Viruses: 932487
Help
Entry
932487 CDS
T40000
Symbol
SPV068, SWPVgp068
Name
(RefSeq) Swinepox virus; SPV068 RNA polymerase subunit RPO147
KO
K25273
Poxviridae DNA-directed RNA polymerase 147 kDa subunit [EC:
2.7.7.6
]
Virus
10276
Swinepox virus
Taxonomy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
VOG
VOG cluster
Motif
Pfam:
RNA_pol_Rpb1_2
RNA_pol_Rpb1_5
RNA_pol_Rpb1_3
RNA_pol_Rpb1_4
RNA_pol_Rpb1_1
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
932487
NCBI-ProteinID:
NP_570228
UniProt:
Q8V3M7
LinkDB
All DBs
Position
NC_003389:58782..62639
Genome browser
AA seq
1285 aa
AA seq
DB search
MAVISKVTYSLYNQEEINATDVFINHVKNDDDIGTVKDGRLGAMDGSLCRTCGRTELQCF
GHWGKVRLYETHIVKPEYIGEVIRIINHICIRCGFLRSREPYIEDITKMSSHSLKKIKDR
ILSKKKSCWNSKCMQPYQKITFSKKKVCFINKSDEITVPNALIYQKITSIYKRFWPLLEI
YQKPENLFYKNFFPVPPLIIRPAISFWIDSIPKETNELTYLLGMIVKYCNMNADEQVIQK
AVIEYDDIKIISNNTTSINLSYITSGKNNMIRSYIVARRKDQTARSVIGPDTCLTINEVG
VPEYIRNTLTEKIFVNPFTTKYVHELFTTNNVKFYFNKRLNQLTRIKQGKFIKNKIHMLP
GDWIEIPLREHTSIIFGRQPSLHRYNVIASTIKHTEGDTIKIPPGIANSQNADFDGDEEW
MILEQNPKAVIEQSILMYPTTLLKHDIHGAPVYGSIQDEVVAAYSLFRMENLSLDEVMNL
LGKYGLGFPVQNKSTFSGKDIFEYLIGDKVNYPGVLQDGKLLVDNIVSDYVVAMRHMSLA
GLIADYKSNIEGIDFIIKSSYVFKRYLEIYGFSVTFMELRPTSDFTNRLEAINVEKIELI
KDSYNRYLTDVDSGKILPLSKSMESDAVESMLSTLTNLNIREIEEYMKQTLKTNPDNSLI
RMAKAGYKVNSTELMYILGTYGQQRIDGEPSETKVLGRVLPYYLPDSKDPEGRGYILNSL
IQGLTGSQYYFSMLVARSQSTDIVCETSRTGTLARKIIKKMEDMVVDGYGQVVYGNILIK
YAANYTKVSSSICKPIELLFPNESMIWFLEISALWTKIKNGFIYSQKQKISKNTLSPFNF
LVFIEPTTDDLAIGAKDLYNMIQSVIEDIKENYFFTICNIDFIEYIFLTHLNPSRVRITK
ENAINIFKKFYEKLNYSLGGGTPIGIISAQVLSEKFTQQALSSFHTTEKSGAIKHKLGFN
EFNNLTNLSKNKTEIITLISEDIEKLQNIKINFEFVCLGELNPTISLDKKDNRYIIDIIV
NRIYIKRSELTELVVEYMIERFISFNVLVKEWGMETFIDDEFNIRFRVFISFIEPEELSL
NKFMMVLPGAANKGKISKFKIPITQHTYLDDFNKSTKMNRITVELMNLKELGSFDLENVN
VYPGIWNTYDIFGIEAARSYLCEALLNTYGEGFDYLYQPCDLLSSLLCMSYEPESVNKFK
FGSTSAIKRATFGDNKALLHAALHKKSEPVSDNSSCHFFSKVPKIGTGYYKYFINLELLT
RLEKKLSVKISDRKIEKITELTEDF
NT seq
3858 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggcagttatatctaaagttacgtatagtttatataatcaggaagagatcaatgcaaca
gatgtatttattaatcatgttaaaaatgatgacgatatcggtacagtaaaagatggtaga
ttgggtgccatggatggttcattgtgtagaacgtgtggtcgtactgaattgcagtgtttt
ggacactggggaaaagttagattatacgagacacatattgttaaaccagaatatataggt
gaagttattagaataataaatcatatttgtatcagatgtggattcttacgatctagagaa
ccatatatagaagatataacaaaaatgtcatcgcattcgttaaaaaaaataaaagataga
atactatcgaagaaaaaatcatgttggaatagtaaatgtatgcaaccgtatcagaaaatt
acattttcaaaaaaaaaagtgtgttttattaataaatcagatgagattaccgtacccaac
gcgctaatttatcaaaagataacatctatttataaacgattttggccactattggaaata
tatcaaaaacctgaaaatctattttataaaaactttttccctgtacctcctcttattatc
aggcccgcaattagcttttggatagatagcatacccaaagaaactaatgaattaacatat
ttattaggaatgattgtcaaatattgtaacatgaatgccgatgaacaagttatccaaaag
gcagttatagaatacgatgatataaaaataatatcgaataatacaactagtattaattta
tcatatataacatctggtaaaaataatatgatacgaagctatatagtcgctagacgaaaa
gatcaaactgctagatctgttataggaccagatacatgtttaacaattaatgaagtcggt
gttcctgaatatattaggaacacactcactgaaaaaatatttgttaacccatttactaca
