Viruses: 935289
Help
Entry
935289 CDS
T40000
Symbol
BYMVgp1
Name
(RefSeq) Bean yellow mosaic virus; polyprotein
Virus
12197
Bean yellow mosaic virus
Taxonomy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
VOG
VOG cluster
Motif
Pfam:
Peptidase_C6
Poty_coat
RdRP_1
Poty_PP
Peptidase_S30
Potyvirid-P3
Peptidase_C4
Helicase_C
DEAD
Trypsin_2
Flavi_DEAD
ResIII
Cas3-like_C_2
Peptidase_C3
Radical_SAM_C
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
935289
NCBI-ProteinID:
NP_612218
RS:
NC_003492
UniProt:
Q65892
LinkDB
All DBs
Position
NC_003492:191..9361
Genome browser
AA seq
3056 aa
AA seq
DB search
MTTINIGTIPVVINQNANTQMGEGTKNIFPFVKDFIDPFADLEMRCAERVKRMGELCFSK
KGRYITMIPKPDYIKTREKEQREEELNFQNSEHVLSSIGTTCTPEHYSSRNNGMQVSFKT
QHYKRTIRKPRIQAKKRDLKGQHTIHYVAKELLSIVKKRDMVLEVADKRKHANFATFRRY
GKTYGMHIALNHMVRKRRRVDVTLNKLMTEIAMHCAIPFECLDTLTLRKGHSGLVLQTET
VPNVHKIKSKITIVRGVVNEGNIPVLVDARKKLSGKDMSTIREFSAGDLFWKGYNQTFID
NRPTDLNHQCTSDLNVTQCGSVMALLTLALFPCGRITCKKCVENFLNQNNKERFNNASVF
INQVIQLLEKGFSEFKHSKEILLMFKERLQMENPATDQCMEIAKATAALPEAPFSHIKEI
NNVLLKYGSLSNEEVGGASKHLLEVVRYIRNRTDSIQRNDLSKFRNKISSKTHVNLDLMC
DNQLDKNANFVWGQRAYHAKRFLSNYFNEINPSEGYDKFIFRKLPNGARELAIGRLIMPT
NFEAFREQMKGNMIDNGPIGKDCVSRMRGSFCYPCCCTTDDVGNAVLSDFKMPTKYHLVL
GGNDLAKYIELPSDSTGNMYIAKDGYCHINIFFAMLVNVSEEKSKDFTKMVRDQIMPKLG
EWPTMMDVATACWQLTVWFPDTLSAELPRILVDHKLGIMHVLDSYGSISAGYHVLKANIV
SQLIKFASDDLESELKYYRVGGDWNFGNRVRTDTKFLLKSIYRPDLLERIIEHEPFVLVL
AMQSPAVLLALFNSASLEKAVQYWMHREMQVSHIMTLLAVLASNVSASRLLTTQFEIIEA
SAPQILAEMDKVHQPMHSIHSANVFLMNLNESRETDKTIDELGFYSFKKSSRILMEKTLM
ADLEEQWQGLGLLERLSLIKRSWRVRAKYSSFAIQREEPGIRDKFTTSLKLSGAQIKQQL
LAQKDQAVHFVERRIERTKKFVANQAIGLVKMCLPRLADIVNVLTVIMLLNALLAFMLDH
IKRFNEARRIAQEKKEKQHLRELNTLYSKHWDNEKPTYLEFKSDVIEKLPHTLATFEKYY
SEDDKYTFQAKPNDMIALEKIVAVTALILMIFDAERSDCVYKVLNKLKGILSTTTQDAYR
FQSLDTSKTLLEEKEMTIDFEINEGEVKAFSGTQTTFSEWWDNQLQNGNVITHYRTEGQF
MEFTRANAQPVANEIAHNDAQDILVRGAVGSGKSTGLPFYLSNKGKVLMIESTRPLAENV
FKQLKSEPFYVSPTLRMRGTTSYGASPITIMTSGYALHYYANNPAMMKEYKFVIIDECHV
HDASAIAFVSLLKEYSFDGKLIKVSATPPGREVEFTTQYPVTLVTEESLSFEQFVSQQGT
GANCDMLDVCDNILVYVASYNEVDQLSKMLLDRGHIVTKVDGRTMKNGKTEIESKGSRSK
RHFIVATNIIENGVTLDIEGVVDFGLKVVPELDVDNRLMRYTKQSVSYGERIQRLGRVGR
HKAGKALRIGVTEKGLMKPPSVITTEAAFYCFAYGLPVMAEGVTPSLLSKCTVQQARSMM
