Viruses: 80558671
Help
Entry
80558671 CDS
T40000
Symbol
QLL95_gp0657
Name
(RefSeq) Cotonvirus japonicus; methionyl-tRNA synthetase
Virus
2811091
Cotonvirus japonicus
Taxonomy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
VOG
VOG cluster
Motif
Pfam:
tRNA-synt_1g
tRNA-synt_1
Anticodon_3
Anticodon_1
tRNA-synt_1e
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
80558671
NCBI-ProteinID:
YP_010842074
RS:
NC_079139
LinkDB
All DBs
Position
NC_079139:1128411..1130048
Genome browser
AA seq
545 aa
AA seq
DB search
MKYFVTSALPYTNNASPHLGNLVGALLSGDVYTRFKRQQGHEVIYLCGTDEYGTTTMVKA
RQEGVTCRELCDKYFELHKQVYDWFNIDFDVFGRTSTQHQTEITHEIFAGLFNNGFIEHK
TITQTFCETCNMFLADSYIKGICYHDNCLGKNIMTNGDQCELCQRLIDVDLLINPFCGIC
KTIPIKRETNHMFLKLGELTDKITSYLENTNLKPNIMSIAKSWLNMGLTSRCITRDLTWG
TPVPTHISSVLIPYENKVFYVWFDAPIGYYSILANHRNDWREWLNSGVKWVSTQGKDNVP
FHTIVFPATILGSGINLPLIDEICGTDYLLYEGEKFSKSQNIGLFGDKVAEISPKLGINE
DYWRYYLMKIRPETQDASFSLEEFVTVIKSDLVNNIGNYINRVFSVVWKTDLREFECEID
FELRTFIDKYLEAMENFKFRDGLKQCLELSSRGNQYVQSMKPWVMIKTNDVNLKSVLNYS
ISICWVLLKLLQPFIPRTSNKLLTSFESNFSNIFEIQENLKLKITSNIELPFKNIEYSEI
HELIL
NT seq
1638 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaatattttgtcacgtcagctttaccttataccaataatgcatcaccacatttgggt
aatcttgtgggtgctttgttaagtggagatgtatatactagatttaaacgacaacaaggc
catgaggttatttatctttgtgggactgatgaatatggaactacaacaatggtgaaagct
cgacaagaaggagtgacatgtcgtgaactttgcgataaatattttgaattacacaagcaa
gtttatgattggtttaatattgattttgatgtatttggaagaacatctacacaacatcaa
actgaaattactcatgaaatatttgctggattgttcaacaatggatttattgaacacaaa
acaataacacaaacattttgtgaaacttgcaatatgtttttagctgatagttatataaaa
ggtatatgttaccatgataattgcttgggtaaaaatatcatgacaaatggtgatcaatgt
gaactttgtcaaagattaattgatgttgatttactcattaatcctttttgtggcatttgt
aaaactatacctatcaaacgtgaaacaaatcatatgtttttaaaattaggtgaattaact
gacaaaataacatcatatttggagaatacaaatttaaaacctaatatcatgtcaatagct
aaatcatggttaaatatgggattaactagtcgttgtataactagagatttgacgtgggga
actccagtcccaacacacattagttcagttttaattccatacgaaaataaagttttttat
gtgtggtttgatgcaccaattggttattattccattttagcaaatcatcgtaatgactgg
cgtgaatggttaaattctggtgtaaaatgggtttcaacacaaggcaaagataatgttcct
tttcatacaatagtattccctgctacaattttaggtagtggaattaatttgccattaata
gatgaaatttgtggtacagattatttattgtatgaaggagagaaattttccaaaagccaa
aatattggattatttggtgataaagttgcagaaatttcacccaaattaggaattaatgaa
gattattggagatattatttaatgaaaattcgtcccgaaacacaagatgcatcatttagt
ttagaagaatttgtgacagtaattaaatcagatttagtgaataatattggtaattatatt
aacagagtttttagtgttgtttggaaaactgatttaagagaatttgaatgtgaaattgat
ttcgaacttcgaacattcattgataaatatttagaagccatggagaattttaaatttaga
gatggattaaaacaatgtttagaattgagttcccgaggtaaccaatatgttcaatctatg
aaaccttgggtaatgattaaaacaaatgatgttaatttaaaatcagtattaaattatagc
atcagtatttgttgggtactattaaaattacttcagccatttattcctcgaacatcaaat
aagttattgacaagttttgagtctaattttagtaatatttttgaaatacaagaaaatctt
aaactaaaaatcacaagtaatattgaattaccatttaaaaatattgaatattccgaaatc
catgaattaattttataa
DBGET
integrated database retrieval system