KEGG   Viruses: 8250714
Entry
8250714           CDS       T40000                                 
Symbol
MoroL_gp2
Name
(RefSeq) Morogoro mammarenavirus; polymerase
  KO
K25303  Mammarenavirus RNA-directed RNA polymerase L [EC:2.7.7.48 3.1.-.-]
Virus
573900  Morogoro mammarenavirus
SSDB
Motif
Pfam: Arena_RNA_pol ArenaCapSnatch
Other DBs
NCBI-GeneID: 8250714
NCBI-ProteinID: YP_003090217
RS: NC_013058
UniProt: C6ZK03
LinkDB
Position
NC_013058:complement(463..7161)
AA seq 2232 aa
MEELLGECKDLISKYLAGDERLSQQKLAFLVQTEPKMLLIEGLKLLSLCIEIDSCQANGC
EHNTESLSVELILQKKGVLCPGLAFVVPDGFKFSGNTLILLECFVRTSPTNFEQKYREDM
VKLEALKSDLNSVDIVLLPLIDGRTSFHTELFPEWANEKFRNNLFSLLEYSQQSSRMFEE
SEYSRLCESLTKTGVRTSGIESLNILSDSRADHHERLLQLCHRGLNNRMTPLEVRKEIIL
EYQAFRNKLREESIPRQFVKTDRIKLLDDFNTLYVDREGDGPHNLNVLRERFIWSSPIVT
ALYGDYGSVHLGEGGDLPTSSCVAGWKSLLNKIKSLKLLNTRRKLLLTFDTIILLAHLRD
EKQLGSMVSSEWLGSSFLSVNDRLVSLEATQRELKNWLSRRRDNIVKKGHPQPQNLSMCF
YDIIKKLLTRAEEMLKVVNLSFCDYVTETDILERESFEKLIHLERRGVQPTMSYERLCER
DFPYPLLDIDSQGQNDLKRLSSISLALVNSMKTSSVAKVRQNEHGAARYKKVRCKEAFNQ
SFVMGEKRFNLIYQKTGEGSKCYAINNSERGEVCSFYADPKRFFPAIFSQDVISKVLDAM
SSWLSDCVELKEQEASLKLLLKMVIILILANPSKRAQKFLQGLRYFIMAFVSDYHHKQLM
EKLREDLITDSEYLLYSVVRTIFSIVLDNKVTTMLTNRFKYVLNLSYMCHFITKETPDRL
TDQIKCFEKYLEPKLEFDSLNVNPKESGDEEEKLLLLNSAEKFLSKPDCLTGDTISYKQP
GVSRKLFSMMTSSFNNGSLTKGGDLKGGFKDPLVTAGCATALDLASNKSVVVNKYSDGER
VLNYDHDKLVATSVCQLSEVFERKTKYLLNKEDYDYKVQKTLTDLVIGTKKDKQGGGKSG
EVEQLDEVLLSSDALGCLEEVKESIDTVLNRYKFDRALDDKKEHIEGEHKSLTDLKKVME
VKGFHSTHYNLIQAEITHHTIEDFDESVLPNGSYQLISEGFYENLDLRNRYFYLDSLESC
PIRCITQAVSTRTLNEGQYFQCFKSLLLQMNAGRLTGKYSHYKNKCLNFKIDRERLMSDV
RISERESNSEALGKALSLTNCTTAVLKNLCFYSQESPQSYTSLGPDTGRLKFSLSYKEQV
GGNRELYIGDLRTKMFTRLIEDYFEALTKQYKGSCLNDENEFSNAILAMKLNVSLAQVSY
SLDHSKWGPMMSPFLFLVFLQNLHWETQDDLGDIKSKDHISTLLSWHIHKLIEVPFNVVN
AMMKSYLKSRLGLKRTFHETITESFFFESFRVDEVPSHLSSIIDMGQGILHNTSDFYGLI
SERFINYCIKCLFEEGVESFTSSDDQITLFGKGLTELMGSDSEEFQNILEFHYYLSDRLN
KFISPKSVVGTFVAEFKSRFYVWGDEVPLLTKFVAAALHNVKCKDPHQLAETIDTILDQS
IANGVPVSICNALQVRTIDVLKYAQYPIDPFLMFLNSDVKDWVDGBRGYRIMRNIEGILP
RGTEKVRKILRVVFNKLKTGELHEEFTAIYLSGDPVESFTKLSELIGESELQKDDLSVCW
LNLTAHHPLRMVMRQKVLYTGAISVEDEKLPTLVKTLQSKLSSGFTRGAQKLLCEAVNKS
AFQSSIASGFVGLCKTLGSKCVRYLDKTTTYIRSLISRLSEIQGVKKLKLGGVDLWDTRE
LTDSIPEDLAGYLRPVLWDYFCISLSTSLELGPWVLGEPKIKSKKPNINFNPCDYFPMKP
THTRLLEDKVGFNHIIHSFRRLYPSIYEKHLLPFMSDLASTKMKWTPRIKFLDLCVVLDV
NCEAMSLISHVVKWKREEHYIVLSSDLAVAHDRTHLPLTDERVVTTYDVVQNFMRQVYFE
SFVRPFVATSRTLGSFTWFPHKSSLPESEGLGLLGPFSSFVEKVIYKGIERPMYKNDLHS
