Viruses: 80558689
Help
Entry
80558689 CDS
T40000
Symbol
QLL95_gp0639
Name
(RefSeq) Cotonvirus japonicus; putative F-box and FNIP repeat-containing protein
Virus
2811091
Cotonvirus japonicus
Taxonomy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
VOG
VOG cluster
Motif
Pfam:
FNIP
TPR_leprecan
AcMNPV_Ac75
F-box
p450
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
80558689
NCBI-ProteinID:
YP_010842092
RS:
NC_079139
LinkDB
All DBs
Position
NC_079139:1148537..1150363
Genome browser
AA seq
608 aa
AA seq
DB search
MDVLNYDVLIYLLDYVDDHDKIIFMLTCKKYYTLRAHVNFWNFYDYDKVKNLDFRHKIKR
LYYRNVKTYKESKQIITGTKKEFIYDKITCWIPENTTHLVFANKYNRKISNIPNTITHLT
FGRDFNQPIENSIPNSVTHLTFGNRFNQSIENAIPDSVTHLTFGFHFNQPIENSIPNSVT
HLTFGNRFNQIIKNLIPNSVTLSPMEQVMKKVLPSSLTHLTFGYHFNQPIENSIPDSVTH
LTFGLDFNQSIENSIPNSVTHLTFGNNFDQCIVKCIPNSVTHLTFGLHFNQPIENSIPNS
ITHLTFGNYFNQPIKNAIPNSVTNLTFGNHFNQSIKNAIPNSVTNLTFGYHFNQSIENSI
PNSVTNLTFGYNFNQSIKNAIPNSITNLIFGHHFNQPIKNAIPYGVTHLNLGSKFNQSIK
NCIPDSVLHLTFGIDFEQPIKNYISSNVKYLCFNNVIKKMSDITIPTSVTHLVFTNEIDK
LVHGSIPNSVTNIEFSNNFCMSSSKNKNCYENYYDEIFDVLPVSLTCLSIICRDLFFFGG
SIPKNITHLTLGKNFYDNDLQLITENITKLKLYMSRDVDILDILEIIPKTKTQMNLIFPG
VKITRKQY
NT seq
1827 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggatgtattgaattatgatgtgttaatatatttattagattatgttgacgatcatgat
aaaataattttcatgttaacatgtaaaaaatattatacattaagagcacacgtaaatttc
tggaatttttatgattatgacaaagttaaaaatcttgattttcgacacaaaattaaaaga
ttatattatcgcaatgtaaaaacttacaaagaaagtaaacaaataatcacaggtacgaag
aaagaatttatttatgataaaataacttgttggattcccgaaaatacaacacatttggtt
tttgcaaataaatataatcgtaaaataagtaacatacctaatacaataacacatttaact
tttggtcgtgattttaatcagccaatcgaaaattcaattcccaatagtgttacacattta
acttttggtaataggtttaatcaatccattgaaaatgcaattcctgatagtgtaactcat
ttaacttttggttttcattttaatcagccaattgaaaattcaattcccaatagtgtaaca
catttaacttttggtaataggtttaatcaaattattaaaaatttaattcccaatagtgta
accttgtctccaatggagcaggttatgaaaaaggtattaccttcttcattaacacattta
acttttggttatcattttaatcaacccatagaaaattcgattcctgatagtgtaactcat
ttaacttttggtcttgattttaatcagtcaattgaaaattcaattcccaatagtgtaact
catttaacttttggtaataattttgatcaatgtatagtgaaatgtattcctaatagtgta
actcatttaacttttggtcttcattttaatcagccaattgaaaattcaattccaaacagt
ataactcatttaacttttggtaattattttaaccagccaattaaaaatgcaattcctaat
agtgttacaaatttaacttttggtaatcattttaatcaatcaattaaaaatgcaattcct
aatagtgttacaaatttaacttttggttatcattttaatcaatcaattgaaaattcaatt
cccaatagtgttacaaatttaacttttggttataattttaatcaatcaattaaaaatgca
attcctaatagtattacaaatttaatttttggtcatcattttaatcagccaattaaaaat
gcaattccttatggagtaacacatttaaatttgggatccaaatttaatcaatctatcaaa
aattgtattcctgacagtgtattacatttaactttcggaattgattttgaacaaccaatt
aaaaattatatttcttcgaatgttaaatatttatgtttcaataatgttatcaaaaaaatg
tcagatattactatacctacaagcgttactcatttagtatttacgaatgagattgataaa
ttagtacatggtagtataccaaatagtgttactaatatagaattttctaataatttttgc
atgtcttcaagtaaaaataaaaattgttatgaaaattattatgatgaaatatttgacgta
ttacctgtgtcattaacttgtttaagtattatatgtcgtgatttgttcttttttggggga
tcaatacccaaaaatatcactcatttgactcttgggaaaaatttttacgataatgatttg
caacttattacggaaaatattaccaaattaaaattatacatgtctcgtgatgtggatatt
ttggatattttggaaattataccaaaaacaaaaacgcaaatgaatttaatttttccgggt
gtaaaaataacgcgtaaacaatattaa
DBGET
integrated database retrieval system