SFELPIMYTVNLVRFDGTMHPSVHNLLKPYKLRDSNVVLNKMAIPHGNVRNWPTVRDFKH
MGVRIDIPEDTRVPFHARGIPDKLHKEIFEVCCKYKGDAGFSKLNVVNACKIAYTLQTDP
SSIQRTIKILDELIAREQQKREYFQNVANTSCAGSSYSLSNIINAIRARSTSDYTQENLS
VLHSARAQLLEFKNINSDFSNLSTLSEFGALECLQFESLQGVSKHLQLKGHWNKPVLIQD
FLIAAGVLGGGCWMLYQYFKQETSKAFVFQGKNRRTKQKLRFRDARDMKGRMEVYADEGT
IVENFGSKYTKKGKVRGTTTGMGTKTRRFTNMYGFDPTEYSFARYLDPITGETLDEQPIT
NLNLVSEHFQEMRRKYRENDIMESQHFAASPSIEAYFVKDAGQKVLKVDLTPHKPLLYSD
KFGNIMGYPEREGELRQTGTAEFIDPKELPEPKESTDFDFESLSKIGGLRDYNPIAANVC
LLENESAEYCDEIYGIGYGNVIITNQHLFRHNNGELTIKSKHGTFKCKNTCALKLLPIEG
HDLLLIQMPKDFPVFPQKLRFREPTHEDKIVLVSTNFQEKSFSSVVSESSNISRVKQANF
FKHWISTVAGQCGNPMVSTKDGFIVGIHSLTAISGDLNVFTSIPPNFEDEVLKQMSKKNW
CCGWKLNTSQIGWDGIKIVDDQPKDPFPVSKMVGLLNDLQLSFQSAKNTKWLLERAHGNI
KAVAQASSALVTKHVVKGKCRLFEVYLTTDEEAEKFFRPLMGAYQKSRLNKEAYVKDLMK
YATPIEVGLVDTRCFERCFEKVQNMLELKGFSKCNYVTYGPDILSALNMKAAMGALYSGK
KKDHFSEISEEKFDNILQASCERLYSGRMGVWNGSLKAELRPQEKVLANKTRSFTAAPID
TLLAGKVCVDDFNNKFYSLHLKIPSTVGITKFYGGWDRLLNSLPDGWVYCDADGSQFDSS
LTPYLLNAVLEMRLRLMEEWDLGEQMLKNLYTEIVYTPILTPDGTVVKKFKGNNSGQPST
VVDNTLMVIMAVYYAAEKLGIKGNLEDTLVFFANGDDLLIAIKPECESYLDKFEGLFSEL
GLKYDFSSRTKNKGDLWFMSHRGIQIDGMWIPKLEEERIVSILEWDRAIQPEHRLEAICA
AMIEAWGYPTLLNHIRKFYLWVLGQAPYSQLSAEGKAPYISEVALKHLYTEERVTPAELE
RYSIALIDCFESESDEVLVCRFQSDQEIFNAGETKKDKARKNEENPDKNSEGQSSRQIVP
DRDVNAGTVGTFSVPRLKKIAGKLNIPRIGGKIVLNLDHLLEYNPPQDDISNVIATQAQF
EAWYNGVKQAYEVEDSQMGIILNGLMVWCIENGTSGDLQGEWTMMDGEEQVTYPLKPILD
NAKPTFRQIMSHFSEVAEAYIEKRNATERYMPRYGLQRNLTDYGLARYAFDFYKLTSKTP
VRAREAHMQMKAAAVRGKSTRLFGLDGNVGTDEENTERHTAGDVNRDMHTMLGVRI
NT seq
9171 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgactactattaatattggaactattccggtagtaataaaccaaaacgctaacacccag
atgggtgagggcaccaaaaatatttttccttttgttaaggattttattgatccttttgct
gatttggagatgaggtgcgctgagcgggttaagcgcatgggagaattatgtttttcaaag
aagggacgctacatcacgatgattccaaaacccgactacatcaagaccagagagaaggag
cagcgtgaggaagagctgaactttcaaaatagtgagcatgttctgagctcaattggcact
acttgcactcctgaacactactcttcacgaaacaacgggatgcaagtttcgtttaaaaca
cagcattacaaaagaaccattagaaaacctcgcatacaggccaaaaagagagacctgaaa
ggccaacatacaattcattatgtggcgaaggaacttctcagcattgtaaagaagagggat
atggttctagaggttgctgacaagagaaagcatgcaaactttgccactttcaggagatac
ggaaaaacttacggtatgcacatagctctaaaccacatggtgaggaagagacgtagagtt
