Viruses: 80558888
Help
Entry
80558888 CDS
T40000
Symbol
QLL95_gp0440
Name
(RefSeq) Cotonvirus japonicus; transposase
Virus
2811091
Cotonvirus japonicus
Taxonomy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
VOG
VOG cluster
Motif
Pfam:
Cas12f1-like_TNB
Zn_ribbon_TiaS
HTH_OrfB_IS605
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
80558888
NCBI-ProteinID:
YP_010842291
RS:
NC_079139
LinkDB
All DBs
Position
NC_079139:1352425..1354005
Genome browser
AA seq
526 aa
AA seq
DB search
MFWNDQCAKLSKSLWIPSNIIDHKPNKRKYFKCDNPNITFNYFSDNIKINKNIKFNDIKV
TNNDDKKDKLKNKLVKAENSRYLKEQNNKKSKLTKLELKQKHENFLNKIKVKVNQLDGFV
RSRRIRILPNNQQKNTIQQWIYDTTSIYNRLVSKFNQIYYNCQEIVDNMNVDKKFYHLGK
LIKQNTEFPINFRKLRALKCDIFVKDYPRVPYCVISDTIKEFVSNVKSCITKMSKGLITE
FKFKPRKYNRICSSIPIESHYTKEKGFYPSYFGEIKTNDESFSWLDIQHDYKLIYDKYSD
KYYIHVPKYVYRKKPIIKKPIAVMDPGARTFQTIYGMDHVITIGDDLGSTFKKSLLKIDN
LKSKLSKPGKYKFNKKLNKKTKIKKWKYKKAIDRHHKKMDHIQQELHYKTANYLCNHYDH
IVVTTFSSKKVGLKKNDLDKMTKRILGKLSHYKFRQRLFTKCEELGSQYYEVDESFTSKT
CCKCGNIHKTLGSSKVYDCAKCKNILDRDVNAAICILIKNKDLLLK
NT seq
1581 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgttttggaatgatcaatgtgctaaattatccaaatctttatggattccttcaaacata
attgatcacaaacccaacaaaagaaaatattttaaatgtgacaacccaaatatcactttt
aattattttagtgacaacattaaaatcaataaaaacattaaatttaatgatatcaaagtt
accaataatgatgataaaaaagacaaattaaaaaataaattagttaaagcagaaaattct
agatatttaaaagaacaaaacaataagaaatctaaattaactaaattagaactaaaacaa
aaacatgaaaattttctcaataaaatcaaagttaaagtcaaccaattagatggttttgta
agatctcgaagaatacgaattcttccgaataatcaacaaaaaaataccatccaacaatgg
atttacgatacaacttctatttataatagattagttagtaaatttaatcagatttattac
aattgtcaagaaattgttgacaatatgaatgttgacaaaaaattctatcatttgggaaaa
ttaattaaacaaaacactgagtttcccattaattttcgtaaattaagagcattaaaatgt
gatatttttgttaaagattatccaagagtaccttattgtgttatttcagatacaattaaa
gaatttgtctctaatgtaaaatcttgtatcacaaaaatgtccaaaggtttaattaccgaa
tttaaatttaaaccgagaaaatataatagaatttgttcatcaattcccatagagtctcat
tatacaaaagaaaaaggattttatccatcatattttggtgaaattaaaaccaatgatgaa
tcattttcatggttagacattcaacatgattataaattaatttatgataaatactccgat
aaatattatattcatgttcctaaatatgtttatcgaaagaaacctataataaaaaaaccg
attgcagttatggatccaggagcacgaacttttcaaaccatttatggaatggaccatgtg
attaccattggagatgatttaggttcgactttcaagaagagtctgttaaaaatagacaat
ttaaaatccaaattatcaaaaccaggaaaatataaattcaataaaaaattaaacaagaaa
actaaaatcaagaagtggaaatataagaaagccattgatcgtcatcataaaaagatggat
catatccaacaagaattacactataaaacagctaattacttatgtaatcattatgatcat
attgtagtaactacttttagtagtaaaaaagttggattgaaaaagaatgaccttgataaa
atgacaaaaaggatccttggaaagttatctcattataaatttagacaacgccttttcacg
aagtgtgaggagttaggtagtcaatactatgaggtagatgaatcatttacaagtaaaaca
tgttgtaaatgtggaaatatacataagacattaggatcatcaaaagtgtatgattgcgcg
aagtgtaaaaacatattagatcgagatgtaaatgcagcaatatgtattttaattaagaat
aaagatttattgttaaaataa
DBGET
integrated database retrieval system
