Viruses: 80558809
Help
Entry
80558809 CDS
T40000
Symbol
QLL95_gp0519
Name
(RefSeq) Cotonvirus japonicus; putative ankyrin repeat protein
Virus
2811091
Cotonvirus japonicus
Taxonomy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
VOG
VOG cluster
Motif
Pfam:
Ank_2
Ank_4
Ank
Ank_5
Ank_3
ANK_LRRK2
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
80558809
NCBI-ProteinID:
YP_010842212
RS:
NC_079139
LinkDB
All DBs
Position
NC_079139:1269922..1272657
Genome browser
AA seq
911 aa
AA seq
DB search
MIINECLLLIYVQFFLEKIEFYKIILDRLTTSSKSMENIKFNNQFEYECCLGIKCKGFTE
LMFMAKNANKITNCKTKIMMRIADLIFEKPLELKKYINSVNKLGWTALMLACRNSNTTSN
DDIVESLLISSVDIYKENNNKDTALSLALFYAGTDSNIQTVKLLLDKWNANNLAENYEHY
FAVAWKNKLHNVELLKMLINVCAGTHYKREIFTNIVKNSRTKRNSIILKILSEYMTDIDY
TCSNNYTPLMLACRYSSSTSDNATVKLLLEKGANPDYKQKNEYLPIILASSYSTTTSNID
TVKLLLEYDADINIRDVYRNTALIMAIKNSRTSSNFETVKFLLDNGANVHYVNKYLDSPL
HMAIEKYVSDSAIIELLLEHKANINLKNEQGESCLFLFIMSNPLTRHYEKYKEIIKLFLD
CDADINSLTKYNRTPQSLMLDYYIKQKGQNEKVNEILNLFLETKINYNNYYNYNNYGLLQ
LASHSHEFNMTDIVVKLVKYGADVNLINSEGESALLIAARTGKCENLYFISLLLSLGANV
NIQDSRDTTCLKYAIKFRNLEMIELLLEHGADTNLIDCIRNNILSYIFSNGRIQNENDLK
IIKLLVKYGAKVNFDNGVNSILNKALDIESYIGPRIVEFLLDNGADPNYYGNNNYNGLHY
LIKKNNIFNDNILTNINLLLKHDANPNLLDSNGNNSVLLAIKTCCPFKLINVLIDNGGNI
HVINKKNKTALIYAVKLTNINIDYCLELVNLLLDNKINAQLRDSRGQTALIKAVNKILYN
KTFHNELFGTNGIFTRLSEHTSFDTMDNNGKTVMAYIHDEYMVDFIKLFKKKCVQDYLTK
TIHNEIIESNLEFLMKPNSIRTRIATIQWYSDRGETYQELIKRDAQLFDYFGINDIDDLH
LKIGLTSKYVN
NT seq
2736 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgattataaatgaatgccttttactgatttatgttcaattttttctggaaaaaattgaa
ttttataaaataattttagatagacttactacaagttcaaaatcaatggaaaatattaag
tttaataaccaatttgaatatgaatgttgtctcggtattaaatgtaaaggttttacagaa
ttgatgttcatggcaaagaatgccaataaaattaccaattgtaagacaaaaataatgatg
cgaattgcagatttaatttttgaaaaaccattagagttaaaaaaatatatcaatagtgta
aataaactaggatggactgcattaatgttggcttgtagaaattctaatacaactagtaac
gatgatatagtagaatctttactaatatcaagtgtagatatttataaagaaaataataat
aaagatacagcactttcactagcattattttatgcaggtaccgatagtaatatacaaaca
gtcaaattattattggataaatggaatgcaaataatttagcggaaaattatgaacattat
ttcgccgttgcttggaaaaataagttacataatgttgaattattgaaaatgttaattaat
gtttgtgcgggtacacactataaacgcgaaatttttacaaatattgtcaaaaattctcgc
acaaaaagaaatagcataattttaaaaattttatcggaatatatgactgacatcgattat
acatgttctaataattatacacctctaatgttagcatgtcgatatagttcaagtactagt
gataatgcaactgttaaattattgcttgaaaaaggcgcgaatcctgattacaaacaaaaa
aatgagtatttacctataatattagcgtcatcatattccacaacgaccagtaatattgat
accgttaaattattacttgaatatgatgctgatattaatatccgtgatgtttatcgtaat
actgctttgataatggcaattaaaaattctcgtacttctagtaattttgaaactgttaaa
tttttattggataatggcgccaatgttcattatgtcaacaaatatttagattctccttta
cacatggcaattgaaaaatacgttagtgattcggctattattgaattattgttagagcac
aaagctaatattaatttaaaaaatgaacaaggagaatcttgcttatttttatttatcatg
tcaaatccattgactcgacattatgaaaaatataaagaaatcataaaattatttttagat
tgtgatgctgatataaattcactcaccaaatataatagaactccacaatctttaatgttg
gattattatattaaacaaaaaggacaaaatgaaaaagtaaatgaaattttaaatttattt
ttagaaacgaaaatcaattacaataattattataattataataattatggattattacaa
ttagcgagtcattctcatgaatttaatatgacagatattgtcgtaaaacttgtgaaatat
ggagctgatgttaatttgattaattctgaaggagaaagtgcattattaatagctgcacga
actggtaaatgtgaaaatttatattttatcagtttattattaagtttaggagctaacgtc
aatattcaagattcaagagatacaacttgtttgaaatatgcgatcaaatttagaaattta
gaaatgatagaattattattagaacatggtgctgatacaaatttaattgattgtatcaga
aataatattttatcatacatattttctaatggtagaattcaaaacgaaaacgatttgaag
attattaaattgttggtgaaatatggagctaaagttaattttgacaatggagttaattct
attttgaataaagctcttgatattgaatcttatattggaccaagaattgttgaattttta
ttagataatggagcagatcccaattattatggtaacaataattacaatggcttacattat
ttgataaaaaaaaataatattttcaatgataatattttaacgaacatcaatttattattg
aaacatgatgcgaatccaaatttattagatagtaatggtaacaattctgttttattagcc
attaaaacgtgttgtccctttaaattaattaacgttttaatagataatggtggtaatatt
catgttattaataaaaaaaataaaactgcattaatatacgcagtcaaattaacaaacata
aacattgattattgtttagaacttgtaaatttattattggataataaaataaatgcacaa
ttgcgtgattctcgtggacaaactgctttaattaaagcagttaataaaatactctataat
aaaacttttcacaatgaattatttggtacaaatggtatttttactcggttatccgaacat
acaagttttgatacaatggataataatggtaaaacagttatggcatatattcatgatgaa
tacatggtggatttcattaaacttttcaaaaaaaaatgtgttcaagattatttaaccaaa
actatacacaatgaaattattgaatcaaatttagaatttctgatgaaaccaaattcaatt
cgaactagaattgctactatacaatggtattcagatcgaggagagacatatcaagaatta
attaagcgtgatgctcaattatttgattattttggaattaatgatattgatgatttgcat
ttgaaaattggtttaaccagtaaatatgttaattaa
DBGET
integrated database retrieval system