gacgtcacgttgaataaattgatgactgagattgccatgcattgtgcaattccatttgaa
tgcttggacactttgaccctcaggaaaggacacagtgggttagttttacaaactgaaacg
gtgcccaatgttcataagattaagtcaaaaatcactattgtgagaggagtagtgaatgaa
gggaatattccagttctcgttgatgcaaggaagaaattgtctggcaaagacatgagtacc
ataagagagttttcagctggtgacttattctggaagggatataatcaaacattcattgac
aatagaccaacagacctaaatcaccaatgcacatcagatttgaatgtaacacagtgtgga
tcagtcatggcgcttttaactttagctttatttccttgtggtcgcatcacttgcaagaag
tgtgttgaaaacttccttaaccagaataataaggagagatttaataatgcaagtgtgttc
ataaaccaagtcatccagcttttggaaaaagggttctcagagttcaaacactcgaaagaa
attttgttgatgttcaaagaaagactccaaatggagaaccctgcaacagatcaatgcatg
gaaattgcaaaagctacagcagcgttgcccgaggcaccattcagtcatatcaaagaaatt
aataatgtcttactgaaatatggaagtctcagcaatgaagaagttgggggtgcaagcaag
cacttgcttgaagtggtgcgttatataaggaacaggacagattccatccagaggaacgat
ctcagcaagttcaggaataaaatttcttcgaagacccacgttaatttggatttaatgtgt
gacaaccagctggacaaaaatgccaattttgtgtggggtcagagagcgtaccatgctaag
cgatttcttagcaactacttcaacgaaatcaacccatcggaggggtatgacaaattcatt
tttaggaaattgccgaacggagctcgagagttagctataggaagattgatcatgcctacg
aactttgaagcttttagggaacagatgaaaggaaacatgattgataatggaccaattggg
aaggattgtgtatcacgcatgaggggttcattctgttacccttgctgttgcacaactgat
gatgtgggaaatgcagtattatccgatttcaagatgccaacaaaataccaccttgttctg
ggtggaaacgatctggctaagtacatagaattaccatcggatagcacaggcaatatgtac
atagcgaaagatggttattgtcatataaacatctttttcgcaatgttggtaaatgtttca
gaggaaaaatcgaaggattttacaaaaatggttcgtgatcaaataatgccgaaattaggt
gaatggccaactatgatggatgtcgcaacagcttgttggcaactgacagtttggtttcct
gacacgttgagtgctgaattgcccagaattttagttgatcacaagctcggaatcatgcat
gtccttgactcatatggttcaattagcgcgggataccatgttttgaaagcaaatatagta
tctcagctaattaagtttgctagtgatgaccttgaatctgaactgaagtattatagagtt
ggtggtgattggaactttggcaaccgagtccgaactgatacaaaatttcttctcaagagt
atatataggcctgatttgctagagaggataatagagcatgaaccattcgtgctagtgtta
gccatgcagtcgccagctgtcttattagccctttttaacagcgcttcattggagaaagca
gttcagtattggatgcacagggagatgcaagtttcacatataatgacactattggctgtt
ttggcttcaaatgtgagcgcttcgaggctgttaaccacacaatttgagatcattgaagca
agtgcacctcagattcttgcggaaatggacaaggtccatcaacccatgcactcaattcat
agtgctaacgtcttcctaatgaacttgaatgaaagtcgagaaacagacaagacaatagat
gaattgggcttctattcgttcaagaaatccagcagaattttaatggaaaaaaccttaatg
gcggatttggaggagcaatggcaaggattaggattgttggaacgattatctttaataaag