aaatatgtacatgaattatttactaccaataatgttaagttttattttaataaacgactt
aatcaattaacaagaataaaacagggtaaattcataaaaaataaaatacatatgttacca
ggagattggatagagatcccattgagagaacatacaagtattatatttggaagacagcca
tcgttgcatagatataacgtgatagcatctacaattaaacatactgaaggagacactatt
aaaataccaccaggtatagcaaattcacaaaatgcagactttgacggagatgaggaatgg
atgatattggaacaaaatcctaaagctgttatagaacaaagtatactcatgtatcctacg
acgttattgaaacatgatattcatggtgctcctgtatatggatctatacaagacgaagtc
gttgcagcatattcattgtttaggatggaaaatttatctttggatgaagtaatgaatctt
ctaggtaaatatggattaggatttccagtacaaaataaatcgacattttcaggtaaagat
attttcgaatacttaataggtgataaagttaactatccgggtgtattacaagatggtaag
ttgttggtggacaacattgtaagtgattatgttgtggctatgcgacacatgtcattagcg
ggactcattgctgattataagtctaatatagaaggcattgattttataataaaatcatca
tacgtgtttaagagatacttagaaatttatggatttagtgtaacatttatggaacttaga
cctacatcagattttacgaatagattagaagccataaatgtagaaaaaatcgaattaatc
aaagattcatataatagatatctaacggatgtagatagtggaaaaattcttccactatct
aagtctatggaatccgatgcggttgagtccatgttatcaactctcacgaatcttaatata
agagagatagaggaatatatgaaacaaacacttaaaactaatcccgataatagtttaata
agaatggcaaaagcaggatataaagtaaattctacagagttaatgtatatattaggaaca
tatggtcaacagcgtatagacggagaaccttctgaaacaaaagtgcttggtagagtttta
ccatattatcttccagattcaaaagatccagaaggaagaggatatatacttaattctcta
atccagggtttaacgggttctcagtattatttttccatgcttgttgcgagatcacaatct
acagatattgtatgtgaaacatctagaactggaactctcgccaggaaaattattaaaaaa
atggaagacatggttgttgatggatatggacaagtagtatatggtaatatactcataaaa
tatgcagctaattatacaaaagtatcatcatctatttgtaaacccatagaattattattt
ccaaatgaatcaatgatttggtttttagaaataagtgcattatggacaaaaataaaaaat
ggatttatatactcacaaaaacaaaaaatatcgaagaatacactatcgccgtttaatttt
cttgtatttatagaaccaactacagatgatttagctattggcgcaaaggatttatataat
atgatacaaagtgttatcgaagatataaaagagaattatttctttactatatgtaatatc
gatttcatagaatatatatttcttactcatttgaatccatctagagttagaatcactaaa
gaaaatgctattaatatatttaagaaattttatgaaaaattgaactattccttaggaggt
ggtacacctataggtattatatctgctcaggtattatctgaaaaatttacacaacaagca
ttatcaagttttcatactacagagaaaagtggtgctataaaacataaactgggatttaat
gaattcaataatttaacaaatctaagtaaaaataaaactgagattattacactgatttct
gaagatattgaaaaattacaaaatatcaaaatcaattttgaatttgtttgtttaggtgaa
cttaatcctactatatcattagataaaaaagataatagatatataattgatataattgtt
aatagaatatatataaaacgatctgaattaaccgaattggttgtagaatatatgatagaa
agatttatatcatttaatgtattagtaaaagaatggggaatggaaacatttatagacgac
gaatttaatatacgttttagagtatttatatcttttattgaaccagaagaattatctttg
aacaaatttatgatggtattaccaggagccgccaataaaggtaagataagtaaatttaag
atacctataacacaacatacatatttagacgattttaataaatctactaaaatgaataga
ataacagtggaactcatgaatctcaaagagcttggtagttttgatttagaaaatgtaaac
gtatatccgggtatatggaatacatacgatatattcggtatagaagctgctcgatcatat
ttatgtgaagcgttacttaacacatacggagagggtttcgattatttgtatcaaccatgt
gatttattgtctagtttattatgtatgagttatgaacccgagtcagttaataaattcaaa
tttggatccacaagtgccataaaacgtgcaacattcggagataataaagcattattacac
gcagctttacataaaaagtctgaaccggtgagtgataatagcagttgtcattttttcagt
aaagtacctaaaataggaacagggtattataaatactttataaatttagagttattaact
cgtttagagaaaaaactctctgtaaaaatatcggatagaaaaatagaaaaaataacagaa
ctaactgaagatttctaa
DBGET
integrated database retrieval system
