Viruses: 9384531
Help
Entry
9384531 CDS
T40000
Symbol
34, IME08_gp231
Name
(RefSeq) Escherichia phage IME08; tail fiber protein proximal subunit
KO
K26775
Straboviridae long-tail fiber proximal subunit
Virus
698728
Escherichia phage IME08
Taxonomy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
VOG
VOG cluster
Motif
Pfam:
Gp34_2nd
Gp34_trimer
Gp34_C
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
9384531
NCBI-ProteinID:
YP_003734382
UniProt:
D7RMP5
LinkDB
All DBs
Position
NC_014260:152104..156003
Genome browser
AA seq
1299 aa
AA seq
DB search
MADILKPAFRATSGLDAAGEKVINVAKADYNVLDDGVNVEFFIDENTIQAYDETRGYKKG
FAVIHDQRIWVAQRDIDAPAGTFVPGYWTATRTDPKWITVASPTRQLASGEYIAVDSAAS
FTTFTLPPNPTDGDTVVIKDIGGRVGYNEIKVQSSSAPGGGNQKIVRFGNQFTETLITKP
FSYNMLIFANRLWHFWEAGNEERGIRVEPNMAQFQSQAGDNVLRRYTSGAIIKFTLPKYA
NQGDMIKTVDIDGLGSKFHLIVETFDASSSLGKLGQHSMEFRTSGDGFFVYNSTEKLWYV
WDGDRQTRLRVIRDDVELLANESVIVFGPNNTTPQTINITLPTSVAQGDVVKIALNYLRK
AQTVNIKAAVGDKIASSVQLLQFPKRSEYPPDTEWVLNDVLTFNGNLSYTPVIELSYIED
STTGGKYWVVAQNVPTVERVDSKDDLTRARLGVIALASQTQANVDHENNPEKELAITPQT
LANRVATESRRGIARIATTAQVNQNTGFAFQDDLIISPKKLNERTATETRRGVAEIATQQ
ETDAGVDDTTIITPKKLQTRQGTETLSGIVKYVSTTGTTPADSRATVGTNVYNKNTTTLV
ISPKALDQYKANYENQGAVYLATQAEVNAGATNQGFSNSAVTPETLGARRATDTNHGLIE
IATQAETDAGTDYTRAVTPKTLNDRNATQTLTGIARIGTQVEFDAGVLDNVISTPLKIKT
RFNNTARTSVSAASGLVESGTLWNHYTLDIREASNTQRGTARLATQTEVNTGTDDKTIIT
PLKLQAKKATENAEGIIQLATQAEVIDGTVSNKAFSPKHYKYIVQQEKSWEATSARRGYV
KLTTGTATWEGDDTNGSVANLAKFEDSGFAISPLQMNTALTHYLPIKGKAFDSDKLDNLD
SSQFVRRDIDQIVEGTLTLRKNIRVDGQLATGGTGEFGGSLAANSTFTLRNTGTATRIIF
EKGPQTGTNPAQSMSIRVWGNQFGGGSDQTRSTVFEVGDETSNHFYSQRNNLGNITMSIN
GTVQPINVNASGSLNASGVATFGSSVTANGEFISKSANAFRAISGDYGFLIRNDGTNTYF
LLTHPGGQTGGFSGLRPLAINNTSGQVTIAEGLVIAKGATINSGGLTVNSRIRSQGSKPA
DLYSRKPDADNTGFWSVDVNDSATYNQFPGYFKMVEKTNEVTGLPYLVRGEEVKSPGTLT
QFGNTLNSLYQDWITYPNTADGSTTRWTRTWQQNKNAWSGFVQVFDGGNPPQPSDIGALP
SDNASMSNLTIRDWLRIGNVRMVPDPVTRSVKFEWIDTP
NT seq
3900 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggctgatattttaaaacctgcattccgtgctacatccggactcgatgctgcgggcgag
aaagttatcaatgttgccaaagccgattacaatgtattagatgatggcgtcaacgttgaa
ttctttatagatgagaacaccatccaggcgtacgacgagacgcgcggatataagaaaggg
tttgcagtaatccatgaccaacgtatctgggttgctcaacgtgatatcgatgctcctgca
ggaacctttgtacctggttattggactgctacccgtactgaccctaaatggattaccgta
gcgtctcctacacgccagctggcttccggtgaatatattgcagtagattctgctgctagc
tttactacatttaccctgcctcctaaccctactgatggcgataccgttgtaattaaagat
attggcggacgtgttggttataacgaaatcaaggtccaatctagttctgctcctggcggc
ggtaaccagaaaattgttcgttttggtaatcagtttactgagaccttaattacgaagcct
ttttcttataacatgcttatctttgctaaccgtctttggcatttctgggaagcaggtaat
gaagaacgtggtatccgtgtagaaccaaacatggcccagttccaatcacaagcaggtgat
aacgttctccgtcgttatacttcaggtgcaataattaagtttactcttcctaagtatgca
aaccaaggtgatatgattaaaaccgttgatatcgatggtttaggaagtaagttccactta
atcgttgaaacgtttgatgcttcatcttcattaggtaagcttggtcagcatagcatggaa
ttccgtacctcaggtgatggattctttgtttataactctaccgaaaaattatggtatgtt
tgggacggcgaccgtcaaactcgtttacgtgtaattcgtgacgatgttgagctcttggct
aatgaaagtgttattgtttttggccctaataatacaacaccacagacgattaatatcaca