cggtcgtggcgagtgcgagcaaagtattcaagctttgcaatccaacgagaagagccaggt
ataagagacaagttcacaacctcactcaagttatcaggggctcagataaaacaacagtta
cttgctcaaaaggatcaggctgtccattttgtagaaaggagaattgaaagaactaagaag
tttgtcgcaaaccaggccattggcttggttaagatgtgtttaccaagactagcagacatc
gtgaacgttttgacggttatcatgttgctaaacgctctactagcattcatgcttgatcac
ataaaaagatttaatgaagctaggaggatagcccaggagaagaaggaaaagcagcacttg
agagagctaaacactttgtatagcaagcactgggataatgaaaaaccaacatacctggaa
ttcaagtctgatgtgattgaaaagttaccgcatacgctcgcaacctttgaaaagtactac
tccgaggacgacaagtacacttttcaagcaaaaccaaatgacatgatcgctcttgagaag
attgttgcagtaacagcactgatactcatgatttttgatgctgagaggagtgattgtgtt
tacaaagttctgaacaaattgaagggcattttgtcaacaaccacacaggatgcatacagg
tttcaaagcttagacacctccaaaactcttctggaagagaaagagatgaccattgatttt
gaaattaatgaaggtgaagtgaaggcattctcaggcacacaaacaactttctctgagtgg
tgggacaatcaactgcagaatggaaatgtgataacccactacagaacagagggccaattt
atggagttcacgagagctaatgcgcaacctgtggcgaatgaaattgcacacaatgatgca
caagacatactcgtgagaggtgctgttggatctgggaaatcaactggtctgccgttttat
ttgagcaataaaggaaaggttttaatgattgagtcaacaagacctttagctgaaaatgtt
ttcaaacaattaaagagtgaacctttctatgtaagtcccacgctccgtatgagaggtaca
acaagctacggagcatcaccaatcaccataatgactagtgggtacgctttacactattat
gcaaacaatccagcaatgatgaaagagtataagtttgtcataatagatgagtgtcatgta
catgatgcaagtgcaattgccttcgtaagcttgctcaaggaatattcatttgacggcaag
ctcattaaagtgtctgcaacacctccagggagagaagtggaattcacaacgcagtatcct
gtgactctagtgacggaggagagtctctctttcgagcagtttgtttcacaacagggtacg
ggtgcaaattgtgatatgttggatgtttgtgataatatacttgtctatgtagcaagctac
aatgaagttgatcaattatcaaaaatgctactagatagaggacacattgtaaccaaagtg
gatgggagaaccatgaagaatggtaaaacagagattgaaagcaagggcagcagatcaaag
cgacactttattgtggcaacaaacatcattgaaaatggtgtaacgcttgacattgaaggt
gtcgtcgattttggtctcaaagtggtgccagagttagatgtggataacaggctaatgaga
tacacaaagcaaagtgtttcttatggagagagaatacagaggcttggaagagttggaaga
cacaaggctggcaaggcattgagaattggtgtaactgaaaaaggattgatgaaaccaccc
agcgttatcacaactgaagctgctttttactgttttgcgtatggattaccggttatggcc
gagggtgtaacaccaagtttactcagcaaatgtacagtgcagcaagcgcgtagcatgatg
agctttgagcttccaataatgtacacagtgaatttggtaagatttgatggcactatgcat
ccttctgtgcataacttactgaagccgtataaactaagggattcaaatgtggtgctgaat
aagatggcgatacctcatgggaatgtgcggaactggcccacagttagagatttcaaacac
atgggggttcgtattgatatacctgaagacacccgtgttccttttcacgcccgtggcatc
