Viruses: 80558560
Help
Entry
80558560 CDS
T40000
Symbol
QLL95_gp0768
Name
(RefSeq) Cotonvirus japonicus; putative DNA repair protein
Virus
2811091
Cotonvirus japonicus
Taxonomy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
VOG
VOG cluster
Motif
Pfam:
Metallophos
AAA_23
SMC_N
Metallophos_2
YgaB
DEK_C
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
80558560
NCBI-ProteinID:
YP_010841963
RS:
NC_079139
LinkDB
All DBs
Position
NC_079139:1005573..1009649
Genome browser
AA seq
1358 aa
AA seq
DB search
MSVKSENKKTSKSESKNKSQSETSVSSDKSITYIKLVDDNKTEVNCIYHLSDIHIRNTQR
HVEYKEVFNRTYKKIKTDLESKQNINPIESLIVLTGDIVHTKTELSPEVINITYHFFKSL
CEITNVILIPGNHDCNLSNKNRMDALSPIIDDIGKLPNLYYLKKSGIYQYYNIVFGVTSV
FDDKLVDSSKINKEMWKKIKQKNKYKIALYHGPVHGAKTDVGYRMHNEQLLVEDFNGYDY
VLLGDIHKFQYLNEQKTIAYSGSLIQQSYGESLNGHGILKWNILDGNSEHFEIRNDYGFC
TVKIVDGKIIDTKIPKKPRIRFILENTNQLQYQEVVNTLEKTYLINEIVKESSFKTKYNH
SSPSKTKEKPTAYKTQETIIKSYLEKNNLDKDTIISIIDLHKKIYQKILSDKKDTVNDVM
HNAVQNQKWKILELQFSNTLSYGKDNIIDFRKYDPNKIIGIFAPNHYGKSAILDIILFCL
FDKCSRGERRDILNKNKNDMYCSILLSVGSQQYFIERIGTRNKNGLTVKIDVNFFSITTD
KKGKTKREKLNGLDKNDTNKKISELIGDYNDYLTTCFCLQQGKSSNFIDMTQLQKKEYLN
DVLKLNVFENCHNYGKDKLKQMTGQLKLLEQSIGNKSIEDFKEKINSLCSDIKNFSSQKI
YIEQELMPDVDFILSNIPHKPKIHYDELSDYKLNTYQEIIDQITEIESLLNKLNINNDFK
DIQSDIDEEKNKLLELSKIFNENEINREHDLLELRSVKEGLIKQLVKISKFTNKDDVNDL
QDEIAKCLDRIIIIDHVLEEHKNDELTDKMSRIDELKIIIDKFRKSLKIIRDYDNEYIMD
LKKNLSIAKSEFDLAIKDLFEVKNILNVEEKNNLSKTVELKKYFINNLVSNQKLLESYEL
GLSQNNDTIINNVTKKNQQVINKESKWIETTKKSIEFNNTKSLDTDKIRNNYKQLKFKLS
DYYMNVINQQHNDSINEKINKAQQELDALSEFSGTKREINNLLQEKNILQEKIKLLESKI
KEIKCIECGIESNNIIQLKIDKVQQDIDLIIDSQKNESKKLDQLRSIISNKESILKNHQK
QIDKYHKYYNHYVLLNKYLLDYFCWSQRNDMIIKWSKQKNDLTNKLHLMTEELNKKQVEL
DFYKKEIEQYINSRKEFDDKSAQVNIYQHYVQIMNCNGLPYEILKTYLPLIESDVNEILH
SMVSFSIEFMFYDENKIEDQKSKQMKSTMGSVNVNICYEGMKPYSVQLVSGFERFIIGLA
IRMTLCQISLTAKPNFLIIDEGWSCLDSENLNNVGTIMNYIKTQYEHVIIISHLEELKNQ
ADYIINIDKRDGHSYIQDQHKITGKKYHGKKQMKVVEL
NT seq
4077 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagtgtaaaatctgagaacaaaaaaacatcaaaatctgaatctaaaaataaatcacaa
tcagaaactagtgttagttctgataaatctattacatatattaaattggttgacgataat
aaaacagaagtgaattgtatttatcatttatctgacatacatatcagaaatactcaaaga
catgttgaatacaaagaagtatttaatagaacatataaaaaaataaaaacagatttagaa
tccaaacaaaacataaatccaatagaatccttgattgttcttacaggagatattgtacat
actaaaactgaattaagtcccgaagtcattaatatcacatatcatttttttaaatcattg
tgtgaaattactaatgttattctcataccaggaaaccatgattgtaatttgtccaataaa
aatagaatggatgcattaagtcctattattgatgatattggaaaattacccaatctttat
tatttgaaaaaatccggtatttatcaatattataatattgtatttggtgtaactagtgtt
tttgatgataaactggttgattctagcaaaattaataaagaaatgtggaaaaaaattaaa
caaaaaaataaatataaaatagctctttatcatggtcctgttcatggagcgaaaacagat
gttggatatcgtatgcataatgaacaattacttgttgaagattttaatggttatgattat
gttttgttgggtgatattcataaatttcagtatttaaatgaacaaaaaacaatagcatat
tcaggatctttaattcaacaatcatatggcgaaagtttaaatggtcacggtatattaaaa
tggaatattttggatggaaatagtgaacattttgaaataagaaacgattatggtttttgt
acggtgaaaatagttgatggaaaaattattgatacaaaaattccaaaaaaaccaagaata
cgttttattttggaaaatactaatcaattacaataccaagaagttgtgaatactcttgaa
aaaacatatttgatcaatgaaatagtcaaagaatctagttttaaaactaaatataatcat