GYAWLDFECSPAVVNLSQLIACGLTQQKICREPEELFDLLSEVSTGGVQITLTINFQVKS
QGESLSEKFSIHLLWKGEILEGGVFKPYSLEGMYSGKVHRSALVDCWRLAQTSSWFKRDC
RSMWQLSTENLCEYLADSHSIPDAIPLPVFLEGEIMCLDVYDFNHVGPDYDDIPLVVDSG
YLLEGTRKLIPFNPKIFDQDLRVFIGELSEDHRDVLIDSLSRMIKSRVEQSLHWLQVDIV
GVVEETMPGSHADFLNEVMSRTDGWVDFKGYSLCFSKSLGKVMVQSSEGTLRLKGRLCRS
LHDNPPPPEDID
NT seq 6699 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atggaagagcttttaggagaatgtaaggacttgataagcaaatacttggcaggtgatgaa
agactctctcaacaaaagttagcatttcttgtgcaaactgagccaaaaatgcttctcata
gagggactgaagcttttgtccctctgcattgagatagatagctgtcaagccaacggatgt
gaacataacacagagtccctgtcagtggagctcatactacagaagaaaggggtcctatgc
cctggcttagctttcgtggttcctgatggattcaagttttcaggcaacacattaatcttg
cttgaatgttttgtaagaacatctcccaccaattttgagcaaaaatatagagaagacatg
gtgaagcttgaggcattgaaatctgaccttaattctgtcgacatagtgctactacccctc
atagatggtagaaccagcttccacacagaattatttcccgagtgggctaatgaaaagttt
agaaataatttattctctctgcttgagtattctcaacaatcatctaggatgtttgaagag
tcagagtactcaaggttgtgtgagtccttgacaaagacgggagtcagaacatctgggatt
gagagccttaacattttatcagattctagagcagatcatcatgaaaggttgctgcaactg
tgtcacagggggttgaataacagaatgacaccacttgaggttcgaaaagaaatcattctg
gaataccaagcattcagaaataaactcagagaggaaagcatccccagacagtttgttaaa
acagacagaattaagcttctagatgattttaacaccctttatgtagatagagaaggtgat
ggtcctcacaatttaaacgtgctaagggaaagatttatctggtcctctccaattgtaaca
gcattgtatggtgattatggytctgttcacctaggtgagggtggggacttgccaacttcc
agttgtgttgctggctggaaatctctcctcaataagattaaatccctcaaactattgaac
actaggagaaagcttctactaacctttgataccataatactcttagcccacttaagggat
gagaaacaactcgggagcatggttagctccgagtggttgggatcttcttttctaagtgtt
aatgataggttggtgtcacttgaggctactcagagggaattgaagaactggttgagcagg
agaagggataacatagtaaagaaaggccatccacagcctcagaatttgagtatgtgcttc
tatgacatcattaagaaactcttaaccagggcagaggaaatgctaaaggtggtgaatttg
agtttttgcgattatgtaactgagactgacatcttggaaagagagagctttgaaaaactg
attcacctagagaggaggggggttcagcccacgatgagttatgaaagactttgtgaaagg
gacttcccatatccactacttgatattgactcccagggtcagaacgacttaaaaagactt
tcgagtatctctctggcattggtgaactcgatgaaaacatcttctgttgcaaaagttaga
cagaatgagcacggtgcagctaggtacaagaaagtcagatgtaaagaggcctttaatcaa
agttttgttatgggagaaaagcgttttaatctcatttatcaaaagaccggtgaaggttct
aaatgttacgccatcaacaactctgagcgtggagaagtttgttcattttatgcagatcct
aaaagattcttcccagccattttttcacaagatgtgatatccaaggtactggatgccatg
tcaagctggctttctgattgtgttgaactaaaagagcaggaagcaagcttgaaattgtta
ttaaaaatggtcataatcctcattttagccaaccctagcaaaagggctcaaaagtttttg
caaggtttgaggtacttcataatggcttttgtgtcagactatcaccacaagcagctaatg
