcagcaacagaatctaataaacctgattgtatcaaaatattatgtgattatggtatt
aatatcgaacaaaaaacagatattaataatgaaataataaaaggagctacatctttacat
ttagcagcatattataatcgaattgaagctgctgttatgttaatatctttaggagcaaac
attaattctctagatattaataatcaaacaccgttacatacagcaattattcaaggaaat
tatgaaatagtaaaactattgagaaattacaaagcaaatttattcattatagattcattt
ggtggtattccaatgtcatattgtcgtgattcaaaaataaaagattatttggccaatcct
ttactcaagccattaatgaaattagccagtgggaatttttcaacaatttctgaaaaaaat
gcgtgtaaattgttgcgcgaaaatgaatcaattggcatattgaataatagtgatattatt
gatgtagttaattttgatggcaaaactccattaatgatggctattattaattcaaaatat
gaactagtcaaattattcctggaactgggtgcaaatccagctcatgaaaataatcaagga
aataattgttatttttgggttttttggatcaacaatccgaaaattactagcttatttgat
aaaccagatattaaagtcgttgaaaaaataaatcaactcaaaaaaatatcaattaaaaat
tctcaaaatgctatgattttatatttgaacaataaacccaaaactacaacaatttcacaa
aaaatgacatcaagtatttattcgagaatggatgattttattaatgatattggaaaatca
tcttattttataaaatcaatttgtaataatccactattagagtcagtttctattattgat
ctttttgatcaaaaagaatttctaaaattatgctcactcgatagttgcgctgatattatt
tttgaagctaaagtattgaccattaatttgatcgcttctggtaatactaatttggaacca
catcaagcaattacaataactatgtattctaccatactttcgtcattaataaattcttta
atactaaaagaaaatatatcttttatgaaagtttacattcaacatttaatggaaagttta
aatcgactaccttccttcgaagcagaagtttttattggaactgataaattatgtaataga
gaacgttttattgttggagaaaaaattagctggccaattttcatttcaggttctacttca
tggaagattgcgacagaaaatacaattaattttactacaaagaaacaaggaactatattt
ttaattagatcacgtacaggtaaatatattggtcaatattcttttacaccttttgactca
gaagtagtatttttaccaaatactaattttactgtaacagcttggtacacaggagatgtt
attgcacttggtcagtctaatattagaacacactcttttgaggttaaagaagataatatt
cataaaatgattcatagcaataatagtcttatcattgagttgacagaaatttaa
DBGET
integrated database retrieval system