Viruses: 80558480
Help
Entry
80558480 CDS
T40000
Symbol
QLL95_gp0848
Name
(RefSeq) Cotonvirus japonicus; putative ring finger protein
Virus
2811091
Cotonvirus japonicus
Taxonomy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
VOG
VOG cluster
Motif
Pfam:
zf-C3HC4_3
zf-RING_2
zf-C3HC4_2
zf-C3HC4
zf-RING_UBOX
zf-RING_4
zf-RING_5
Prok-RING_4
zf-rbx1
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
80558480
NCBI-ProteinID:
YP_010841883
RS:
NC_079139
LinkDB
All DBs
Position
NC_079139:complement(905440..907374)
Genome browser
AA seq
644 aa
AA seq
DB search
MKQTFRIIHVNKKNVNLYYDTTNGFIIDKINNKIIYKLKKRESSYYYYFKLEFDTFKYKT
IYQPKTQTYKKIVCGSIYNFNIYLNLVNLIKNNIDKCINQIISYYLTIIQIRQFKSNKKY
LCDNILLFLQSRIDKNIKLIPWNFFALTDRIAFDLKNKNFVDSKNSQNCVFKKRGCIIET
NNIIKLINDIENKIPPEKTLIIIPTGMINYWSNNNVINFDKLLKSAKNNFKNLELGDITS
IIIHECYIQYIPLIKNVMNNTPLCEYIWMVNTLPLKYYISSKDNIHGKFNVNNLSKLTNI
WANFTTDNKKSSKTELIKFLTCSFNEIYIKYNYALRTYNIKSINLTNFESSIYQTFNKFY
FDWKSKLSNDKNNIYSFSTKQKNYDIESRIYDSVLTLCMSVIPDIEVQNFFSKYINKILS
ANRICIEKINELQQNYKTLRKTSYQKFNDKSIIDFKYIIKDLSDNKNKILTSIKNREKYL
TKGFYDAYTEEKCPVCYSDDMINTKLICGHNVCLECTLNILPNTKSCPLCAESININKMV
IIRDSIPEYTSNIVKFFDKIHNNNTIIVSDLFELSNLLQKNLNILNINDFYIVEKIFSYH
DIEKIIIVTLPKHLMRNYNVYNFAHYFENINPNIKIIVMEVTMF
NT seq
1935 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaacaaacatttagaataatccacgtcaataaaaaaaatgtaaatttatactatgat
accacaaatggttttattattgataaaattaacaataaaataatttacaaattaaaaaaa
cgcgaatcttcttattattattattttaaattagaatttgatacgtttaaatacaaaaca
atatatcaaccaaagacgcaaacttataaaaaaatagtatgtggtagtatctataatttt
aatatatatttaaatttagttaatttaattaaaaataatattgataaatgtattaatcaa
attatttcatattatctaacaattatacaaattcgacaatttaaatccaataaaaaatat
ttgtgtgataatattttattgtttttacaatcaagaattgataaaaacattaaattaatt
ccatggaatttttttgcactgacggatcgaatagctttcgatctcaagaataaaaatttt
gttgattcaaaaaattcacaaaattgtgtgtttaaaaaacgaggatgtattatcgaaact
aataatattattaaattaattaacgatatcgaaaataaaataccaccagaaaaaacctta
ataattattcctacaggcatgataaattattggtcaaataataatgttattaattttgat
aaacttttaaaatcagcaaaaaataatttcaaaaatttagaacttggtgatattaccagc
attattattcatgagtgttatattcaatatatacctttaattaagaatgttatgaataac
acaccattatgcgaatatatttggatggttaatacattacctcttaaatattacatatca
tcaaaagataatattcatggtaaatttaatgtaaataatttatcaaaattgacaaatata
tgggcaaattttacaacagataataaaaaatcgagtaaaactgaactcataaaattttta
acttgctcttttaatgaaatatatataaaatataactatgcgttacgtacttataatata
aaaagcataaatttaactaattttgaatcaagtatttatcaaacttttaataaattctat
tttgattggaaatcgaaattatcgaatgataagaataatatttattctttttccacaaaa
caaaaaaattatgatatagaatcacgtatttatgatagcgttttaacgttatgcatgtca
gttatacctgatattgaagttcaaaattttttttctaaatatatcaataaaattttatca
gcaaatcgtatatgtattgaaaaaataaatgaacttcaacagaattacaaaacattaaga
aaaacttcatatcaaaaatttaatgataaatctattattgattttaaatatataataaaa
gatttatctgataataaaaataaaattttaacctcaattaaaaatcgagaaaaatatcta
acaaaagggttttatgacgcatatactgaggaaaaatgtcctgtttgttattccgatgat
atgattaatactaaattaatatgtggtcataatgtttgtttggaatgcaccttaaatata
ttacctaatacaaaatcatgtccattatgcgcggaatctataaatataaataaaatggtc
ataatacgtgattcaattccagaatacacatcaaatattgttaaattttttgataaaatt
cacaataataatactatcattgtatccgatttatttgaattatctaatcttctgcaaaaa
aatttaaatattttaaacataaatgatttttacattgttgagaaaattttttcatatcac
gatatagaaaaaataattattgttactttaccaaaacatttgatgcgaaattataatgtt
tataattttgcacattattttgaaaatataaatccaaatattaaaatcattgtaatggaa
gttacaatgttttga
DBGET
integrated database retrieval system
