Viruses: 80558581
Help
Entry
80558581 CDS
T40000
Symbol
QLL95_gp0747
Name
(RefSeq) Cotonvirus japonicus; putative ATP-dependent DNA helicase
KO
K26903
Mimiviridae putative ATP-dependent DNA helicase
Virus
2811091
Cotonvirus japonicus
Taxonomy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
VOG
VOG cluster
Motif
Pfam:
UvrD-helicase
RNase_T
AAA_19
UvrD_C
Viral_helicase1
UvrD_C_2
AAA_22
Big_5
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
80558581
NCBI-ProteinID:
YP_010841984
RS:
NC_079139
LinkDB
All DBs
Position
NC_079139:1029278..1032394
Genome browser
AA seq
1038 aa
AA seq
DB search
MINLSNQDVEFILYLIGNVSDFVSDFTIKTYLKILGCEIDNLKLFVDEKYQIEVKKLTKI
LINNPKILQSIRQYIITKQSNIEFLKIFSEEQITYITDLNSIDTKLIACAGSGKTRSIIG
KIRFMVEHKMVKRENIYAVTFSKHAAVDFHRRIRELFPDHEKFCCLKNFSTIDSLAKSIL
SRIKSHKSENVEILSIALRNFLKNATLEEIDVIRKFKNINHLFIDEAQDLNDIQHDIAVL
LKKHFGTIIHLCGDPNQNIYQFRRSSNSYILEFSGKQFELTKNFRSTKEIINFSEDIKPT
NTTRSVSATNKSGSKTVIITKTSSDVHKLMLTFIELYEKKKDLSNIAIICPTRGIKANNS
VGLAIIFNFLKINKIPVNQLYDESGSNADRKKLVDKIPGHINLLTYHGTKGLEFDVVFVM
DFYHALFNSKPTYEDHNINQYLLYVATSRAISKMFICSYTNNFGGYLNHWITRVNPDTYI
SDSPLKIHKLAFNEGCEYVTMGITELLENLSDEQLSTIYDYLDIDDGNGSFVNRIYEDFR
DIDRHKNEALFGIFCEEFFYLSNYLAKHVTPRKFVLIENIINSKFIVVDNDIECNQLRTY
INNTDLTWEKFYAIKNSIPKNIINLIEKYFNKNKQLNEYIICTSEFVYIVEANKSDIEMT
YKKYLNPMDYHYDYNNILIDFYYLIVVQYAYENNHYYYINDHGKDKQQLLKSGHQLFSKI
NSFVKKNYQYRNINNKIIVNYNKLMLKGEIDFIETNMYGNETIVEIKCVNEINIKYYIQL
LLYNFCHYNTYNNKIAKPQNLFKNGFKIINLLSGLEHYVIVSVSPENMFNILQILSVIGN
LNFSDMNLVYDLETTDQITKQGPYNYKPTIPRSNIYYYGNKYYATIYPEITEIAIKDYET
GMIIINTLVKPTSNINPVAEKKTGITKNMLTDKPSITTIQNILTTKMARFIKCIMMAHNG
NSFDNKIVLFYKLVDPLRTSFIDTMSIIPIHMPNNTKLQNKRLEEIYAALFNKTFQAHRA
MEDVDALISIMKFLGIQF
NT seq
3117 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgatcaatttatcgaaccaagatgtagaatttatattatatttaattggaaatgtatct
gattttgtttcagattttaccataaaaacatatttaaaaattcttggttgtgaaatcgac
aatctgaaattatttgtcgatgaaaaatatcaaattgaagtaaaaaaattaacaaaaata
ttaatcaataatccaaaaattttacaatcaattcgacaatatattatcactaaacaatcc
aatattgagtttttaaaaatattttccgaagaacaaataacatatattactgatttgaat
tctatcgacacaaaattaattgcatgtgctggatctggtaaaactagatctattattggt
aaaataagatttatggtagaacataaaatggttaaacgtgaaaatatttatgcagtgaca
ttttcaaaacatgctgctgtggattttcatcgtagaataagagaattatttcctgaccac
gaaaaattttgttgtttgaaaaatttctcaacaattgattcattagcaaaatcgatatta
agtcgaataaaatcacataaatcagaaaatgtggaaattttatccatagcattaagaaat
ttcttgaaaaatgcaactttggaagaaattgatgttattcgtaaatttaaaaatattaat
catttatttattgatgaagctcaagatctcaatgacatacaacatgatattgcagtgtta