ccagataagttgcacaaagaaatctttgaagtgtgttgtaagtacaagggtgatgctgga
ttcagtaaactgaatgtagtcaatgcatgcaagatagcatacactctccaaacagaccct
tcatcaattcagaggacaataaaaatacttgatgagctgatagcgcgtgagcaacaaaag
cgagaatatttccaaaatgtggccaacacatcatgtgctggttccagctactctttgtca
aatatcatcaatgccatcagagcaaggagcacaagcgattacactcaggagaatttgagc
gttttgcacagtgccagagcacaattgctggaattcaagaatataaacagtgatttctcc
aatctatcaactctaagcgaatttggtgcccttgaatgtttgcaatttgaatctttgcaa
ggggtaagcaagcatcttcagttaaaaggacattggaataaaccagtgttgatccaggac
tttttaattgcagcgggagtgctcggaggtgggtgttggatgctttatcaatatttcaaa
caagagacgagcaaggcatttgtgttccaaggaaagaacagaaggacaaagcagaagttg
aggtttcgagatgctagagacatgaaaggccgcatggaagtttacgcggatgaggggact
atagtggaaaactttggcagcaaatacacaaagaagggaaaagttagaggtaccacaact
ggtatgggaacaaagactagaagatttacaaatatgtacggtttcgatccaacagagtac
tcttttgctagatacttggaccctatcacaggtgaaacactggatgaacaacccataaca
aatttgaatcttgtttctgaacactttcaggaaatgagaagaaaatacagagagaatgat
atcatggagtcgcagcacttcgctgcaagccccagtattgaagcttattttgtcaaagac
gcaggccagaaagttttgaaagtcgacttgacaccacacaaacctttgttgtatagtgac
aagtttggaaacattatgggttatcctgagagagaaggggagttaaggcaaactggcaca
gctgagtttattgatcccaaagagctaccagaaccaaaagagtctacggatttcgatttt
gagagtctcagcaagataggaggtttacgtgactataacccaatagctgcaaatgtttgt
ttgttagaaaacgaatcagcagagtattgtgatgagatatacggcattgggtatggaaac
gtgatcataacgaatcagcatttgttcaggcacaataatggagaattgaccattaaatcc
aaacatggaactttcaagtgcaagaacacgtgcgcactcaagttgcttccgatagaaggc
cacgatctactcctcattcaaatgccaaaagatttccccgtgttcccacagaaactcaga
ttcagggaaccaacacatgaggacaagatagttctcgtgagcacaaacttccaggagaaa
agcttttcaagtgtagtttcagaatccagtaacatatcaagggtgaagcaagctaatttc
ttcaaacattggatttcgacagtagccggacagtgtggtaatcctatggtttccactaaa
gatggttttattgtagggattcacagtttgactgcaatttcaggtgaccttaatgtgttc
acatctataccaccaaattttgaggatgaagtgctaaaacaaatgagcaaaaagaactgg
tgttgtggctggaagttgaacacgtcacaaattggatgggatgggattaaaattgtggat
gatcaaccaaaggatcctttcccagtttcgaagatggtagggttgttgaatgaccttcaa
ttgagtttccagagtgcgaagaatacaaagtggctattggaacgagctcatggcaacata
aaggcagttgcccaggcttccagcgctcttgtcactaaacatgttgtaaaaggaaaatgc
cgcttgtttgaagtttacttaacaacggatgaagaagcagagaaattctttcgaccattg
atgggtgcgtaccagaaaagtcgattaaataaggaggcatacgtgaaagatttgatgaaa
tacgcaactccaatagaagttggtcttgtcgacacgaggtgctttgagagatgttttgag
