Viruses: 80558542
Help
Entry
80558542 CDS
T40000
Symbol
QLL95_gp0786
Name
(RefSeq) Cotonvirus japonicus; putative ATP-dependent RNA helicase
Virus
2811091
Cotonvirus japonicus
Taxonomy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
VOG
VOG cluster
Motif
Pfam:
SNF2-rel_dom
Helicase_C
ResIII
DEAD
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
80558542
NCBI-ProteinID:
YP_010841945
RS:
NC_079139
LinkDB
All DBs
Position
NC_079139:complement(986760..988082)
Genome browser
AA seq
440 aa
AA seq
DB search
MIVLNPHQKTPIRFMKKNRGIILFHSTGAGKSLTALYSVYQFDYNITIIGPKSSKKAFID
NINKADMDINRFTFYTYTKIKKILESDITFFKNTSVIVDEAHTLRNENMYNLYIASALMI
APKVILLTATPVVNYFNDLSVLVNIVKGQDVLPTDRLLFDHMFYDEETMLLINTNTLFNK
LLNSISYYKTTDTINYPSSKTHIMEVEMDYMQIDEYKYYIKKIIYGDTNVPDNYDIFNIN
YGLLPNKKRNFFLNVTRQLSNIAKQADFSPKIQEIIDKITKGPYPIVVYSNFLKNGIYSI
AVLLEKNNISYKIISGFVTQDKLNIIVNNYNNGMFKVLLLSSAGSESLDLKNTRQVHIME
PHWNESKITQVIGRSIRYGSHINLPIEERKVDIYRWISIFPEQYKNISADQYLMELSLKK
TKLWNKYLEIVIDASIENNH
NT seq
1323 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgattgttttaaatccacatcaaaaaacaccaatacgattcatgaaaaaaaatcgtgga
ataattttatttcattctacaggagcaggcaaatcacttacagctttatattcagtttat
caatttgattataatattactataatcggacctaaaagttctaaaaaagcttttattgat
aacataaataaagctgatatggatattaatcgttttacattttatacttacacaaaaata
aaaaaaatactagagtctgatattaccttttttaaaaatacatctgtaattgtcgatgaa
gcacatactttgcgcaatgaaaatatgtataatttatatattgctagtgctcttatgata
gctcctaaagtaatattattgacagctacacctgtggtaaattatttcaatgatttatca
gtattggttaatattgtcaaaggacaagacgtattaccaacagatcgattattatttgat
catatgttttatgacgaagaaacaatgctacttataaatactaatactttattcaataaa
ttattaaattcaatatcatattataaaaccactgacacaataaattacccttcaagtaaa
actcatattatggaagtagaaatggattacatgcaaattgatgaatataaatattatatc
aaaaaaataatatatggtgataccaatgttcctgataattatgatatctttaacattaat
tatggattattacctaataaaaaaagaaatttttttttaaatgtgacaagacaattatct
aatattgcaaaacaagctgactttagtcctaaaattcaagaaattattgataaaatcacc
aaaggtccatatccaattgtcgtatattctaattttcttaagaatggaatatactcaata
gcagttttattagaaaaaaacaatattagttataaaataatttctggttttgtgacacaa
gacaaactcaatatcatcgttaataattataacaatggtatgtttaaagtattattatta
tcatcagcaggatccgaaagtttagatttaaaaaatacaagacaagttcatataatggaa
cctcattggaacgaatcaaaaattacgcaagttattggtcgttctataagatacggttct
catattaatttacctatagaagaaagaaaggttgatatatatcgttggatatctattttc
cctgaacaatataaaaatatttctgctgatcaatatttaatggaattaagtttgaaaaaa
acaaaactttggaataaatatcttgaaatagtaattgatgcatctattgaaaataatcat
tga
DBGET
integrated database retrieval system