ttaaaaaaacattttggtacaattatacatttatgcggagatcctaatcaaaatatttat
caattcagaagatcatcaaattcatatattttggaattttcgggaaaacaattcgaatta
acaaaaaattttagatcaacaaaagaaattattaatttttccgaagacataaaacctaca
aatacaacaagatcagtttcggccacaaataaatctgggtcaaaaacagtaattatcaca
aaaacatcaagtgatgtacataaattaatgttaacatttattgaactttatgaaaagaaa
aaagatttatcaaacattgccattatttgtccaactagaggtatcaaagcaaataatagt
gtcggacttgctattatttttaattttttgaaaataaataaaataccagttaatcaactt
tatgatgaatcaggttctaatgcggatagaaaaaaattagtagacaaaataccaggtcat
attaatttattaacatatcatggaacaaaaggattagaatttgatgtagtttttgtaatg
gatttttatcatgcactttttaattctaaaccaacatatgaagatcataatattaatcaa
tatttgttatatgttgcaacatcacgagcaatttctaaaatgtttatttgttcgtataca
aataattttggaggatatttaaatcattggataactcgtgtgaatcctgatacatacata
tcagattctccattaaaaatacataaactagcttttaatgaaggttgtgaatatgtaaca
atgggaataacagaattattggaaaatttatctgatgaacaattatctacaatatatgat
tatcttgatattgatgatggaaatggatcttttgttaatagaatatatgaagattttcgt
gacattgatcgtcataaaaatgaagctttatttggaatcttttgtgaagaatttttttat
ttgagtaattatttggctaaacatgtaacaccaagaaaatttgttttgattgagaacatt
attaattccaaatttatagtggtagataatgatattgaatgtaatcaattaagaacttac
ataaataataccgacttgacttgggaaaaattttatgccatcaaaaattctattccgaaa
aatattattaatctaatagaaaaatattttaataaaaataaacagttgaatgaatatatt
atttgcacaagtgaatttgtatatattgtagaagcaaataaatccgatattgaaatgaca
tacaaaaaatatttgaatccaatggattatcattatgattataacaatatcttaattgat
ttctattatttaattgtcgtacagtatgcttatgaaaataatcattattattacattaat
gatcatggaaaagacaaacaacaattattaaaatcaggtcatcaattattttccaaaatc
aatagttttgtgaagaaaaattatcaatatcgtaatattaataataaaattattgttaac
tacaataaacttatgttaaaaggagaaattgattttatagaaaccaatatgtatggtaat
gaaactattgtagaaattaaatgtgtcaatgaaattaatattaaatattatatacagtta
ttattatataatttttgtcattacaatacttataataacaaaatcgctaaacctcaaaat
ttgtttaaaaatggttttaaaattattaatttattgtccggattagaacattatgtaatt
gtttctgtcagtcctgaaaatatgtttaatattttacaaatattatcagttataggaaat
ttaaattttagtgatatgaatttagtttatgatttagaaaccactgatcaaataactaaa
caaggaccttataattataaaccaactattccaagatcgaatatttattattatggaaat
aaatattatgcaactatatatcctgaaataactgaaattgccattaaagattatgaaact
ggtatgattattattaatactcttgttaaaccaacatctaatattaatccagtggctgaa
aagaaaactggtattactaaaaatatgttaactgataaaccatcaataacaacaatacaa
aatatattaacaacaaaaatggcacggtttattaaatgtattatgatggcacataatggt
aatagttttgataataaaattgtattattttataaacttgttgatccactccgaacaagt
tttattgatacaatgagtattataccaatacatatgccaaataataccaaattacaaaat
aaaagactagaagagatttatgctgcgttgttcaataaaactttccaagctcatagagca
atggaagatgttgatgctttaatttccattatgaaatttttaggaatacaattttaa
DBGET
integrated database retrieval system