aaggttcaaaatatgttggaattgaagggtttcagcaaatgcaactacgtcacttatggg
cccgacattctaagcgctctcaatatgaaggcagcaatgggtgcattgtactcaggaaag
aaaaaggatcacttctcagagatcagtgaggaaaaattcgacaacattctccaagcaagt
tgtgagagattgtacagtggtcgaatgggtgtttggaatggatcattgaaagcagagctg
agaccacaagaaaaagtgctcgcaaataaaactcgatcatttacagcagcaccaattgac
acacttttggctggaaaggtttgtgtggatgatttcaacaataagttctacagtttgcac
ctgaagatcccgtcgacagtgggaataacaaagttctatggtggttgggatcggctgctc
aattctttaccagatggatgggtgtactgcgatgctgatggttcccaatttgacagctca
ctcactccataccttttgaatgctgtccttgagatgcggttgagacttatggaagaatgg
gatttgggtgaacagatgttgaaaaatctttatacagaaattgtgtacacacccatattg
acaccagatggaacggttgtcaagaagtttaaagggaataacagtggacagccatccaca
gtggttgacaacacgctcatggttattatggcagtttattatgcagcggaaaagcttggt
atcaaggggaatctcgaagatacacttgttttctttgccaacggggatgacctgctaatt
gccattaaaccagagtgtgaatcgtaccttgataaatttgagggcttgtttagtgaactg
ggattaaagtatgatttcagtagcagaacgaagaacaaaggtgacttgtggtttatgtca
cacagaggaattcaaatagatgggatgtggattcctaaattggaagaggagcgcatcgtt
tcaattctggagtgggacagagctattcaaccagaacatagacttgaggcaatatgcgca
gcaatgattgaagcatggggctatccaactctattaaaccacataaggaagttctacctt
tgggtcttagggcaagcaccatatagtcaattgagtgctgagggcaaggcaccatacatt
tcagaagtcgcgctcaagcacctatacactgaggagagagtcacaccagccgaattggaa
aggtatagcattgcattaatcgactgttttgagtccgagagtgatgaggtgcttgtgtgt
cgttttcaatcagatcaagagatattcaatgcaggtgagacgaagaaggataaagcgagg
aagaatgaagaaaatcctgataagaactctgaggggcagagtagcaggcaaatagtgcca
gacagagatgtgaatgcaggaactgttggaacgttttcagttcctaggctcaagaaaata
gcaggaaagctaaatattcctaggattggtggaaagatagttctcaatctagaccacctg
ctggaatataacccaccacaagatgacatttcaaatgttatagcaacacaagcacagttt
gaagcatggtacaatggtgtcaaacaagcatatgaggttgaagattcacagatgggaatt
attctgaatggccttatggtgtggtgcatagagaatggcacatcaggagatttacaaggt
gaatggacaatgatggatggagaggagcaggtgacataccctttaaaacctatcttggac
aatgcaaagccaacattccgccaaataatgtcacatttctcggaagttgcggaagcctac
attgaaaagaggaatgcaacagagaggtacatgccacggtatgggcttcagaggaaccta
actgattatggcttggctagatatgcttttgacttctacaagctgacttcaaaaactcct
gtacgtgctagggaagcacacatgcaaatgaaggcggcagcagttaggggcaagtcaacc
cgattatttggacttgatggcaatgttggaacagacgaggagaacacagagagacacaca
gcaggagatgtcaatcgtgatatgcacaccatgcttggtgttcgtatttag
DBGET
integrated database retrieval system