gagaagttgagggaggatctgataactgattctgaataccttctctatagtgtagttaga
actattttctcaattgttctcgacaacaaggtgacaactatgctaacaaataggtttaaa
tatgttttaaacctttcatatatgtgccacttcatcaccaaagaaactccggatagattg
acagaccaaatcaagtgttttgagaagtatttagagcctaagttagagtttgacagcttg
aatgtgaatcctaaggaatcaggagatgaagaagaaaaactcttgttgttaaactccgct
gagaagttcctctctaaaccggattgtctaacaggtgatacaatctcctataaacaaccg
ggtgtgtctagaaaattattctcaatgatgacctcctcattcaacaatggatcattgaca
aaaggaggagatctcaaaggtgggttcaaagaccccttggtcaccgctgggtgtgcaaca
gcattagaccttgccagcaataagagtgtggttgtaaataagtattcagatggtgagagg
gtattgaattacgaccatgacaaattagtagccacctctgtttgccaactgtctgaagtg
tttgagaggaaaacaaagtacttacttaataaagaagattatgactacaaagttcagaaa
accctcactgatttggtgattggaaccaagaaggataagcagggaggtggtaagagtggt
gaagttgagcagctagatgaagtcttactgagtagtgatgcattagggtgccttgaagag
gttaaagaatcaattgacactgtactgaacaggtacaaatttgatcgagccttagatgac
aagaaggaacatatagaaggagaacataaatcactaactgatttgaagaaagttatggag
gtcaaaggatttcacagcacccattacaatttaattcaggctgagataacccatcatact
atagaggactttgatgaatcagttttgcccaatgggtcttaccaactgatctcagaaggg
ttttatgaaaatctagatttgaggaataggtatttctatcttgattctctggaatcttgt
cctatcagatgtattacccaggctgtgtcaactaggacactcaatgaaggtcagtacttt
caatgttttaaatctctattactacagatgaatgctggaagattaactggcaagtattct
cattataagaacaagtgtctgaatttcaaaattgacagagagaggttgatgagtgatgtt
aggattagtgagagagagagtaattcagaagcacttgggaaagcactctcactaactaat
tgcacaacagcagtgctaaagaatttatgcttttacagccaagagtcaccacaatcttac
acatcgttgggacctgatactgggaggttaaagttctcattgtcctacaaagagcaagtt
gggggaaatagagagctttatataggggacctcaggaccaagatgttcaccagactgata
gaagattattttgaggcattgactaagcaatacaaggggagttgcttaaatgatgagaat
gagtttagcaatgccattctggcaatgaagctcaatgtctcactggctcaggtttcatat
agtttagaccatagtaagtggggcccaatgatgtccccatttctattcttggtgttttta
cagaacctgcactgggaaacacaagatgaccttggagacattaaaagcaaagaccatatt
agtactttgttatcttggcacattcacaaattgattgaagttcctttcaatgttgtcaat
gcaatgatgaagtcctacctcaaatctaggttaggtttgaagagaacttttcatgagaca
atcacagagtccttcttcttcgagagctttagagttgatgaggtaccatcacatctgagt
tccattattgacatgggtcagggcatattgcacaatacctcagatttttatgggttgatt
agtgagagattcataaattactgcataaagtgcttgtttgaagagggtgttgaatccttc
acatcaagtgatgatcaaataaccctctttggcaaggggctgacggaactaatgggaagt
gattccgaggaatttcaaaacatcttagagtttcactactatttaagtgacaggcttaac
aaattcataagtcctaagagtgtggtagggacctttgttgctgagttcaaatctagattt
tatgtttggggtgatgaagtaccccttttaaccaaattcgttgctgctgctcttcacaac
gtaaaatgcaaagacccccatcagctcgctgagacgattgatacaattctggatcagtca
atagcaaatggtgtgcctgtttctatatgtaatgctctacaggtgcgaacaatagatgtt