tcaagtccttctaaaactaaagaaaaacctactgcttataaaactcaagaaacaataatt
aagtcatatttagaaaaaaataatttagacaaagatactattatatctattattgatttg
cataaaaaaatttatcaaaaaattttatcagataaaaaagataccgttaatgatgtaatg
cacaatgctgttcaaaatcagaaatggaaaatacttgaattgcaattttcaaatacatta
tcatatggaaaagataatataattgattttagaaaatatgatcctaataaaattatagga
atttttgcacctaatcattatggtaaatctgctattttagacatcatattattttgttta
tttgataaatgtagtaggggagaacgaagggatattttaaataaaaataaaaatgatatg
tattgttctatattattaagtgttggtagtcaacaatattttattgaaagaattggtaca
agaaacaaaaatggtttaaccgttaaaattgatgttaattttttttctattacaacagat
aaaaaaggtaaaacaaaacgtgaaaagctcaatggtttagataaaaatgatacaaataaa
aaaatatctgaattaataggtgattataatgattatctaacaacttgtttttgtttacaa
caaggtaaaagtagtaattttattgatatgactcaattacaaaaaaaagaatatcttaat
gatgttttaaaattaaatgtttttgaaaattgtcataattatggcaaagataaattaaaa
caaatgactggtcaattaaaattattagaacaaagtattggtaacaaatcaattgaagat
tttaaagaaaaaataaattcattatgttcagatattaaaaattttagttcgcagaaaatt
tatattgaacaagaattaatgccggatgtagattttattttgtcaaatattcctcataaa
ccaaaaatccattacgatgaattgtctgattacaaactaaacacttaccaagaaattatt
gatcaaataacagaaatagaatctttattaaataaacttaatattaataatgattttaaa
gatatacaatcagacatagacgaagaaaaaaataaattattagaattatctaaaatattc
aacgaaaatgagataaatcgagaacatgatttattggaattacgcagtgtgaaagaaggt
ttaatcaaacaacttgtaaaaatttccaaattcaccaataaagatgatgtgaatgattta
caagatgaaatcgcaaaatgtttagatcgcattataataattgatcatgttttagaagaa
cacaaaaatgatgaattgacggataaaatgtctcgtattgacgaattaaaaattattatt
gataaatttcgtaaatcattgaaaataatccgtgactatgataacgaatatattatggat
ttaaaaaaaaatttatctatcgcaaaatctgaatttgatcttgcaatcaaagaccttttt
gaagttaaaaatattttgaatgttgaagaaaaaaataatttatcaaaaaccgttgaatta
aaaaaatattttattaataatttagtatctaatcaaaaattactagaatcgtatgaacta
ggattatcacaaaataatgatactataattaacaatgttacaaaaaaaaatcaacaagta
attaacaaagaatctaaatggattgaaacaacgaaaaaatctattgaatttaacaataca
aaaagtttagatactgataaaattagaaataattataaacaattaaaattcaaattgtct
gattattatatgaatgtaataaatcaacagcacaatgattcaatcaacgaaaaaattaat
aaagctcaacaagaattggatgcattatcagaattttcaggaacaaaacgtgaaattaat
aatttattacaagaaaaaaatattctccaagaaaaaataaaattattagaatccaaaatt
aaagaaattaaatgtattgaatgtggaattgaatccaataatattattcaactaaaaata
gataaagtacaacaagatattgatcttattattgatagtcaaaaaaatgaatcaaaaaaa
cttgatcaactgagatcaataatatctaacaaagaatccattttaaaaaatcatcaaaaa
caaattgataaatatcataaatattataatcattatgttttattaaataaatatttattg
gattatttttgttggtcacaacgaaatgatatgattattaaatggtcaaagcaaaaaaat
gatttaacaaataaattgcatttaatgacagaagaactcaataaaaaacaagtagaactc
gatttttataaaaaagaaatagaacaatatattaattcaagaaaggaatttgatgataaa
tcagcacaagttaatatttatcaacattatgttcagattatgaattgtaatggattacca
tatgaaatattaaaaacatatttaccacttattgaatcagatgtgaatgaaattttacat
tcaatggtaagttttagtattgaatttatgttttatgatgaaaataaaattgaagatcaa
aaatcaaaacaaatgaaatcaactatgggatctgtaaatgttaatatttgttatgaagga
atgaagccttatagtgtacaattagtttcaggttttgaaagatttattattggtttggct
attagaatgacattatgtcaaatttctctgacagctaaacctaatttcttaattattgat
gaaggatggagttgtttagattctgaaaatttaaataatgttggaacgattatgaattat
attaaaacacaatatgaacacgtaataattattagtcatttggaagaattaaaaaatcaa
gctgattatattattaacattgacaaacgcgatggacatagttacattcaagatcaacat
aaaattacggggaaaaagtatcatggtaaaaaacaaatgaaagttgttgaattataa
DBGET
integrated database retrieval system
