Viruses: 80558774
Help
Entry
80558774 CDS
T40000
Symbol
QLL95_gp0554
Name
(RefSeq) Cotonvirus japonicus; WD40 domain protein
Virus
2811091
Cotonvirus japonicus
Taxonomy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
VOG
VOG cluster
Motif
Pfam:
WD40_Prp19
Beta-prop_EML_2
WD40_WDHD1_1st
WD40_CDC20-Fz
WD40
ANAPC4_WD40
Beta-prop_WDR90_POC16_2nd
EIF3I
WDR55
Beta-prop_TEP1_2nd
WD40_MABP1-WDR62_2nd
Beta-prop_WDR19_1st
Beta-prop_EML
Beta-prop_IFT140_1st
WDR90_beta-prop_4th
Beta-prop_IFT122_1st
Beta-prop_HPS5
Beta-prop_CAF1B_HIR1
WD40_MABP1-WDR62_1st
WDR54
BTB
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
80558774
NCBI-ProteinID:
YP_010842177
RS:
NC_079139
LinkDB
All DBs
Position
NC_079139:1233563..1234993
Genome browser
AA seq
476 aa
AA seq
DB search
MQLSIVLVDNVQEIKISVKHDILAQSCTYFTNLLTKFQEQNSTIIKLTVPYAKIAADIIE
QLSNSDSIINDSLDVEYQLKFYKTCVFFGIEIDHEFLQNIKVPHQHFDLLLDIIDIIGYD
EHTIKIVIDNLPLDYDLSTFPKSLIDEMYTISTSYKIIAGTNFGDIQLWDPDTRMLLNNN
SIDCTRLWEIYYVLDGSVIIRNNTNNVYTYNLNNHKITEIYKISCETRFHISYSSANKHL
AITDDKKIIIKNLIDNTNIKIIKYKKDCSRPFYSPNNKYFAVSNIDGITIYDGLSYKFKK
NIYQIGNSCCAFSHDNKIIAIGSQDSNIYIYEIKNGKLKMTLSQHRGSVMNISFSKDGLW
MVSIAECARINIWNTTTMMLHCYINNYNDLTQIKFTPDCNQIIVSSYGYIHIYDVRSGEL
MDIFDDYDGDNTFKLEYSDSEISVDYKYDKNVLSIDIIQNFDDEIINKIKNYMNYN
NT seq
1431 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcaattatcaattgtacttgttgataatgttcaagaaattaagattagtgtcaaacat
gatattttagctcaatcgtgtacatatttcacaaatttactaactaaattccaagaacaa
aatagtaccataattaaattaacagtaccttatgccaaaattgcagctgatattattgaa
caattatccaattcagattctattattaatgatagtctggatgttgaataccaattaaaa
ttttataaaacatgtgtattttttggaattgaaatcgatcatgaatttttgcaaaacata
aaagttcctcatcaacattttgatttgttactagatattattgatatcattggatatgat
gaacatactattaaaattgttattgataatttaccattagattatgatctttccacgttt
ccaaagtcactcattgatgagatgtatacaatttctacatcatataaaattattgcaggt
acaaatttcggagatatacaactttgggatccggatacaagaatgttattgaataataat
agtattgattgtacacgtttatgggaaatttattatgtactagacggtagtgttattatt
agaaataatacaaataatgtttacacgtataatttaaacaatcataaaataactgaaata
tacaaaatttcatgcgaaacacgatttcatatttcttattcgtcagcaaataaacatttg
gctattactgatgataaaaaaattattataaaaaatctaatagataatacaaacataaaa
ataataaaatacaaaaaagattgttcacgaccattttattcacccaataataaatatttt
gccgtttcaaatattgacggtataacaatttatgatggtttgtcatataaatttaaaaaa
aatatttaccaaataggaaattcatgttgcgcattttctcatgataataaaattattgcg
attggtagtcaagattccaatatttacatttatgaaataaaaaatggaaaattaaaaatg
acattgtcgcaacatcgaggtagtgtaatgaacatttcattttccaaagatggactttgg
atggtttcaatcgcggaatgtgcaaggataaatatttggaataccacaacaatgatgtta
cattgttatataaataattataatgatttaacacaaataaaatttactccggattgtaat
caaattattgtttcaagttatggttacatacatatatatgatgtaagatctggagaatta
atggatatatttgatgattatgacggtgataacacatttaaactcgagtattcagattca
gaaattagtgtagattataaatatgataaaaatgttttatctattgatattatccaaaat
tttgatgatgaaattattaataaaattaaaaattatatgaattacaattaa
DBGET
integrated database retrieval system