ttacccacaagcgtagcccagggtgatgtcgttaagattgctctgaactatctccgtaaa
gctcagacggtaaatattaaggcagccgtaggagataaaatagcttcttcggttcaattg
ctccagttccctaaacgttctgaatatccgccggataccgaatgggtattgaatgatgta
ttgactttcaatggtaacttaagttatactccggttattgaactgagttatatcgaagac
tcaaccacaggtggcaaatattgggttgttgcccagaacgttcctactgtagaacgtgtg
gattctaaggatgatttaactcgcgcgcgtctcggtgttattgctctggcgtcacagacc
caagcaaacgtcgaccatgaaaataatcctgaaaaagaactggctatcaccccacagact
ttagctaatcgtgtagcgactgaatcacgacgtggtattgctcgtattgctacaactgct
caggtaaaccagaatactggatttgcattccaggacgatttgattatttctcctaagaaa
ttaaacgaacgtactgctaccgaaactcgtcgtggtgtcgctgaaattgctacgcaacag
gaaactgatgcaggtgttgatgatacaaccattatcactcctaagaagctacagacgcgc
cagggaaccgaaaccctgtcaggtatagtaaaatacgtatccaccacaggaaccactcct
gcggactctagagcaactgtaggtactaacgtttataataagaacacaactactttagtt
atttctcctaaagctttggaccaatataaagctaactatgagaaccaaggcgctgtatat
cttgctacgcaagccgaagttaacgctggtgctactaaccaaggttttagtaactcagct
gttacacctgaaacattaggtgctcgtcgtgctactgatactaatcacggtttaattgaa
attgctacgcaagcagagactgatgctggaactgattatactcgtgcggtaacgcctaag
acgttaaatgacaggaatgctactcaaacacttactggtattgctcgtattggtactcaa
gtagaatttgatgcaggtgtattagataatgttatttcaactccgttgaaaattaaaaca
cgttttaataatactgctagaacttctgtctcagcagccagtggtttggttgaatcagga
accttatggaaccattatacactagatatccgagaagcaagtaatactcaacgtggtacg
gctcgtttggctacccaaactgaagttaatactggtaccgatgacaaaacaatcatcact
ccgcttaagcttcaagctaaaaaggctaccgaaaacgctgaaggtattatccaactcgct
actcaggccgaagttattgatggtacggtaagtaataaagcgtttagtcctaagcattac
aaatatatcgttcaacaggaaaaatcctgggaagctacttctgctcgtagaggatatgtt
aaattaaccacaggtacagccacttgggaaggtgacgacactaatggttctgttgctaac
ctggctaaatttgaagattccggctttgctatttcccctcttcaaatgaacaccgcttta
actcattatcttccgattaaaggtaaggcttttgactctgataaattggacaacctggat
agctctcagttcgtcaggagagatattgaccaaatagttgaaggaacattaacccttcgt
aaaaacatcagagtggatggccagttggctacaggcggtactggtgaatttggtggttct
ttagctgctaatagcacatttaccctccgtaatacaggaacggctacgcgtataatattt
gaaaagggtcctcaaacaggaaccaaccctgcccaatctatgagtattcgcgtatggggt
aaccaatttggcggcgggtccgaccaaacccgttctacagtgtttgaagttggcgatgaa
acctctaaccacttctatagccagcgtaacaatttaggtaacattaccatgagtattaat
ggtactgtccaacctattaatgttaacgcttcaggttcattgaacgcttccggtgttgca
acatttggtagttcagttacggccaatggtgaattcattagcaagtctgcaaacgcattt
agagcaattagtggtgattacggattccttattcgcaatgatggcactaatacctatttt
ttgctaacccatccaggaggccagactggcggatttagtggattgcgtcctttagctatt
aataatacatccggccaggttacaattgccgaagggcttgttattgctaaaggtgctact
ataaactcaggtggtttaactgttaattctagaattcgttcacagggttctaaacctgct
gacctttattcgagaaaacctgatgcagataatacaggcttctggtctgttgacgttaat
gattcagccacatataaccagttcccaggttattttaaaatggttgaaaagaccaacgaa
gtaaccggactgccgtatctggtccgcggtgaagaagttaaatctcctggtacgttaact
cagttcggtaacactctgaattcgctttaccaagattggattacctatccaaatactgca
gacggaagcactactcgttggactcgtacttggcagcaaaataaaaatgcttggtctgga
tttgttcaggtatttgatggcggtaacccaccacaaccgtccgatatcggtgctttgcct
tctgacaacgcttcaatgagtaacttgaccattcgtgattggttacgtatcggtaacgta
cgtatggttccggacccggtaactcgttctgttaaattcgaatggattgatacaccataa
DBGET
integrated database retrieval system