ttaaaatatgctcagtatcccatagatccctttttaatgtttctgaactcagatgttaaa
gactgggttgatggcracagagggtacagaattatgaggaacattgagggcatactacca
agaggtactgagaaggtaaggaagattctcagagtggtatttaataagctaaagacaggt
gaattacacgaagaattcacagctatttacttgtctggtgacccagtggaatcattcact
aaactaagcgaactcataggtgaatctgaacttcaaaaggatgatttatccgtttgctgg
ttaaacttgactgcacaccatccattacggatggtcatgagacaaaaagtgctatacaca
ggagccatcagtgttgaagacgaaaaactaccaactttagtgaagacattacagagtaaa
ctttcatcaggcttcacaagaggagcacaaaagctgttatgcgaggctgtcaacaaaagt
gcatttcaaagctctattgcatctggttttgtgggcctgtgcaagactctagggagtaag
tgtgtcaggtatctagataaaaccaccacatacataaggtcattgatttctagattgtct
gagatccagggggtcaaaaagctcaagctaggaggggtggacttgtgggacacaagggag
cttacagacagtatccccgaggatttagcaggttacttaaggccagtattatgggactat
ttttgtatctcactatccacttctcttgaattgggcccatgggttttgggggagcctaag
ataaaaagtaaaaagcctaatataaatttcaatccatgtgattattttcccatgaagcca
acccacacaaggcttcttgaagacaaggtgggattcaaccatataatccactccttcaga
agactttacccatcaatttatgaaaaacatctactcccatttatgagtgatttagcatcc
acaaagatgaaatggactccaaggataaaattcctagatctatgtgtggtgcttgatgta
aattgcgaagctatgtcattaatatcacatgtagttaaatggaagagagaagaacactat
attgttttatcttctgatttggctgtggctcatgatagaacgcatttgcccctcacagat
gagagagtagtgacgacttatgatgttgttcaaaatttcatgaggcaagtgtattttgag
tctttcgtaaggccatttgtggcaacaagtaggacattgggttcattcacttggttccca
cacaagtcctcattgcctgagtccgaaggtttagggctgttgggacccttctcatctttt
gtagaaaaagtcatttacaaaggaattgaacgaccaatgtataaaaatgatcttcattct
ggctatgcatggttggactttgaatgttctcctgctgtggtcaatctaagtcaactcata
gcatgtggtttaacacagcaaaaaatttgtcgtgagcctgaagagctattcgatctcctc
tctgaggtgagcactggtggtgtgcagattacattaacgattaactttcaggttaagagc
caaggggagtcactgtctgagaaattctccattcacctcttgtggaaaggcgaaatcctg
gaggggggtgtttttaagccctactcactggaaggcatgtatagtggcaaagttcacaga
tcagccctggtagattgttggaggctagctcagacctcatcttggttcaagagagactgc
agaagtatgtggcaactatccacagaaaacctgtgtgaatatttagctgacagccactcg
attcctgatgctatcccattgccagtattcctggagggggagataatgtgtttggatgtg
tatgatttcaatcatgttgggccagactatgatgacatacctctcgtggttgattcaggt
tatctccttgaggggacaagaaagttgatccccttcaaccccaagatttttgaccaggat
ttgagagttttcataggagagctctcagaggatcaccgggatgtgttgattgactctctg
tcaagaatgattaaatcaagggtggagcagtctcttcactggctgcaggtggacatagtc
ggggttgtggaggaaacaatgcctgggagtcatgcagatttcctcaatgaggtgatgtca
aggacagacggttgggttgatttcaaagggtacagtttgtgttttagtaaatcgttgggg
aaggtgatggtccaaagctcagagggaacactcaggctgaagggcagattgtgcagatcc
ctgcatgacaacccacctcctccggaggacattgactga

DBGET integrated database retrieval system